MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007775	TGCGCT	2	12	188174	188185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604914
3502	NC_007775	GGTT	2	8	188192	188199	0 %	50 %	50 %	0 %	86604914
3503	NC_007775	GCG	2	6	188262	188267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604914
3504	NC_007775	CT	3	6	188447	188452	0 %	50 %	0 %	50 %	86604915
3505	NC_007775	GTT	2	6	188475	188480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604915
3506	NC_007775	GGC	2	6	188490	188495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604915
3507	NC_007775	GCTGG	2	10	188511	188520	0 %	20 %	60 %	20 %	86604915
3508	NC_007775	TGGGC	2	10	188590	188599	0 %	20 %	60 %	20 %	86604915
3509	NC_007775	CTG	2	6	188643	188648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604915
3510	NC_007775	AAC	2	6	188654	188659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604915
3511	NC_007775	CTG	2	6	188798	188803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604915
3512	NC_007775	TGG	2	6	188872	188877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604915
3513	NC_007775	GGTT	2	8	188899	188906	0 %	50 %	50 %	0 %	86604915
3514	NC_007775	GA	3	6	188950	188955	50 %	0 %	50 %	0 %	86604915
3515	NC_007775	C	7	7	188978	188984	0 %	0 %	0 %	100 %	86604915
3516	NC_007775	TCG	2	6	188993	188998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604915
3517	NC_007775	GGT	2	6	189068	189073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604915
3518	NC_007775	CAG	2	6	189080	189085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604915
3519	NC_007775	GCG	2	6	189141	189146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604915
3520	NC_007775	CCA	2	6	189229	189234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604915
3521	NC_007775	ACC	2	6	189266	189271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604915
3522	NC_007775	GCG	2	6	189295	189300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604915
3523	NC_007775	GGT	2	6	189446	189451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604915
3524	NC_007775	TCG	2	6	189504	189509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604915
3525	NC_007775	AGG	2	6	189536	189541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604915
3526	NC_007775	GCG	2	6	189550	189555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604915
3527	NC_007775	AGCC	2	8	189602	189609	25 %	0 %	25 %	50 %	86604915
3528	NC_007775	CAC	2	6	189617	189622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604915
3529	NC_007775	CGAC	2	8	190562	190569	25 %	0 %	25 %	50 %	86604916
3530	NC_007775	A	6	6	190602	190607	100 %	0 %	0 %	0 %	86604916
3531	NC_007775	GCC	2	6	190637	190642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604916
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3533	NC_007775	GGA	2	6	190820	190825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604916
3534	NC_007775	TGG	2	6	191074	191079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604917
3535	NC_007775	CCT	2	6	191135	191140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604917
3536	NC_007775	TCGG	2	8	191182	191189	0 %	25 %	50 %	25 %	86604917
3537	NC_007775	GAG	2	6	191190	191195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604917
3538	NC_007775	CTG	2	6	191196	191201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604917
3539	NC_007775	CTG	2	6	191217	191222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604917
3540	NC_007775	TGG	2	6	191248	191253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604917
3541	NC_007775	GGC	2	6	191279	191284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604917
3542	NC_007775	CGG	2	6	191290	191295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604917
3543	NC_007775	GTG	2	6	191304	191309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604917
3544	NC_007775	CAA	2	6	191384	191389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604917
3545	NC_007775	TGG	2	6	191398	191403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604917
3546	NC_007775	GGC	2	6	191406	191411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604917
3547	NC_007775	GGT	2	6	191414	191419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604917
3548	NC_007775	GCC	2	6	191504	191509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604917
3549	NC_007775	TTG	2	6	191529	191534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604917
3550	NC_007775	TGA	2	6	191659	191664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604917
3551	NC_007775	GTTTG	2	10	191699	191708	0 %	60 %	40 %	0 %	86604917
3552	NC_007775	TTCTG	2	10	191780	191789	0 %	60 %	20 %	20 %	86604917
3553	NC_007775	TGC	2	6	191951	191956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604917
3554	NC_007775	CAGG	2	8	191961	191968	25 %	0 %	50 %	25 %	86604917
3555	NC_007775	GCC	2	6	191994	191999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604917
3556	NC_007775	GCG	2	6	192006	192011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604917
3557	NC_007775	GGA	2	6	192110	192115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604917
3558	NC_007775	GCT	2	6	192155	192160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604917
3559	NC_007775	GCA	2	6	192164	192169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604917
3560	NC_007775	CTG	2	6	192332	192337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604918
3561	NC_007775	CGA	2	6	192388	192393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604918
3562	NC_007775	GCC	2	6	192410	192415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604918
3563	NC_007775	CGC	2	6	192420	192425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604918
3564	NC_007775	TGA	2	6	192471	192476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604918
3565	NC_007775	GGC	2	6	192519	192524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604918
3566	NC_007775	CAG	2	6	192593	192598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604918
3567	NC_007775	CCG	2	6	192646	192651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604918
3568	NC_007775	CAC	2	6	192703	192708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604918
3569	NC_007775	TGCTGG	2	12	192774	192785	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	86604918
3570	NC_007775	AGC	2	6	192794	192799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604918
3571	NC_007775	GCA	2	6	192808	192813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604918
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3573	NC_007775	GCA	2	6	192829	192834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604918
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3577	NC_007775	TGG	2	6	193005	193010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604918
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3579	NC_007775	CTG	5	15	193028	193042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604918
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3581	NC_007775	CAC	2	6	193132	193137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604918
3582	NC_007775	CTG	2	6	193139	193144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604918
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3588	NC_007775	CTG	2	6	193433	193438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604918
3589	NC_007775	GCG	2	6	193504	193509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604918
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3591	NC_007775	GCC	2	6	193613	193618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604918
3592	NC_007775	GCC	2	6	193622	193627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604918
3593	NC_007775	TGG	2	6	193674	193679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604918
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3596	NC_007775	TGG	2	6	193743	193748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604918
3597	NC_007775	CT	4	8	193774	193781	0 %	50 %	0 %	50 %	86604918
3598	NC_007775	GCCAG	2	10	193827	193836	20 %	0 %	40 %	40 %	86604918
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3601	NC_007775	TG	3	6	194235	194240	0 %	50 %	50 %	0 %	86604919
3602	NC_007775	TCT	2	6	194271	194276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604919
3603	NC_007775	CGG	2	6	194302	194307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604919
3604	NC_007775	GAG	2	6	194334	194339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604919
3605	NC_007775	GGC	2	6	194344	194349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604919
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3607	NC_007775	GGA	2	6	194393	194398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604919
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3609	NC_007775	CCCG	2	8	194480	194487	0 %	0 %	25 %	75 %	86604919
3610	NC_007775	TGG	2	6	194499	194504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604919
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3616	NC_007775	GCAGC	2	10	194662	194671	20 %	0 %	40 %	40 %	86604919
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3620	NC_007775	AGGCCA	2	12	194835	194846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604919
3621	NC_007775	GCGG	2	8	194875	194882	0 %	0 %	75 %	25 %	86604919
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3994	NC_007775	CTG	2	6	212297	212302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604931
3995	NC_007775	CGC	2	6	212374	212379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604931
3996	NC_007775	TGGC	2	8	212392	212399	0 %	25 %	50 %	25 %	86604931
3997	NC_007775	GTC	2	6	212403	212408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604931
3998	NC_007775	GCG	2	6	212448	212453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604931
3999	NC_007775	ACC	2	6	212488	212493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604931
4000	NC_007775	GGC	2	6	212554	212559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604931

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