MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS2096 chromosome

Total Repeats: 33770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008023	GAT	2	6	320299	320304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991819
5502	NC_008023	TTATC	2	10	320347	320356	20 %	60 %	0 %	20 %	94991820
5503	NC_008023	AC	3	6	320385	320390	50 %	0 %	0 %	50 %	94991820
5504	NC_008023	A	6	6	320462	320467	100 %	0 %	0 %	0 %	94991820
5505	NC_008023	ATG	2	6	320498	320503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991820
5506	NC_008023	TAGA	2	8	320652	320659	50 %	25 %	25 %	0 %	94991820
5507	NC_008023	ATT	2	6	320678	320683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991820
5508	NC_008023	GAT	2	6	320735	320740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991820
5509	NC_008023	A	7	7	320752	320758	100 %	0 %	0 %	0 %	94991820
5510	NC_008023	TGGT	2	8	320852	320859	0 %	50 %	50 %	0 %	94991821
5511	NC_008023	TCAA	2	8	320867	320874	50 %	25 %	0 %	25 %	94991821
5512	NC_008023	ATAGC	2	10	320897	320906	40 %	20 %	20 %	20 %	94991821
5513	NC_008023	A	7	7	320925	320931	100 %	0 %	0 %	0 %	94991821
5514	NC_008023	AGC	2	6	321038	321043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991821
5515	NC_008023	GCT	2	6	321046	321051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991821
5516	NC_008023	ATT	2	6	321052	321057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991821
5517	NC_008023	A	6	6	321077	321082	100 %	0 %	0 %	0 %	94991821
5518	NC_008023	TG	3	6	321090	321095	0 %	50 %	50 %	0 %	94991821
5519	NC_008023	TTA	2	6	321112	321117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991821
5520	NC_008023	A	6	6	321208	321213	100 %	0 %	0 %	0 %	94991821
5521	NC_008023	T	6	6	321252	321257	0 %	100 %	0 %	0 %	94991821
5522	NC_008023	AAC	3	9	321260	321268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991821
5523	NC_008023	AAG	2	6	321278	321283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991821
5524	NC_008023	T	6	6	321328	321333	0 %	100 %	0 %	0 %	94991821
5525	NC_008023	ATTT	2	8	321402	321409	25 %	75 %	0 %	0 %	94991821
5526	NC_008023	GAAA	2	8	321411	321418	75 %	0 %	25 %	0 %	94991821
5527	NC_008023	ATA	2	6	321436	321441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991821
5528	NC_008023	TAC	2	6	321490	321495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991821
5529	NC_008023	TTG	2	6	321595	321600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991822
5530	NC_008023	GGT	2	6	321725	321730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991822
5531	NC_008023	GAA	3	9	321741	321749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991822
5532	NC_008023	GAA	2	6	321780	321785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991822
5533	NC_008023	AATT	2	8	321868	321875	50 %	50 %	0 %	0 %	94991822
5534	NC_008023	AAG	2	6	321895	321900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991822
5535	NC_008023	ACCA	2	8	321969	321976	50 %	0 %	0 %	50 %	94991822
5536	NC_008023	TGA	2	6	321992	321997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991822
5537	NC_008023	ATG	2	6	322014	322019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991822
5538	NC_008023	TTA	2	6	322054	322059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991822
5539	NC_008023	AGC	2	6	322159	322164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991822
5540	NC_008023	TAC	2	6	322186	322191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991822
5541	NC_008023	GAA	2	6	322199	322204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991822
5542	NC_008023	GCT	2	6	322231	322236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991823
5543	NC_008023	TTG	2	6	322239	322244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991823
5544	NC_008023	GAA	2	6	322250	322255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991823
5545	NC_008023	CT	3	6	322328	322333	0 %	50 %	0 %	50 %	94991823
5546	NC_008023	AAG	2	6	322407	322412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991823
5547	NC_008023	TTG	2	6	322494	322499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991823
5548	NC_008023	ACAA	2	8	322503	322510	75 %	0 %	0 %	25 %	94991823
5549	NC_008023	TGA	2	6	322531	322536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991823
5550	NC_008023	ATT	2	6	322573	322578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991823
5551	NC_008023	A	6	6	322607	322612	100 %	0 %	0 %	0 %	94991823
5552	NC_008023	ACA	2	6	322643	322648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991823
5553	NC_008023	ATT	2	6	322650	322655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991823
5554	NC_008023	ATTG	2	8	322690	322697	25 %	50 %	25 %	0 %	94991823
5555	NC_008023	CAG	2	6	322716	322721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991823
5556	NC_008023	TTA	2	6	322974	322979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991824
5557	NC_008023	GAAG	2	8	323024	323031	50 %	0 %	50 %	0 %	94991824
5558	NC_008023	TAA	2	6	323068	323073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991824
5559	NC_008023	GT	3	6	323094	323099	0 %	50 %	50 %	0 %	94991824
5560	NC_008023	TAC	2	6	323133	323138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94991824
5561	NC_008023	GATTG	2	10	323172	323181	20 %	40 %	40 %	0 %	94991824
5562	NC_008023	ATG	2	6	323211	323216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991824
5563	NC_008023	GAAAT	2	10	323247	323256	60 %	20 %	20 %	0 %	94991824
5564	NC_008023	GAAA	2	8	323296	323303	75 %	0 %	25 %	0 %	94991824
5565	NC_008023	ATCG	2	8	323394	323401	25 %	25 %	25 %	25 %	94991824
5566	NC_008023	A	7	7	323444	323450	100 %	0 %	0 %	0 %	94991824
5567	NC_008023	TAAA	2	8	323547	323554	75 %	25 %	0 %	0 %	94991824
5568	NC_008023	A	6	6	323552	323557	100 %	0 %	0 %	0 %	94991824
5569	NC_008023	A	6	6	323591	323596	100 %	0 %	0 %	0 %	94991824
5570	NC_008023	TGA	2	6	323597	323602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991824
5571	NC_008023	A	6	6	323602	323607	100 %	0 %	0 %	0 %	94991825
5572	NC_008023	TCC	2	6	323658	323663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94991825
5573	NC_008023	TGG	2	6	323781	323786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991825
5574	NC_008023	AGA	2	6	323802	323807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991825
5575	NC_008023	T	6	6	324007	324012	0 %	100 %	0 %	0 %	94991826
5576	NC_008023	GAC	2	6	324039	324044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991826
5577	NC_008023	CAA	2	6	324057	324062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991826
5578	NC_008023	A	6	6	324075	324080	100 %	0 %	0 %	0 %	94991826
5579	NC_008023	TGC	2	6	324150	324155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991826
5580	NC_008023	ATT	2	6	324175	324180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991826
5581	NC_008023	TGA	2	6	324201	324206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991826
5582	NC_008023	ATCA	2	8	324283	324290	50 %	25 %	0 %	25 %	94991826
5583	NC_008023	TAA	2	6	324330	324335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991826
5584	NC_008023	ATT	2	6	324371	324376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991826
5585	NC_008023	AGA	2	6	324408	324413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991826
5586	NC_008023	ATGA	2	8	324454	324461	50 %	25 %	25 %	0 %	94991826
5587	NC_008023	ACA	2	6	324525	324530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94991826
5588	NC_008023	AAT	2	6	324581	324586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991826
5589	NC_008023	ATGATT	2	12	324915	324926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	94991827
5590	NC_008023	ATT	2	6	324975	324980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991827
5591	NC_008023	T	6	6	324992	324997	0 %	100 %	0 %	0 %	94991827
5592	NC_008023	TAT	2	6	325013	325018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991827
5593	NC_008023	TATCGC	2	12	325148	325159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94991827
5594	NC_008023	A	6	6	325198	325203	100 %	0 %	0 %	0 %	94991827
5595	NC_008023	TTA	2	6	325245	325250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991827
5596	NC_008023	GTT	2	6	325263	325268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991827
5597	NC_008023	ATG	2	6	325350	325355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991827
5598	NC_008023	TTG	2	6	325378	325383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991827
5599	NC_008023	ATG	2	6	325462	325467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991828
5600	NC_008023	ACAA	3	12	325468	325479	75 %	0 %	0 %	25 %	94991828
5601	NC_008023	CTT	2	6	325496	325501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991828
5602	NC_008023	T	6	6	325543	325548	0 %	100 %	0 %	0 %	94991828
5603	NC_008023	ATA	2	6	325571	325576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94991828
5604	NC_008023	GTTA	2	8	325671	325678	25 %	50 %	25 %	0 %	94991828
5605	NC_008023	TTATC	2	10	325730	325739	20 %	60 %	0 %	20 %	94991828
5606	NC_008023	GCA	2	6	325753	325758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94991828
5607	NC_008023	AAGACC	2	12	325791	325802	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	94991828
5608	NC_008023	TGG	2	6	325827	325832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94991828
5609	NC_008023	ATT	2	6	325891	325896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991828
5610	NC_008023	TTTA	2	8	326053	326060	25 %	75 %	0 %	0 %	94991828
5611	NC_008023	A	7	7	326411	326417	100 %	0 %	0 %	0 %	94991829
5612	NC_008023	GGA	2	6	326528	326533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94991829
5613	NC_008023	GTT	2	6	326744	326749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991829
5614	NC_008023	GAT	2	6	326786	326791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991829
5615	NC_008023	CTTA	2	8	326799	326806	25 %	50 %	0 %	25 %	94991829
5616	NC_008023	GCAT	2	8	326823	326830	25 %	25 %	25 %	25 %	94991829
5617	NC_008023	GAA	2	6	326864	326869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94991829
5618	NC_008023	CATGA	2	10	326993	327002	40 %	20 %	20 %	20 %	94991829
5619	NC_008023	TGC	2	6	327063	327068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94991829
5620	NC_008023	TGA	2	6	327072	327077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991829
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5622	NC_008023	ATT	2	6	327149	327154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94991829
5623	NC_008023	TC	3	6	327387	327392	0 %	50 %	0 %	50 %	94991830
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5625	NC_008023	GTT	2	6	327433	327438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991830
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5997	NC_008023	CTT	2	6	347595	347600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94991854
5998	NC_008023	TGA	2	6	347601	347606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94991854
5999	NC_008023	GTT	2	6	347621	347626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94991854
6000	NC_008023	GACT	2	8	347661	347668	25 %	25 %	25 %	25 %	94991854

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