MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 plasmid pSR35

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007678	AT	3	6	622	627	50 %	50 %	0 %	0 %	83816884
2	NC_007678	CT	3	6	1836	1841	0 %	50 %	0 %	50 %	83816880
3	NC_007678	GC	3	6	2327	2332	0 %	0 %	50 %	50 %	83816880
4	NC_007678	AG	3	6	2579	2584	50 %	0 %	50 %	0 %	83816880
5	NC_007678	TC	3	6	3486	3491	0 %	50 %	0 %	50 %	83816872
6	NC_007678	TC	3	6	4493	4498	0 %	50 %	0 %	50 %	83816872
7	NC_007678	CT	3	6	5388	5393	0 %	50 %	0 %	50 %	83816872
8	NC_007678	GC	3	6	6764	6769	0 %	0 %	50 %	50 %	83816885
9	NC_007678	GA	3	6	6866	6871	50 %	0 %	50 %	0 %	83816885
10	NC_007678	AG	4	8	7144	7151	50 %	0 %	50 %	0 %	83816885
11	NC_007678	AG	3	6	7416	7421	50 %	0 %	50 %	0 %	83816885
12	NC_007678	TC	3	6	10146	10151	0 %	50 %	0 %	50 %	83816869
13	NC_007678	GT	3	6	11314	11319	0 %	50 %	50 %	0 %	83816861
14	NC_007678	GA	3	6	11677	11682	50 %	0 %	50 %	0 %	83816861
15	NC_007678	AC	3	6	14031	14036	50 %	0 %	0 %	50 %	83816862
16	NC_007678	TC	3	6	15458	15463	0 %	50 %	0 %	50 %	83816886
17	NC_007678	GC	3	6	15687	15692	0 %	0 %	50 %	50 %	83816886
18	NC_007678	TC	3	6	16082	16087	0 %	50 %	0 %	50 %	83816865
19	NC_007678	CG	3	6	17024	17029	0 %	0 %	50 %	50 %	83816864
20	NC_007678	CT	3	6	17597	17602	0 %	50 %	0 %	50 %	83816864
21	NC_007678	TC	3	6	17975	17980	0 %	50 %	0 %	50 %	83816866
22	NC_007678	GC	3	6	18058	18063	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
23	NC_007678	CG	3	6	18389	18394	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
24	NC_007678	GA	3	6	18456	18461	50 %	0 %	50 %	0 %	83816858
25	NC_007678	GC	3	6	18753	18758	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
26	NC_007678	GC	3	6	19113	19118	0 %	0 %	50 %	50 %	83816858
27	NC_007678	GA	3	6	19907	19912	50 %	0 %	50 %	0 %	83816859
28	NC_007678	GC	4	8	20052	20059	0 %	0 %	50 %	50 %	83816859
29	NC_007678	TC	3	6	20408	20413	0 %	50 %	0 %	50 %	83816883
30	NC_007678	TC	3	6	20420	20425	0 %	50 %	0 %	50 %	83816883
31	NC_007678	CG	3	6	20745	20750	0 %	0 %	50 %	50 %	83816883
32	NC_007678	CT	3	6	21521	21526	0 %	50 %	0 %	50 %	83816874
33	NC_007678	TC	3	6	21587	21592	0 %	50 %	0 %	50 %	83816874
34	NC_007678	AT	3	6	21763	21768	50 %	50 %	0 %	0 %	83816874
35	NC_007678	GA	3	6	22077	22082	50 %	0 %	50 %	0 %	83816874
36	NC_007678	CG	3	6	22331	22336	0 %	0 %	50 %	50 %	83816876
37	NC_007678	GC	3	6	22351	22356	0 %	0 %	50 %	50 %	83816876
38	NC_007678	GA	3	6	22358	22363	50 %	0 %	50 %	0 %	83816876
39	NC_007678	CG	3	6	22442	22447	0 %	0 %	50 %	50 %	83816876
40	NC_007678	GC	3	6	23928	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	83816881
41	NC_007678	TA	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	83816871
42	NC_007678	TC	3	6	26252	26257	0 %	50 %	0 %	50 %	83816871
43	NC_007678	CT	3	6	26525	26530	0 %	50 %	0 %	50 %	83816871
44	NC_007678	GA	3	6	26809	26814	50 %	0 %	50 %	0 %	83816871
45	NC_007678	GA	3	6	26899	26904	50 %	0 %	50 %	0 %	83816871
46	NC_007678	CA	3	6	27071	27076	50 %	0 %	0 %	50 %	83816871
47	NC_007678	AT	3	6	27302	27307	50 %	50 %	0 %	0 %	83816871
48	NC_007678	GT	3	6	27403	27408	0 %	50 %	50 %	0 %	83816871
49	NC_007678	CT	3	6	30016	30021	0 %	50 %	0 %	50 %	83816877
50	NC_007678	TG	3	6	30366	30371	0 %	50 %	50 %	0 %	83816877
51	NC_007678	GC	3	6	30448	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	83816877
52	NC_007678	GA	3	6	31347	31352	50 %	0 %	50 %	0 %	83816878
53	NC_007678	CT	3	6	31503	31508	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
54	NC_007678	CG	3	6	31695	31700	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
55	NC_007678	GC	3	6	31724	31729	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
56	NC_007678	TC	3	6	31970	31975	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
57	NC_007678	TC	3	6	32657	32662	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.