MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 F plasmid

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008036	CCG	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152872
2	NC_008036	GAA	2	6	391	396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	98152872
3	NC_008036	TTC	2	6	490	495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152872
4	NC_008036	GTG	2	6	526	531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98152872
5	NC_008036	AAG	2	6	584	589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	98152872
6	NC_008036	TCG	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152872
7	NC_008036	TTG	2	6	723	728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152872
8	NC_008036	CTG	2	6	856	861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152872
9	NC_008036	TTC	2	6	1142	1147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152873
10	NC_008036	GCG	2	6	1380	1385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152873
11	NC_008036	GCT	2	6	1436	1441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152873
12	NC_008036	TTG	2	6	1515	1520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152873
13	NC_008036	CCG	2	6	1702	1707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152873
14	NC_008036	TCC	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	98152873
15	NC_008036	CTT	2	6	1768	1773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152873
16	NC_008036	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152873
17	NC_008036	TGC	2	6	1868	1873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152874
18	NC_008036	GCA	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152874
19	NC_008036	CTG	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152874
20	NC_008036	GCT	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152874
21	NC_008036	CCT	2	6	2123	2128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	98152874
22	NC_008036	GCC	2	6	2165	2170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152874
23	NC_008036	GGC	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152874
24	NC_008036	GTA	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152874
25	NC_008036	TTC	2	6	2830	2835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152874
26	NC_008036	GAT	2	6	2865	2870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152874
27	NC_008036	CGC	2	6	2897	2902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152874
28	NC_008036	GAT	2	6	3006	3011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152874
29	NC_008036	CTG	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152874
30	NC_008036	CCG	2	6	3217	3222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152874
31	NC_008036	TGC	2	6	3246	3251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152874
32	NC_008036	GCT	2	6	3398	3403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152874
33	NC_008036	CGG	2	6	3479	3484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152874
34	NC_008036	CTT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152874
35	NC_008036	CAT	2	6	3698	3703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152874
36	NC_008036	ATC	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152874
37	NC_008036	GGC	2	6	3855	3860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152874
38	NC_008036	GGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152874
39	NC_008036	GGC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152874
40	NC_008036	GAT	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152874
41	NC_008036	CGA	2	6	4346	4351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152874
42	NC_008036	TGT	2	6	4385	4390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152874
43	NC_008036	TTC	2	6	4393	4398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152874
44	NC_008036	GCA	2	6	4523	4528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152874
45	NC_008036	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	98152874
46	NC_008036	GCC	2	6	4624	4629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152874
47	NC_008036	ACG	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152874
48	NC_008036	CGC	2	6	4931	4936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152875
49	NC_008036	GCT	2	6	5008	5013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152875
50	NC_008036	ACA	2	6	5025	5030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	98152875
51	NC_008036	CTT	2	6	5074	5079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152875
52	NC_008036	GCA	2	6	5116	5121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152875
53	NC_008036	GGC	2	6	5147	5152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152875
54	NC_008036	GCA	2	6	5169	5174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152876
55	NC_008036	ACG	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152876
56	NC_008036	GGC	2	6	5244	5249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152876
57	NC_008036	GAT	3	9	5283	5291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152876
58	NC_008036	CGC	2	6	5294	5299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152876
59	NC_008036	CGC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152876
60	NC_008036	GCG	2	6	5743	5748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152877
61	NC_008036	TGG	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98152877
62	NC_008036	CGA	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152877
63	NC_008036	GCA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152877
64	NC_008036	CAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	98152877
65	NC_008036	CGG	2	6	6423	6428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152877
66	NC_008036	GAT	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152877
67	NC_008036	TGG	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98152877
68	NC_008036	TCG	2	6	6594	6599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152877
69	NC_008036	CGC	2	6	6611	6616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152877
70	NC_008036	GCC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152877
71	NC_008036	CTG	2	6	6698	6703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152877
72	NC_008036	GCA	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152877
73	NC_008036	CGA	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152877
74	NC_008036	GCA	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152877
75	NC_008036	TCG	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152877
76	NC_008036	TTA	2	6	6829	6834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	98152877
77	NC_008036	TGC	2	6	6921	6926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152877
78	NC_008036	GCG	2	6	6981	6986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152877
79	NC_008036	TTG	2	6	7169	7174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152878
80	NC_008036	ACA	2	6	7340	7345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	98152878
81	NC_008036	CGA	2	6	7410	7415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152878
82	NC_008036	GCC	2	6	7444	7449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152878
83	NC_008036	TCA	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152878
84	NC_008036	CTT	2	6	7543	7548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152878
85	NC_008036	GGC	2	6	7689	7694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152878
86	NC_008036	CTG	2	6	7747	7752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152878
87	NC_008036	GCG	2	6	7811	7816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152878
88	NC_008036	CTG	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152878
89	NC_008036	GTT	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152878
90	NC_008036	GCG	2	6	8053	8058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152878
91	NC_008036	TAT	2	6	8113	8118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	98152878
92	NC_008036	GGA	2	6	8166	8171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	98152878
93	NC_008036	TTC	2	6	8191	8196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152878
94	NC_008036	AGT	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152878
95	NC_008036	TCA	2	6	8271	8276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152878
96	NC_008036	TGG	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98152878
97	NC_008036	GTT	2	6	8389	8394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152878
98	NC_008036	CAG	2	6	8410	8415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152878
99	NC_008036	GGC	2	6	8428	8433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152878
100	NC_008036	CAA	2	6	8553	8558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	98152878
101	NC_008036	ATG	2	6	8579	8584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152878
102	NC_008036	GGT	2	6	8591	8596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98152879
103	NC_008036	TGT	2	6	8654	8659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152879
104	NC_008036	TGT	2	6	9091	9096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152880
105	NC_008036	GAG	2	6	9147	9152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	98152880
106	NC_008036	ATG	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	98152880
107	NC_008036	TCA	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152880
108	NC_008036	GTC	2	6	9349	9354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152880
109	NC_008036	TGT	2	6	9398	9403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	98152880
110	NC_008036	GGC	2	6	9429	9434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152880
111	NC_008036	TCA	2	6	9544	9549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152880
112	NC_008036	CTT	2	6	9659	9664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152880
113	NC_008036	CTT	2	6	9881	9886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152880
114	NC_008036	GCC	2	6	9990	9995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152880
115	NC_008036	TCG	2	6	10033	10038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152880
116	NC_008036	TCG	2	6	10400	10405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152881
117	NC_008036	CAT	2	6	10429	10434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152881
118	NC_008036	GAA	2	6	10492	10497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	98152881
119	NC_008036	CCT	2	6	10529	10534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	98152881
120	NC_008036	GCC	2	6	10559	10564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152881
121	NC_008036	TTC	2	6	10605	10610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	98152881
122	NC_008036	CGG	2	6	10623	10628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152881
123	NC_008036	CCG	2	6	10689	10694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152881
124	NC_008036	GAC	2	6	10759	10764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152881
125	NC_008036	ACA	2	6	10913	10918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	98152881
126	NC_008036	CGA	2	6	10922	10927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152881
127	NC_008036	TCA	2	6	10949	10954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152881
128	NC_008036	GCA	2	6	11028	11033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152881
129	NC_008036	GCA	2	6	11223	11228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152881
130	NC_008036	GCG	2	6	11267	11272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152881
131	NC_008036	ACC	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	98152881
132	NC_008036	GAG	2	6	11548	11553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	98152881
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259	NC_008036	ATC	2	6	20075	20080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	98152892
260	NC_008036	TGG	2	6	20084	20089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	98152892
261	NC_008036	GCT	2	6	20166	20171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152892
262	NC_008036	CGA	2	6	20219	20224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152893
263	NC_008036	GTC	2	6	20310	20315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	98152893
264	NC_008036	GCG	2	6	20329	20334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152893
265	NC_008036	CCG	2	6	20379	20384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152893
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279	NC_008036	CGG	2	6	21651	21656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152894
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281	NC_008036	CGA	2	6	21727	21732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	98152894
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290	NC_008036	CGG	2	6	22330	22335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	98152894
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293	NC_008036	CGC	2	6	22471	22476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	98152895
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.