MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008048	TCG	2	6	135404	135409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3002	NC_008048	GCG	2	6	135468	135473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485636
3003	NC_008048	CGC	2	6	135560	135565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3004	NC_008048	CG	3	6	135568	135573	0 %	0 %	50 %	50 %	103485636
3005	NC_008048	CGA	2	6	135590	135595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3006	NC_008048	TGG	2	6	135626	135631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485636
3007	NC_008048	CGC	2	6	135686	135691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3008	NC_008048	CCG	2	6	135722	135727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3009	NC_008048	GAC	2	6	135784	135789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3010	NC_008048	GGCGC	2	10	135950	135959	0 %	0 %	60 %	40 %	103485636
3011	NC_008048	GATC	2	8	135966	135973	25 %	25 %	25 %	25 %	103485636
3012	NC_008048	CGA	2	6	135978	135983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3013	NC_008048	CGC	2	6	135988	135993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3014	NC_008048	GCG	2	6	136021	136026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485636
3015	NC_008048	CGA	2	6	136043	136048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3016	NC_008048	GCG	2	6	136134	136139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485636
3017	NC_008048	AC	3	6	136165	136170	50 %	0 %	0 %	50 %	103485636
3018	NC_008048	TGCC	2	8	136181	136188	0 %	25 %	25 %	50 %	103485636
3019	NC_008048	GACC	2	8	136212	136219	25 %	0 %	25 %	50 %	103485636
3020	NC_008048	CG	3	6	136260	136265	0 %	0 %	50 %	50 %	103485636
3021	NC_008048	CGC	2	6	136326	136331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3022	NC_008048	GTTC	2	8	136377	136384	0 %	50 %	25 %	25 %	103485636
3023	NC_008048	CGAG	2	8	136456	136463	25 %	0 %	50 %	25 %	103485636
3024	NC_008048	GCT	2	6	136497	136502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3025	NC_008048	GAA	2	6	136507	136512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103485636
3026	NC_008048	GCT	2	6	136515	136520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485636
3027	NC_008048	CCG	2	6	136549	136554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3028	NC_008048	AGG	2	6	136556	136561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485636
3029	NC_008048	GC	3	6	136575	136580	0 %	0 %	50 %	50 %	103485636
3030	NC_008048	GCC	2	6	136615	136620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485636
3031	NC_008048	GCG	2	6	136647	136652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485636
3032	NC_008048	TCCG	2	8	136701	136708	0 %	25 %	25 %	50 %	103485636
3033	NC_008048	CGG	2	6	136734	136739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485636
3034	NC_008048	GCAT	2	8	137016	137023	25 %	25 %	25 %	25 %	103485637
3035	NC_008048	GCG	3	9	137076	137084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485637
3036	NC_008048	GAT	2	6	137106	137111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485637
3037	NC_008048	CG	3	6	137147	137152	0 %	0 %	50 %	50 %	103485637
3038	NC_008048	CTT	2	6	137267	137272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485637
3039	NC_008048	CGC	2	6	137324	137329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485637
3040	NC_008048	CGT	2	6	137367	137372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485637
3041	NC_008048	CGG	2	6	137437	137442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485637
3042	NC_008048	TGCGC	2	10	137456	137465	0 %	20 %	40 %	40 %	103485637
3043	NC_008048	CG	3	6	137516	137521	0 %	0 %	50 %	50 %	103485637
3044	NC_008048	CTT	2	6	137531	137536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485637
3045	NC_008048	CCG	2	6	137624	137629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485637
3046	NC_008048	CAT	2	6	137646	137651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485637
3047	NC_008048	TGC	2	6	137675	137680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485637
3048	NC_008048	CGA	2	6	137684	137689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485637
3049	NC_008048	GAC	2	6	138019	138024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485638
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3051	NC_008048	GCG	3	9	138203	138211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485638
3052	NC_008048	CGC	2	6	138232	138237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485638
3053	NC_008048	CGA	2	6	138304	138309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485638
3054	NC_008048	GTC	2	6	138419	138424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485638
3055	NC_008048	CGA	2	6	138454	138459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485638
3056	NC_008048	CGCAC	2	10	138472	138481	20 %	0 %	20 %	60 %	103485638
3057	NC_008048	CGGA	2	8	138557	138564	25 %	0 %	50 %	25 %	103485638
3058	NC_008048	TGG	2	6	138593	138598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485638
3059	NC_008048	CCCG	2	8	138616	138623	0 %	0 %	25 %	75 %	103485638
3060	NC_008048	GGA	2	6	138808	138813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485639
3061	NC_008048	AACT	2	8	138836	138843	50 %	25 %	0 %	25 %	103485639
3062	NC_008048	TCG	2	6	138911	138916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485639
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3065	NC_008048	GAC	2	6	139059	139064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485639
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3068	NC_008048	CGT	2	6	139486	139491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485640
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3070	NC_008048	GCA	2	6	139724	139729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485640
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3072	NC_008048	CGG	2	6	139771	139776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485640
3073	NC_008048	GCTCG	2	10	139918	139927	0 %	20 %	40 %	40 %	103485640
3074	NC_008048	TTG	2	6	139990	139995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485640
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3081	NC_008048	TCGG	2	8	140984	140991	0 %	25 %	50 %	25 %	103485641
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3087	NC_008048	TCG	2	6	141179	141184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485641
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3089	NC_008048	CCT	2	6	141207	141212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103485641
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3091	NC_008048	GAC	3	9	141238	141246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485641
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3093	NC_008048	GCC	2	6	141301	141306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485641
3094	NC_008048	CGC	2	6	141387	141392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485641
3095	NC_008048	ATCGAC	2	12	141427	141438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	103485641
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3100	NC_008048	GGC	2	6	141628	141633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485641
3101	NC_008048	CGG	2	6	141642	141647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485641
3102	NC_008048	TGGTG	2	10	141672	141681	0 %	40 %	60 %	0 %	103485641
3103	NC_008048	TGG	2	6	141918	141923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485642
3104	NC_008048	GAG	2	6	141986	141991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485642
3105	NC_008048	GC	3	6	142008	142013	0 %	0 %	50 %	50 %	103485642
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3108	NC_008048	CG	3	6	142128	142133	0 %	0 %	50 %	50 %	103485642
3109	NC_008048	GCG	3	9	142131	142139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3110	NC_008048	GGC	2	6	142154	142159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3111	NC_008048	GCG	2	6	142171	142176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
3112	NC_008048	CGT	2	6	142217	142222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485642
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3117	NC_008048	GCG	2	6	142358	142363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485642
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3120	NC_008048	CGC	2	6	142483	142488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485642
3121	NC_008048	GGCGC	2	10	142512	142521	0 %	0 %	60 %	40 %	103485642
3122	NC_008048	GGCGGG	2	12	142535	142546	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	103485642
3123	NC_008048	TCG	2	6	142710	142715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3124	NC_008048	GCC	2	6	142781	142786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485643
3125	NC_008048	GAC	2	6	142796	142801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485643
3126	NC_008048	GCC	2	6	142853	142858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485643
3127	NC_008048	GC	3	6	142905	142910	0 %	0 %	50 %	50 %	103485643
3128	NC_008048	TCG	2	6	143022	143027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485643
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3130	NC_008048	GCG	2	6	143064	143069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485643
3131	NC_008048	GC	3	6	143072	143077	0 %	0 %	50 %	50 %	103485643
3132	NC_008048	CTT	2	6	143114	143119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485643
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3139	NC_008048	GTC	2	6	143342	143347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485643
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3141	NC_008048	GCG	2	6	143370	143375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485643
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3201	NC_008048	CAT	2	6	146309	146314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485647
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3232	NC_008048	CG	4	8	147836	147843	0 %	0 %	50 %	50 %	103485649
3233	NC_008048	CAGC	2	8	147857	147864	25 %	0 %	25 %	50 %	103485649
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3240	NC_008048	CGG	3	9	148235	148243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485649
3241	NC_008048	CAA	3	9	148256	148264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103485649
3242	NC_008048	GCA	2	6	148324	148329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485649
3243	NC_008048	GCGG	2	8	148362	148369	0 %	0 %	75 %	25 %	103485649
3244	NC_008048	CCT	2	6	148417	148422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103485649
3245	NC_008048	GCT	2	6	148436	148441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485649
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3247	NC_008048	CCCG	2	8	148574	148581	0 %	0 %	25 %	75 %	103485649
3248	NC_008048	CGG	2	6	148631	148636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485649
3249	NC_008048	AT	3	6	148705	148710	50 %	50 %	0 %	0 %	103485649
3250	NC_008048	CGG	2	6	148865	148870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485649
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3252	NC_008048	CGG	3	9	149102	149110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485650
3253	NC_008048	TCA	2	6	149146	149151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485650
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3262	NC_008048	GGC	2	6	149339	149344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485650
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3273	NC_008048	TCG	2	6	149764	149769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485650
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3300	NC_008048	TCG	2	6	151179	151184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485651
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3314	NC_008048	CGT	2	6	151648	151653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485651
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3319	NC_008048	GC	3	6	152038	152043	0 %	0 %	50 %	50 %	103485652
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3323	NC_008048	ATC	2	6	152220	152225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485652
3324	NC_008048	CGA	2	6	152257	152262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485652
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3328	NC_008048	TCACGG	2	12	152623	152634	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	103485653
3329	NC_008048	CGA	2	6	152659	152664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485653
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3331	NC_008048	ACC	2	6	152688	152693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485653
3332	NC_008048	GCGA	2	8	152712	152719	25 %	0 %	50 %	25 %	103485653
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3338	NC_008048	CGCGG	2	10	152840	152849	0 %	0 %	60 %	40 %	103485653
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3344	NC_008048	GCCGC	2	10	153129	153138	0 %	0 %	40 %	60 %	103485653
3345	NC_008048	TCC	2	6	153141	153146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103485653
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3347	NC_008048	ACC	2	6	153240	153245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485653
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3355	NC_008048	ACG	2	6	153504	153509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485653
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3357	NC_008048	CG	3	6	153514	153519	0 %	0 %	50 %	50 %	103485653
3358	NC_008048	CGG	2	6	153541	153546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485653
3359	NC_008048	AGC	2	6	153576	153581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485653
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3483	NC_008048	CCA	2	6	157363	157368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485654
3484	NC_008048	CG	4	8	157398	157405	0 %	0 %	50 %	50 %	103485654
3485	NC_008048	AGCG	2	8	157417	157424	25 %	0 %	50 %	25 %	103485654
3486	NC_008048	CGCC	2	8	157443	157450	0 %	0 %	25 %	75 %	103485654
3487	NC_008048	GCA	3	9	157476	157484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485654
3488	NC_008048	CAG	2	6	157552	157557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485654
3489	NC_008048	GCC	2	6	157586	157591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485654
3490	NC_008048	AGC	2	6	157601	157606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485654
3491	NC_008048	GC	3	6	157614	157619	0 %	0 %	50 %	50 %	103485654
3492	NC_008048	CGG	2	6	157621	157626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485654
3493	NC_008048	GC	3	6	157630	157635	0 %	0 %	50 %	50 %	103485654
3494	NC_008048	GTC	2	6	157654	157659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485654
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3496	NC_008048	GCG	3	9	157685	157693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485654
3497	NC_008048	GC	3	6	157707	157712	0 %	0 %	50 %	50 %	103485654
3498	NC_008048	CAG	2	6	157768	157773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485654
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3500	NC_008048	TCG	2	6	157799	157804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485654

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