MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007775	GGT	3	9	50156	50164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604783
1003	NC_007775	CAG	2	6	50186	50191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604783
1004	NC_007775	CCGGCC	2	12	50202	50213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604783
1005	NC_007775	CGC	2	6	50219	50224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604783
1006	NC_007775	GCCC	2	8	50282	50289	0 %	0 %	25 %	75 %	86604783
1007	NC_007775	AG	3	6	50300	50305	50 %	0 %	50 %	0 %	86604783
1008	NC_007775	CCG	2	6	50377	50382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604783
1009	NC_007775	TCAG	2	8	50427	50434	25 %	25 %	25 %	25 %	86604783
1010	NC_007775	CAG	2	6	50441	50446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604783
1011	NC_007775	GCC	2	6	50459	50464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604783
1012	NC_007775	CAG	2	6	50489	50494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604783
1013	NC_007775	GATGCC	2	12	50510	50521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86604783
1014	NC_007775	AGT	2	6	50572	50577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604783
1015	NC_007775	CAG	2	6	50600	50605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604783
1016	NC_007775	TCC	2	6	50631	50636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604783
1017	NC_007775	CAAC	2	8	50687	50694	50 %	0 %	0 %	50 %	86604783
1018	NC_007775	CGG	2	6	50728	50733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604783
1019	NC_007775	CCA	2	6	50746	50751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604783
1020	NC_007775	G	6	6	50855	50860	0 %	0 %	100 %	0 %	86604783
1021	NC_007775	C	6	6	50871	50876	0 %	0 %	0 %	100 %	86604783
1022	NC_007775	GAG	2	6	50942	50947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604783
1023	NC_007775	CCA	2	6	50993	50998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604783
1024	NC_007775	AG	3	6	51072	51077	50 %	0 %	50 %	0 %	86604784
1025	NC_007775	CTT	2	6	51152	51157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604784
1026	NC_007775	CAT	2	6	51206	51211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604784
1027	NC_007775	GCG	2	6	51225	51230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604784
1028	NC_007775	GCA	2	6	51241	51246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604784
1029	NC_007775	TCC	2	6	51309	51314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604784
1030	NC_007775	AGC	2	6	51324	51329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604784
1031	NC_007775	CTG	2	6	51368	51373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604784
1032	NC_007775	CAGC	2	8	51374	51381	25 %	0 %	25 %	50 %	86604784
1033	NC_007775	CGC	2	6	51469	51474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604784
1034	NC_007775	C	6	6	51494	51499	0 %	0 %	0 %	100 %	86604784
1035	NC_007775	CCCGG	2	10	51510	51519	0 %	0 %	40 %	60 %	86604784
1036	NC_007775	GAT	2	6	51545	51550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604784
1037	NC_007775	CCA	2	6	51574	51579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604784
1038	NC_007775	CTG	2	6	51594	51599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604784
1039	NC_007775	AGC	2	6	51714	51719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604784
1040	NC_007775	AGG	2	6	51741	51746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604786
1041	NC_007775	AGT	2	6	51758	51763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604786
1042	NC_007775	AAG	2	6	51765	51770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604786
1043	NC_007775	CAT	2	6	51844	51849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604786
1044	NC_007775	CAGG	2	8	51879	51886	25 %	0 %	50 %	25 %	86604786
1045	NC_007775	A	6	6	52016	52021	100 %	0 %	0 %	0 %	86604786
1046	NC_007775	TTC	2	6	52028	52033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604786
1047	NC_007775	TGA	2	6	52044	52049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604786
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1049	NC_007775	TCC	2	6	52211	52216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604786
1050	NC_007775	CTT	2	6	52233	52238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604786
1051	NC_007775	CCT	2	6	52266	52271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604786
1052	NC_007775	CTT	2	6	52272	52277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604786
1053	NC_007775	T	9	9	52301	52309	0 %	100 %	0 %	0 %	86604786
1054	NC_007775	TAA	2	6	52425	52430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86604786
1055	NC_007775	TGT	2	6	52451	52456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604786
1056	NC_007775	TTG	2	6	52510	52515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604786
1057	NC_007775	CCTG	2	8	52592	52599	0 %	25 %	25 %	50 %	86604786
1058	NC_007775	GCT	2	6	52604	52609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604786
1059	NC_007775	CCA	2	6	52939	52944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604787
1060	NC_007775	GCC	2	6	52949	52954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604787
1061	NC_007775	CTG	2	6	52982	52987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604787
1062	NC_007775	AG	3	6	52998	53003	50 %	0 %	50 %	0 %	86604787
1063	NC_007775	CAG	2	6	53150	53155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604787
1064	NC_007775	TCA	2	6	53245	53250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604787
1065	NC_007775	GGT	2	6	53303	53308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604787
1066	NC_007775	TCG	2	6	53346	53351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604787
1067	NC_007775	CCGGG	2	10	53352	53361	0 %	0 %	60 %	40 %	86604787
1068	NC_007775	GCG	2	6	53372	53377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604787
1069	NC_007775	TGC	2	6	53382	53387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604787
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1071	NC_007775	C	6	6	53447	53452	0 %	0 %	0 %	100 %	86604787
1072	NC_007775	C	6	6	53574	53579	0 %	0 %	0 %	100 %	86604787
1073	NC_007775	GGC	3	9	53606	53614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604787
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1076	NC_007775	CGG	2	6	53704	53709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604787
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1080	NC_007775	CAG	2	6	53786	53791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604787
1081	NC_007775	CAGCCG	2	12	53808	53819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86604787
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1083	NC_007775	CTTGCA	2	12	53993	54004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86604788
1084	NC_007775	GCCA	2	8	54030	54037	25 %	0 %	25 %	50 %	86604788
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1096	NC_007775	ATG	2	6	54634	54639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604788
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1099	NC_007775	GCC	2	6	54733	54738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604788
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1101	NC_007775	CGA	2	6	54770	54775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604788
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1104	NC_007775	CAGAT	2	10	54940	54949	40 %	20 %	20 %	20 %	86604788
1105	NC_007775	ATC	2	6	54990	54995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604788
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1109	NC_007775	GCG	2	6	55226	55231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604788
1110	NC_007775	ATC	2	6	55287	55292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604788
1111	NC_007775	GTCG	2	8	55332	55339	0 %	25 %	50 %	25 %	86604788
1112	NC_007775	GGA	2	6	55418	55423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604788
1113	NC_007775	GAT	2	6	55424	55429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604788
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1115	NC_007775	ACA	2	6	55603	55608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604788
1116	NC_007775	ATT	2	6	55620	55625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86604788
1117	NC_007775	GAT	2	6	55700	55705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604788
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1122	NC_007775	A	6	6	56123	56128	100 %	0 %	0 %	0 %	86604788
1123	NC_007775	CAA	2	6	56252	56257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604788
1124	NC_007775	GGC	2	6	56333	56338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604788
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