MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 2004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007759	CGCTC	2	10	428	437	0 %	20 %	20 %	60 %	85857846
2	NC_007759	GAAAA	2	10	4532	4541	80 %	0 %	20 %	0 %	85857848
3	NC_007759	GAGAA	2	10	5186	5195	60 %	0 %	40 %	0 %	85857848
4	NC_007759	TGAAA	2	10	5394	5403	60 %	20 %	20 %	0 %	85857849
5	NC_007759	CTATG	2	10	5418	5427	20 %	40 %	20 %	20 %	85857849
6	NC_007759	ACGGC	2	10	5855	5864	20 %	0 %	40 %	40 %	85857849
7	NC_007759	CCGGA	2	10	5987	5996	20 %	0 %	40 %	40 %	85857849
8	NC_007759	GGACG	2	10	6050	6059	20 %	0 %	60 %	20 %	85857849
9	NC_007759	GAAAA	2	10	6196	6205	80 %	0 %	20 %	0 %	85857849
10	NC_007759	TTTGA	2	10	8506	8515	20 %	60 %	20 %	0 %	85857851
11	NC_007759	GGTGG	2	10	8536	8545	0 %	20 %	80 %	0 %	85857851
12	NC_007759	TACGG	2	10	8746	8755	20 %	20 %	40 %	20 %	85857851
13	NC_007759	ATAGG	2	10	10145	10154	40 %	20 %	40 %	0 %	85857852
14	NC_007759	TTTTG	2	10	10788	10797	0 %	80 %	20 %	0 %	85857852
15	NC_007759	AATCG	2	10	11571	11580	40 %	20 %	20 %	20 %	85857853
16	NC_007759	ATCAT	2	10	11918	11927	40 %	40 %	0 %	20 %	85857854
17	NC_007759	AAAGG	2	10	14151	14160	60 %	0 %	40 %	0 %	85857856
18	NC_007759	AAATA	2	10	14161	14170	80 %	20 %	0 %	0 %	85857856
19	NC_007759	CCTCG	2	10	14923	14932	0 %	20 %	20 %	60 %	85857858
20	NC_007759	GGGAA	2	10	15397	15406	40 %	0 %	60 %	0 %	85857858
21	NC_007759	ATGCG	2	10	15472	15481	20 %	20 %	40 %	20 %	85857858
22	NC_007759	TGCCC	2	10	15482	15491	0 %	20 %	20 %	60 %	85857858
23	NC_007759	TCTTT	2	10	16832	16841	0 %	80 %	0 %	20 %	85857860
24	NC_007759	GATGA	2	10	19366	19375	40 %	20 %	40 %	0 %	85857862
25	NC_007759	GCAGA	2	10	19864	19873	40 %	0 %	40 %	20 %	85857862
26	NC_007759	GGCCT	2	10	21252	21261	0 %	20 %	40 %	40 %	85857863
27	NC_007759	CATCT	2	10	21303	21312	20 %	40 %	0 %	40 %	85857863
28	NC_007759	CGCGG	2	10	22543	22552	0 %	0 %	60 %	40 %	85857864
29	NC_007759	GAACG	2	10	22996	23005	40 %	0 %	40 %	20 %	85857865
30	NC_007759	GGGTC	2	10	25263	25272	0 %	20 %	60 %	20 %	85857869
31	NC_007759	TTCAT	2	10	27247	27256	20 %	60 %	0 %	20 %	85857871
32	NC_007759	GAACA	2	10	27744	27753	60 %	0 %	20 %	20 %	85857871
33	NC_007759	CGTTC	2	10	27764	27773	0 %	40 %	20 %	40 %	85857871
34	NC_007759	ACCAG	2	10	29749	29758	40 %	0 %	20 %	40 %	85857873
35	NC_007759	TGCCA	2	10	33326	33335	20 %	20 %	20 %	40 %	85857875
36	NC_007759	CCTGA	2	10	33585	33594	20 %	20 %	20 %	40 %	85857875
37	NC_007759	CTCCG	2	10	34037	34046	0 %	20 %	20 %	60 %	85857875
38	NC_007759	TTGAT	2	10	38320	38329	20 %	60 %	20 %	0 %	85857880
39	NC_007759	TTCTC	2	10	39574	39583	0 %	60 %	0 %	40 %	85857882
40	NC_007759	GTCGG	2	10	42423	42432	0 %	20 %	60 %	20 %	85857884
41	NC_007759	CGTTT	2	10	45579	45588	0 %	60 %	20 %	20 %	85857887
42	NC_007759	GCTCG	2	10	45987	45996	0 %	20 %	40 %	40 %	85857887
43	NC_007759	CGGTT	2	10	47654	47663	0 %	40 %	40 %	20 %	85857889
44	NC_007759	CAGAG	2	10	50565	50574	40 %	0 %	40 %	20 %	85857892
45	NC_007759	GGGCA	2	10	50763	50772	20 %	0 %	60 %	20 %	85857892
46	NC_007759	CGTAT	2	10	51084	51093	20 %	40 %	20 %	20 %	85857892
47	NC_007759	GTCCG	2	10	51544	51553	0 %	20 %	40 %	40 %	85857892
48	NC_007759	CGGAA	2	10	51912	51921	40 %	0 %	40 %	20 %	85857893
49	NC_007759	CAGGC	2	10	53234	53243	20 %	0 %	40 %	40 %	85857894
50	NC_007759	TCCTT	2	10	55357	55366	0 %	60 %	0 %	40 %	85857896
51	NC_007759	AAAGC	2	10	58816	58825	60 %	0 %	20 %	20 %	85857900
52	NC_007759	CCGCT	2	10	60270	60279	0 %	20 %	20 %	60 %	85857902
53	NC_007759	CCTGC	2	10	64658	64667	0 %	20 %	20 %	60 %	85857905
54	NC_007759	GAATT	2	10	64682	64691	40 %	40 %	20 %	0 %	85857905
55	NC_007759	GATCT	2	10	68942	68951	20 %	40 %	20 %	20 %	85857911
56	NC_007759	GCCGT	2	10	68966	68975	0 %	20 %	40 %	40 %	85857911
57	NC_007759	CATGC	2	10	70525	70534	20 %	20 %	20 %	40 %	85857912
58	NC_007759	GGCAT	2	10	70655	70664	20 %	20 %	40 %	20 %	85857912
59	NC_007759	GCGGT	2	10	79111	79120	0 %	20 %	60 %	20 %	85857921
60	NC_007759	GCCTT	2	10	81239	81248	0 %	40 %	20 %	40 %	85857923
61	NC_007759	GCCGG	2	10	83951	83960	0 %	0 %	60 %	40 %	85857927
62	NC_007759	GACAT	2	10	87007	87016	40 %	20 %	20 %	20 %	85857931
63	NC_007759	AGCAC	2	10	89228	89237	40 %	0 %	20 %	40 %	85857933
64	NC_007759	GAAGC	2	10	91085	91094	40 %	0 %	40 %	20 %	85857935
65	NC_007759	GCAGG	2	10	91479	91488	20 %	0 %	60 %	20 %	85857935
66	NC_007759	TTCCA	2	10	91595	91604	20 %	40 %	0 %	40 %	85857935
67	NC_007759	GATGA	2	10	92257	92266	40 %	20 %	40 %	0 %	85857936
68	NC_007759	GAAAG	2	10	92531	92540	60 %	0 %	40 %	0 %	85857936
69	NC_007759	CGGAC	2	10	94696	94705	20 %	0 %	40 %	40 %	85857938
70	NC_007759	GGCCA	2	10	98004	98013	20 %	0 %	40 %	40 %	85857941
71	NC_007759	CGGAT	2	10	101992	102001	20 %	20 %	40 %	20 %	85857944
72	NC_007759	TGCCG	2	10	103548	103557	0 %	20 %	40 %	40 %	85857945
73	NC_007759	CGCTT	2	10	103744	103753	0 %	40 %	20 %	40 %	85857945
74	NC_007759	CGGAT	2	10	106256	106265	20 %	20 %	40 %	20 %	85857949
75	NC_007759	GAAGG	2	10	109308	109317	40 %	0 %	60 %	0 %	85857951
76	NC_007759	ATTTC	2	10	110194	110203	20 %	60 %	0 %	20 %	85857951
77	NC_007759	TCTTT	2	10	110719	110728	0 %	80 %	0 %	20 %	85857952
78	NC_007759	TTCCC	2	10	111774	111783	0 %	40 %	0 %	60 %	85857953
79	NC_007759	TCCAG	2	10	113099	113108	20 %	20 %	20 %	40 %	85857957
80	NC_007759	ACGGA	2	10	114979	114988	40 %	0 %	40 %	20 %	85857957
81	NC_007759	TCCCG	2	10	118401	118410	0 %	20 %	20 %	60 %	85857962
82	NC_007759	AGCTC	2	10	119354	119363	20 %	20 %	20 %	40 %	85857962
83	NC_007759	GGCAG	2	10	121527	121536	20 %	0 %	60 %	20 %	85857964
84	NC_007759	CACTT	2	10	122191	122200	20 %	40 %	0 %	40 %	85857964
85	NC_007759	GGACA	2	10	124025	124034	40 %	0 %	40 %	20 %	85857965
86	NC_007759	GTTCC	2	10	125605	125614	0 %	40 %	20 %	40 %	85857966
87	NC_007759	GCCGA	2	10	125838	125847	20 %	0 %	40 %	40 %	85857966
88	NC_007759	TCCCG	2	10	126408	126417	0 %	20 %	20 %	60 %	85857966
89	NC_007759	TTCGA	2	10	128219	128228	20 %	40 %	20 %	20 %	85857968
90	NC_007759	TCTTT	2	10	128826	128835	0 %	80 %	0 %	20 %	85857969
91	NC_007759	GGAGA	2	10	134347	134356	40 %	0 %	60 %	0 %	85857975
92	NC_007759	ATCGT	2	10	138249	138258	20 %	40 %	20 %	20 %	85857979
93	NC_007759	CCGTA	2	10	140295	140304	20 %	20 %	20 %	40 %	85857980
94	NC_007759	GGCGG	2	10	141775	141784	0 %	0 %	80 %	20 %	85857982
95	NC_007759	CTTTT	2	10	144018	144027	0 %	80 %	0 %	20 %	85857983
96	NC_007759	TGTAA	2	10	146273	146282	40 %	40 %	20 %	0 %	85857984
97	NC_007759	GCGGT	2	10	147327	147336	0 %	20 %	60 %	20 %	85857985
98	NC_007759	GACGC	2	10	148523	148532	20 %	0 %	40 %	40 %	85857986
99	NC_007759	CGGAA	2	10	150604	150613	40 %	0 %	40 %	20 %	85857988
100	NC_007759	CTTCG	2	10	151370	151379	0 %	40 %	20 %	40 %	85857988
101	NC_007759	TCCAG	2	10	152814	152823	20 %	20 %	20 %	40 %	85857989
102	NC_007759	GTGCA	2	10	153643	153652	20 %	20 %	40 %	20 %	85857990
103	NC_007759	TTCCA	2	10	154553	154562	20 %	40 %	0 %	40 %	85857991
104	NC_007759	TTGAT	2	10	154877	154886	20 %	60 %	20 %	0 %	85857991
105	NC_007759	CATCG	2	10	155329	155338	20 %	20 %	20 %	40 %	85857991
106	NC_007759	TTTTC	2	10	155971	155980	0 %	80 %	0 %	20 %	85857991
107	NC_007759	TGGAT	2	10	159613	159622	20 %	40 %	40 %	0 %	85857996
108	NC_007759	AAAGA	2	10	159908	159917	80 %	0 %	20 %	0 %	85857996
109	NC_007759	TTCTG	2	10	160037	160046	0 %	60 %	20 %	20 %	85857996
110	NC_007759	GATCG	2	10	161129	161138	20 %	20 %	40 %	20 %	85857997
111	NC_007759	TACGG	2	10	162638	162647	20 %	20 %	40 %	20 %	85857999
112	NC_007759	AACGG	2	10	164904	164913	40 %	0 %	40 %	20 %	85858000
113	NC_007759	ACACA	2	10	166612	166621	60 %	0 %	0 %	40 %	85858002
114	NC_007759	CCTGC	2	10	169874	169883	0 %	20 %	20 %	60 %	85858006
115	NC_007759	CGCCT	2	10	171217	171226	0 %	20 %	20 %	60 %	85858008
116	NC_007759	TTTTC	2	10	171288	171297	0 %	80 %	0 %	20 %	85858008
117	NC_007759	CTGGC	2	10	173117	173126	0 %	20 %	40 %	40 %	85858012
118	NC_007759	GAATG	2	10	174262	174271	40 %	20 %	40 %	0 %	85858013
119	NC_007759	CGGAA	2	10	175555	175564	40 %	0 %	40 %	20 %	85858013
120	NC_007759	ATCGG	2	10	177262	177271	20 %	20 %	40 %	20 %	85858015
121	NC_007759	GCAGG	2	10	180335	180344	20 %	0 %	60 %	20 %	85858016
122	NC_007759	TTACC	2	10	184490	184499	20 %	40 %	0 %	40 %	85858019
123	NC_007759	TGATT	2	10	186771	186780	20 %	60 %	20 %	0 %	85858020
124	NC_007759	CTCCA	2	10	189484	189493	20 %	20 %	0 %	60 %	85858024
125	NC_007759	TCCAT	2	10	190261	190270	20 %	40 %	0 %	40 %	85858024
126	NC_007759	CAGGC	2	10	195232	195241	20 %	0 %	40 %	40 %	85858029
127	NC_007759	TTCCG	2	10	195768	195777	0 %	40 %	20 %	40 %	85858030
128	NC_007759	TTCCT	2	10	196054	196063	0 %	60 %	0 %	40 %	85858031
129	NC_007759	CAGCG	2	10	200949	200958	20 %	0 %	40 %	40 %	85858037
130	NC_007759	GTCAT	2	10	202272	202281	20 %	40 %	20 %	20 %	85858038
131	NC_007759	TCCGT	2	10	205051	205060	0 %	40 %	20 %	40 %	85858042
132	NC_007759	ATCGA	2	10	207504	207513	40 %	20 %	20 %	20 %	85858045
133	NC_007759	TCGAT	2	10	207857	207866	20 %	40 %	20 %	20 %	85858046
134	NC_007759	CGGCG	2	10	208154	208163	0 %	0 %	60 %	40 %	85858046
135	NC_007759	ATGGA	2	10	208210	208219	40 %	20 %	40 %	0 %	85858046
136	NC_007759	ACGGG	2	10	208946	208955	20 %	0 %	60 %	20 %	85858047
137	NC_007759	AAAGG	2	10	212800	212809	60 %	0 %	40 %	0 %	85858051
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