MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber DSM 13855 chromosome

Total Repeats: 56924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007677	CCG	2	6	12	17	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
2	NC_007677	CAT	2	6	43	48	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83815237
3	NC_007677	GCC	2	6	63	68	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
4	NC_007677	GGA	2	6	112	117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
5	NC_007677	GAC	2	6	122	127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
6	NC_007677	TAC	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83815237
7	NC_007677	GAG	2	6	179	184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
8	NC_007677	ACG	2	6	249	254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
9	NC_007677	GAC	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
10	NC_007677	GGA	2	6	277	282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
11	NC_007677	GCC	2	6	373	378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
12	NC_007677	TCG	2	6	383	388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815237
13	NC_007677	CGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815237
14	NC_007677	CGA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
15	NC_007677	CGA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
16	NC_007677	GCC	2	6	617	622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
17	NC_007677	CGG	2	6	676	681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
18	NC_007677	TCT	2	6	756	761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815237
19	NC_007677	CAC	2	6	781	786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83815237
20	NC_007677	GAC	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
21	NC_007677	CGG	2	6	883	888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
22	NC_007677	AGG	2	6	903	908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
23	NC_007677	TTC	2	6	911	916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815237
24	NC_007677	CGG	2	6	963	968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
25	NC_007677	CCG	2	6	974	979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
26	NC_007677	GAG	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
27	NC_007677	CCG	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
28	NC_007677	CCG	2	6	1081	1086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
29	NC_007677	GAC	2	6	1097	1102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
30	NC_007677	CGA	2	6	1114	1119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
31	NC_007677	GCC	2	6	1274	1279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815237
32	NC_007677	CGA	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
33	NC_007677	AAG	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83815237
34	NC_007677	CGG	2	6	1450	1455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815237
35	NC_007677	CAA	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83815237
36	NC_007677	GGA	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815237
37	NC_007677	GAC	2	6	1511	1516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815237
38	NC_007677	CCT	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814447
39	NC_007677	ATC	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814447
40	NC_007677	CGG	2	6	1989	1994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814447
41	NC_007677	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814447
42	NC_007677	ACG	2	6	2052	2057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
43	NC_007677	GGA	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
44	NC_007677	GCA	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
45	NC_007677	CCT	2	6	2119	2124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814447
46	NC_007677	ATG	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814447
47	NC_007677	GAG	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
48	NC_007677	GGT	2	6	2224	2229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814447
49	NC_007677	CCA	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814447
50	NC_007677	GGA	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
51	NC_007677	CGA	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
52	NC_007677	GAC	2	6	2372	2377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
53	NC_007677	CGA	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
54	NC_007677	GTC	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814447
55	NC_007677	CTC	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814447
56	NC_007677	GAG	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814447
57	NC_007677	CGA	2	6	2719	2724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
58	NC_007677	GGT	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83814447
59	NC_007677	CGA	3	9	2785	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814447
60	NC_007677	TCA	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814447
61	NC_007677	CTG	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816215
62	NC_007677	ACG	2	6	3018	3023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816215
63	NC_007677	AAC	2	6	3189	3194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	83816215
64	NC_007677	TCG	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816215
65	NC_007677	GCC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816215
66	NC_007677	CGA	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816215
67	NC_007677	GCA	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816215
68	NC_007677	CGT	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83816215
69	NC_007677	ACT	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83816215
70	NC_007677	AGG	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816215
71	NC_007677	AAG	2	6	3475	3480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83816215
72	NC_007677	CCG	2	6	3595	3600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816215
73	NC_007677	CCG	2	6	3625	3630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83816215
74	NC_007677	TCC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83816215
75	NC_007677	TTC	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816215
76	NC_007677	TTC	2	6	4291	4296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815766
77	NC_007677	CGG	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815766
78	NC_007677	TCG	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815766
79	NC_007677	TCT	2	6	4700	4705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83815766
80	NC_007677	CCG	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815766
81	NC_007677	GGA	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815766
82	NC_007677	CCT	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814655
83	NC_007677	CGA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814655
84	NC_007677	ACC	2	6	5417	5422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814655
85	NC_007677	ATC	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814655
86	NC_007677	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814655
87	NC_007677	TCG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814655
88	NC_007677	GTC	2	6	5839	5844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814655
89	NC_007677	TCT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83814655
90	NC_007677	AGC	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814655
91	NC_007677	ATG	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	83814655
92	NC_007677	TCG	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814221
93	NC_007677	CAC	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814221
94	NC_007677	CGC	2	6	6278	6283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814221
95	NC_007677	GAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814221
96	NC_007677	CCT	2	6	6307	6312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814221
97	NC_007677	CAC	2	6	6404	6409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814221
98	NC_007677	TCG	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814221
99	NC_007677	TCC	2	6	6789	6794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814221
100	NC_007677	CAC	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814221
101	NC_007677	CGG	2	6	6946	6951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814221
102	NC_007677	CAC	2	6	6986	6991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83814221
103	NC_007677	CCG	2	6	7220	7225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815955
104	NC_007677	GTT	2	6	7282	7287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	83815955
105	NC_007677	CGA	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815955
106	NC_007677	CTG	2	6	7606	7611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815955
107	NC_007677	CTC	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83815955
108	NC_007677	CGT	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815955
109	NC_007677	TCG	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815955
110	NC_007677	CAC	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83815955
111	NC_007677	GGC	2	6	7780	7785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815955
112	NC_007677	GAC	2	6	8149	8154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815163
113	NC_007677	GAG	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83815163
114	NC_007677	GCG	2	6	8228	8233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83815163
115	NC_007677	GCA	2	6	8259	8264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815163
116	NC_007677	CGA	2	6	8340	8345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815163
117	NC_007677	GCC	2	6	8350	8355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815163
118	NC_007677	ACG	2	6	8366	8371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83815163
119	NC_007677	ATC	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83815163
120	NC_007677	GCC	2	6	8589	8594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814509
121	NC_007677	AGG	2	6	8614	8619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814509
122	NC_007677	GGC	2	6	8630	8635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83814509
123	NC_007677	GAC	2	6	8729	8734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83814509
124	NC_007677	CGT	2	6	8745	8750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83814509
125	NC_007677	CAT	2	6	8840	8845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83814509
126	NC_007677	CCT	2	6	8906	8911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	83814509
127	NC_007677	GAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	83814509
128	NC_007677	CCG	2	6	8986	8991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83814509
129	NC_007677	GGA	2	6	9017	9022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83814509
130	NC_007677	TTC	2	6	9147	9152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816549
131	NC_007677	TCT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	83816549
132	NC_007677	GAG	2	6	9168	9173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	83816549
133	NC_007677	GAC	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83816549
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254	NC_007677	TCG	2	6	17407	17412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815143
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256	NC_007677	ATT	2	6	17496	17501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	83815143
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258	NC_007677	GCT	2	6	17512	17517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815143
259	NC_007677	TCA	2	6	17578	17583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	83815143
260	NC_007677	CTG	2	6	17595	17600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83815143
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263	NC_007677	CCG	2	6	17671	17676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83815143
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