MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10270 chromosome

Total Repeats: 1235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008022	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	94989511
2	NC_008022	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	94989512
3	NC_008022	TGGTA	2	10	3571	3580	20 %	40 %	40 %	0 %	94989513
4	NC_008022	GATTT	2	10	6137	6146	20 %	60 %	20 %	0 %	94989515
5	NC_008022	TCAAT	2	10	11645	11654	40 %	40 %	0 %	20 %	94989520
6	NC_008022	ATTAA	2	10	11966	11975	60 %	40 %	0 %	0 %	94989520
7	NC_008022	TACAC	2	10	15915	15924	40 %	20 %	0 %	40 %	94989523
8	NC_008022	TAAAT	2	10	15925	15934	60 %	40 %	0 %	0 %	94989523
9	NC_008022	AGTGA	2	10	33229	33238	40 %	20 %	40 %	0 %	94989527
10	NC_008022	ATTTT	2	10	33928	33937	20 %	80 %	0 %	0 %	94989528
11	NC_008022	TTGAT	2	10	34117	34126	20 %	60 %	20 %	0 %	94989528
12	NC_008022	TGGTG	2	10	36201	36210	0 %	40 %	60 %	0 %	94989531
13	NC_008022	AGCAG	2	10	43522	43531	40 %	0 %	40 %	20 %	94989536
14	NC_008022	GGTCA	2	10	43886	43895	20 %	20 %	40 %	20 %	94989536
15	NC_008022	TTGGG	2	10	44282	44291	0 %	40 %	60 %	0 %	94989537
16	NC_008022	GCAGG	2	10	48362	48371	20 %	0 %	60 %	20 %	94989539
17	NC_008022	CTGCC	2	10	49327	49336	0 %	20 %	20 %	60 %	94989541
18	NC_008022	CTCAG	2	10	49720	49729	20 %	20 %	20 %	40 %	94989541
19	NC_008022	TTTAT	2	10	50306	50315	20 %	80 %	0 %	0 %	94989542
20	NC_008022	ATAGA	2	10	51404	51413	60 %	20 %	20 %	0 %	94989542
21	NC_008022	TGTAT	2	10	54200	54209	20 %	60 %	20 %	0 %	94989544
22	NC_008022	TATTT	2	10	54279	54288	20 %	80 %	0 %	0 %	94989544
23	NC_008022	TCGGA	2	10	54628	54637	20 %	20 %	40 %	20 %	94989546
24	NC_008022	GCTTT	2	10	57374	57383	0 %	60 %	20 %	20 %	94989549
25	NC_008022	TTTTC	2	10	57572	57581	0 %	80 %	0 %	20 %	94989549
26	NC_008022	AAACC	2	10	57637	57646	60 %	0 %	0 %	40 %	94989549
27	NC_008022	ATTCA	2	10	60095	60104	40 %	40 %	0 %	20 %	94989551
28	NC_008022	TTTTA	2	10	63866	63875	20 %	80 %	0 %	0 %	94989553
29	NC_008022	AAAGC	2	10	64059	64068	60 %	0 %	20 %	20 %	94989553
30	NC_008022	TTTGG	2	10	68053	68062	0 %	60 %	40 %	0 %	94989560
31	NC_008022	TTCAC	2	10	68409	68418	20 %	40 %	0 %	40 %	94989561
32	NC_008022	GAAAT	2	10	69490	69499	60 %	20 %	20 %	0 %	94989563
33	NC_008022	TCCAA	2	10	75190	75199	40 %	20 %	0 %	40 %	94989575
34	NC_008022	CTTGG	2	10	89399	89408	0 %	40 %	40 %	20 %	94989590
35	NC_008022	TCTTA	2	10	89817	89826	20 %	60 %	0 %	20 %	94989590
36	NC_008022	CACTC	2	10	91361	91370	20 %	20 %	0 %	60 %	94989592
37	NC_008022	GATTG	2	10	93622	93631	20 %	40 %	40 %	0 %	94989593
38	NC_008022	TTGAT	2	10	103781	103790	20 %	60 %	20 %	0 %	94989598
39	NC_008022	AAATC	2	10	103949	103958	60 %	20 %	0 %	20 %	94989598
40	NC_008022	TGAAG	2	10	109265	109274	40 %	20 %	40 %	0 %	94989607
41	NC_008022	TTTAG	2	10	111124	111133	20 %	60 %	20 %	0 %	94989610
42	NC_008022	TAGGT	2	10	116259	116268	20 %	40 %	40 %	0 %	94989617
43	NC_008022	TAAAT	2	10	116392	116401	60 %	40 %	0 %	0 %	94989617
44	NC_008022	TTTCT	2	10	119307	119316	0 %	80 %	0 %	20 %	94989619
45	NC_008022	ATGGT	2	10	119826	119835	20 %	40 %	40 %	0 %	94989619
46	NC_008022	TAGCA	2	10	120428	120437	40 %	20 %	20 %	20 %	94989620
47	NC_008022	ATCAA	2	10	120799	120808	60 %	20 %	0 %	20 %	94989620
48	NC_008022	ATCAC	2	10	120859	120868	40 %	20 %	0 %	40 %	94989620
49	NC_008022	CGGCT	2	10	121562	121571	0 %	20 %	40 %	40 %	94989621
50	NC_008022	TTACT	2	10	122035	122044	20 %	60 %	0 %	20 %	94989622
51	NC_008022	ATTGA	2	10	122604	122613	40 %	40 %	20 %	0 %	94989622
52	NC_008022	TACAA	2	10	124062	124071	60 %	20 %	0 %	20 %	94989622
53	NC_008022	AAATC	2	10	124499	124508	60 %	20 %	0 %	20 %	94989622
54	NC_008022	GGTAA	2	10	129395	129404	40 %	20 %	40 %	0 %	94989626
55	NC_008022	TTTTA	2	10	132672	132681	20 %	80 %	0 %	0 %	94989628
56	NC_008022	GCTTT	3	15	133248	133262	0 %	60 %	20 %	20 %	94989628
57	NC_008022	GTCAT	2	10	133567	133576	20 %	40 %	20 %	20 %	94989628
58	NC_008022	TAGTG	2	10	134514	134523	20 %	40 %	40 %	0 %	94989629
59	NC_008022	GTTAA	2	10	134917	134926	40 %	40 %	20 %	0 %	94989629
60	NC_008022	AATAA	2	10	134946	134955	80 %	20 %	0 %	0 %	94989629
61	NC_008022	TTGAT	2	10	136033	136042	20 %	60 %	20 %	0 %	94989630
62	NC_008022	TTGAC	2	10	137255	137264	20 %	40 %	20 %	20 %	94989632
63	NC_008022	TACCT	2	10	137436	137445	20 %	40 %	0 %	40 %	94989632
64	NC_008022	AATCA	2	10	138215	138224	60 %	20 %	0 %	20 %	94989633
65	NC_008022	TCATG	2	10	138822	138831	20 %	40 %	20 %	20 %	94989634
66	NC_008022	AACAA	2	10	139968	139977	80 %	0 %	0 %	20 %	94989635
67	NC_008022	CAAAA	2	10	141185	141194	80 %	0 %	0 %	20 %	94989637
68	NC_008022	GTCTT	2	10	141396	141405	0 %	60 %	20 %	20 %	94989637
69	NC_008022	TTTTA	2	10	142258	142267	20 %	80 %	0 %	0 %	94989637
70	NC_008022	AAAGC	2	10	143447	143456	60 %	0 %	20 %	20 %	94989639
71	NC_008022	AGTTC	2	10	143697	143706	20 %	40 %	20 %	20 %	94989639
72	NC_008022	GCTGA	2	10	143717	143726	20 %	20 %	40 %	20 %	94989639
73	NC_008022	ATCGC	2	10	147091	147100	20 %	20 %	20 %	40 %	94989642
74	NC_008022	TTGGG	2	10	148494	148503	0 %	40 %	60 %	0 %	94989643
75	NC_008022	GTACG	2	10	152885	152894	20 %	20 %	40 %	20 %	94989647
76	NC_008022	GAAAA	2	10	153804	153813	80 %	0 %	20 %	0 %	94989648
77	NC_008022	GGATT	2	10	153921	153930	20 %	40 %	40 %	0 %	94989648
78	NC_008022	TTTTG	2	10	154441	154450	0 %	80 %	20 %	0 %	94989648
79	NC_008022	TCATG	2	10	155949	155958	20 %	40 %	20 %	20 %	94989650
80	NC_008022	GTATC	2	10	157210	157219	20 %	40 %	20 %	20 %	94989651
81	NC_008022	GTCGC	2	10	157649	157658	0 %	20 %	40 %	40 %	94989652
82	NC_008022	CTTGT	2	10	162985	162994	0 %	60 %	20 %	20 %	94989657
83	NC_008022	GCCTA	2	10	163702	163711	20 %	20 %	20 %	40 %	94989658
84	NC_008022	GCAAC	2	10	163919	163928	40 %	0 %	20 %	40 %	94989658
85	NC_008022	AAGGT	2	10	165601	165610	40 %	20 %	40 %	0 %	94989658
86	NC_008022	ATTTG	2	10	171885	171894	20 %	60 %	20 %	0 %	94989666
87	NC_008022	CAAGA	2	10	173807	173816	60 %	0 %	20 %	20 %	94989667
88	NC_008022	GTTTG	2	10	174975	174984	0 %	60 %	40 %	0 %	94989668
89	NC_008022	TGGAT	2	10	175925	175934	20 %	40 %	40 %	0 %	94989669
90	NC_008022	TTGCC	2	10	176300	176309	0 %	40 %	20 %	40 %	94989669
91	NC_008022	ATTTT	2	10	181861	181870	20 %	80 %	0 %	0 %	94989673
92	NC_008022	GTTTG	2	10	183389	183398	0 %	60 %	40 %	0 %	94989674
93	NC_008022	TGAAA	2	10	183564	183573	60 %	20 %	20 %	0 %	94989675
94	NC_008022	TTGAT	2	10	183812	183821	20 %	60 %	20 %	0 %	94989675
95	NC_008022	CCAAA	2	10	186159	186168	60 %	0 %	0 %	40 %	94989681
96	NC_008022	TCCCA	2	10	186361	186370	20 %	20 %	0 %	60 %	94989681
97	NC_008022	AGCCA	2	10	187207	187216	40 %	0 %	20 %	40 %	94989682
98	NC_008022	GGAAA	2	10	190158	190167	60 %	0 %	40 %	0 %	94989685
99	NC_008022	TAATC	2	10	192984	192993	40 %	40 %	0 %	20 %	94989689
100	NC_008022	TTTAC	2	10	197116	197125	20 %	60 %	0 %	20 %	94989694
101	NC_008022	CAAAC	2	10	199635	199644	60 %	0 %	0 %	40 %	94989697
102	NC_008022	AGATA	2	10	199749	199758	60 %	20 %	20 %	0 %	94989697
103	NC_008022	ATATA	2	10	200538	200547	60 %	40 %	0 %	0 %	94989697
104	NC_008022	AGTAT	2	10	202275	202284	40 %	40 %	20 %	0 %	94989700
105	NC_008022	GTTTT	2	10	202495	202504	0 %	80 %	20 %	0 %	94989701
106	NC_008022	TTTTG	2	10	204425	204434	0 %	80 %	20 %	0 %	94989702
107	NC_008022	ATCGC	2	10	205743	205752	20 %	20 %	20 %	40 %	94989704
108	NC_008022	TTTTA	2	10	206911	206920	20 %	80 %	0 %	0 %	94989705
109	NC_008022	CTAAT	2	10	207149	207158	40 %	40 %	0 %	20 %	94989705
110	NC_008022	GAATG	2	10	207672	207681	40 %	20 %	40 %	0 %	94989705
111	NC_008022	CCTTC	2	10	212099	212108	0 %	40 %	0 %	60 %	94989709
112	NC_008022	TAAGA	2	10	212144	212153	60 %	20 %	20 %	0 %	94989709
113	NC_008022	TGGAT	2	10	214233	214242	20 %	40 %	40 %	0 %	94989711
114	NC_008022	CTTTT	2	10	214403	214412	0 %	80 %	0 %	20 %	94989711
115	NC_008022	GAGAA	2	10	215774	215783	60 %	0 %	40 %	0 %	94989713
116	NC_008022	GTTAT	2	10	216799	216808	20 %	60 %	20 %	0 %	94989714
117	NC_008022	AAGAT	2	10	216885	216894	60 %	20 %	20 %	0 %	94989714
118	NC_008022	AAATG	2	10	218433	218442	60 %	20 %	20 %	0 %	94989715
119	NC_008022	CAAAT	2	10	219578	219587	60 %	20 %	0 %	20 %	94989717
120	NC_008022	CCTTT	2	10	223945	223954	0 %	60 %	0 %	40 %	94989722
121	NC_008022	CTCAT	2	10	224023	224032	20 %	40 %	0 %	40 %	94989723
122	NC_008022	TTTTC	2	10	224243	224252	0 %	80 %	0 %	20 %	94989723
123	NC_008022	TTATT	2	10	224483	224492	20 %	80 %	0 %	0 %	94989723
124	NC_008022	TTGTC	2	10	225983	225992	0 %	60 %	20 %	20 %	94989725
125	NC_008022	GCAGC	2	10	230239	230248	20 %	0 %	40 %	40 %	94989729
126	NC_008022	ATTCC	2	10	231544	231553	20 %	40 %	0 %	40 %	94989731
127	NC_008022	TGCTT	2	10	235564	235573	0 %	60 %	20 %	20 %	94989735
128	NC_008022	AATCA	2	10	236085	236094	60 %	20 %	0 %	20 %	94989736
129	NC_008022	AAAAC	2	10	238111	238120	80 %	0 %	0 %	20 %	94989738
130	NC_008022	GAAAC	2	10	240205	240214	60 %	0 %	20 %	20 %	94989738
131	NC_008022	CCAAT	2	10	242460	242469	40 %	20 %	0 %	40 %	94989741
132	NC_008022	CAAGA	2	10	243234	243243	60 %	0 %	20 %	20 %	94989741
133	NC_008022	TTTGG	2	10	246220	246229	0 %	60 %	40 %	0 %	94989744
134	NC_008022	TTTTA	2	10	250724	250733	20 %	80 %	0 %	0 %	94989747
135	NC_008022	TGGTT	2	10	252662	252671	0 %	60 %	40 %	0 %	94989749
136	NC_008022	TTTGC	2	10	253927	253936	0 %	60 %	20 %	20 %	94989751
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