MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	GA	3	6	229	234	50 %	0 %	50 %	0 %	87159870
2	NC_007792	AT	3	6	284	289	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
3	NC_007792	AC	3	6	592	597	50 %	0 %	0 %	50 %	87159870
4	NC_007792	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
5	NC_007792	AT	3	6	1267	1272	50 %	50 %	0 %	0 %	87159858
6	NC_007792	TA	3	6	1774	1779	50 %	50 %	0 %	0 %	87159858
7	NC_007792	TA	3	6	2585	2590	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
8	NC_007792	AT	3	6	2625	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
9	NC_007792	TA	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
10	NC_007792	TA	3	6	3267	3272	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
11	NC_007792	AT	3	6	3329	3334	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
12	NC_007792	AG	3	6	5003	5008	50 %	0 %	50 %	0 %	87159883
13	NC_007792	AT	3	6	5822	5827	50 %	50 %	0 %	0 %	87159860
14	NC_007792	TA	3	6	6329	6334	50 %	50 %	0 %	0 %	87159860
15	NC_007792	AT	3	6	6803	6808	50 %	50 %	0 %	0 %	87159864
16	NC_007792	AT	3	6	8115	8120	50 %	50 %	0 %	0 %	87159879
17	NC_007792	CA	3	6	8415	8420	50 %	0 %	0 %	50 %	87159879
18	NC_007792	AT	3	6	8984	8989	50 %	50 %	0 %	0 %	87159872
19	NC_007792	TA	3	6	9491	9496	50 %	50 %	0 %	0 %	87159872
20	NC_007792	AG	3	6	10225	10230	50 %	0 %	50 %	0 %	87159868
21	NC_007792	AT	3	6	11668	11673	50 %	50 %	0 %	0 %	87159849
22	NC_007792	AT	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	87159853
23	NC_007792	TA	3	6	12119	12124	50 %	50 %	0 %	0 %	87159853
24	NC_007792	TA	3	6	12403	12408	50 %	50 %	0 %	0 %	87159853
25	NC_007792	AT	3	6	13398	13403	50 %	50 %	0 %	0 %	87159848
26	NC_007792	TA	3	6	13757	13762	50 %	50 %	0 %	0 %	87159848
27	NC_007792	AT	3	6	13961	13966	50 %	50 %	0 %	0 %	87159848
28	NC_007792	AT	3	6	14585	14590	50 %	50 %	0 %	0 %	87159857
29	NC_007792	AT	3	6	14611	14616	50 %	50 %	0 %	0 %	87159857
30	NC_007792	AC	3	6	15439	15444	50 %	0 %	0 %	50 %	87159857
31	NC_007792	TA	3	6	15463	15468	50 %	50 %	0 %	0 %	87159857
32	NC_007792	AT	3	6	17112	17117	50 %	50 %	0 %	0 %	87159856
33	NC_007792	AT	3	6	17497	17502	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
34	NC_007792	AT	3	6	17871	17876	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
35	NC_007792	GA	3	6	18054	18059	50 %	0 %	50 %	0 %	87159878
36	NC_007792	AT	3	6	18400	18405	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
37	NC_007792	AT	3	6	18991	18996	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
38	NC_007792	AT	3	6	19580	19585	50 %	50 %	0 %	0 %	87159852
39	NC_007792	AT	3	6	19656	19661	50 %	50 %	0 %	0 %	87159852
40	NC_007792	TA	4	8	19771	19778	50 %	50 %	0 %	0 %	87159852
41	NC_007792	AT	3	6	20090	20095	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
42	NC_007792	AT	3	6	20737	20742	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
43	NC_007792	TC	3	6	20795	20800	0 %	50 %	0 %	50 %	87159851
44	NC_007792	TA	3	6	20816	20821	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
45	NC_007792	AT	3	6	21075	21080	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
46	NC_007792	TA	3	6	21325	21330	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
47	NC_007792	TG	3	6	21930	21935	0 %	50 %	50 %	0 %	87159873
48	NC_007792	TA	3	6	22362	22367	50 %	50 %	0 %	0 %	87159873
49	NC_007792	AT	3	6	22660	22665	50 %	50 %	0 %	0 %	87159881
50	NC_007792	AT	3	6	23387	23392	50 %	50 %	0 %	0 %	87159874
51	NC_007792	TA	3	6	23894	23899	50 %	50 %	0 %	0 %	87159874
52	NC_007792	TA	3	6	24534	24539	50 %	50 %	0 %	0 %	87159850
53	NC_007792	TA	3	6	24635	24640	50 %	50 %	0 %	0 %	87159850
54	NC_007792	AT	3	6	24782	24787	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
55	NC_007792	AT	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
56	NC_007792	AT	4	8	25817	25824	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
57	NC_007792	AT	4	8	25944	25951	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
58	NC_007792	AT	5	10	26216	26225	50 %	50 %	0 %	0 %	87159882
59	NC_007792	AT	3	6	26254	26259	50 %	50 %	0 %	0 %	87159882
60	NC_007792	TA	3	6	29127	29132	50 %	50 %	0 %	0 %	87159865
61	NC_007792	TA	3	6	30865	30870	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
62	NC_007792	AT	3	6	31313	31318	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
63	NC_007792	TA	3	6	31354	31359	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
64	NC_007792	AT	3	6	31711	31716	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
65	NC_007792	TA	3	6	31974	31979	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
66	NC_007792	AT	3	6	32098	32103	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
67	NC_007792	AG	3	6	36371	36376	50 %	0 %	50 %	0 %	87159869
68	NC_007792	AC	3	6	36433	36438	50 %	0 %	0 %	50 %	87159869
69	NC_007792	TA	3	6	36826	36831	50 %	50 %	0 %	0 %	87159867

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.