MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS9429 chromosome

Total Repeats: 33598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008021	CTT	2	6	36764	36769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987654
502	NC_008021	AAG	2	6	36820	36825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987654
503	NC_008021	TAT	2	6	36832	36837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987654
504	NC_008021	TTC	2	6	37029	37034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987654
505	NC_008021	GAT	2	6	37098	37103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987654
506	NC_008021	ATT	2	6	37120	37125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987654
507	NC_008021	AATC	2	8	37129	37136	50 %	25 %	0 %	25 %	94987654
508	NC_008021	ACTGAG	2	12	37149	37160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94987654
509	NC_008021	GTC	2	6	37195	37200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987654
510	NC_008021	GAA	2	6	37223	37228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987654
511	NC_008021	AT	3	6	37283	37288	50 %	50 %	0 %	0 %	94987654
512	NC_008021	TGA	2	6	37298	37303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987654
513	NC_008021	GTC	2	6	37378	37383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987654
514	NC_008021	CTC	2	6	37467	37472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987654
515	NC_008021	AC	3	6	37488	37493	50 %	0 %	0 %	50 %	94987654
516	NC_008021	GCG	2	6	37527	37532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94987654
517	NC_008021	GGT	2	6	37542	37547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987654
518	NC_008021	CAGGCG	2	12	37603	37614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	94987654
519	NC_008021	GCG	2	6	37680	37685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94987654
520	NC_008021	TTC	2	6	37694	37699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987654
521	NC_008021	TGGT	2	8	37789	37796	0 %	50 %	50 %	0 %	94987654
522	NC_008021	CTTG	2	8	37853	37860	0 %	50 %	25 %	25 %	94987654
523	NC_008021	CGG	2	6	37886	37891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94987654
524	NC_008021	CAG	2	6	37936	37941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987654
525	NC_008021	GGT	2	6	38049	38054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987654
526	NC_008021	GTT	2	6	38181	38186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987654
527	NC_008021	CAA	2	6	38222	38227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987654
528	NC_008021	ATG	2	6	38293	38298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987654
529	NC_008021	TTG	2	6	38305	38310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987654
530	NC_008021	GTT	2	6	38352	38357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987654
531	NC_008021	CAG	2	6	38410	38415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987654
532	NC_008021	ACC	2	6	38521	38526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987654
533	NC_008021	GGT	2	6	38532	38537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987654
534	NC_008021	ACA	2	6	38598	38603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987654
535	NC_008021	TGC	2	6	38666	38671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987654
536	NC_008021	CTT	2	6	38805	38810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987654
537	NC_008021	GGT	2	6	38853	38858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987654
538	NC_008021	ACC	2	6	38897	38902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987654
539	NC_008021	ACA	2	6	38925	38930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987654
540	NC_008021	TC	4	8	38948	38955	0 %	50 %	0 %	50 %	94987654
541	NC_008021	CTA	2	6	38984	38989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987654
542	NC_008021	AGA	2	6	39011	39016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987654
543	NC_008021	TCAG	2	8	39046	39053	25 %	25 %	25 %	25 %	94987654
544	NC_008021	GGT	2	6	39108	39113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987654
545	NC_008021	CAG	2	6	39185	39190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987654
546	NC_008021	AGC	2	6	39323	39328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987654
547	NC_008021	ACAG	2	8	39371	39378	50 %	0 %	25 %	25 %	94987654
548	NC_008021	GAA	2	6	39387	39392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987654
549	NC_008021	CTG	2	6	39397	39402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987654
550	NC_008021	ATC	2	6	39615	39620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987654
551	NC_008021	CAG	2	6	39640	39645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987654
552	NC_008021	ATC	2	6	39744	39749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987654
553	NC_008021	TCT	2	6	39788	39793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987654
554	NC_008021	CT	3	6	39835	39840	0 %	50 %	0 %	50 %	94987654
555	NC_008021	TTGG	2	8	39908	39915	0 %	50 %	50 %	0 %	94987654
556	NC_008021	TGT	2	6	39974	39979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987654
557	NC_008021	ATC	2	6	40128	40133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987654
558	NC_008021	GAA	2	6	40432	40437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987655
559	NC_008021	ACTT	2	8	40483	40490	25 %	50 %	0 %	25 %	94987655
560	NC_008021	AAG	2	6	40520	40525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987655
561	NC_008021	AATC	2	8	40603	40610	50 %	25 %	0 %	25 %	94987655
562	NC_008021	CCT	2	6	40808	40813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94987655
563	NC_008021	TCG	2	6	40842	40847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987655
564	NC_008021	AAG	2	6	40880	40885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987655
565	NC_008021	TGA	2	6	40922	40927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987655
566	NC_008021	TGC	2	6	40944	40949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987655
567	NC_008021	GGT	2	6	41037	41042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987655
568	NC_008021	TGA	2	6	41124	41129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987655
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571	NC_008021	GAA	2	6	41317	41322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987655
572	NC_008021	A	6	6	41352	41357	100 %	0 %	0 %	0 %	94987655
573	NC_008021	GTT	2	6	41461	41466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987655
574	NC_008021	TGAT	2	8	41468	41475	25 %	50 %	25 %	0 %	94987655
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577	NC_008021	GCT	2	6	41638	41643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987655
578	NC_008021	GT	3	6	41650	41655	0 %	50 %	50 %	0 %	94987655
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581	NC_008021	TTGA	2	8	41701	41708	25 %	50 %	25 %	0 %	94987655
582	NC_008021	TGG	2	6	41739	41744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987655
583	NC_008021	GAA	3	9	41797	41805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987655
584	NC_008021	AGA	2	6	41820	41825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987655
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587	NC_008021	A	7	7	41958	41964	100 %	0 %	0 %	0 %	94987656
588	NC_008021	TGG	2	6	42015	42020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987656
589	NC_008021	AG	3	6	42049	42054	50 %	0 %	50 %	0 %	94987656
590	NC_008021	TGCT	2	8	42098	42105	0 %	50 %	25 %	25 %	94987656
591	NC_008021	TG	3	6	42152	42157	0 %	50 %	50 %	0 %	94987656
592	NC_008021	ATT	2	6	42166	42171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987656
593	NC_008021	GCA	2	6	42172	42177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987656
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595	NC_008021	GAA	2	6	42268	42273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987656
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599	NC_008021	AAGG	2	8	42436	42443	50 %	0 %	50 %	0 %	94987656
600	NC_008021	CGT	2	6	42502	42507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987656
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609	NC_008021	ATC	2	6	42898	42903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987656
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611	NC_008021	AGCAG	2	10	43154	43163	40 %	0 %	40 %	20 %	94987657
612	NC_008021	AGTT	2	8	43169	43176	25 %	50 %	25 %	0 %	94987657
613	NC_008021	ATC	2	6	43189	43194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987657
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616	NC_008021	GATT	2	8	43319	43326	25 %	50 %	25 %	0 %	94987657
617	NC_008021	GTCT	2	8	43329	43336	0 %	50 %	25 %	25 %	94987657
618	NC_008021	TTG	2	6	43354	43359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987657
619	NC_008021	TAT	2	6	43391	43396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987657
620	NC_008021	CCTG	2	8	43415	43422	0 %	25 %	25 %	50 %	94987657
621	NC_008021	GGTCA	2	10	43518	43527	20 %	20 %	40 %	20 %	94987657
622	NC_008021	CAA	2	6	43530	43535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987657
623	NC_008021	TTG	2	6	43885	43890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987658
624	NC_008021	TTGGG	2	10	43914	43923	0 %	40 %	60 %	0 %	94987658
625	NC_008021	TGG	2	6	43937	43942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987658
626	NC_008021	CGA	2	6	43988	43993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987658
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628	NC_008021	TCG	2	6	44069	44074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94987658
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