MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 74428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007613	TGGC	2	8	273224	273231	0 %	25 %	50 %	25 %	82542854
4502	NC_007613	AATCTG	2	12	273306	273317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82542854
4503	NC_007613	ACA	2	6	273320	273325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542854
4504	NC_007613	AC	3	6	273543	273548	50 %	0 %	0 %	50 %	161984983
4505	NC_007613	AG	3	6	273664	273669	50 %	0 %	50 %	0 %	161984983
4506	NC_007613	CAGC	2	8	273780	273787	25 %	0 %	25 %	50 %	161984983
4507	NC_007613	TCT	2	6	273807	273812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984983
4508	NC_007613	TGG	2	6	273846	273851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984983
4509	NC_007613	CCA	2	6	273915	273920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161984983
4510	NC_007613	CTG	2	6	273932	273937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984983
4511	NC_007613	GCG	2	6	273938	273943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984983
4512	NC_007613	GCC	2	6	273994	273999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984983
4513	NC_007613	CGC	2	6	274009	274014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984983
4514	NC_007613	CGG	2	6	274056	274061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984983
4515	NC_007613	GTG	2	6	274145	274150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161984983
4516	NC_007613	GCG	2	6	274290	274295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984983
4517	NC_007613	CGC	2	6	274344	274349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984983
4518	NC_007613	CAA	2	6	274352	274357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984983
4519	NC_007613	GACCG	2	10	274369	274378	20 %	0 %	40 %	40 %	161984983
4520	NC_007613	ATC	2	6	274391	274396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984983
4521	NC_007613	TGC	2	6	274500	274505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542856
4522	NC_007613	TC	3	6	274509	274514	0 %	50 %	0 %	50 %	82542856
4523	NC_007613	GGC	2	6	274532	274537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542856
4524	NC_007613	GCG	2	6	274575	274580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542856
4525	NC_007613	TGG	2	6	274587	274592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542856
4526	NC_007613	GCA	2	6	274665	274670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542856
4527	NC_007613	GGT	2	6	274717	274722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542856
4528	NC_007613	GCT	2	6	274738	274743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542856
4529	NC_007613	A	6	6	274838	274843	100 %	0 %	0 %	0 %	82542856
4530	NC_007613	GGT	2	6	274889	274894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542856
4531	NC_007613	CG	3	6	274919	274924	0 %	0 %	50 %	50 %	82542856
4532	NC_007613	GGC	2	6	274927	274932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542856
4533	NC_007613	TTA	2	6	274946	274951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82542856
4534	NC_007613	CGA	2	6	274954	274959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542856
4535	NC_007613	CTG	3	9	275006	275014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542856
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4538	NC_007613	TTG	2	6	275160	275165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542856
4539	NC_007613	GCA	2	6	275181	275186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542856
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4541	NC_007613	TGG	2	6	275374	275379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542857
4542	NC_007613	GGC	2	6	275385	275390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542857
4543	NC_007613	GCC	3	9	275418	275426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542857
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4545	NC_007613	GCA	2	6	275493	275498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542857
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4550	NC_007613	GCC	2	6	275785	275790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542857
4551	NC_007613	GC	3	6	275843	275848	0 %	0 %	50 %	50 %	82542857
4552	NC_007613	GCG	2	6	275908	275913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542857
4553	NC_007613	CG	3	6	275930	275935	0 %	0 %	50 %	50 %	82542857
4554	NC_007613	TCAG	2	8	275952	275959	25 %	25 %	25 %	25 %	82542857
4555	NC_007613	GTG	2	6	275983	275988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542857
4556	NC_007613	CTTT	2	8	276021	276028	0 %	75 %	0 %	25 %	82542857
4557	NC_007613	GC	3	6	276042	276047	0 %	0 %	50 %	50 %	82542857
4558	NC_007613	TGC	2	6	276202	276207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542858
4559	NC_007613	GGT	2	6	276215	276220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542858
4560	NC_007613	CGC	2	6	276244	276249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82542858
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4562	NC_007613	CG	3	6	276258	276263	0 %	0 %	50 %	50 %	82542858
4563	NC_007613	ATC	2	6	276330	276335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542858
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4565	NC_007613	CT	3	6	276498	276503	0 %	50 %	0 %	50 %	82542858
4566	NC_007613	GCT	2	6	276518	276523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542858
4567	NC_007613	TGCG	2	8	276532	276539	0 %	25 %	50 %	25 %	82542858
4568	NC_007613	GAG	2	6	276588	276593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82542858
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4571	NC_007613	TGAA	2	8	276691	276698	50 %	25 %	25 %	0 %	82542858
4572	NC_007613	TAC	2	6	276704	276709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542858
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4574	NC_007613	GCG	2	6	276878	276883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82542858
4575	NC_007613	CGGG	2	8	276927	276934	0 %	0 %	75 %	25 %	82542858
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4579	NC_007613	ATC	2	6	277183	277188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542859
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4586	NC_007613	CGT	2	6	277595	277600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542859
4587	NC_007613	GCACA	2	10	277617	277626	40 %	0 %	20 %	40 %	82542859
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4589	NC_007613	GA	3	6	277772	277777	50 %	0 %	50 %	0 %	82542859
4590	NC_007613	TCA	2	6	277787	277792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542859
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4593	NC_007613	CAA	2	6	277907	277912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542859
4594	NC_007613	GC	3	6	277963	277968	0 %	0 %	50 %	50 %	82542859
4595	NC_007613	CGA	2	6	277990	277995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542859
4596	NC_007613	TGT	2	6	278532	278537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542860
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4599	NC_007613	CAG	2	6	278666	278671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542860
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4602	NC_007613	CAGC	2	8	278759	278766	25 %	0 %	25 %	50 %	82542860
4603	NC_007613	ATCAC	2	10	278823	278832	40 %	20 %	0 %	40 %	82542860
4604	NC_007613	T	6	6	278873	278878	0 %	100 %	0 %	0 %	82542860
4605	NC_007613	CAC	2	6	279076	279081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82542861
4606	NC_007613	AGGA	2	8	279099	279106	50 %	0 %	50 %	0 %	82542861
4607	NC_007613	ATGGAA	2	12	279113	279124	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82542861
4608	NC_007613	CAT	2	6	279149	279154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82542861
4609	NC_007613	GCA	2	6	279174	279179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542861
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4611	NC_007613	GCA	2	6	279232	279237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542861
4612	NC_007613	GAT	2	6	279464	279469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82542862
4613	NC_007613	CA	3	6	279506	279511	50 %	0 %	0 %	50 %	82542862
4614	NC_007613	CAG	2	6	279531	279536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542862
4615	NC_007613	AGC	2	6	279587	279592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82542862
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4617	NC_007613	CTG	2	6	279640	279645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542862
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4620	NC_007613	TGC	2	6	279683	279688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542862
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4623	NC_007613	A	6	6	279782	279787	100 %	0 %	0 %	0 %	82542862
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4992	NC_007613	CAA	2	6	302011	302016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82542886
4993	NC_007613	CTG	2	6	302195	302200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
4994	NC_007613	TGC	2	6	302217	302222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
4995	NC_007613	TGT	2	6	302232	302237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
4996	NC_007613	GCT	2	6	302266	302271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
4997	NC_007613	GTG	2	6	302292	302297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82542886
4998	NC_007613	GTT	2	6	302383	302388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82542886
4999	NC_007613	CTG	2	6	302407	302412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886
5000	NC_007613	CTG	2	6	302519	302524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82542886

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