MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007775	GCA	2	6	25065	25070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
502	NC_007775	A	6	6	25070	25075	100 %	0 %	0 %	0 %	86604759
503	NC_007775	CAG	3	9	25178	25186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
504	NC_007775	GCC	2	6	25203	25208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
505	NC_007775	CAG	2	6	25238	25243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
506	NC_007775	CCAGCC	2	12	25286	25297	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	86604759
507	NC_007775	AAGG	2	8	25416	25423	50 %	0 %	50 %	0 %	86604759
508	NC_007775	CCGC	2	8	25429	25436	0 %	0 %	25 %	75 %	86604759
509	NC_007775	AGC	2	6	25454	25459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
510	NC_007775	CAG	2	6	25506	25511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
511	NC_007775	CGC	2	6	25512	25517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
512	NC_007775	C	6	6	25544	25549	0 %	0 %	0 %	100 %	86604759
513	NC_007775	C	6	6	25552	25557	0 %	0 %	0 %	100 %	86604759
514	NC_007775	CAG	2	6	25577	25582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
515	NC_007775	CAG	2	6	25586	25591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
516	NC_007775	CAG	2	6	25604	25609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
517	NC_007775	CGC	2	6	25610	25615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
518	NC_007775	TGG	2	6	25627	25632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604759
519	NC_007775	C	6	6	25648	25653	0 %	0 %	0 %	100 %	86604759
520	NC_007775	CGC	2	6	25661	25666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
521	NC_007775	GCC	2	6	25722	25727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
522	NC_007775	AAG	2	6	25770	25775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604759
523	NC_007775	AGC	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
524	NC_007775	GCG	2	6	25862	25867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604759
525	NC_007775	GCA	2	6	25890	25895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
526	NC_007775	GCA	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
527	NC_007775	AGT	2	6	25924	25929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604759
528	NC_007775	GCC	2	6	25951	25956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
529	NC_007775	TCC	2	6	25959	25964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604759
530	NC_007775	CAG	2	6	25967	25972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
531	NC_007775	CAC	3	9	25979	25987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604759
532	NC_007775	CAG	2	6	25997	26002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604759
533	NC_007775	GCCA	2	8	26007	26014	25 %	0 %	25 %	50 %	86604759
534	NC_007775	CCG	2	6	26027	26032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604759
535	NC_007775	TGC	2	6	26037	26042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604759
536	NC_007775	CAC	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604759
537	NC_007775	TCG	2	6	26209	26214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604760
538	NC_007775	TCATCT	2	12	26278	26289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	86604760
539	NC_007775	CCAC	2	8	26297	26304	25 %	0 %	0 %	75 %	86604760
540	NC_007775	CAG	2	6	26331	26336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604760
541	NC_007775	CCGCA	2	10	26409	26418	20 %	0 %	20 %	60 %	86604760
542	NC_007775	GGT	2	6	26421	26426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604760
543	NC_007775	GGCA	2	8	26499	26506	25 %	0 %	50 %	25 %	86604760
544	NC_007775	AGT	2	6	26516	26521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604760
545	NC_007775	TGC	2	6	26859	26864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604761
546	NC_007775	ACC	2	6	26895	26900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604761
547	NC_007775	TCG	2	6	26916	26921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604761
548	NC_007775	CAC	2	6	26968	26973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604761
549	NC_007775	C	6	6	26993	26998	0 %	0 %	0 %	100 %	86604761
550	NC_007775	ATC	2	6	27044	27049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604761
551	NC_007775	GAC	2	6	27080	27085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604761
552	NC_007775	CGA	2	6	27100	27105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604761
553	NC_007775	TCA	2	6	27170	27175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604762
554	NC_007775	GCA	2	6	27176	27181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604762
555	NC_007775	GGC	2	6	27183	27188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604762
556	NC_007775	CAC	2	6	27240	27245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604762
557	NC_007775	CCG	2	6	27297	27302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604762
558	NC_007775	CAC	2	6	27312	27317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604762
559	NC_007775	CTT	2	6	27323	27328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604762
560	NC_007775	GCCT	2	8	27338	27345	0 %	25 %	25 %	50 %	86604762
561	NC_007775	ATC	2	6	27409	27414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604762
562	NC_007775	C	6	6	27464	27469	0 %	0 %	0 %	100 %	86604762
563	NC_007775	CGG	2	6	27558	27563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604762
564	NC_007775	CAG	3	9	27597	27605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604762
565	NC_007775	AGA	2	6	27733	27738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604762
566	NC_007775	GCT	2	6	27752	27757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604762
567	NC_007775	GCT	2	6	27767	27772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604762
568	NC_007775	CCA	2	6	27782	27787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604762
569	NC_007775	GTT	2	6	27821	27826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604762
570	NC_007775	TCCA	2	8	27886	27893	25 %	25 %	0 %	50 %	86604762
571	NC_007775	CTGG	2	8	27939	27946	0 %	25 %	50 %	25 %	86604762
572	NC_007775	CCG	2	6	27983	27988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604762
573	NC_007775	CAG	2	6	28026	28031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604762
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575	NC_007775	CTT	2	6	28076	28081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604762
576	NC_007775	CGG	2	6	28145	28150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604762
577	NC_007775	AGG	2	6	28300	28305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604762
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580	NC_007775	GAC	2	6	28434	28439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604762
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584	NC_007775	AAAGA	2	10	28697	28706	80 %	0 %	20 %	0 %	86604762
585	NC_007775	C	6	6	28719	28724	0 %	0 %	0 %	100 %	86604762
586	NC_007775	AAC	2	6	28771	28776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604762
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589	NC_007775	GCA	2	6	29081	29086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604762
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593	NC_007775	C	6	6	29231	29236	0 %	0 %	0 %	100 %	86604762
594	NC_007775	CGC	2	6	29244	29249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604762
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597	NC_007775	GGC	2	6	29303	29308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604762
598	NC_007775	AG	3	6	29312	29317	50 %	0 %	50 %	0 %	86604762
599	NC_007775	TGATCA	2	12	29411	29422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	86604762
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603	NC_007775	TGG	5	15	29872	29886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604763
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605	NC_007775	GC	3	6	29955	29960	0 %	0 %	50 %	50 %	86604763
606	NC_007775	TGG	2	6	29984	29989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604763
607	NC_007775	TGT	2	6	29999	30004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604763
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610	NC_007775	GGA	2	6	30080	30085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604763
611	NC_007775	CTT	2	6	30143	30148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604763
612	NC_007775	ATG	2	6	30160	30165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604763
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614	NC_007775	CTGG	2	8	30541	30548	0 %	25 %	50 %	25 %	86604764
615	NC_007775	TGG	2	6	30609	30614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604764
616	NC_007775	CT	4	8	30632	30639	0 %	50 %	0 %	50 %	86604764
617	NC_007775	GGTGCT	2	12	30643	30654	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	86604764
618	NC_007775	TGG	2	6	30668	30673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604764
619	NC_007775	GC	3	6	30674	30679	0 %	0 %	50 %	50 %	86604764
620	NC_007775	GT	3	6	30707	30712	0 %	50 %	50 %	0 %	86604764
621	NC_007775	CTT	2	6	30745	30750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604764
622	NC_007775	TGTT	2	8	30774	30781	0 %	75 %	25 %	0 %	86604764
623	NC_007775	C	6	6	30809	30814	0 %	0 %	0 %	100 %	86604764
624	NC_007775	AGA	2	6	30838	30843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604764
625	NC_007775	GGC	2	6	30961	30966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604765
626	NC_007775	G	8	8	30979	30986	0 %	0 %	100 %	0 %	86604765
627	NC_007775	CGG	2	6	30994	30999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604765
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