MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007613	GCC	2	6	302589	302594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542886
5002	NC_007613	CTG	3	9	302618	302626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5003	NC_007613	GCC	2	6	302659	302664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542886
5004	NC_007613	TTC	2	6	302684	302689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542886
5005	NC_007613	ATC	2	6	302702	302707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542886
5006	NC_007613	GCT	2	6	302740	302745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5007	NC_007613	TGC	2	6	302784	302789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5008	NC_007613	CTT	2	6	302800	302805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542886
5009	NC_007613	CT	3	6	302826	302831	0 %	50 %	0 %	50 %	82542886
5010	NC_007613	GCT	3	9	302884	302892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5011	NC_007613	GTT	2	6	302896	302901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
5012	NC_007613	TTG	2	6	303080	303085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
5013	NC_007613	TGCT	2	8	303092	303099	0 %	50 %	25 %	25 %	82542886
5014	NC_007613	GCT	2	6	303142	303147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5015	NC_007613	CTT	2	6	303184	303189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542886
5016	NC_007613	CCG	2	6	303271	303276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542886
5017	NC_007613	TGG	2	6	303283	303288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542886
5018	NC_007613	GC	3	6	303353	303358	0 %	0 %	50 %	50 %	82542886
5019	NC_007613	TGC	2	6	303393	303398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5020	NC_007613	TCTTT	2	10	303400	303409	0 %	80 %	0 %	20 %	82542886
5021	NC_007613	TTG	2	6	303503	303508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
5022	NC_007613	CGG	2	6	303595	303600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542886
5023	NC_007613	CGC	2	6	303617	303622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542886
5024	NC_007613	TGC	2	6	303660	303665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5025	NC_007613	TTG	2	6	303695	303700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
5026	NC_007613	GTT	2	6	303731	303736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
5027	NC_007613	TGC	3	9	303786	303794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5028	NC_007613	CTG	2	6	303802	303807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5029	NC_007613	CGC	2	6	303815	303820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542886
5030	NC_007613	GTG	2	6	303821	303826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542886
5031	NC_007613	CG	3	6	303836	303841	0 %	0 %	50 %	50 %	82542886
5032	NC_007613	CTT	2	6	303874	303879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542886
5033	NC_007613	CTG	2	6	303884	303889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5034	NC_007613	GCC	2	6	303975	303980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542886
5035	NC_007613	TCT	2	6	303999	304004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542886
5036	NC_007613	CTG	2	6	304028	304033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5037	NC_007613	CGG	2	6	304035	304040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542886
5038	NC_007613	CTT	2	6	304045	304050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542886
5039	NC_007613	TTG	2	6	304088	304093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
5040	NC_007613	TGC	3	9	304098	304106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5041	NC_007613	GTAA	2	8	304110	304117	50 %	25 %	25 %	0 %	82542886
5042	NC_007613	TTC	2	6	304124	304129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542886
5043	NC_007613	AGTA	2	8	304133	304140	50 %	25 %	25 %	0 %	82542886
5044	NC_007613	CGC	2	6	304192	304197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542886
5045	NC_007613	TGC	2	6	304242	304247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
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5048	NC_007613	GCA	2	6	304341	304346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542886
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5050	NC_007613	GC	3	6	304466	304471	0 %	0 %	50 %	50 %	82542886
5051	NC_007613	GGTT	2	8	304506	304513	0 %	50 %	50 %	0 %	82542886
5052	NC_007613	CGG	2	6	304588	304593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542886
5053	NC_007613	AG	3	6	304634	304639	50 %	0 %	50 %	0 %	82542886
5054	NC_007613	CAG	2	6	304679	304684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5055	NC_007613	GGT	2	6	304685	304690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542886
5056	NC_007613	AATC	2	8	304756	304763	50 %	25 %	0 %	25 %	82542886
5057	NC_007613	CGT	2	6	304849	304854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542887
5058	NC_007613	TGC	2	6	304865	304870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542887
5059	NC_007613	TGC	3	9	304877	304885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542887
5060	NC_007613	TTC	2	6	304897	304902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82542887
5061	NC_007613	TGGC	2	8	304964	304971	0 %	25 %	50 %	25 %	82542887
5062	NC_007613	AC	3	6	304974	304979	50 %	0 %	0 %	50 %	82542887
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5064	NC_007613	CCAG	2	8	305097	305104	25 %	0 %	25 %	50 %	82542887
5065	NC_007613	CT	3	6	305219	305224	0 %	50 %	0 %	50 %	82542887
5066	NC_007613	TCA	2	6	305276	305281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542887
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5069	NC_007613	TGG	2	6	305377	305382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542887
5070	NC_007613	CACG	2	8	305427	305434	25 %	0 %	25 %	50 %	82542887
5071	NC_007613	GAT	2	6	305479	305484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542887
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5073	NC_007613	GTT	2	6	305529	305534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542887
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5075	NC_007613	TGC	2	6	305564	305569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542887
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5077	NC_007613	AAT	2	6	305605	305610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82542887
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5080	NC_007613	CG	3	6	305736	305741	0 %	0 %	50 %	50 %	82542887
5081	NC_007613	ATTC	2	8	305742	305749	25 %	50 %	0 %	25 %	82542887
5082	NC_007613	ACC	2	6	305783	305788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542887
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5086	NC_007613	CAG	2	6	305923	305928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542887
5087	NC_007613	AGA	2	6	306231	306236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82542888
5088	NC_007613	TGAA	2	8	306332	306339	50 %	25 %	25 %	0 %	82542888
5089	NC_007613	GGC	2	6	306379	306384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542888
5090	NC_007613	TCA	2	6	306398	306403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542888
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5094	NC_007613	GGCG	2	8	306648	306655	0 %	0 %	75 %	25 %	82542888
5095	NC_007613	CTG	2	6	306691	306696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542888
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5103	NC_007613	TGG	2	6	307117	307122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542889
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5105	NC_007613	A	6	6	307213	307218	100 %	0 %	0 %	0 %	82542889
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5110	NC_007613	GGC	2	6	307469	307474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542889
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5123	NC_007613	CG	3	6	308676	308681	0 %	0 %	50 %	50 %	82542890
5124	NC_007613	ATC	2	6	308684	308689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542890
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5233	NC_007613	AG	3	6	316169	316174	50 %	0 %	50 %	0 %	82542894
5234	NC_007613	ACC	2	6	316214	316219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542894
5235	NC_007613	ATTAAT	2	12	316231	316242	50 %	50 %	0 %	0 %	82542894
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5237	NC_007613	TTTGAT	2	12	316323	316334	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	82542895
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5242	NC_007613	AGT	2	6	316527	316532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542895
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5245	NC_007613	GC	3	6	316735	316740	0 %	0 %	50 %	50 %	82542896
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5369	NC_007613	TGA	2	6	323276	323281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542902
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