MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella flexneri 5 str. 8401 chromosome

Total Repeats: 75589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008258	GGC	2	6	259618	259623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804298
4502	NC_008258	GT	3	6	259677	259682	0 %	50 %	50 %	0 %	110804298
4503	NC_008258	GAA	2	6	259726	259731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804298
4504	NC_008258	GAG	2	6	259739	259744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110804298
4505	NC_008258	GAT	2	6	259777	259782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804298
4506	NC_008258	GAA	2	6	259865	259870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804298
4507	NC_008258	GTC	2	6	259875	259880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804298
4508	NC_008258	CAA	2	6	259930	259935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804298
4509	NC_008258	GAA	2	6	259940	259945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804298
4510	NC_008258	TTA	2	6	260044	260049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110804298
4511	NC_008258	AAC	2	6	260278	260283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804298
4512	NC_008258	GAT	2	6	260373	260378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804299
4513	NC_008258	GTG	2	6	260379	260384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804299
4514	NC_008258	TGC	2	6	260399	260404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804299
4515	NC_008258	GCT	2	6	260444	260449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804299
4516	NC_008258	GCA	2	6	260453	260458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804299
4517	NC_008258	GAAG	2	8	260495	260502	50 %	0 %	50 %	0 %	110804299
4518	NC_008258	TGA	3	9	260540	260548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804299
4519	NC_008258	CA	3	6	260572	260577	50 %	0 %	0 %	50 %	110804299
4520	NC_008258	AAG	2	6	260647	260652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804299
4521	NC_008258	CTG	2	6	260658	260663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804299
4522	NC_008258	ACG	2	6	260710	260715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804299
4523	NC_008258	A	7	7	260772	260778	100 %	0 %	0 %	0 %	110804299
4524	NC_008258	GCA	2	6	260977	260982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804300
4525	NC_008258	GAC	2	6	260990	260995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804300
4526	NC_008258	CAAAG	2	10	260998	261007	60 %	0 %	20 %	20 %	110804300
4527	NC_008258	GCT	2	6	261124	261129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
4528	NC_008258	GGT	2	6	261149	261154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804300
4529	NC_008258	AAG	2	6	261183	261188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804300
4530	NC_008258	CTG	2	6	261320	261325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
4531	NC_008258	GTG	2	6	261335	261340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804300
4532	NC_008258	A	6	6	261386	261391	100 %	0 %	0 %	0 %	110804300
4533	NC_008258	GGC	2	6	261404	261409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804300
4534	NC_008258	CG	3	6	261439	261444	0 %	0 %	50 %	50 %	110804300
4535	NC_008258	GAT	2	6	261533	261538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804300
4536	NC_008258	GAA	2	6	261599	261604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804300
4537	NC_008258	ACC	2	6	261614	261619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804300
4538	NC_008258	AAG	2	6	261632	261637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804300
4539	NC_008258	GCGAC	2	10	261720	261729	20 %	0 %	40 %	40 %	110804300
4540	NC_008258	ATG	2	6	261803	261808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804300
4541	NC_008258	AAC	3	9	261809	261817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110804300
4542	NC_008258	CTG	2	6	261836	261841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
4543	NC_008258	CT	3	6	261898	261903	0 %	50 %	0 %	50 %	110804300
4544	NC_008258	CGC	2	6	261946	261951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804300
4545	NC_008258	ACC	2	6	262067	262072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804300
4546	NC_008258	CGG	2	6	262081	262086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804300
4547	NC_008258	CTG	2	6	262115	262120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804300
4548	NC_008258	GCG	2	6	262130	262135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804300
4549	NC_008258	GAC	2	6	262260	262265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804301
4550	NC_008258	A	6	6	262359	262364	100 %	0 %	0 %	0 %	110804301
4551	NC_008258	TGA	2	6	262450	262455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804302
4552	NC_008258	CTG	2	6	262469	262474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804302
4553	NC_008258	GCG	2	6	262481	262486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804302
4554	NC_008258	CGGA	2	8	262493	262500	25 %	0 %	50 %	25 %	110804302
4555	NC_008258	GAT	2	6	262577	262582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804302
4556	NC_008258	GATGCT	2	12	262594	262605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110804302
4557	NC_008258	TCG	2	6	262631	262636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804302
4558	NC_008258	TGGC	2	8	262675	262682	0 %	25 %	50 %	25 %	110804302
4559	NC_008258	TTG	2	6	262683	262688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804302
4560	NC_008258	CCA	2	6	262883	262888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804303
4561	NC_008258	GGT	2	6	262974	262979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804303
4562	NC_008258	GT	3	6	262991	262996	0 %	50 %	50 %	0 %	110804303
4563	NC_008258	GCG	2	6	263031	263036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804303
4564	NC_008258	CTG	3	9	263041	263049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804303
4565	NC_008258	GCA	2	6	263090	263095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804303
4566	NC_008258	CAG	2	6	263126	263131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804304
4567	NC_008258	CGG	2	6	263165	263170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804304
4568	NC_008258	CCG	2	6	263374	263379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804304
4569	NC_008258	T	6	6	263404	263409	0 %	100 %	0 %	0 %	110804304
4570	NC_008258	CGT	2	6	263438	263443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804304
4571	NC_008258	CAT	2	6	263450	263455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804304
4572	NC_008258	GTG	2	6	263457	263462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804304
4573	NC_008258	TAA	2	6	263497	263502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110804304
4574	NC_008258	TGG	2	6	263508	263513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804304
4575	NC_008258	CGA	2	6	263588	263593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804304
4576	NC_008258	TGC	2	6	263619	263624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804305
4577	NC_008258	CGG	2	6	263714	263719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804305
4578	NC_008258	TGT	2	6	263724	263729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804305
4579	NC_008258	TGA	2	6	263736	263741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804305
4580	NC_008258	ACT	2	6	263771	263776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804305
4581	NC_008258	TGA	2	6	263829	263834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804305
4582	NC_008258	ATG	2	6	263855	263860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804305
4583	NC_008258	TGG	2	6	263861	263866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804305
4584	NC_008258	CTG	2	6	263896	263901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804305
4585	NC_008258	CGG	2	6	263943	263948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804305
4586	NC_008258	GCT	2	6	263952	263957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804305
4587	NC_008258	TCA	2	6	264002	264007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804305
4588	NC_008258	CTGA	2	8	264013	264020	25 %	25 %	25 %	25 %	110804305
4589	NC_008258	CAG	2	6	264034	264039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804305
4590	NC_008258	GAT	2	6	264040	264045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804305
4591	NC_008258	CTTC	2	8	264148	264155	0 %	50 %	0 %	50 %	110804305
4592	NC_008258	GCT	2	6	264426	264431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4593	NC_008258	TTG	2	6	264461	264466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110804306
4594	NC_008258	GACC	2	8	264561	264568	25 %	0 %	25 %	50 %	110804306
4595	NC_008258	GCG	2	6	264613	264618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804306
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4598	NC_008258	CG	3	6	264819	264824	0 %	0 %	50 %	50 %	110804306
4599	NC_008258	TAC	2	6	264868	264873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804306
4600	NC_008258	TGC	2	6	264893	264898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4601	NC_008258	CCG	2	6	264932	264937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110804306
4602	NC_008258	CAG	2	6	265162	265167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4603	NC_008258	CGA	2	6	265212	265217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4604	NC_008258	GGC	2	6	265221	265226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804306
4605	NC_008258	CCGC	2	8	265235	265242	0 %	0 %	25 %	75 %	110804306
4606	NC_008258	TGG	2	6	265295	265300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110804306
4607	NC_008258	TGC	2	6	265304	265309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4608	NC_008258	AGC	2	6	265343	265348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4609	NC_008258	CTG	2	6	265354	265359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4610	NC_008258	TGC	2	6	265397	265402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4611	NC_008258	CAC	2	6	265419	265424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110804306
4612	NC_008258	AGTA	2	8	265528	265535	50 %	25 %	25 %	0 %	110804306
4613	NC_008258	CGG	2	6	265598	265603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804306
4614	NC_008258	CTG	2	6	265618	265623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110804306
4615	NC_008258	CAG	2	6	265860	265865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110804307
4616	NC_008258	CGG	2	6	265877	265882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110804307
4617	NC_008258	ATG	2	6	265912	265917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804307
4618	NC_008258	CAT	2	6	265919	265924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110804307
4619	NC_008258	GAA	2	6	265997	266002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110804307
4620	NC_008258	TGA	2	6	266030	266035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804307
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4643	NC_008258	ATG	2	6	267221	267226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110804309
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