MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 2885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007607	GGC	2	6	73998	74003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524499
1002	NC_007607	GACG	2	8	74064	74071	25 %	0 %	50 %	25 %	82524499
1003	NC_007607	GGA	2	6	74097	74102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524499
1004	NC_007607	TGC	2	6	74117	74122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524499
1005	NC_007607	GTGA	2	8	74148	74155	25 %	25 %	50 %	0 %	82524499
1006	NC_007607	TAG	2	6	74528	74533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524500
1007	NC_007607	GTC	2	6	74725	74730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524500
1008	NC_007607	T	6	6	74967	74972	0 %	100 %	0 %	0 %	82524501
1009	NC_007607	TAAGTG	2	12	75090	75101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524501
1010	NC_007607	AATG	2	8	75199	75206	50 %	25 %	25 %	0 %	82524501
1011	NC_007607	AGC	2	6	75464	75469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524502
1012	NC_007607	TGCG	2	8	75575	75582	0 %	25 %	50 %	25 %	82524502
1013	NC_007607	CAG	2	6	75604	75609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524502
1014	NC_007607	AG	4	8	75707	75714	50 %	0 %	50 %	0 %	82524503
1015	NC_007607	ATT	2	6	75749	75754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524503
1016	NC_007607	GAC	2	6	75765	75770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524503
1017	NC_007607	CTG	2	6	75800	75805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524503
1018	NC_007607	GGT	2	6	75835	75840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524503
1019	NC_007607	ATG	2	6	75866	75871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524503
1020	NC_007607	GAA	2	6	75911	75916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524503
1021	NC_007607	TGA	2	6	76563	76568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524504
1022	NC_007607	G	7	7	76636	76642	0 %	0 %	100 %	0 %	82524504
1023	NC_007607	ACT	2	6	76689	76694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524504
1024	NC_007607	CGA	2	6	76734	76739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524504
1025	NC_007607	CTT	2	6	76869	76874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524504
1026	NC_007607	CTA	2	6	76932	76937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524504
1027	NC_007607	CAT	2	6	77148	77153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524505
1028	NC_007607	ATAA	2	8	77161	77168	75 %	25 %	0 %	0 %	82524505
1029	NC_007607	TGA	2	6	77280	77285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524505
1030	NC_007607	AAT	2	6	77317	77322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524505
1031	NC_007607	GCT	2	6	77391	77396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524505
1032	NC_007607	TAAC	2	8	77417	77424	50 %	25 %	0 %	25 %	82524505
1033	NC_007607	A	7	7	77448	77454	100 %	0 %	0 %	0 %	82524505
1034	NC_007607	CCT	2	6	77497	77502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524505
1035	NC_007607	ACA	2	6	77523	77528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524505
1036	NC_007607	AAT	2	6	77686	77691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524505
1037	NC_007607	AG	3	6	77701	77706	50 %	0 %	50 %	0 %	82524505
1038	NC_007607	T	7	7	77709	77715	0 %	100 %	0 %	0 %	82524505
1039	NC_007607	GAAT	2	8	77763	77770	50 %	25 %	25 %	0 %	82524505
1040	NC_007607	ATC	2	6	77799	77804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524505
1041	NC_007607	ACA	2	6	77886	77891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524505
1042	NC_007607	ACAA	2	8	77945	77952	75 %	0 %	0 %	25 %	82524505
1043	NC_007607	CAG	2	6	78121	78126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524505
1044	NC_007607	TGC	2	6	78138	78143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524505
1045	NC_007607	CCT	2	6	78204	78209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524505
1046	NC_007607	GCTCT	2	10	78253	78262	0 %	40 %	20 %	40 %	82524505
1047	NC_007607	GGA	2	6	78297	78302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524505
1048	NC_007607	GAAT	2	8	78492	78499	50 %	25 %	25 %	0 %	82524505
1049	NC_007607	AGA	2	6	78576	78581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524505
1050	NC_007607	GATGCG	2	12	78658	78669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82524505
1051	NC_007607	CAG	2	6	78709	78714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524505
1052	NC_007607	CTGA	2	8	78727	78734	25 %	25 %	25 %	25 %	82524505
1053	NC_007607	GCA	2	6	79125	79130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524506
1054	NC_007607	CTG	3	9	79217	79225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524506
1055	NC_007607	ATG	2	6	79263	79268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524506
1056	NC_007607	ATT	2	6	79536	79541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524507
1057	NC_007607	AAT	3	9	79563	79571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524507
1058	NC_007607	CAG	2	6	79630	79635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524507
1059	NC_007607	GTT	2	6	79773	79778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524507
1060	NC_007607	TGC	2	6	79810	79815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524507
1061	NC_007607	ATA	2	6	79864	79869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524507
1062	NC_007607	AG	3	6	79871	79876	50 %	0 %	50 %	0 %	82524507
1063	NC_007607	TGAGT	2	10	79907	79916	20 %	40 %	40 %	0 %	82524507
1064	NC_007607	AAAG	2	8	79959	79966	75 %	0 %	25 %	0 %	82524507
1065	NC_007607	A	6	6	80025	80030	100 %	0 %	0 %	0 %	82524507
1066	NC_007607	CGAC	2	8	80045	80052	25 %	0 %	25 %	50 %	82524507
1067	NC_007607	TTA	2	6	80085	80090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524507
1068	NC_007607	CTGT	2	8	80547	80554	0 %	50 %	25 %	25 %	82524508
1069	NC_007607	CTT	2	6	80633	80638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524508
1070	NC_007607	TACT	2	8	80667	80674	25 %	50 %	0 %	25 %	82524508
1071	NC_007607	GGT	2	6	80701	80706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524508
1072	NC_007607	A	7	7	80707	80713	100 %	0 %	0 %	0 %	82524508
1073	NC_007607	CGG	2	6	80720	80725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524508
1074	NC_007607	TC	3	6	80906	80911	0 %	50 %	0 %	50 %	82524509
1075	NC_007607	TTGCC	2	10	80913	80922	0 %	40 %	20 %	40 %	82524509
1076	NC_007607	ATG	2	6	80968	80973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524509
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1081	NC_007607	CTG	2	6	81196	81201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524509
1082	NC_007607	GT	3	6	81212	81217	0 %	50 %	50 %	0 %	82524509
1083	NC_007607	CTG	2	6	81337	81342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524509
1084	NC_007607	GAA	2	6	81366	81371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524509
1085	NC_007607	TTA	2	6	81444	81449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524509
1086	NC_007607	GAT	2	6	81501	81506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524509
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1088	NC_007607	A	6	6	81597	81602	100 %	0 %	0 %	0 %	82524509
1089	NC_007607	CTG	2	6	81637	81642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524509
1090	NC_007607	CTG	2	6	81673	81678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524509
1091	NC_007607	GACG	2	8	81687	81694	25 %	0 %	50 %	25 %	82524509
1092	NC_007607	GGA	2	6	81709	81714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524509
1093	NC_007607	GAT	2	6	81879	81884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524509
1094	NC_007607	TGA	2	6	81953	81958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524509
1095	NC_007607	TGA	2	6	81965	81970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524509
1096	NC_007607	CGA	2	6	82049	82054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524509
1097	NC_007607	AGT	2	6	82077	82082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524509
1098	NC_007607	CAGT	2	8	82126	82133	25 %	25 %	25 %	25 %	82524509
1099	NC_007607	ACTG	2	8	82140	82147	25 %	25 %	25 %	25 %	82524509
1100	NC_007607	GCC	2	6	82156	82161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524510
1101	NC_007607	T	7	7	82169	82175	0 %	100 %	0 %	0 %	82524510
1102	NC_007607	ACC	2	6	82176	82181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524510
1103	NC_007607	AGTA	2	8	82208	82215	50 %	25 %	25 %	0 %	82524510
1104	NC_007607	AAG	2	6	82244	82249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524510
1105	NC_007607	AGCG	2	8	82312	82319	25 %	0 %	50 %	25 %	82524510
1106	NC_007607	GTG	2	6	82342	82347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524510
1107	NC_007607	GCG	2	6	82351	82356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524510
1108	NC_007607	GGC	2	6	82493	82498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524511
1109	NC_007607	CTG	2	6	82590	82595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524511
1110	NC_007607	ACG	2	6	82715	82720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524512
1111	NC_007607	C	7	7	82724	82730	0 %	0 %	0 %	100 %	82524512
1112	NC_007607	CTT	2	6	82772	82777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524512
1113	NC_007607	CG	3	6	82871	82876	0 %	0 %	50 %	50 %	82524512
1114	NC_007607	CA	3	6	82878	82883	50 %	0 %	0 %	50 %	82524512
1115	NC_007607	T	6	6	82950	82955	0 %	100 %	0 %	0 %	82524512
1116	NC_007607	GA	3	6	82987	82992	50 %	0 %	50 %	0 %	82524512
1117	NC_007607	GCTG	2	8	82993	83000	0 %	25 %	50 %	25 %	82524512
1118	NC_007607	GCG	2	6	83021	83026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524512
1119	NC_007607	GCA	2	6	83032	83037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524512
1120	NC_007607	CA	3	6	83057	83062	50 %	0 %	0 %	50 %	82524512
1121	NC_007607	A	7	7	83095	83101	100 %	0 %	0 %	0 %	82524512
1122	NC_007607	TGA	2	6	83182	83187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524512
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1124	NC_007607	CCG	2	6	83278	83283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524512
1125	NC_007607	TGA	2	6	83295	83300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524512
1126	NC_007607	GCC	2	6	83304	83309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524512
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1128	NC_007607	CAG	2	6	83351	83356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524512
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