MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008048	GC	3	6	18293	18298	0 %	0 %	50 %	50 %	103485521
502	NC_008048	GCT	2	6	18355	18360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485521
503	NC_008048	GCT	3	9	18394	18402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485521
504	NC_008048	GGCG	2	8	18451	18458	0 %	0 %	75 %	25 %	103485521
505	NC_008048	CG	3	6	18520	18525	0 %	0 %	50 %	50 %	103485521
506	NC_008048	GCG	2	6	18531	18536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485521
507	NC_008048	CTG	2	6	18548	18553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485521
508	NC_008048	TCG	2	6	18636	18641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485521
509	NC_008048	CGAC	2	8	18643	18650	25 %	0 %	25 %	50 %	103485521
510	NC_008048	AGC	2	6	18702	18707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485521
511	NC_008048	CGA	2	6	18721	18726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485521
512	NC_008048	ACG	2	6	18735	18740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485521
513	NC_008048	GCG	2	6	18747	18752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485521
514	NC_008048	CCG	2	6	18791	18796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485521
515	NC_008048	CG	4	8	18795	18802	0 %	0 %	50 %	50 %	103485521
516	NC_008048	GC	3	6	18832	18837	0 %	0 %	50 %	50 %	103485521
517	NC_008048	GCC	2	6	18862	18867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485522
518	NC_008048	ACC	2	6	18877	18882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485522
519	NC_008048	GGC	2	6	18892	18897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485522
520	NC_008048	GCC	2	6	18904	18909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485522
521	NC_008048	GGC	2	6	18920	18925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485522
522	NC_008048	GCC	2	6	18951	18956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485522
523	NC_008048	CG	3	6	19000	19005	0 %	0 %	50 %	50 %	103485522
524	NC_008048	TCGA	2	8	19033	19040	25 %	25 %	25 %	25 %	103485522
525	NC_008048	CGG	2	6	19073	19078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485522
526	NC_008048	TCGC	2	8	19096	19103	0 %	25 %	25 %	50 %	103485522
527	NC_008048	GCC	2	6	19174	19179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485522
528	NC_008048	GAC	3	9	19191	19199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485522
529	NC_008048	GC	4	8	19230	19237	0 %	0 %	50 %	50 %	103485522
530	NC_008048	GGC	2	6	19264	19269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
531	NC_008048	GAC	2	6	19279	19284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
532	NC_008048	CGT	2	6	19296	19301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485523
533	NC_008048	GCG	2	6	19339	19344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
534	NC_008048	CCGG	2	8	19402	19409	0 %	0 %	50 %	50 %	103485523
535	NC_008048	CTG	2	6	19429	19434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485523
536	NC_008048	ATG	2	6	19496	19501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485523
537	NC_008048	CGA	2	6	19521	19526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
538	NC_008048	CGGCG	2	10	19570	19579	0 %	0 %	60 %	40 %	103485523
539	NC_008048	CGCCGG	2	12	19632	19643	0 %	0 %	50 %	50 %	103485523
540	NC_008048	CGA	2	6	19672	19677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
541	NC_008048	CAT	2	6	19678	19683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485523
542	NC_008048	CGA	2	6	19716	19721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
543	NC_008048	GCGT	2	8	19722	19729	0 %	25 %	50 %	25 %	103485523
544	NC_008048	GCG	2	6	19766	19771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
545	NC_008048	CCG	2	6	19829	19834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485523
546	NC_008048	CCT	2	6	19950	19955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103485523
547	NC_008048	GGC	2	6	19991	19996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
548	NC_008048	CGG	2	6	20031	20036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
549	NC_008048	GCG	2	6	20039	20044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
550	NC_008048	T	6	6	20058	20063	0 %	100 %	0 %	0 %	103485523
551	NC_008048	GCG	2	6	20066	20071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
552	NC_008048	AGC	2	6	20123	20128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
553	NC_008048	CGG	3	9	20148	20156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
554	NC_008048	GC	3	6	20188	20193	0 %	0 %	50 %	50 %	103485523
555	NC_008048	CGG	4	12	20202	20213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485523
556	NC_008048	CCG	2	6	20229	20234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485523
557	NC_008048	CG	3	6	20233	20238	0 %	0 %	50 %	50 %	103485523
558	NC_008048	TCG	2	6	20240	20245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485523
559	NC_008048	AGC	2	6	20252	20257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
560	NC_008048	GCCC	2	8	20284	20291	0 %	0 %	25 %	75 %	103485523
561	NC_008048	AGC	2	6	20297	20302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
562	NC_008048	CGTG	2	8	20370	20377	0 %	25 %	50 %	25 %	103485523
563	NC_008048	CGAA	2	8	20378	20385	50 %	0 %	25 %	25 %	103485523
564	NC_008048	CGA	2	6	20449	20454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485523
565	NC_008048	GGC	2	6	20729	20734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485524
566	NC_008048	CGT	2	6	20744	20749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
567	NC_008048	CG	3	6	20759	20764	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
568	NC_008048	CGG	2	6	20773	20778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485524
569	NC_008048	TGC	2	6	20827	20832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
570	NC_008048	CG	3	6	20834	20839	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
571	NC_008048	CGC	2	6	20855	20860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485524
572	NC_008048	CGG	2	6	20911	20916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485524
573	NC_008048	GCG	2	6	20935	20940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485524
574	NC_008048	TCG	2	6	20965	20970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
575	NC_008048	GCG	2	6	21014	21019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485524
576	NC_008048	AC	3	6	21031	21036	50 %	0 %	0 %	50 %	103485524
577	NC_008048	TAT	2	6	21114	21119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	103485524
578	NC_008048	CTG	2	6	21150	21155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
579	NC_008048	GCT	2	6	21173	21178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
580	NC_008048	CCG	2	6	21212	21217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485524
581	NC_008048	CG	3	6	21229	21234	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
582	NC_008048	GTT	2	6	21238	21243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485524
583	NC_008048	GCTG	2	8	21256	21263	0 %	25 %	50 %	25 %	103485524
584	NC_008048	CG	3	6	21291	21296	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
585	NC_008048	CAT	2	6	21303	21308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485524
586	NC_008048	GC	3	6	21311	21316	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
587	NC_008048	T	6	6	21332	21337	0 %	100 %	0 %	0 %	103485524
588	NC_008048	TCG	2	6	21457	21462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
589	NC_008048	TA	3	6	21486	21491	50 %	50 %	0 %	0 %	103485524
590	NC_008048	ATGGC	2	10	21538	21547	20 %	20 %	40 %	20 %	103485524
591	NC_008048	TGA	2	6	21586	21591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485524
592	NC_008048	GCG	2	6	21592	21597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485524
593	NC_008048	CTG	2	6	21660	21665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
594	NC_008048	G	6	6	21673	21678	0 %	0 %	100 %	0 %	103485524
595	NC_008048	GGTGCT	2	12	21680	21691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	103485524
596	NC_008048	CGA	2	6	21715	21720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485524
597	NC_008048	CAT	2	6	21761	21766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485524
598	NC_008048	TGG	2	6	21825	21830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485524
599	NC_008048	GC	3	6	21835	21840	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
600	NC_008048	CCTT	2	8	21844	21851	0 %	50 %	0 %	50 %	103485524
601	NC_008048	GGC	2	6	21861	21866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485524
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603	NC_008048	GC	3	6	21879	21884	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
604	NC_008048	TGC	2	6	21892	21897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485524
605	NC_008048	TTA	2	6	21917	21922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	103485524
606	NC_008048	GC	3	6	21926	21931	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
607	NC_008048	CAGGCG	2	12	21993	22004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	103485524
608	NC_008048	GC	3	6	22041	22046	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
609	NC_008048	CG	3	6	22070	22075	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
610	NC_008048	GC	3	6	22094	22099	0 %	0 %	50 %	50 %	103485524
611	NC_008048	CGCC	2	8	22223	22230	0 %	0 %	25 %	75 %	103485525
612	NC_008048	GTT	2	6	22272	22277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485525
613	NC_008048	GCC	2	6	22287	22292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485525
614	NC_008048	CGGT	2	8	22345	22352	0 %	25 %	50 %	25 %	103485525
615	NC_008048	GCCC	2	8	22370	22377	0 %	0 %	25 %	75 %	103485525
616	NC_008048	ATC	2	6	22381	22386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485525
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618	NC_008048	CGAC	2	8	22403	22410	25 %	0 %	25 %	50 %	103485525
619	NC_008048	GAA	2	6	22419	22424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103485525
620	NC_008048	TCGA	2	8	22546	22553	25 %	25 %	25 %	25 %	103485525
621	NC_008048	TCG	2	6	22639	22644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485525
622	NC_008048	CGC	2	6	22664	22669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485525
623	NC_008048	CG	3	6	22688	22693	0 %	0 %	50 %	50 %	103485525
624	NC_008048	GCC	2	6	22699	22704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485525
625	NC_008048	GCC	2	6	22770	22775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485525
626	NC_008048	ATA	2	6	22809	22814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	103485525
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628	NC_008048	TTC	2	6	22884	22889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485525
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