MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 2856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008048	GGGCA	2	10	650	659	20 %	0 %	60 %	20 %	103485499
2	NC_008048	AGGGC	2	10	1786	1795	20 %	0 %	60 %	20 %	103485500
3	NC_008048	CGTTC	2	10	4474	4483	0 %	40 %	20 %	40 %	103485502
4	NC_008048	TGCCG	2	10	6399	6408	0 %	20 %	40 %	40 %	103485505
5	NC_008048	GCATC	2	10	10268	10277	20 %	20 %	20 %	40 %	103485511
6	NC_008048	GCGCG	2	10	11275	11284	0 %	0 %	60 %	40 %	103485513
7	NC_008048	CACCG	2	10	13643	13652	20 %	0 %	20 %	60 %	103485516
8	NC_008048	CCGCG	2	10	15349	15358	0 %	0 %	40 %	60 %	103485519
9	NC_008048	CTCTC	2	10	17092	17101	0 %	40 %	0 %	60 %	103485521
10	NC_008048	GCGCT	2	10	17622	17631	0 %	20 %	40 %	40 %	103485521
11	NC_008048	TGGCG	2	10	18042	18051	0 %	20 %	60 %	20 %	103485521
12	NC_008048	CGGCG	2	10	19570	19579	0 %	0 %	60 %	40 %	103485523
13	NC_008048	ATGGC	2	10	21538	21547	20 %	20 %	40 %	20 %	103485524
14	NC_008048	ACCGA	2	10	23188	23197	40 %	0 %	20 %	40 %	103485525
15	NC_008048	GGATT	2	10	29077	29086	20 %	40 %	40 %	0 %	103485528
16	NC_008048	GCCGG	2	10	29998	30007	0 %	0 %	60 %	40 %	103485528
17	NC_008048	ATGAA	2	10	31274	31283	60 %	20 %	20 %	0 %	103485529
18	NC_008048	CGGGA	2	10	33463	33472	20 %	0 %	60 %	20 %	103485532
19	NC_008048	CGATG	2	10	35264	35273	20 %	20 %	40 %	20 %	103485534
20	NC_008048	CGGCG	2	10	35663	35672	0 %	0 %	60 %	40 %	103485534
21	NC_008048	GCGCC	2	10	35901	35910	0 %	0 %	40 %	60 %	103485534
22	NC_008048	GCGCC	2	10	37114	37123	0 %	0 %	40 %	60 %	103485535
23	NC_008048	TCGGG	2	10	37191	37200	0 %	20 %	60 %	20 %	103485535
24	NC_008048	GCAGC	2	10	39935	39944	20 %	0 %	40 %	40 %	103485537
25	NC_008048	CCGCG	2	10	41837	41846	0 %	0 %	40 %	60 %	103485540
26	NC_008048	CCCAG	2	10	41915	41924	20 %	0 %	20 %	60 %	103485540
27	NC_008048	GCAAG	2	10	42933	42942	40 %	0 %	40 %	20 %	103485541
28	NC_008048	GCGCC	2	10	43008	43017	0 %	0 %	40 %	60 %	103485541
29	NC_008048	CCGCG	2	10	44950	44959	0 %	0 %	40 %	60 %	103485542
30	NC_008048	GCACG	2	10	45343	45352	20 %	0 %	40 %	40 %	103485542
31	NC_008048	GCGCA	2	10	45650	45659	20 %	0 %	40 %	40 %	103485542
32	NC_008048	GCCGC	2	10	46249	46258	0 %	0 %	40 %	60 %	103485543
33	NC_008048	AGGGC	2	10	47684	47693	20 %	0 %	60 %	20 %	103485545
34	NC_008048	CGCGC	2	10	48123	48132	0 %	0 %	40 %	60 %	103485545
35	NC_008048	CGCGA	2	10	48351	48360	20 %	0 %	40 %	40 %	103485545
36	NC_008048	GCCGC	2	10	48598	48607	0 %	0 %	40 %	60 %	103485545
37	NC_008048	CTGGT	2	10	50357	50366	0 %	40 %	40 %	20 %	103485546
38	NC_008048	GCGCG	2	10	50911	50920	0 %	0 %	60 %	40 %	103485546
39	NC_008048	ATGCT	2	10	53770	53779	20 %	40 %	20 %	20 %	103485547
40	NC_008048	CCGGC	2	10	57220	57229	0 %	0 %	40 %	60 %	103485549
41	NC_008048	GCCCG	2	10	57720	57729	0 %	0 %	40 %	60 %	103485550
42	NC_008048	CGGCG	2	10	58462	58471	0 %	0 %	60 %	40 %	103485552
43	NC_008048	CGGCC	2	10	58854	58863	0 %	0 %	40 %	60 %	103485553
44	NC_008048	CGCGC	2	10	60802	60811	0 %	0 %	40 %	60 %	103485553
45	NC_008048	TGCGG	2	10	68707	68716	0 %	20 %	60 %	20 %	103485558
46	NC_008048	GCGCC	2	10	68824	68833	0 %	0 %	40 %	60 %	103485558
47	NC_008048	TGCGG	2	10	69073	69082	0 %	20 %	60 %	20 %	103485558
48	NC_008048	TCGCT	2	10	71702	71711	0 %	40 %	20 %	40 %	103485562
49	NC_008048	GTGCA	2	10	78317	78326	20 %	20 %	40 %	20 %	103485570
50	NC_008048	GTCCG	2	10	78603	78612	0 %	20 %	40 %	40 %	103485570
51	NC_008048	AGCTC	2	10	81979	81988	20 %	20 %	20 %	40 %	103485573
52	NC_008048	CAGTG	2	10	82055	82064	20 %	20 %	40 %	20 %	103485573
53	NC_008048	CGGGC	2	10	82724	82733	0 %	0 %	60 %	40 %	103485574
54	NC_008048	CGGCC	2	10	84433	84442	0 %	0 %	40 %	60 %	103485576
55	NC_008048	GCGCG	2	10	85668	85677	0 %	0 %	60 %	40 %	103485579
56	NC_008048	TGCGG	2	10	86713	86722	0 %	20 %	60 %	20 %	103485579
57	NC_008048	CTGGA	2	10	86788	86797	20 %	20 %	40 %	20 %	103485579
58	NC_008048	CGATG	2	10	87295	87304	20 %	20 %	40 %	20 %	103485580
59	NC_008048	GATCA	2	10	87619	87628	40 %	20 %	20 %	20 %	103485580
60	NC_008048	CAGTC	2	10	87858	87867	20 %	20 %	20 %	40 %	103485581
61	NC_008048	CACAT	2	10	88125	88134	40 %	20 %	0 %	40 %	103485581
62	NC_008048	CGGCG	2	10	89745	89754	0 %	0 %	60 %	40 %	103485583
63	NC_008048	TCGGT	2	10	90080	90089	0 %	40 %	40 %	20 %	103485583
64	NC_008048	GCCCG	2	10	90216	90225	0 %	0 %	40 %	60 %	103485583
65	NC_008048	ACAGC	2	10	91305	91314	40 %	0 %	20 %	40 %	103485585
66	NC_008048	ACCAA	2	10	91768	91777	60 %	0 %	0 %	40 %	103485586
67	NC_008048	CGATC	2	10	94771	94780	20 %	20 %	20 %	40 %	103485589
68	NC_008048	GCGCG	2	10	96874	96883	0 %	0 %	60 %	40 %	103485592
69	NC_008048	ACGGC	2	10	100534	100543	20 %	0 %	40 %	40 %	103485595
70	NC_008048	AGTCC	2	10	101302	101311	20 %	20 %	20 %	40 %	103485596
71	NC_008048	GCCAG	2	10	103007	103016	20 %	0 %	40 %	40 %	103485598
72	NC_008048	CGCGA	2	10	104497	104506	20 %	0 %	40 %	40 %	103485601
73	NC_008048	TCGAT	2	10	104703	104712	20 %	40 %	20 %	20 %	103485601
74	NC_008048	CGACC	2	10	106173	106182	20 %	0 %	20 %	60 %	103485604
75	NC_008048	GCCGG	2	10	106374	106383	0 %	0 %	60 %	40 %	103485604
76	NC_008048	ATATC	2	10	106567	106576	40 %	40 %	0 %	20 %	103485604
77	NC_008048	GATCC	2	10	108318	108327	20 %	20 %	20 %	40 %	103485606
78	NC_008048	CCGAC	2	10	111795	111804	20 %	0 %	20 %	60 %	103485609
79	NC_008048	GACGC	2	10	113045	113054	20 %	0 %	40 %	40 %	103485611
80	NC_008048	CGCTG	2	10	116503	116512	0 %	20 %	40 %	40 %	103485615
81	NC_008048	GCAGC	2	10	117486	117495	20 %	0 %	40 %	40 %	103485617
82	NC_008048	GCGGA	2	10	119188	119197	20 %	0 %	60 %	20 %	103485618
83	NC_008048	GTCGG	2	10	119823	119832	0 %	20 %	60 %	20 %	103485618
84	NC_008048	GCAAG	2	10	120543	120552	40 %	0 %	40 %	20 %	103485619
85	NC_008048	GATCA	2	10	122613	122622	40 %	20 %	20 %	20 %	103485622
86	NC_008048	ATGAA	2	10	122963	122972	60 %	20 %	20 %	0 %	103485623
87	NC_008048	GCCGT	2	10	123518	123527	0 %	20 %	40 %	40 %	103485624
88	NC_008048	GCGGA	2	10	126926	126935	20 %	0 %	60 %	20 %	103485628
89	NC_008048	GCAAC	2	10	128764	128773	40 %	0 %	20 %	40 %	103485630
90	NC_008048	CCGCT	2	10	129339	129348	0 %	20 %	20 %	60 %	103485631
91	NC_008048	GGAGG	2	10	131195	131204	20 %	0 %	80 %	0 %	103485633
92	NC_008048	AGATG	2	10	132234	132243	40 %	20 %	40 %	0 %	103485634
93	NC_008048	GGCCG	2	10	133854	133863	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
94	NC_008048	GGCGC	2	10	134173	134182	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
95	NC_008048	GATTT	2	10	135280	135289	20 %	60 %	20 %	0 %	103485636
96	NC_008048	GGCGC	2	10	135950	135959	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
97	NC_008048	TGCGC	2	10	137456	137465	0 %	20 %	40 %	40 %	103485637
98	NC_008048	CGCAC	2	10	138472	138481	20 %	0 %	20 %	60 %	103485638
99	NC_008048	GCTCG	2	10	139918	139927	0 %	20 %	40 %	40 %	103485640
100	NC_008048	TGGTG	2	10	141672	141681	0 %	40 %	60 %	0 %	103485641
101	NC_008048	GGCGC	2	10	142512	142521	0 %	0 %	60 %	40 %	103485642
102	NC_008048	GCCGC	2	10	146280	146289	0 %	0 %	40 %	60 %	103485647
103	NC_008048	GTAAA	2	10	150497	150506	60 %	20 %	20 %	0 %	103485650
104	NC_008048	GCGCC	2	10	152050	152059	0 %	0 %	40 %	60 %	103485652
105	NC_008048	CGCGG	2	10	152840	152849	0 %	0 %	60 %	40 %	103485653
106	NC_008048	GCCGC	2	10	153129	153138	0 %	0 %	40 %	60 %	103485653
107	NC_008048	CAGCG	2	10	156386	156395	20 %	0 %	40 %	40 %	103485654
108	NC_008048	CGCGC	2	10	157177	157186	0 %	0 %	40 %	60 %	103485654
109	NC_008048	GGATC	2	10	159336	159345	20 %	20 %	40 %	20 %	103485655
110	NC_008048	TGCGC	2	10	159836	159845	0 %	20 %	40 %	40 %	103485656
111	NC_008048	CGAGG	2	10	159957	159966	20 %	0 %	60 %	20 %	103485656
112	NC_008048	CGCGG	2	10	162051	162060	0 %	0 %	60 %	40 %	103485658
113	NC_008048	GTCGC	2	10	163093	163102	0 %	20 %	40 %	40 %	103485658
114	NC_008048	GCCCC	2	10	166272	166281	0 %	0 %	20 %	80 %	103485661
115	NC_008048	TTCCC	2	10	167961	167970	0 %	40 %	0 %	60 %	103485663
116	NC_008048	GTACG	2	10	168859	168868	20 %	20 %	40 %	20 %	103485663
117	NC_008048	CGTGT	2	10	170600	170609	0 %	40 %	40 %	20 %	103485664
118	NC_008048	AAGCC	2	10	171519	171528	40 %	0 %	20 %	40 %	103485664
119	NC_008048	GGCGC	2	10	173679	173688	0 %	0 %	60 %	40 %	103485666
120	NC_008048	ATCGC	2	10	174583	174592	20 %	20 %	20 %	40 %	103485667
121	NC_008048	TGCGC	2	10	174612	174621	0 %	20 %	40 %	40 %	103485667
122	NC_008048	GCGCG	2	10	177597	177606	0 %	0 %	60 %	40 %	103485669
123	NC_008048	CCGAC	2	10	177967	177976	20 %	0 %	20 %	60 %	103485669
124	NC_008048	CGACG	2	10	178037	178046	20 %	0 %	40 %	40 %	103485669
125	NC_008048	GCCGA	2	10	178149	178158	20 %	0 %	40 %	40 %	103485669
126	NC_008048	CGCGC	2	10	179174	179183	0 %	0 %	40 %	60 %	103485670
127	NC_008048	CGCGC	2	10	182912	182921	0 %	0 %	40 %	60 %	103485675
128	NC_008048	GCGCG	2	10	187087	187096	0 %	0 %	60 %	40 %	103485677
129	NC_008048	GCATC	2	10	188847	188856	20 %	20 %	20 %	40 %	103485678
130	NC_008048	TCGCC	2	10	189701	189710	0 %	20 %	20 %	60 %	103485679
131	NC_008048	GCCAG	2	10	191317	191326	20 %	0 %	40 %	40 %	103485679
132	NC_008048	CGATC	2	10	191608	191617	20 %	20 %	20 %	40 %	103485680
133	NC_008048	TGCGC	2	10	192742	192751	0 %	20 %	40 %	40 %	103485680
134	NC_008048	CGATG	2	10	194178	194187	20 %	20 %	40 %	20 %	103485681
135	NC_008048	ACCGA	2	10	195570	195579	40 %	0 %	20 %	40 %	103485682
136	NC_008048	CGCAG	2	10	199817	199826	20 %	0 %	40 %	40 %	103485685
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250	NC_008048	GCGAT	2	10	303597	303606	20 %	20 %	40 %	20 %	103485798
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259	NC_008048	CGGCC	2	10	314151	314160	0 %	0 %	40 %	60 %	103485804
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262	NC_008048	GGCGA	2	10	315194	315203	20 %	0 %	60 %	20 %	103485805
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