MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007608	AGT	2	6	69685	69690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524747
1002	NC_007608	AC	3	6	69788	69793	50 %	0 %	0 %	50 %	82524747
1003	NC_007608	TGA	2	6	69844	69849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524747
1004	NC_007608	AAT	2	6	69876	69881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524747
1005	NC_007608	GCT	2	6	69918	69923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524747
1006	NC_007608	AAT	2	6	69927	69932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524747
1007	NC_007608	TGG	2	6	70004	70009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524747
1008	NC_007608	TCTG	2	8	70013	70020	0 %	50 %	25 %	25 %	82524747
1009	NC_007608	GAA	2	6	70367	70372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524748
1010	NC_007608	CGG	2	6	70379	70384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524748
1011	NC_007608	GC	3	6	70395	70400	0 %	0 %	50 %	50 %	82524748
1012	NC_007608	GAA	2	6	70418	70423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524748
1013	NC_007608	GCC	2	6	70424	70429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524748
1014	NC_007608	T	7	7	70649	70655	0 %	100 %	0 %	0 %	82524749
1015	NC_007608	TC	3	6	70750	70755	0 %	50 %	0 %	50 %	82524749
1016	NC_007608	TTGCC	2	10	70757	70766	0 %	40 %	20 %	40 %	82524749
1017	NC_007608	ATG	2	6	70812	70817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524749
1018	NC_007608	TTG	2	6	70828	70833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524749
1019	NC_007608	CAT	2	6	70886	70891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524749
1020	NC_007608	CCG	2	6	70967	70972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524749
1021	NC_007608	ACGCC	2	10	71005	71014	20 %	0 %	20 %	60 %	82524749
1022	NC_007608	CTG	2	6	71040	71045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524749
1023	NC_007608	GT	3	6	71056	71061	0 %	50 %	50 %	0 %	82524749
1024	NC_007608	CTG	2	6	71181	71186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524749
1025	NC_007608	GAA	2	6	71210	71215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524749
1026	NC_007608	TTA	2	6	71288	71293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524749
1027	NC_007608	GAT	2	6	71345	71350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524749
1028	NC_007608	ATC	2	6	71404	71409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524749
1029	NC_007608	A	6	6	71441	71446	100 %	0 %	0 %	0 %	82524749
1030	NC_007608	CTG	2	6	71481	71486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524749
1031	NC_007608	CTG	2	6	71517	71522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524749
1032	NC_007608	GACG	2	8	71531	71538	25 %	0 %	50 %	25 %	82524749
1033	NC_007608	GGA	2	6	71553	71558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524749
1034	NC_007608	GAT	2	6	71723	71728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524749
1035	NC_007608	TGA	2	6	71797	71802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524749
1036	NC_007608	TGA	2	6	71809	71814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524749
1037	NC_007608	CGA	2	6	71893	71898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524749
1038	NC_007608	GAAGGG	2	12	71899	71910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524749
1039	NC_007608	CAGT	2	8	71970	71977	25 %	25 %	25 %	25 %	82524749
1040	NC_007608	ACTG	2	8	71984	71991	25 %	25 %	25 %	25 %	82524749
1041	NC_007608	GT	3	6	72055	72060	0 %	50 %	50 %	0 %	82524750
1042	NC_007608	GA	3	6	72062	72067	50 %	0 %	50 %	0 %	82524750
1043	NC_007608	GGAT	2	8	72095	72102	25 %	25 %	50 %	0 %	82524750
1044	NC_007608	TG	3	6	72182	72187	0 %	50 %	50 %	0 %	82524750
1045	NC_007608	GAA	2	6	72240	72245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524750
1046	NC_007608	CG	3	6	72249	72254	0 %	0 %	50 %	50 %	82524750
1047	NC_007608	CTG	2	6	72265	72270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524750
1048	NC_007608	CAA	2	6	72716	72721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524752
1049	NC_007608	AT	3	6	72764	72769	50 %	50 %	0 %	0 %	82524752
1050	NC_007608	TCA	3	9	72781	72789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524752
1051	NC_007608	CAA	2	6	72818	72823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524752
1052	NC_007608	TTC	2	6	72900	72905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524752
1053	NC_007608	A	6	6	72939	72944	100 %	0 %	0 %	0 %	82524752
1054	NC_007608	GGT	2	6	73074	73079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524751
1055	NC_007608	CGTAAA	2	12	73104	73115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82524751
1056	NC_007608	AAG	2	6	73127	73132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524751
1057	NC_007608	GAT	2	6	73167	73172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524751
1058	NC_007608	T	7	7	73172	73178	0 %	100 %	0 %	0 %	82524751
1059	NC_007608	GAA	2	6	73182	73187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524751
1060	NC_007608	TGA	2	6	73217	73222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524751
1061	NC_007608	A	6	6	73278	73283	100 %	0 %	0 %	0 %	82524751
1062	NC_007608	TCT	2	6	73288	73293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524751
1063	NC_007608	TGA	2	6	73307	73312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524751
1064	NC_007608	CGG	2	6	73382	73387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524751
1065	NC_007608	CGGA	2	8	73423	73430	25 %	0 %	50 %	25 %	82524751
1066	NC_007608	CGCCC	2	10	73433	73442	0 %	0 %	20 %	80 %	82524751
1067	NC_007608	GTG	2	6	73597	73602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524753
1068	NC_007608	TCA	2	6	73607	73612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524753
1069	NC_007608	A	6	6	73630	73635	100 %	0 %	0 %	0 %	82524753
1070	NC_007608	CTG	2	6	73709	73714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524753
1071	NC_007608	GCA	2	6	73738	73743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524753
1072	NC_007608	GGT	2	6	73794	73799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524753
1073	NC_007608	CA	3	6	73889	73894	50 %	0 %	0 %	50 %	82524753
1074	NC_007608	CAG	2	6	73907	73912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524753
1075	NC_007608	GGT	2	6	73946	73951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524753
1076	NC_007608	TGA	2	6	74001	74006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524753
1077	NC_007608	GCA	2	6	74078	74083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524753
1078	NC_007608	GAAG	2	8	74084	74091	50 %	0 %	50 %	0 %	82524753
1079	NC_007608	GGAAT	2	10	74101	74110	40 %	20 %	40 %	0 %	82524753
1080	NC_007608	CCG	2	6	74131	74136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524753
1081	NC_007608	CCGGTG	2	12	74219	74230	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82524753
1082	NC_007608	GTC	2	6	74232	74237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524753
1083	NC_007608	ACA	2	6	74277	74282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524753
1084	NC_007608	GAA	2	6	74300	74305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524753
1085	NC_007608	TGA	2	6	74313	74318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524753
1086	NC_007608	TAC	2	6	74384	74389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524753
1087	NC_007608	CGG	2	6	74411	74416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524753
1088	NC_007608	GAA	2	6	74423	74428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524753
1089	NC_007608	GTG	2	6	74429	74434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524753
1090	NC_007608	CAT	2	6	74437	74442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524753
1091	NC_007608	GTGC	2	8	74524	74531	0 %	25 %	50 %	25 %	82524753
1092	NC_007608	GGT	2	6	74622	74627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524753
1093	NC_007608	TTCG	2	8	75294	75301	0 %	50 %	25 %	25 %	82524754
1094	NC_007608	TC	3	6	75332	75337	0 %	50 %	0 %	50 %	82524754
1095	NC_007608	CCA	2	6	75354	75359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524754
1096	NC_007608	AGT	2	6	75413	75418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524754
1097	NC_007608	TCA	2	6	75456	75461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524754
1098	NC_007608	T	7	7	75521	75527	0 %	100 %	0 %	0 %	82524755
1099	NC_007608	ATGC	2	8	75533	75540	25 %	25 %	25 %	25 %	82524755
1100	NC_007608	AGAT	2	8	75544	75551	50 %	25 %	25 %	0 %	82524755
1101	NC_007608	CATTTT	2	12	75648	75659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	82524755
1102	NC_007608	ACG	2	6	76359	76364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1103	NC_007608	AAAC	2	8	76366	76373	75 %	0 %	0 %	25 %	82524756
1104	NC_007608	ACA	2	6	76399	76404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524756
1105	NC_007608	CTG	2	6	76415	76420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1106	NC_007608	GTT	2	6	76421	76426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524756
1107	NC_007608	CAGC	2	8	76430	76437	25 %	0 %	25 %	50 %	82524756
1108	NC_007608	CAT	2	6	76570	76575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524756
1109	NC_007608	ACGC	2	8	76609	76616	25 %	0 %	25 %	50 %	82524756
1110	NC_007608	GAT	3	9	76667	76675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524756
1111	NC_007608	CGG	2	6	76776	76781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524756
1112	NC_007608	TCT	2	6	76789	76794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524756
1113	NC_007608	TCGCT	2	10	76821	76830	0 %	40 %	20 %	40 %	82524756
1114	NC_007608	GAA	2	6	76837	76842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524756
1115	NC_007608	GCA	2	6	76847	76852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1116	NC_007608	GCA	2	6	76892	76897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1117	NC_007608	CGT	3	9	76927	76935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1118	NC_007608	GTA	2	6	76958	76963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524756
1119	NC_007608	TCA	2	6	76986	76991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524756
1120	NC_007608	CTC	2	6	77108	77113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524756
1121	NC_007608	GCT	2	6	77156	77161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524756
1122	NC_007608	TAA	2	6	77233	77238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524756
1123	NC_007608	GTT	2	6	77254	77259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524756
1124	NC_007608	CGC	2	6	77272	77277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524756
1125	NC_007608	TAC	2	6	77303	77308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524756
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1127	NC_007608	ATG	2	6	77390	77395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524756
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