MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_007613	ACGGG	2	10	165751	165760	20 %	0 %	60 %	20 %	82542760
3003	NC_007613	GAA	2	6	165761	165766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542760
3004	NC_007613	GCG	2	6	165781	165786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542760
3005	NC_007613	TGA	2	6	165852	165857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542760
3006	NC_007613	GTG	2	6	165913	165918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542760
3007	NC_007613	TTA	2	6	165967	165972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542760
3008	NC_007613	GAA	2	6	165980	165985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542760
3009	NC_007613	AGC	2	6	166060	166065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542760
3010	NC_007613	CGA	2	6	166066	166071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542760
3011	NC_007613	TG	3	6	166082	166087	0 %	50 %	50 %	0 %	82542760
3012	NC_007613	AGC	2	6	166131	166136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542760
3013	NC_007613	ATC	2	6	166140	166145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542760
3014	NC_007613	TGG	2	6	166194	166199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542760
3015	NC_007613	T	6	6	166259	166264	0 %	100 %	0 %	0 %	82542760
3016	NC_007613	TAAA	2	8	166287	166294	75 %	25 %	0 %	0 %	82542760
3017	NC_007613	CTGC	2	8	166331	166338	0 %	25 %	25 %	50 %	82542760
3018	NC_007613	ATT	2	6	166366	166371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542760
3019	NC_007613	TCT	2	6	166396	166401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542760
3020	NC_007613	TA	3	6	166407	166412	50 %	50 %	0 %	0 %	82542760
3021	NC_007613	AGC	2	6	166455	166460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542760
3022	NC_007613	ATT	2	6	166492	166497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542760
3023	NC_007613	TTA	2	6	166514	166519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542760
3024	NC_007613	ATT	2	6	166686	166691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542760
3025	NC_007613	GCC	2	6	166698	166703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542760
3026	NC_007613	TGC	2	6	166704	166709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542760
3027	NC_007613	GACC	2	8	166729	166736	25 %	0 %	25 %	50 %	82542760
3028	NC_007613	A	7	7	166916	166922	100 %	0 %	0 %	0 %	82542761
3029	NC_007613	CT	3	6	166976	166981	0 %	50 %	0 %	50 %	82542761
3030	NC_007613	CGG	2	6	166986	166991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542761
3031	NC_007613	CTT	2	6	166998	167003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542761
3032	NC_007613	CAG	2	6	167018	167023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542761
3033	NC_007613	CGC	2	6	167106	167111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542761
3034	NC_007613	CAG	2	6	167129	167134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542761
3035	NC_007613	TTC	2	6	167135	167140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542761
3036	NC_007613	TGA	2	6	167143	167148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542761
3037	NC_007613	TGG	2	6	167218	167223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542761
3038	NC_007613	TCA	2	6	167262	167267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542761
3039	NC_007613	GTC	2	6	167288	167293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542761
3040	NC_007613	CAA	2	6	167296	167301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542761
3041	NC_007613	GTT	2	6	167306	167311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542761
3042	NC_007613	GGT	2	6	167621	167626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542761
3043	NC_007613	CGG	2	6	167686	167691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542761
3044	NC_007613	ATCGGT	2	12	167696	167707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82542761
3045	NC_007613	TGG	2	6	167751	167756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542761
3046	NC_007613	TAT	2	6	167788	167793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542761
3047	NC_007613	TCC	2	6	167879	167884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542761
3048	NC_007613	GTGAT	2	10	167910	167919	20 %	40 %	40 %	0 %	82542761
3049	NC_007613	CAG	2	6	167944	167949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542761
3050	NC_007613	GCA	2	6	167991	167996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542761
3051	NC_007613	GCA	2	6	168052	168057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542761
3052	NC_007613	AGC	2	6	168059	168064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542761
3053	NC_007613	CAA	2	6	168121	168126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542761
3054	NC_007613	AAC	2	6	168152	168157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542761
3055	NC_007613	GAA	2	6	168193	168198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542761
3056	NC_007613	GTGAT	2	10	168201	168210	20 %	40 %	40 %	0 %	82542761
3057	NC_007613	CAG	2	6	168224	168229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542761
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3059	NC_007613	TGGC	3	12	168493	168504	0 %	25 %	50 %	25 %	161984988
3060	NC_007613	CAT	2	6	168551	168556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984988
3061	NC_007613	GCG	2	6	168604	168609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984988
3062	NC_007613	GTC	2	6	168657	168662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984988
3063	NC_007613	ATG	2	6	168819	168824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984988
3064	NC_007613	TTG	2	6	168849	168854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984988
3065	NC_007613	GGA	2	6	168875	168880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161984988
3066	NC_007613	TGA	2	6	168886	168891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984988
3067	NC_007613	GATC	2	8	168950	168957	25 %	25 %	25 %	25 %	161984988
3068	NC_007613	TCAA	2	8	168958	168965	50 %	25 %	0 %	25 %	161984988
3069	NC_007613	GTG	2	6	168972	168977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984988
3070	NC_007613	TTG	2	6	168982	168987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161984988
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3084	NC_007613	TGA	2	6	169586	169591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161984988
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3088	NC_007613	GTC	2	6	169804	169809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542763
3089	NC_007613	TCA	2	6	169868	169873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542763
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3091	NC_007613	CGA	2	6	169938	169943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542763
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3095	NC_007613	CCACG	2	10	170336	170345	20 %	0 %	20 %	60 %	161984987
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3101	NC_007613	ACA	2	6	170651	170656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984987
3102	NC_007613	T	7	7	170698	170704	0 %	100 %	0 %	0 %	161984987
3103	NC_007613	G	6	6	170765	170770	0 %	0 %	100 %	0 %	161984987
3104	NC_007613	ATA	2	6	170813	170818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161984987
3105	NC_007613	CGC	2	6	170825	170830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984987
3106	NC_007613	TGC	2	6	170946	170951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984987
3107	NC_007613	A	6	6	170961	170966	100 %	0 %	0 %	0 %	161984987
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3110	NC_007613	GCA	2	6	171155	171160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542765
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3118	NC_007613	CCG	2	6	171635	171640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542765
3119	NC_007613	TGG	2	6	171642	171647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542765
3120	NC_007613	CTT	2	6	171662	171667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542765
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3490	NC_007613	CG	3	6	192980	192985	0 %	0 %	50 %	50 %	82542783
3491	NC_007613	TGG	2	6	193043	193048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542783
3492	NC_007613	TGG	2	6	193082	193087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542783
3493	NC_007613	GAA	2	6	193117	193122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542783
3494	NC_007613	GCA	2	6	193146	193151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542783
3495	NC_007613	CAT	2	6	193188	193193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542783
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