MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 33598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_008021	CTA	2	6	1830413	1830418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989503
33502	NC_008021	TAA	2	6	1830434	1830439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989503
33503	NC_008021	AT	3	6	1830465	1830470	50 %	50 %	0 %	0 %	94989503
33504	NC_008021	AAC	2	6	1830492	1830497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989503
33505	NC_008021	A	6	6	1830515	1830520	100 %	0 %	0 %	0 %	94989503
33506	NC_008021	T	7	7	1830530	1830536	0 %	100 %	0 %	0 %	94989503
33507	NC_008021	ATT	2	6	1830586	1830591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989503
33508	NC_008021	TAT	3	9	1830704	1830712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989503
33509	NC_008021	AAAT	2	8	1830758	1830765	75 %	25 %	0 %	0 %	94989503
33510	NC_008021	TAC	2	6	1830797	1830802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989503
33511	NC_008021	TAG	2	6	1830821	1830826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989503
33512	NC_008021	AACCA	2	10	1830891	1830900	60 %	0 %	0 %	40 %	94989503
33513	NC_008021	CAGC	2	8	1830948	1830955	25 %	0 %	25 %	50 %	94989503
33514	NC_008021	ATATT	2	10	1831087	1831096	40 %	60 %	0 %	0 %	94989503
33515	NC_008021	CAGA	2	8	1831128	1831135	50 %	0 %	25 %	25 %	94989503
33516	NC_008021	AT	3	6	1831149	1831154	50 %	50 %	0 %	0 %	94989503
33517	NC_008021	T	7	7	1831175	1831181	0 %	100 %	0 %	0 %	94989503
33518	NC_008021	GTTT	2	8	1831223	1831230	0 %	75 %	25 %	0 %	94989503
33519	NC_008021	A	6	6	1831235	1831240	100 %	0 %	0 %	0 %	94989503
33520	NC_008021	A	7	7	1831321	1831327	100 %	0 %	0 %	0 %	94989503
33521	NC_008021	A	6	6	1831458	1831463	100 %	0 %	0 %	0 %	94989503
33522	NC_008021	AGG	2	6	1831469	1831474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94989503
33523	NC_008021	AAAGG	2	10	1831497	1831506	60 %	0 %	40 %	0 %	94989503
33524	NC_008021	TCT	2	6	1832790	1832795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989504
33525	NC_008021	AATC	2	8	1832871	1832878	50 %	25 %	0 %	25 %	94989504
33526	NC_008021	AT	3	6	1832909	1832914	50 %	50 %	0 %	0 %	94989504
33527	NC_008021	TTC	2	6	1832923	1832928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989504
33528	NC_008021	TCT	2	6	1832946	1832951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989504
33529	NC_008021	GAA	2	6	1833056	1833061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989504
33530	NC_008021	GTTT	2	8	1833063	1833070	0 %	75 %	25 %	0 %	94989504
33531	NC_008021	GAC	2	6	1833136	1833141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989505
33532	NC_008021	TTTC	2	8	1833167	1833174	0 %	75 %	0 %	25 %	94989505
33533	NC_008021	AGC	2	6	1833188	1833193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989505
33534	NC_008021	GAT	2	6	1833231	1833236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989505
33535	NC_008021	CT	3	6	1833652	1833657	0 %	50 %	0 %	50 %	94989506
33536	NC_008021	TGA	2	6	1833733	1833738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989506
33537	NC_008021	T	7	7	1833779	1833785	0 %	100 %	0 %	0 %	94989506
33538	NC_008021	AAT	2	6	1833786	1833791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989506
33539	NC_008021	AAT	2	6	1833816	1833821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989506
33540	NC_008021	T	7	7	1833938	1833944	0 %	100 %	0 %	0 %	94989506
33541	NC_008021	CTT	2	6	1833959	1833964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989506
33542	NC_008021	TCA	2	6	1834015	1834020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989506
33543	NC_008021	T	6	6	1834061	1834066	0 %	100 %	0 %	0 %	94989506
33544	NC_008021	TCTT	2	8	1834095	1834102	0 %	75 %	0 %	25 %	94989506
33545	NC_008021	AGG	2	6	1834404	1834409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94989507
33546	NC_008021	ATT	2	6	1834420	1834425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989507
33547	NC_008021	AAT	2	6	1834432	1834437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989507
33548	NC_008021	AAAT	2	8	1834460	1834467	75 %	25 %	0 %	0 %	94989507
33549	NC_008021	CAA	2	6	1834478	1834483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989507
33550	NC_008021	AAC	2	6	1834501	1834506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989507
33551	NC_008021	TAC	2	6	1834515	1834520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989507
33552	NC_008021	TTA	2	6	1834559	1834564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989507
33553	NC_008021	CTT	2	6	1834580	1834585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989507
33554	NC_008021	GTT	2	6	1834714	1834719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989507
33555	NC_008021	TAA	2	6	1834722	1834727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94989507
33556	NC_008021	GTT	2	6	1834783	1834788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989507
33557	NC_008021	TGT	2	6	1834827	1834832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94989507
33558	NC_008021	AGATA	2	10	1834845	1834854	60 %	20 %	20 %	0 %	94989507
33559	NC_008021	TTGCTA	2	12	1834904	1834915	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94989507
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33561	NC_008021	CAA	2	6	1835021	1835026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989507
33562	NC_008021	CAGA	2	8	1835035	1835042	50 %	0 %	25 %	25 %	94989507
33563	NC_008021	TGC	2	6	1835043	1835048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94989507
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33566	NC_008021	AATT	2	8	1835106	1835113	50 %	50 %	0 %	0 %	94989507
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33569	NC_008021	TTA	2	6	1835201	1835206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989507
33570	NC_008021	ATT	2	6	1835209	1835214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989507
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33573	NC_008021	GTA	2	6	1835341	1835346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989507
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33579	NC_008021	TAT	2	6	1835794	1835799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94989508
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33581	NC_008021	ACG	2	6	1835845	1835850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94989508
33582	NC_008021	A	7	7	1835878	1835884	100 %	0 %	0 %	0 %	94989508
33583	NC_008021	ATC	2	6	1835894	1835899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94989508
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33587	NC_008021	A	8	8	1836006	1836013	100 %	0 %	0 %	0 %	94989508
33588	NC_008021	AT	3	6	1836040	1836045	50 %	50 %	0 %	0 %	94989508
33589	NC_008021	GAA	2	6	1836119	1836124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94989508
33590	NC_008021	CG	3	6	1836145	1836150	0 %	0 %	50 %	50 %	94989508
33591	NC_008021	TGA	2	6	1836169	1836174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94989508
33592	NC_008021	CAA	2	6	1836179	1836184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94989508
33593	NC_008021	CTCA	2	8	1836191	1836198	25 %	25 %	0 %	50 %	94989508
33594	NC_008021	A	7	7	1836275	1836281	100 %	0 %	0 %	0 %	94989508
33595	NC_008021	CTT	2	6	1836300	1836305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94989508
33596	NC_008021	CT	3	6	1836335	1836340	0 %	50 %	0 %	50 %	94989508
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.