MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_007775	TCT	2	6	78321	78326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604809
1503	NC_007775	TGA	2	6	78664	78669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604810
1504	NC_007775	CACC	2	8	78679	78686	25 %	0 %	0 %	75 %	86604810
1505	NC_007775	GTTG	2	8	78691	78698	0 %	50 %	50 %	0 %	86604810
1506	NC_007775	ATG	2	6	78762	78767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604810
1507	NC_007775	ATT	2	6	78851	78856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86604810
1508	NC_007775	GCG	2	6	78910	78915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604810
1509	NC_007775	CTCCC	2	10	78964	78973	0 %	20 %	0 %	80 %	86604810
1510	NC_007775	AG	3	6	78978	78983	50 %	0 %	50 %	0 %	86604810
1511	NC_007775	GAAG	2	8	78991	78998	50 %	0 %	50 %	0 %	86604810
1512	NC_007775	C	6	6	79242	79247	0 %	0 %	0 %	100 %	86604811
1513	NC_007775	CGG	2	6	79308	79313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604811
1514	NC_007775	T	6	6	79316	79321	0 %	100 %	0 %	0 %	86604811
1515	NC_007775	GT	3	6	79364	79369	0 %	50 %	50 %	0 %	86604811
1516	NC_007775	T	6	6	79393	79398	0 %	100 %	0 %	0 %	86604811
1517	NC_007775	GGC	2	6	79414	79419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604811
1518	NC_007775	CGG	2	6	79449	79454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604811
1519	NC_007775	GCC	2	6	79459	79464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604811
1520	NC_007775	ATC	2	6	79595	79600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604811
1521	NC_007775	CT	3	6	79617	79622	0 %	50 %	0 %	50 %	86604811
1522	NC_007775	GCA	2	6	79689	79694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604811
1523	NC_007775	GTG	2	6	79828	79833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604811
1524	NC_007775	G	6	6	79845	79850	0 %	0 %	100 %	0 %	86604811
1525	NC_007775	GGCC	2	8	79863	79870	0 %	0 %	50 %	50 %	86604811
1526	NC_007775	TCA	2	6	79992	79997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604811
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1528	NC_007775	CCT	2	6	80030	80035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604811
1529	NC_007775	CCA	2	6	80073	80078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604811
1530	NC_007775	GCT	2	6	80125	80130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604811
1531	NC_007775	CAC	2	6	80170	80175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604811
1532	NC_007775	GGA	2	6	80194	80199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604811
1533	NC_007775	GGC	2	6	80203	80208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604811
1534	NC_007775	GGCA	2	8	80218	80225	25 %	0 %	50 %	25 %	86604811
1535	NC_007775	GCGG	2	8	80260	80267	0 %	0 %	75 %	25 %	86604811
1536	NC_007775	GCT	2	6	80296	80301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604811
1537	NC_007775	TGG	2	6	80339	80344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604811
1538	NC_007775	CAC	2	6	80351	80356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604811
1539	NC_007775	GCC	2	6	80359	80364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604811
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1541	NC_007775	TATT	2	8	80376	80383	25 %	75 %	0 %	0 %	86604811
1542	NC_007775	GCC	2	6	80422	80427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604811
1543	NC_007775	CGC	2	6	80435	80440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604811
1544	NC_007775	TGC	2	6	80529	80534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604811
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1548	NC_007775	G	6	6	80629	80634	0 %	0 %	100 %	0 %	86604811
1549	NC_007775	GCT	2	6	80647	80652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604811
1550	NC_007775	CTC	2	6	80720	80725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604811
1551	NC_007775	CGG	2	6	80750	80755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604811
1552	NC_007775	GCCC	2	8	80797	80804	0 %	0 %	25 %	75 %	86604811
1553	NC_007775	CGG	2	6	80837	80842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604811
1554	NC_007775	CG	3	6	80848	80853	0 %	0 %	50 %	50 %	86604811
1555	NC_007775	CCT	2	6	81140	81145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604812
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1557	NC_007775	CTG	2	6	81170	81175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604812
1558	NC_007775	GTT	2	6	81191	81196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604812
1559	NC_007775	AGG	2	6	81246	81251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604812
1560	NC_007775	GTG	2	6	81286	81291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604812
1561	NC_007775	GAT	2	6	81294	81299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604812
1562	NC_007775	TCA	2	6	81325	81330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604812
1563	NC_007775	CTG	2	6	81366	81371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604812
1564	NC_007775	GGC	2	6	81394	81399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604812
1565	NC_007775	GC	3	6	81415	81420	0 %	0 %	50 %	50 %	86604812
1566	NC_007775	G	7	7	81431	81437	0 %	0 %	100 %	0 %	86604812
1567	NC_007775	C	6	6	81490	81495	0 %	0 %	0 %	100 %	86604812
1568	NC_007775	GC	3	6	81537	81542	0 %	0 %	50 %	50 %	86604812
1569	NC_007775	GCC	2	6	81547	81552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604812
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1572	NC_007775	G	6	6	81698	81703	0 %	0 %	100 %	0 %	86604812
1573	NC_007775	CAG	2	6	81723	81728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604812
1574	NC_007775	GAC	2	6	81768	81773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604812
1575	NC_007775	GAG	2	6	81793	81798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604812
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1584	NC_007775	CAA	2	6	82296	82301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604813
1585	NC_007775	GGA	2	6	82326	82331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604813
1586	NC_007775	TCG	2	6	82396	82401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604813
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1593	NC_007775	CAG	2	6	82606	82611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604813
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1598	NC_007775	GCC	2	6	82762	82767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604813
1599	NC_007775	AGA	3	9	82799	82807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604813
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1601	NC_007775	GCG	2	6	83003	83008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604814
1602	NC_007775	AGCC	2	8	83065	83072	25 %	0 %	25 %	50 %	86604814
1603	NC_007775	GCC	2	6	83126	83131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604814
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1606	NC_007775	CCA	2	6	83263	83268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604814
1607	NC_007775	CAC	2	6	83315	83320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604814
1608	NC_007775	TGCT	2	8	83324	83331	0 %	50 %	25 %	25 %	86604814
1609	NC_007775	GGTGC	2	10	83357	83366	0 %	20 %	60 %	20 %	86604814
1610	NC_007775	TGG	2	6	83374	83379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604814
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1614	NC_007775	CCAT	2	8	83547	83554	25 %	25 %	0 %	50 %	86604814
1615	NC_007775	CCGC	2	8	83593	83600	0 %	0 %	25 %	75 %	86604814
1616	NC_007775	CTT	2	6	83602	83607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604814
1617	NC_007775	CGA	3	9	83647	83655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604814
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1623	NC_007775	GAG	2	6	84368	84373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604816
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