MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 33770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008023	TAT	2	6	36834	36839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991521
502	NC_008023	TTC	2	6	37031	37036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991521
503	NC_008023	GAT	2	6	37100	37105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991521
504	NC_008023	ATT	2	6	37122	37127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991521
505	NC_008023	AATC	2	8	37131	37138	50 %	25 %	0 %	25 %	94991521
506	NC_008023	ACTGAG	2	12	37151	37162	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94991521
507	NC_008023	GTC	2	6	37197	37202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991521
508	NC_008023	GAA	2	6	37225	37230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991521
509	NC_008023	AT	3	6	37285	37290	50 %	50 %	0 %	0 %	94991521
510	NC_008023	TGA	2	6	37300	37305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991521
511	NC_008023	GTC	2	6	37380	37385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991521
512	NC_008023	CTC	2	6	37469	37474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94991521
513	NC_008023	AC	3	6	37490	37495	50 %	0 %	0 %	50 %	94991521
514	NC_008023	GCG	2	6	37529	37534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94991521
515	NC_008023	GGT	2	6	37544	37549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991521
516	NC_008023	CAGGCG	2	12	37605	37616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	94991521
517	NC_008023	GCG	2	6	37682	37687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94991521
518	NC_008023	TTC	2	6	37696	37701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991521
519	NC_008023	TGGT	2	8	37791	37798	0 %	50 %	50 %	0 %	94991521
520	NC_008023	CTTG	2	8	37855	37862	0 %	50 %	25 %	25 %	94991521
521	NC_008023	CGG	2	6	37888	37893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94991521
522	NC_008023	CAG	2	6	37938	37943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991521
523	NC_008023	GGT	2	6	38051	38056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991521
524	NC_008023	GTT	2	6	38183	38188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991521
525	NC_008023	CAA	2	6	38224	38229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991521
526	NC_008023	ATG	2	6	38295	38300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991521
527	NC_008023	TTG	2	6	38307	38312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991521
528	NC_008023	GTT	2	6	38354	38359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991521
529	NC_008023	CAG	2	6	38412	38417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991521
530	NC_008023	ACC	2	6	38523	38528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94991521
531	NC_008023	GGT	2	6	38534	38539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991521
532	NC_008023	ACA	2	6	38600	38605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991521
533	NC_008023	TGC	2	6	38668	38673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991521
534	NC_008023	CTT	2	6	38807	38812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991521
535	NC_008023	GGT	2	6	38855	38860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991521
536	NC_008023	ACC	2	6	38899	38904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94991521
537	NC_008023	ACA	2	6	38927	38932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991521
538	NC_008023	TC	4	8	38950	38957	0 %	50 %	0 %	50 %	94991521
539	NC_008023	CTA	2	6	38986	38991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991521
540	NC_008023	AGA	2	6	39013	39018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991521
541	NC_008023	TCAG	2	8	39048	39055	25 %	25 %	25 %	25 %	94991521
542	NC_008023	GGT	2	6	39110	39115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991521
543	NC_008023	CAG	2	6	39187	39192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991521
544	NC_008023	AGC	2	6	39325	39330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991521
545	NC_008023	ACAG	2	8	39373	39380	50 %	0 %	25 %	25 %	94991521
546	NC_008023	GAA	2	6	39389	39394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991521
547	NC_008023	CTG	2	6	39399	39404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991521
548	NC_008023	ATC	2	6	39617	39622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991521
549	NC_008023	CAG	2	6	39642	39647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991521
550	NC_008023	ATC	2	6	39746	39751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991521
551	NC_008023	TCT	2	6	39790	39795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991521
552	NC_008023	CT	3	6	39837	39842	0 %	50 %	0 %	50 %	94991521
553	NC_008023	TTGG	2	8	39910	39917	0 %	50 %	50 %	0 %	94991521
554	NC_008023	TGT	2	6	39976	39981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991521
555	NC_008023	ATC	2	6	40130	40135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991521
556	NC_008023	GAA	2	6	40434	40439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991522
557	NC_008023	ACTT	2	8	40485	40492	25 %	50 %	0 %	25 %	94991522
558	NC_008023	AAG	2	6	40522	40527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991522
559	NC_008023	AATC	2	8	40605	40612	50 %	25 %	0 %	25 %	94991522
560	NC_008023	CCT	2	6	40810	40815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94991522
561	NC_008023	TCG	2	6	40844	40849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991522
562	NC_008023	AAG	2	6	40882	40887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991522
563	NC_008023	TGA	2	6	40924	40929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991522
564	NC_008023	TGC	2	6	40946	40951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991522
565	NC_008023	GGT	2	6	41039	41044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991522
566	NC_008023	TGA	2	6	41126	41131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991522
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569	NC_008023	GAA	2	6	41319	41324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991522
570	NC_008023	A	6	6	41354	41359	100 %	0 %	0 %	0 %	94991522
571	NC_008023	GTT	2	6	41463	41468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991522
572	NC_008023	TGAT	2	8	41470	41477	25 %	50 %	25 %	0 %	94991522
573	NC_008023	ATT	2	6	41519	41524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991522
574	NC_008023	AATT	2	8	41620	41627	50 %	50 %	0 %	0 %	94991522
575	NC_008023	GCT	2	6	41640	41645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991522
576	NC_008023	GT	3	6	41652	41657	0 %	50 %	50 %	0 %	94991522
577	NC_008023	ATT	2	6	41661	41666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991522
578	NC_008023	TC	3	6	41687	41692	0 %	50 %	0 %	50 %	94991522
579	NC_008023	TTGA	2	8	41703	41710	25 %	50 %	25 %	0 %	94991522
580	NC_008023	TGG	2	6	41741	41746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991522
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583	NC_008023	A	6	6	41827	41832	100 %	0 %	0 %	0 %	94991522
584	NC_008023	A	7	7	41896	41902	100 %	0 %	0 %	0 %	94991523
585	NC_008023	A	7	7	41960	41966	100 %	0 %	0 %	0 %	94991523
586	NC_008023	TGG	2	6	42017	42022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991523
587	NC_008023	AG	3	6	42051	42056	50 %	0 %	50 %	0 %	94991523
588	NC_008023	TGCT	2	8	42100	42107	0 %	50 %	25 %	25 %	94991523
589	NC_008023	TG	3	6	42154	42159	0 %	50 %	50 %	0 %	94991523
590	NC_008023	ATT	2	6	42168	42173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991523
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592	NC_008023	A	6	6	42221	42226	100 %	0 %	0 %	0 %	94991523
593	NC_008023	GAA	2	6	42243	42248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991523
594	NC_008023	GTT	2	6	42249	42254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991523
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597	NC_008023	AAGG	2	8	42411	42418	50 %	0 %	50 %	0 %	94991523
598	NC_008023	CGT	2	6	42477	42482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991523
599	NC_008023	GCT	2	6	42509	42514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991523
600	NC_008023	AAC	2	6	42532	42537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991523
601	NC_008023	CTT	2	6	42549	42554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991523
602	NC_008023	AGC	2	6	42578	42583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991523
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607	NC_008023	ATC	2	6	42873	42878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991523
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609	NC_008023	AGCAG	2	10	43129	43138	40 %	0 %	40 %	20 %	94991524
610	NC_008023	AGTT	2	8	43144	43151	25 %	50 %	25 %	0 %	94991524
611	NC_008023	ATC	2	6	43164	43169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991524
612	NC_008023	GGC	2	6	43249	43254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94991524
613	NC_008023	TTG	2	6	43277	43282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991524
614	NC_008023	GATT	2	8	43294	43301	25 %	50 %	25 %	0 %	94991524
615	NC_008023	GTCT	2	8	43304	43311	0 %	50 %	25 %	25 %	94991524
616	NC_008023	TTG	2	6	43329	43334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991524
617	NC_008023	TAT	2	6	43366	43371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991524
618	NC_008023	CCTG	2	8	43390	43397	0 %	25 %	25 %	50 %	94991524
619	NC_008023	GGTCA	2	10	43493	43502	20 %	20 %	40 %	20 %	94991524
620	NC_008023	CAA	2	6	43505	43510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991524
621	NC_008023	TTG	2	6	43860	43865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991525
622	NC_008023	TTGGG	2	10	43889	43898	0 %	40 %	60 %	0 %	94991525
623	NC_008023	TGG	2	6	43912	43917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991525
624	NC_008023	CGA	2	6	43963	43968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991525
625	NC_008023	GAT	2	6	43987	43992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991525
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