MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_007613	GTC	2	6	112143	112148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2002	NC_007613	AGC	2	6	112158	112163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2003	NC_007613	CT	3	6	112199	112204	0 %	50 %	0 %	50 %	82542717
2004	NC_007613	TGGGGC	2	12	112260	112271	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82542717
2005	NC_007613	ATC	2	6	112499	112504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542717
2006	NC_007613	GCTG	2	8	112532	112539	0 %	25 %	50 %	25 %	82542717
2007	NC_007613	CTG	2	6	112580	112585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2008	NC_007613	TGA	2	6	112617	112622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542717
2009	NC_007613	CTT	2	6	112687	112692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542717
2010	NC_007613	GCA	2	6	112712	112717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2011	NC_007613	GACTG	2	10	112727	112736	20 %	20 %	40 %	20 %	82542717
2012	NC_007613	GTG	2	6	112761	112766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542717
2013	NC_007613	GAA	2	6	112777	112782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542717
2014	NC_007613	GCGT	2	8	112926	112933	0 %	25 %	50 %	25 %	82542717
2015	NC_007613	GCAC	2	8	113032	113039	25 %	0 %	25 %	50 %	82542717
2016	NC_007613	GC	3	6	113124	113129	0 %	0 %	50 %	50 %	82542717
2017	NC_007613	AGAGC	2	10	113137	113146	40 %	0 %	40 %	20 %	82542717
2018	NC_007613	TCGT	2	8	113172	113179	0 %	50 %	25 %	25 %	82542717
2019	NC_007613	GAA	2	6	113197	113202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542717
2020	NC_007613	ATC	2	6	113231	113236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542717
2021	NC_007613	CGA	2	6	113239	113244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2022	NC_007613	CAG	2	6	113306	113311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2023	NC_007613	AGA	2	6	113350	113355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542717
2024	NC_007613	GTT	2	6	113403	113408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542717
2025	NC_007613	CTGG	2	8	113410	113417	0 %	25 %	50 %	25 %	82542717
2026	NC_007613	GCG	2	6	113420	113425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542717
2027	NC_007613	CAA	2	6	113440	113445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542717
2028	NC_007613	GAT	2	6	113452	113457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542717
2029	NC_007613	GGC	2	6	113515	113520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542717
2030	NC_007613	CGG	2	6	113551	113556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542717
2031	NC_007613	ACC	2	6	113570	113575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542717
2032	NC_007613	GCA	2	6	113593	113598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2033	NC_007613	GCTTAC	2	12	113660	113671	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	82542717
2034	NC_007613	TAC	3	9	113735	113743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542717
2035	NC_007613	CAC	2	6	113746	113751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542717
2036	NC_007613	GCT	2	6	113860	113865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2037	NC_007613	CCT	2	6	113955	113960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82542717
2038	NC_007613	CG	3	6	114027	114032	0 %	0 %	50 %	50 %	82542717
2039	NC_007613	TGA	2	6	114051	114056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542717
2040	NC_007613	ACG	2	6	114057	114062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2041	NC_007613	GAC	2	6	114131	114136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542717
2042	NC_007613	CAC	2	6	114194	114199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542717
2043	NC_007613	CTT	2	6	114213	114218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542717
2044	NC_007613	GCG	2	6	114230	114235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542717
2045	NC_007613	AAT	2	6	114351	114356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542718
2046	NC_007613	TGA	2	6	114390	114395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542718
2047	NC_007613	CCG	2	6	114581	114586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542718
2048	NC_007613	GCA	2	6	114592	114597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542718
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2051	NC_007613	AGC	2	6	114633	114638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542718
2052	NC_007613	GCA	3	9	114643	114651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542718
2053	NC_007613	GCG	2	6	114661	114666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542718
2054	NC_007613	CGA	2	6	114699	114704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542718
2055	NC_007613	CCGGCA	2	12	114940	114951	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	82542718
2056	NC_007613	GCA	3	9	114970	114978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542718
2057	NC_007613	ACG	2	6	115019	115024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542718
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2062	NC_007613	GGC	2	6	115189	115194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542718
2063	NC_007613	TGC	2	6	115208	115213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542718
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2065	NC_007613	TGA	2	6	115313	115318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542718
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2069	NC_007613	TCA	2	6	115436	115441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542718
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2075	NC_007613	TGA	2	6	115628	115633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542718
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2089	NC_007613	ATCA	2	8	116548	116555	50 %	25 %	0 %	25 %	82542719
2090	NC_007613	GGT	2	6	116563	116568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542719
2091	NC_007613	CTGG	2	8	116569	116576	0 %	25 %	50 %	25 %	82542719
2092	NC_007613	CAAAGT	2	12	116592	116603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82542719
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2102	NC_007613	A	6	6	117280	117285	100 %	0 %	0 %	0 %	82542719
2103	NC_007613	ACT	2	6	117287	117292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542719
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2109	NC_007613	GCT	2	6	117528	117533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542719
2110	NC_007613	CCAT	2	8	117590	117597	25 %	25 %	0 %	50 %	82542719
2111	NC_007613	GGC	2	6	117630	117635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542719
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2114	NC_007613	CTG	2	6	117811	117816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542720
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2117	NC_007613	GTT	2	6	117907	117912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542720
2118	NC_007613	GGCG	2	8	117937	117944	0 %	0 %	75 %	25 %	82542720
2119	NC_007613	GCT	2	6	117973	117978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542720
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2121	NC_007613	CTGA	2	8	118018	118025	25 %	25 %	25 %	25 %	82542720
2122	NC_007613	GCT	2	6	118051	118056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542720
2123	NC_007613	GCT	2	6	118099	118104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542720
2124	NC_007613	AGGCG	2	10	118106	118115	20 %	0 %	60 %	20 %	82542720
2125	NC_007613	CT	3	6	118139	118144	0 %	50 %	0 %	50 %	82542720
2126	NC_007613	GCT	2	6	118147	118152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542720
2127	NC_007613	TC	3	6	118175	118180	0 %	50 %	0 %	50 %	82542720
2128	NC_007613	GCT	2	6	118195	118200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542720
2129	NC_007613	CTGA	2	8	118210	118217	25 %	25 %	25 %	25 %	82542720
2130	NC_007613	GCG	2	6	118230	118235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542720
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2135	NC_007613	GCTG	2	8	118408	118415	0 %	25 %	50 %	25 %	82542720
2136	NC_007613	CCG	2	6	118452	118457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542720
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2152	NC_007613	TTC	2	6	119013	119018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542720
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2221	NC_007613	AGC	2	6	122874	122879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984991
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2223	NC_007613	GGGCA	2	10	122915	122924	20 %	0 %	60 %	20 %	161984991
2224	NC_007613	TGGA	2	8	122938	122945	25 %	25 %	50 %	0 %	161984991
2225	NC_007613	ACT	2	6	123014	123019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984991
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2231	NC_007613	TAA	2	6	123167	123172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542723
2232	NC_007613	TTTC	2	8	123183	123190	0 %	75 %	0 %	25 %	82542723
2233	NC_007613	CAGCG	2	10	123193	123202	20 %	0 %	40 %	40 %	82542723
2234	NC_007613	CCA	2	6	123327	123332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542723
2235	NC_007613	TGG	2	6	123473	123478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542723
2236	NC_007613	CGC	2	6	123513	123518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542723
2237	NC_007613	ACC	2	6	123556	123561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542723
2238	NC_007613	GGTA	2	8	123579	123586	25 %	25 %	50 %	0 %	82542723
2239	NC_007613	TTC	2	6	123682	123687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542723
2240	NC_007613	GGCG	2	8	123732	123739	0 %	0 %	75 %	25 %	82542723
2241	NC_007613	ATT	2	6	123904	123909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542723
2242	NC_007613	CAGTTT	2	12	123919	123930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	82542723
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2244	NC_007613	TAA	2	6	124028	124033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542724
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2247	NC_007613	CGT	2	6	124098	124103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
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2254	NC_007613	TCG	2	6	124400	124405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
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2261	NC_007613	TCG	2	6	124640	124645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542724
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2271	NC_007613	CGA	2	6	125324	125329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542725
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2363	NC_007613	GTTCA	2	10	130420	130429	20 %	40 %	20 %	20 %	82542729
2364	NC_007613	CA	3	6	130428	130433	50 %	0 %	0 %	50 %	82542729
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2489	NC_007613	CCG	2	6	138549	138554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542737
2490	NC_007613	CTG	2	6	138603	138608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542737
2491	NC_007613	GCCCA	2	10	138627	138636	20 %	0 %	20 %	60 %	82542737
2492	NC_007613	AAC	2	6	138662	138667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542737
2493	NC_007613	CAC	2	6	138717	138722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542737
2494	NC_007613	ACC	2	6	138788	138793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542737
2495	NC_007613	GCT	2	6	138814	138819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542737
2496	NC_007613	CTT	2	6	138909	138914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542737
2497	NC_007613	GCT	2	6	139019	139024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542737
2498	NC_007613	CCA	2	6	140421	140426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542738
2499	NC_007613	TCA	2	6	140499	140504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542738
2500	NC_007613	CAC	2	6	140563	140568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542738

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