MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_008258	ATGA	2	8	3234909	3234916	50 %	25 %	25 %	0 %	110807003
53002	NC_008258	T	6	6	3235118	3235123	0 %	100 %	0 %	0 %	110807003
53003	NC_008258	ATT	2	6	3235140	3235145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807003
53004	NC_008258	A	6	6	3235190	3235195	100 %	0 %	0 %	0 %	110807003
53005	NC_008258	AGG	2	6	3235260	3235265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110807003
53006	NC_008258	CT	3	6	3235313	3235318	0 %	50 %	0 %	50 %	110807003
53007	NC_008258	ATT	2	6	3235342	3235347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807003
53008	NC_008258	CAA	2	6	3235405	3235410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110807003
53009	NC_008258	ATT	2	6	3235480	3235485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807003
53010	NC_008258	TAA	2	6	3235507	3235512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110807003
53011	NC_008258	A	7	7	3235534	3235540	100 %	0 %	0 %	0 %	110807003
53012	NC_008258	GTT	2	6	3235556	3235561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110807003
53013	NC_008258	TCAT	2	8	3236679	3236686	25 %	50 %	0 %	25 %	110807004
53014	NC_008258	AGC	2	6	3236714	3236719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807004
53015	NC_008258	CG	3	6	3236809	3236814	0 %	0 %	50 %	50 %	110807004
53016	NC_008258	CGG	2	6	3236869	3236874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807004
53017	NC_008258	CT	3	6	3236879	3236884	0 %	50 %	0 %	50 %	110807004
53018	NC_008258	C	8	8	3236905	3236912	0 %	0 %	0 %	100 %	110807004
53019	NC_008258	TCC	2	6	3236952	3236957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110807004
53020	NC_008258	GAC	3	9	3236982	3236990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807004
53021	NC_008258	GCG	2	6	3236994	3236999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807004
53022	NC_008258	GC	3	6	3237018	3237023	0 %	0 %	50 %	50 %	110807004
53023	NC_008258	CAT	2	6	3237207	3237212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110807005
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53025	NC_008258	TTC	2	6	3237355	3237360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110807005
53026	NC_008258	GCGCC	2	10	3237426	3237435	0 %	0 %	40 %	60 %	110807005
53027	NC_008258	CCGC	2	8	3237440	3237447	0 %	0 %	25 %	75 %	110807005
53028	NC_008258	T	6	6	3237490	3237495	0 %	100 %	0 %	0 %	110807005
53029	NC_008258	GA	3	6	3237513	3237518	50 %	0 %	50 %	0 %	110807005
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53036	NC_008258	CGC	2	6	3237819	3237824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110807005
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53040	NC_008258	GTA	2	6	3238324	3238329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110807006
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53044	NC_008258	CAC	2	6	3238702	3238707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110807006
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53052	NC_008258	GCA	2	6	3239051	3239056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807006
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53078	NC_008258	TGC	2	6	3240627	3240632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807008
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53089	NC_008258	TCAGAT	2	12	3241392	3241403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110807009
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53101	NC_008258	GCA	2	6	3242027	3242032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110807010
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53104	NC_008258	CAAA	2	8	3242757	3242764	75 %	0 %	0 %	25 %	110807011
53105	NC_008258	ATA	2	6	3242802	3242807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110807011
53106	NC_008258	TAT	2	6	3242833	3242838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110807011
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53112	NC_008258	AT	4	8	3243111	3243118	50 %	50 %	0 %	0 %	110807011
53113	NC_008258	CGT	2	6	3243136	3243141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110807011
53114	NC_008258	AT	3	6	3243190	3243195	50 %	50 %	0 %	0 %	110807011
53115	NC_008258	GGC	2	6	3243275	3243280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110807011
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53117	NC_008258	GCGA	2	8	3245143	3245150	25 %	0 %	50 %	25 %	110807012
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