MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_007775	CCCGCG	2	12	104910	104921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604839
2003	NC_007775	CCG	2	6	104934	104939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604839
2004	NC_007775	TCTCC	2	10	104940	104949	0 %	40 %	0 %	60 %	86604839
2005	NC_007775	CGG	2	6	105001	105006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604839
2006	NC_007775	CAT	2	6	105079	105084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604839
2007	NC_007775	CAA	2	6	105199	105204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604839
2008	NC_007775	G	8	8	105205	105212	0 %	0 %	100 %	0 %	86604839
2009	NC_007775	CTGAGC	2	12	105267	105278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86604839
2010	NC_007775	GCC	3	9	105318	105326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604839
2011	NC_007775	TCC	2	6	105328	105333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604839
2012	NC_007775	GGA	2	6	105493	105498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604840
2013	NC_007775	GAG	2	6	105530	105535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604840
2014	NC_007775	GGCA	2	8	105564	105571	25 %	0 %	50 %	25 %	86604840
2015	NC_007775	CGG	2	6	105607	105612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604840
2016	NC_007775	GTG	2	6	105623	105628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604840
2017	NC_007775	GT	3	6	105793	105798	0 %	50 %	50 %	0 %	86604840
2018	NC_007775	TGG	2	6	105819	105824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604840
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2020	NC_007775	ATC	2	6	106004	106009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604840
2021	NC_007775	TTACGA	2	12	106027	106038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	86604840
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2023	NC_007775	GGC	2	6	106114	106119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604840
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2029	NC_007775	CTCG	2	8	106335	106342	0 %	25 %	25 %	50 %	86604840
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2031	NC_007775	AAG	2	6	106413	106418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604841
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2042	NC_007775	GGA	2	6	107377	107382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604842
2043	NC_007775	GTC	3	9	107402	107410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604842
2044	NC_007775	TGA	2	6	107421	107426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604842
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2052	NC_007775	GCT	2	6	107683	107688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604842
2053	NC_007775	CAT	2	6	107821	107826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604843
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2059	NC_007775	GCC	2	6	108072	108077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604843
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2061	NC_007775	GCC	2	6	108261	108266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604843
2062	NC_007775	ACGGC	2	10	108313	108322	20 %	0 %	40 %	40 %	86604843
2063	NC_007775	GCC	2	6	108354	108359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604843
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2065	NC_007775	CGG	2	6	108422	108427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604843
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2069	NC_007775	TCAA	2	8	108900	108907	50 %	25 %	0 %	25 %	86604844
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2105	NC_007775	GA	3	6	110665	110670	50 %	0 %	50 %	0 %	86604846
2106	NC_007775	AGT	2	6	110705	110710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604846
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2115	NC_007775	G	6	6	111065	111070	0 %	0 %	100 %	0 %	86604846
2116	NC_007775	ACC	2	6	111111	111116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604846
2117	NC_007775	GC	3	6	111120	111125	0 %	0 %	50 %	50 %	86604846
2118	NC_007775	GCCAAG	2	12	111145	111156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604846
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2122	NC_007775	GCT	2	6	111532	111537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604847
2123	NC_007775	TATC	2	8	111559	111566	25 %	50 %	0 %	25 %	86604847
2124	NC_007775	GCGGG	2	10	111601	111610	0 %	0 %	80 %	20 %	86604847
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2129	NC_007775	ATC	2	6	111905	111910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604847
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2143	NC_007775	TCG	2	6	112707	112712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604847
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2491	NC_007775	CCG	2	6	132082	132087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604867
2492	NC_007775	GGA	2	6	132181	132186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604867
2493	NC_007775	CAG	2	6	132335	132340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604867
2494	NC_007775	GCA	2	6	132379	132384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604867
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2496	NC_007775	GCC	2	6	132498	132503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604867
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