MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 plasmid pSR35

Total Repeats: 643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007678	CGGC	2	8	28281	28288	0 %	0 %	50 %	50 %	83816888
502	NC_007678	CTT	2	6	28314	28319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816888
503	NC_007678	CTT	2	6	28358	28363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816888
504	NC_007678	ATC	2	6	28437	28442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816888
505	NC_007678	ATC	2	6	28452	28457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816888
506	NC_007678	CTT	2	6	28516	28521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816889
507	NC_007678	GAGC	2	8	28614	28621	25 %	0 %	50 %	25 %	83816889
508	NC_007678	TCC	2	6	28659	28664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816889
509	NC_007678	CGG	2	6	28706	28711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816889
510	NC_007678	CTA	2	6	28716	28721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816889
511	NC_007678	ATC	2	6	28775	28780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816889
512	NC_007678	GGC	2	6	28804	28809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816889
513	NC_007678	TCT	2	6	28815	28820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816889
514	NC_007678	TTC	2	6	28880	28885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816889
515	NC_007678	GCT	2	6	28899	28904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816889
516	NC_007678	CTC	2	6	28927	28932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816889
517	NC_007678	TAG	2	6	29091	29096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816889
518	NC_007678	ACTC	2	8	29277	29284	25 %	25 %	0 %	50 %	83816873
519	NC_007678	CGT	2	6	29350	29355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816873
520	NC_007678	CCG	2	6	29385	29390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816873
521	NC_007678	GCTTGC	2	12	29461	29472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816873
522	NC_007678	CGA	2	6	29509	29514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816873
523	NC_007678	GGT	2	6	29540	29545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816873
524	NC_007678	TGGAG	2	10	29673	29682	20 %	20 %	60 %	0 %	83816877
525	NC_007678	GCCA	2	8	29700	29707	25 %	0 %	25 %	50 %	83816877
526	NC_007678	GGC	2	6	29708	29713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816877
527	NC_007678	GTC	2	6	29728	29733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
528	NC_007678	TCG	2	6	29821	29826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
529	NC_007678	CGC	2	6	29930	29935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816877
530	NC_007678	GCA	2	6	29938	29943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816877
531	NC_007678	CGCGG	2	10	29951	29960	0 %	0 %	60 %	40 %	83816877
532	NC_007678	CCGC	2	8	30006	30013	0 %	0 %	25 %	75 %	83816877
533	NC_007678	CT	3	6	30016	30021	0 %	50 %	0 %	50 %	83816877
534	NC_007678	CGA	2	6	30082	30087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816877
535	NC_007678	CTT	2	6	30122	30127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816877
536	NC_007678	AGT	2	6	30251	30256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816877
537	NC_007678	CGAG	2	8	30269	30276	25 %	0 %	50 %	25 %	83816877
538	NC_007678	CCA	2	6	30322	30327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83816877
539	NC_007678	CGG	2	6	30353	30358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816877
540	NC_007678	TG	3	6	30366	30371	0 %	50 %	50 %	0 %	83816877
541	NC_007678	TGG	2	6	30373	30378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816877
542	NC_007678	GTC	2	6	30417	30422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
543	NC_007678	GC	3	6	30448	30453	0 %	0 %	50 %	50 %	83816877
544	NC_007678	TCC	2	6	30484	30489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816877
545	NC_007678	GCC	2	6	30519	30524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816877
546	NC_007678	CGA	2	6	30578	30583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816877
547	NC_007678	TCG	2	6	30631	30636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
548	NC_007678	CCT	2	6	30680	30685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816877
549	NC_007678	GGGTC	2	10	30689	30698	0 %	20 %	60 %	20 %	83816877
550	NC_007678	GCC	2	6	30745	30750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816877
551	NC_007678	CTC	2	6	30758	30763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816877
552	NC_007678	GAG	2	6	30771	30776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816877
553	NC_007678	TGT	2	6	30822	30827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83816877
554	NC_007678	AGG	2	6	30862	30867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816877
555	NC_007678	CGT	2	6	30875	30880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
556	NC_007678	GTC	2	6	30900	30905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
557	NC_007678	TGG	2	6	30936	30941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816877
558	NC_007678	CGG	2	6	30948	30953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816877
559	NC_007678	AGC	2	6	30985	30990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816877
560	NC_007678	GCT	2	6	31001	31006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816877
561	NC_007678	TCC	2	6	31204	31209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816878
562	NC_007678	CGG	2	6	31269	31274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816878
563	NC_007678	GCCA	2	8	31303	31310	25 %	0 %	25 %	50 %	83816878
564	NC_007678	GA	3	6	31347	31352	50 %	0 %	50 %	0 %	83816878
565	NC_007678	CCATC	2	10	31382	31391	20 %	20 %	0 %	60 %	83816878
566	NC_007678	CTC	2	6	31398	31403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816878
567	NC_007678	CCT	2	6	31406	31411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816878
568	NC_007678	CGG	2	6	31423	31428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816878
569	NC_007678	CGA	2	6	31436	31441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816878
570	NC_007678	GTC	3	9	31461	31469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
571	NC_007678	CTG	2	6	31482	31487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
572	NC_007678	CT	3	6	31503	31508	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
573	NC_007678	GCG	2	6	31535	31540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816878
574	NC_007678	CGT	2	6	31568	31573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
575	NC_007678	GCG	2	6	31663	31668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816878
576	NC_007678	CG	3	6	31695	31700	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
577	NC_007678	GC	3	6	31724	31729	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
578	NC_007678	ATCTT	2	10	31759	31768	20 %	60 %	0 %	20 %	83816878
579	NC_007678	TCG	2	6	31799	31804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
580	NC_007678	GAG	2	6	31813	31818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816878
581	NC_007678	CCGG	2	8	31843	31850	0 %	0 %	50 %	50 %	83816878
582	NC_007678	TCGA	2	8	31912	31919	25 %	25 %	25 %	25 %	83816878
583	NC_007678	GCG	2	6	31938	31943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816878
584	NC_007678	TC	3	6	31970	31975	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
585	NC_007678	ACG	2	6	31990	31995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816878
586	NC_007678	GTCG	2	8	32031	32038	0 %	25 %	50 %	25 %	83816878
587	NC_007678	GTC	2	6	32088	32093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
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589	NC_007678	GGT	2	6	32196	32201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816878
590	NC_007678	GCC	2	6	32209	32214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816878
591	NC_007678	CGA	2	6	32282	32287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816878
592	NC_007678	TCA	2	6	32335	32340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816878
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594	NC_007678	GTT	2	6	32357	32362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83816878
595	NC_007678	GGC	2	6	32522	32527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83816878
596	NC_007678	CGT	2	6	32577	32582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
597	NC_007678	GTGGG	2	10	32591	32600	0 %	20 %	80 %	0 %	83816878
598	NC_007678	TC	3	6	32657	32662	0 %	50 %	0 %	50 %	83816878
599	NC_007678	GCT	2	6	32720	32725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
600	NC_007678	TAAG	2	8	32742	32749	50 %	25 %	25 %	0 %	83816878
601	NC_007678	GCC	2	6	32793	32798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816878
602	NC_007678	CTC	2	6	32973	32978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816878
603	NC_007678	AAGG	2	8	33003	33010	50 %	0 %	50 %	0 %	83816878
604	NC_007678	TTGC	2	8	33051	33058	0 %	50 %	25 %	25 %	83816878
605	NC_007678	CAG	2	6	33191	33196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816878
606	NC_007678	GGGCA	2	10	33213	33222	20 %	0 %	60 %	20 %	83816878
607	NC_007678	TCG	2	6	33307	33312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
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609	NC_007678	CTG	2	6	33328	33333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
610	NC_007678	GTT	2	6	33357	33362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83816878
611	NC_007678	GTC	2	6	33429	33434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
612	NC_007678	CCA	2	6	33476	33481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83816878
613	NC_007678	TGA	2	6	33509	33514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83816878
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615	NC_007678	GTC	2	6	33591	33596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816878
616	NC_007678	TCA	2	6	33607	33612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816878
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618	NC_007678	CAGCT	2	10	33905	33914	20 %	20 %	20 %	40 %	83816870
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621	NC_007678	TGG	2	6	34012	34017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83816870
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623	NC_007678	GAG	2	6	34201	34206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816870
624	NC_007678	AGA	2	6	34217	34222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816870
625	NC_007678	GCC	2	6	34294	34299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816870
626	NC_007678	CTC	2	6	34324	34329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816870
627	NC_007678	CCG	2	6	34347	34352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816870
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