MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 55761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007759	TCG	2	6	198209	198214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858033
3502	NC_007759	GCAT	2	8	198230	198237	25 %	25 %	25 %	25 %	85858033
3503	NC_007759	GCC	2	6	198283	198288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858033
3504	NC_007759	CGG	2	6	198342	198347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85858033
3505	NC_007759	GCA	2	6	198435	198440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858033
3506	NC_007759	GGAA	2	8	198442	198449	50 %	0 %	50 %	0 %	85858033
3507	NC_007759	TTTCTT	2	12	198492	198503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	85858033
3508	NC_007759	CCG	2	6	198521	198526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858033
3509	NC_007759	CAC	2	6	198541	198546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85858033
3510	NC_007759	CCG	2	6	198606	198611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858033
3511	NC_007759	CTT	2	6	198651	198656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858033
3512	NC_007759	T	6	6	198655	198660	0 %	100 %	0 %	0 %	85858033
3513	NC_007759	AATC	2	8	198979	198986	50 %	25 %	0 %	25 %	85858034
3514	NC_007759	CAG	3	9	199058	199066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858034
3515	NC_007759	TGA	2	6	199102	199107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858034
3516	NC_007759	T	6	6	199171	199176	0 %	100 %	0 %	0 %	85858034
3517	NC_007759	TCT	2	6	199525	199530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858035
3518	NC_007759	ATG	2	6	199562	199567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858035
3519	NC_007759	CGA	2	6	199887	199892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858036
3520	NC_007759	GCA	2	6	200026	200031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858036
3521	NC_007759	GA	3	6	200141	200146	50 %	0 %	50 %	0 %	85858036
3522	NC_007759	CGG	2	6	200489	200494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85858037
3523	NC_007759	CAT	2	6	200532	200537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858037
3524	NC_007759	GAA	2	6	200589	200594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858037
3525	NC_007759	CTGG	2	8	200624	200631	0 %	25 %	50 %	25 %	85858037
3526	NC_007759	TGA	2	6	200708	200713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858037
3527	NC_007759	CTGCAC	2	12	200729	200740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858037
3528	NC_007759	GAA	2	6	200754	200759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858037
3529	NC_007759	ACG	2	6	200800	200805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858037
3530	NC_007759	GAA	2	6	200819	200824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858037
3531	NC_007759	CTCC	3	12	200826	200837	0 %	25 %	0 %	75 %	85858037
3532	NC_007759	GGT	2	6	200846	200851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85858037
3533	NC_007759	GTC	2	6	200883	200888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858037
3534	NC_007759	AAC	2	6	200919	200924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85858037
3535	NC_007759	GAA	2	6	200925	200930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858037
3536	NC_007759	CAGCG	2	10	200949	200958	20 %	0 %	40 %	40 %	85858037
3537	NC_007759	GTC	2	6	200988	200993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858037
3538	NC_007759	CGA	2	6	201032	201037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858037
3539	NC_007759	CAA	2	6	201044	201049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85858037
3540	NC_007759	GCT	2	6	201338	201343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858037
3541	NC_007759	AGAC	2	8	201380	201387	50 %	0 %	25 %	25 %	85858037
3542	NC_007759	TCCTGA	2	12	201434	201445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858037
3543	NC_007759	GGGCCA	2	12	201475	201486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85858037
3544	NC_007759	TGATGC	2	12	201545	201556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858037
3545	NC_007759	A	7	7	201560	201566	100 %	0 %	0 %	0 %	85858037
3546	NC_007759	AAG	2	6	201640	201645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858037
3547	NC_007759	GAC	2	6	201756	201761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858037
3548	NC_007759	GC	3	6	201795	201800	0 %	0 %	50 %	50 %	85858037
3549	NC_007759	TCCT	2	8	202128	202135	0 %	50 %	0 %	50 %	85858038
3550	NC_007759	T	6	6	202148	202153	0 %	100 %	0 %	0 %	85858038
3551	NC_007759	T	7	7	202208	202214	0 %	100 %	0 %	0 %	85858038
3552	NC_007759	A	7	7	202222	202228	100 %	0 %	0 %	0 %	85858038
3553	NC_007759	A	6	6	202232	202237	100 %	0 %	0 %	0 %	85858038
3554	NC_007759	ACC	2	6	202252	202257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85858038
3555	NC_007759	AGAA	2	8	202259	202266	75 %	0 %	25 %	0 %	85858038
3556	NC_007759	GTCAT	2	10	202272	202281	20 %	40 %	20 %	20 %	85858038
3557	NC_007759	ATCC	2	8	202297	202304	25 %	25 %	0 %	50 %	85858038
3558	NC_007759	CAG	2	6	202555	202560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858039
3559	NC_007759	ATGAAT	2	12	202613	202624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	85858039
3560	NC_007759	AGG	2	6	202730	202735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858039
3561	NC_007759	TTC	2	6	202756	202761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858039
3562	NC_007759	TGTCGA	2	12	202770	202781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858039
3563	NC_007759	GAA	2	6	202794	202799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858039
3564	NC_007759	CTG	2	6	202810	202815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858039
3565	NC_007759	TGC	2	6	202889	202894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858039
3566	NC_007759	TGA	2	6	202937	202942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858039
3567	NC_007759	GAT	2	6	202944	202949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858039
3568	NC_007759	GTG	2	6	202966	202971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85858039
3569	NC_007759	GCC	2	6	202972	202977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858039
3570	NC_007759	GGA	2	6	203013	203018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858039
3571	NC_007759	CTC	2	6	203091	203096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85858039
3572	NC_007759	TGG	2	6	203198	203203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85858039
3573	NC_007759	GAA	2	6	203257	203262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858039
3574	NC_007759	CGC	3	9	203277	203285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858039
3575	NC_007759	AGG	2	6	203288	203293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858039
3576	NC_007759	AAGA	2	8	203304	203311	75 %	0 %	25 %	0 %	85858039
3577	NC_007759	GAG	3	9	203528	203536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858040
3578	NC_007759	GTC	2	6	203575	203580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858040
3579	NC_007759	T	6	6	203612	203617	0 %	100 %	0 %	0 %	85858040
3580	NC_007759	ATTC	2	8	203652	203659	25 %	50 %	0 %	25 %	85858040
3581	NC_007759	GA	3	6	203714	203719	50 %	0 %	50 %	0 %	85858040
3582	NC_007759	CCAGAT	2	12	203741	203752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858040
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3584	NC_007759	GAT	2	6	203772	203777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858040
3585	NC_007759	TAA	2	6	203809	203814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85858040
3586	NC_007759	CTGG	2	8	203862	203869	0 %	25 %	50 %	25 %	85858040
3587	NC_007759	GAT	2	6	203910	203915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858040
3588	NC_007759	AAT	2	6	203934	203939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85858040
3589	NC_007759	T	8	8	203987	203994	0 %	100 %	0 %	0 %	85858040
3590	NC_007759	TTC	2	6	204235	204240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858041
3591	NC_007759	GTC	2	6	204242	204247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858041
3592	NC_007759	TCGT	2	8	204259	204266	0 %	50 %	25 %	25 %	85858041
3593	NC_007759	CAG	2	6	204333	204338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858041
3594	NC_007759	CGC	2	6	204358	204363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858041
3595	NC_007759	TGT	2	6	204377	204382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	85858041
3596	NC_007759	TCA	2	6	204446	204451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858041
3597	NC_007759	CCG	2	6	204497	204502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858041
3598	NC_007759	CAT	2	6	204621	204626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858041
3599	NC_007759	C	7	7	204650	204656	0 %	0 %	0 %	100 %	85858041
3600	NC_007759	GAG	2	6	204791	204796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858041
3601	NC_007759	T	6	6	204879	204884	0 %	100 %	0 %	0 %	85858042
3602	NC_007759	TCT	2	6	204912	204917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858042
3603	NC_007759	CTG	2	6	204944	204949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858042
3604	NC_007759	TCCGT	2	10	205051	205060	0 %	40 %	20 %	40 %	85858042
3605	NC_007759	GAA	2	6	205541	205546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858043
3606	NC_007759	A	9	9	205545	205553	100 %	0 %	0 %	0 %	85858043
3607	NC_007759	GAT	2	6	205622	205627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858043
3608	NC_007759	ATC	2	6	205634	205639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858043
3609	NC_007759	TC	3	6	205703	205708	0 %	50 %	0 %	50 %	85858043
3610	NC_007759	GGAA	2	8	205731	205738	50 %	0 %	50 %	0 %	85858043
3611	NC_007759	CTG	2	6	205835	205840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858043
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3613	NC_007759	GCGG	2	8	206021	206028	0 %	0 %	75 %	25 %	85858043
3614	NC_007759	CTT	2	6	206060	206065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858043
3615	NC_007759	CTG	2	6	206165	206170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858043
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3619	NC_007759	CAGG	2	8	206337	206344	25 %	0 %	50 %	25 %	85858043
3620	NC_007759	GGA	2	6	206408	206413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858043
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3623	NC_007759	GCC	3	9	206534	206542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85858043
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3993	NC_007759	CAG	2	6	226392	226397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858064
3994	NC_007759	CGG	3	9	226402	226410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85858064
3995	NC_007759	CCA	2	6	226433	226438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85858064
3996	NC_007759	T	6	6	226480	226485	0 %	100 %	0 %	0 %	85858064
3997	NC_007759	AGC	2	6	226534	226539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858064
3998	NC_007759	CGGC	2	8	226564	226571	0 %	0 %	50 %	50 %	85858064
3999	NC_007759	ACC	2	6	226624	226629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85858064
4000	NC_007759	GAT	2	6	226680	226685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85858064

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