MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 54433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007775	G	6	6	239034	239039	0 %	0 %	100 %	0 %	86604959
4502	NC_007775	GTG	2	6	239253	239258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604960
4503	NC_007775	GCT	2	6	239403	239408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604960
4504	NC_007775	CGG	2	6	239452	239457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604960
4505	NC_007775	TTGTT	2	10	239470	239479	0 %	80 %	20 %	0 %	86604960
4506	NC_007775	GAC	2	6	239492	239497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604960
4507	NC_007775	GGT	2	6	239597	239602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604960
4508	NC_007775	GCT	2	6	239604	239609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604960
4509	NC_007775	ACA	2	6	239647	239652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604960
4510	NC_007775	GTC	2	6	239855	239860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604960
4511	NC_007775	GCA	2	6	239947	239952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604960
4512	NC_007775	GTG	3	9	240101	240109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604961
4513	NC_007775	AG	3	6	240187	240192	50 %	0 %	50 %	0 %	86604961
4514	NC_007775	GTG	2	6	240221	240226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604961
4515	NC_007775	CTG	2	6	240233	240238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604961
4516	NC_007775	TTTC	2	8	240348	240355	0 %	75 %	0 %	25 %	86604961
4517	NC_007775	C	6	6	240434	240439	0 %	0 %	0 %	100 %	86604961
4518	NC_007775	C	6	6	240442	240447	0 %	0 %	0 %	100 %	86604961
4519	NC_007775	C	7	7	240454	240460	0 %	0 %	0 %	100 %	86604961
4520	NC_007775	C	6	6	240467	240472	0 %	0 %	0 %	100 %	86604961
4521	NC_007775	C	6	6	240475	240480	0 %	0 %	0 %	100 %	86604961
4522	NC_007775	G	6	6	240487	240492	0 %	0 %	100 %	0 %	86604961
4523	NC_007775	AAGG	2	8	240584	240591	50 %	0 %	50 %	0 %	86604961
4524	NC_007775	TC	3	6	240624	240629	0 %	50 %	0 %	50 %	86604961
4525	NC_007775	CAT	2	6	240643	240648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604961
4526	NC_007775	TAT	2	6	240680	240685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86604961
4527	NC_007775	CAT	2	6	240730	240735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604961
4528	NC_007775	AGG	2	6	240813	240818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604961
4529	NC_007775	GCC	2	6	240890	240895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604961
4530	NC_007775	GAC	2	6	240960	240965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604962
4531	NC_007775	TGG	2	6	241015	241020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604962
4532	NC_007775	GCC	2	6	241028	241033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604962
4533	NC_007775	TCC	2	6	241071	241076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604962
4534	NC_007775	TGT	2	6	241127	241132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604962
4535	NC_007775	AAG	2	6	241161	241166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604962
4536	NC_007775	GAA	2	6	241213	241218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604962
4537	NC_007775	CAA	2	6	241252	241257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86604962
4538	NC_007775	CTG	2	6	241273	241278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604962
4539	NC_007775	CAG	2	6	241307	241312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604962
4540	NC_007775	CAC	2	6	241411	241416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604962
4541	NC_007775	TC	3	6	241443	241448	0 %	50 %	0 %	50 %	86604962
4542	NC_007775	TACCTT	2	12	241479	241490	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	86604962
4543	NC_007775	GCA	2	6	241516	241521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604962
4544	NC_007775	GCC	2	6	241578	241583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604962
4545	NC_007775	TCAA	2	8	241592	241599	50 %	25 %	0 %	25 %	86604962
4546	NC_007775	GTT	2	6	241668	241673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604962
4547	NC_007775	AGCC	2	8	241680	241687	25 %	0 %	25 %	50 %	86604962
4548	NC_007775	CTC	2	6	241724	241729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604962
4549	NC_007775	GCTT	2	8	241994	242001	0 %	50 %	25 %	25 %	86604963
4550	NC_007775	TTGG	2	8	242020	242027	0 %	50 %	50 %	0 %	86604963
4551	NC_007775	TGC	2	6	242199	242204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604963
4552	NC_007775	CTT	2	6	242245	242250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604963
4553	NC_007775	CTG	2	6	242297	242302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604963
4554	NC_007775	GGCT	2	8	242351	242358	0 %	25 %	50 %	25 %	86604963
4555	NC_007775	TGGG	2	8	242393	242400	0 %	25 %	75 %	0 %	86604963
4556	NC_007775	TGG	2	6	242550	242555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604963
4557	NC_007775	CTT	2	6	242627	242632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604963
4558	NC_007775	CTT	2	6	242683	242688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604963
4559	NC_007775	CT	3	6	242710	242715	0 %	50 %	0 %	50 %	86604963
4560	NC_007775	GCT	2	6	242728	242733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604963
4561	NC_007775	C	6	6	242746	242751	0 %	0 %	0 %	100 %	86604963
4562	NC_007775	TGG	2	6	242856	242861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604963
4563	NC_007775	GCA	2	6	242865	242870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604963
4564	NC_007775	G	6	6	243216	243221	0 %	0 %	100 %	0 %	86604963
4565	NC_007775	CGC	2	6	243236	243241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604963
4566	NC_007775	C	6	6	243370	243375	0 %	0 %	0 %	100 %	86604964
4567	NC_007775	GCT	2	6	243380	243385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604964
4568	NC_007775	GAC	2	6	243453	243458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604964
4569	NC_007775	GCA	2	6	243551	243556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604964
4570	NC_007775	GTG	3	9	243636	243644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604964
4571	NC_007775	TGG	2	6	243715	243720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604964
4572	NC_007775	CTA	2	6	243725	243730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604964
4573	NC_007775	ACG	2	6	243736	243741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604964
4574	NC_007775	GGC	2	6	243862	243867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604964
4575	NC_007775	TGG	2	6	243883	243888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604964
4576	NC_007775	TGGC	2	8	243930	243937	0 %	25 %	50 %	25 %	86604964
4577	NC_007775	GCC	2	6	243961	243966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604964
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4579	NC_007775	C	7	7	244152	244158	0 %	0 %	0 %	100 %	86604965
4580	NC_007775	CCG	2	6	244176	244181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604965
4581	NC_007775	TGC	3	9	244310	244318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604965
4582	NC_007775	TGG	2	6	244334	244339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604965
4583	NC_007775	GCC	2	6	244363	244368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604965
4584	NC_007775	TGG	2	6	244421	244426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604965
4585	NC_007775	GCA	2	6	244455	244460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604965
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4587	NC_007775	GCC	2	6	244516	244521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604965
4588	NC_007775	CTGG	2	8	244660	244667	0 %	25 %	50 %	25 %	86604965
4589	NC_007775	GAG	2	6	244684	244689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604965
4590	NC_007775	CT	3	6	244712	244717	0 %	50 %	0 %	50 %	86604965
4591	NC_007775	CTGG	2	8	244722	244729	0 %	25 %	50 %	25 %	86604965
4592	NC_007775	TGC	2	6	244742	244747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604965
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4594	NC_007775	CGT	2	6	244872	244877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604965
4595	NC_007775	GAGCAG	2	12	244957	244968	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86604965
4596	NC_007775	CGG	2	6	244988	244993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604965
4597	NC_007775	GGCT	2	8	244997	245004	0 %	25 %	50 %	25 %	86604965
4598	NC_007775	CTT	2	6	245019	245024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604965
4599	NC_007775	CTGGGA	2	12	245052	245063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	86604965
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4601	NC_007775	GCA	2	6	245116	245121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604965
4602	NC_007775	ATTGCT	2	12	245124	245135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	86604965
4603	NC_007775	TGG	2	6	245149	245154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604965
4604	NC_007775	GGCA	2	8	245162	245169	25 %	0 %	50 %	25 %	86604965
4605	NC_007775	TGC	2	6	245205	245210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604965
4606	NC_007775	GTTCT	2	10	245212	245221	0 %	60 %	20 %	20 %	86604965
4607	NC_007775	CTT	2	6	245298	245303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604965
4608	NC_007775	GGT	2	6	245343	245348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604965
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4610	NC_007775	GCA	2	6	245367	245372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604965
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4612	NC_007775	TGG	2	6	245417	245422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604965
4613	NC_007775	TGA	2	6	245456	245461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604965
4614	NC_007775	CGG	2	6	245468	245473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604965
4615	NC_007775	TGG	2	6	245477	245482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604965
4616	NC_007775	GCG	2	6	245523	245528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604965
4617	NC_007775	ATC	2	6	245835	245840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604966
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4619	NC_007775	CCCT	2	8	245903	245910	0 %	25 %	0 %	75 %	86604966
4620	NC_007775	C	6	6	246028	246033	0 %	0 %	0 %	100 %	86604966
4621	NC_007775	CTC	2	6	246102	246107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604966
4622	NC_007775	C	6	6	246123	246128	0 %	0 %	0 %	100 %	86604966
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4996	NC_007775	GCA	2	6	267732	267737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604983
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