MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007775	GCC	2	6	267923	267928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604983
5002	NC_007775	TGG	2	6	267983	267988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604983
5003	NC_007775	G	6	6	267987	267992	0 %	0 %	100 %	0 %	86604983
5004	NC_007775	GGT	2	6	268018	268023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604983
5005	NC_007775	TGGG	2	8	268045	268052	0 %	25 %	75 %	0 %	86604983
5006	NC_007775	GCA	2	6	268059	268064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604983
5007	NC_007775	G	6	6	268170	268175	0 %	0 %	100 %	0 %	86604983
5008	NC_007775	ATC	2	6	268178	268183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604983
5009	NC_007775	GCT	4	12	268194	268205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604983
5010	NC_007775	TCA	2	6	268230	268235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604983
5011	NC_007775	CTGC	2	8	268239	268246	0 %	25 %	25 %	50 %	86604983
5012	NC_007775	GCT	2	6	268302	268307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604983
5013	NC_007775	CAC	2	6	268375	268380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604983
5014	NC_007775	G	6	6	268437	268442	0 %	0 %	100 %	0 %	86604983
5015	NC_007775	GGCC	2	8	268524	268531	0 %	0 %	50 %	50 %	86604983
5016	NC_007775	CAG	2	6	268543	268548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604983
5017	NC_007775	CTG	2	6	268558	268563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604983
5018	NC_007775	GAGG	2	8	268606	268613	25 %	0 %	75 %	0 %	86604983
5019	NC_007775	CGA	2	6	268693	268698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604984
5020	NC_007775	TGG	2	6	268744	268749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604984
5021	NC_007775	CTG	2	6	268766	268771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604984
5022	NC_007775	CCAG	2	8	268844	268851	25 %	0 %	25 %	50 %	86604984
5023	NC_007775	CCA	2	6	268882	268887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604984
5024	NC_007775	TGC	2	6	268897	268902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604984
5025	NC_007775	GCC	2	6	268993	268998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604984
5026	NC_007775	GCGG	2	8	269110	269117	0 %	0 %	75 %	25 %	86604984
5027	NC_007775	GCC	2	6	269172	269177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604984
5028	NC_007775	GCA	2	6	269188	269193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604984
5029	NC_007775	C	6	6	269208	269213	0 %	0 %	0 %	100 %	86604984
5030	NC_007775	GTA	2	6	269267	269272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604984
5031	NC_007775	TCA	2	6	269386	269391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604984
5032	NC_007775	CAC	2	6	269460	269465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604984
5033	NC_007775	CTC	2	6	269555	269560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604984
5034	NC_007775	CTT	2	6	269615	269620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604984
5035	NC_007775	CGATGT	2	12	269731	269742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86604984
5036	NC_007775	T	6	6	269747	269752	0 %	100 %	0 %	0 %	86604984
5037	NC_007775	CCA	2	6	269761	269766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604984
5038	NC_007775	TCC	2	6	269778	269783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604984
5039	NC_007775	GATG	2	8	269800	269807	25 %	25 %	50 %	0 %	86604984
5040	NC_007775	CCG	2	6	269829	269834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604984
5041	NC_007775	CCG	2	6	269866	269871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604984
5042	NC_007775	GTT	2	6	269879	269884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604984
5043	NC_007775	G	6	6	269921	269926	0 %	0 %	100 %	0 %	86604984
5044	NC_007775	GGCG	2	8	269968	269975	0 %	0 %	75 %	25 %	86604984
5045	NC_007775	GCG	2	6	270107	270112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604984
5046	NC_007775	CGC	2	6	270215	270220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604984
5047	NC_007775	GGC	2	6	270242	270247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604984
5048	NC_007775	CTG	2	6	270323	270328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604984
5049	NC_007775	TCC	2	6	270441	270446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604984
5050	NC_007775	CCG	2	6	270481	270486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604984
5051	NC_007775	CCA	3	9	270523	270531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604984
5052	NC_007775	CCG	2	6	270567	270572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604984
5053	NC_007775	GAT	2	6	270596	270601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604984
5054	NC_007775	CAT	2	6	270629	270634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604984
5055	NC_007775	CCG	2	6	270713	270718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604985
5056	NC_007775	GGT	2	6	270756	270761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604985
5057	NC_007775	TGG	2	6	270833	270838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604985
5058	NC_007775	CGC	2	6	270860	270865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604985
5059	NC_007775	C	6	6	270880	270885	0 %	0 %	0 %	100 %	86604985
5060	NC_007775	CAC	2	6	270888	270893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604985
5061	NC_007775	TGC	3	9	270920	270928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604985
5062	NC_007775	GGCC	2	8	271011	271018	0 %	0 %	50 %	50 %	86604985
5063	NC_007775	GCCC	2	8	271035	271042	0 %	0 %	25 %	75 %	86604985
5064	NC_007775	C	7	7	271040	271046	0 %	0 %	0 %	100 %	86604985
5065	NC_007775	TGT	2	6	271094	271099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604985
5066	NC_007775	G	6	6	271133	271138	0 %	0 %	100 %	0 %	86604985
5067	NC_007775	AGCCC	2	10	271193	271202	20 %	0 %	20 %	60 %	86604985
5068	NC_007775	TCT	2	6	271247	271252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604985
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5070	NC_007775	CGG	2	6	271335	271340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604985
5071	NC_007775	CT	3	6	271363	271368	0 %	50 %	0 %	50 %	86604985
5072	NC_007775	CA	3	6	271392	271397	50 %	0 %	0 %	50 %	86604985
5073	NC_007775	CCGC	2	8	271445	271452	0 %	0 %	25 %	75 %	86604985
5074	NC_007775	CGT	2	6	271469	271474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604985
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5079	NC_007775	CAG	2	6	271698	271703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604985
5080	NC_007775	CCG	2	6	271769	271774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604985
5081	NC_007775	TGGCCA	2	12	271784	271795	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86604985
5082	NC_007775	CAG	2	6	271802	271807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604985
5083	NC_007775	GCC	2	6	271857	271862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604985
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5089	NC_007775	TCG	2	6	272284	272289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604986
5090	NC_007775	TGA	2	6	272363	272368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604986
5091	NC_007775	GCC	2	6	272494	272499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604986
5092	NC_007775	GCCA	2	8	272544	272551	25 %	0 %	25 %	50 %	86604986
5093	NC_007775	A	6	6	272734	272739	100 %	0 %	0 %	0 %	86604986
5094	NC_007775	CGTC	2	8	272772	272779	0 %	25 %	25 %	50 %	86604986
5095	NC_007775	GCA	2	6	272789	272794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604986
5096	NC_007775	CCT	2	6	272823	272828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604987
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5099	NC_007775	CGC	2	6	272967	272972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604987
5100	NC_007775	TCG	2	6	273378	273383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604988
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5102	NC_007775	CAT	2	6	273472	273477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604988
5103	NC_007775	GCC	3	9	273494	273502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604988
5104	NC_007775	CTA	2	6	273517	273522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604988
5105	NC_007775	C	6	6	273527	273532	0 %	0 %	0 %	100 %	86604988
5106	NC_007775	GCA	2	6	273574	273579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604988
5107	NC_007775	GGT	2	6	273580	273585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604988
5108	NC_007775	CGT	2	6	273631	273636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604988
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5110	NC_007775	CCA	3	9	273735	273743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604988
5111	NC_007775	GCC	2	6	273782	273787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604988
5112	NC_007775	CGT	2	6	273793	273798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604988
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5114	NC_007775	AGC	2	6	274028	274033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604989
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5117	NC_007775	CCCG	3	12	274102	274113	0 %	0 %	25 %	75 %	86604989
5118	NC_007775	CCTA	2	8	274199	274206	25 %	25 %	0 %	50 %	86604989
5119	NC_007775	CCT	2	6	274239	274244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604989
5120	NC_007775	CGG	2	6	274349	274354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604989
5121	NC_007775	CAT	2	6	274380	274385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604989
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5123	NC_007775	GCG	2	6	274473	274478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604989
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5493	NC_007775	TGC	2	6	296279	296284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605008
5494	NC_007775	TCG	2	6	296544	296549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605009
5495	NC_007775	GTA	2	6	296550	296555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605009
5496	NC_007775	CTA	2	6	296557	296562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605009
5497	NC_007775	CCG	2	6	296590	296595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605009
5498	NC_007775	AGCTG	2	10	296613	296622	20 %	20 %	40 %	20 %	86605009
5499	NC_007775	AGC	2	6	296672	296677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605009
5500	NC_007775	CCT	3	9	296824	296832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605010

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