MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 2885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007607	CAG	2	6	38470	38475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524447
502	NC_007607	CAA	2	6	38526	38531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524447
503	NC_007607	CAGC	2	8	38563	38570	25 %	0 %	25 %	50 %	82524447
504	NC_007607	CAT	2	6	39281	39286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524448
505	NC_007607	CCT	2	6	39300	39305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524448
506	NC_007607	CAC	2	6	39316	39321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524448
507	NC_007607	ATC	2	6	39354	39359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524448
508	NC_007607	ATT	2	6	39480	39485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524448
509	NC_007607	GCC	2	6	39579	39584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524448
510	NC_007607	A	7	7	39592	39598	100 %	0 %	0 %	0 %	82524448
511	NC_007607	CGG	2	6	39640	39645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524448
512	NC_007607	GCA	2	6	39780	39785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524449
513	NC_007607	GC	3	6	39832	39837	0 %	0 %	50 %	50 %	82524449
514	NC_007607	GGC	2	6	39975	39980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524449
515	NC_007607	TCG	2	6	39991	39996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524449
516	NC_007607	AAG	2	6	40238	40243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524450
517	NC_007607	AACT	2	8	40353	40360	50 %	25 %	0 %	25 %	82524450
518	NC_007607	A	6	6	40377	40382	100 %	0 %	0 %	0 %	82524450
519	NC_007607	GTA	2	6	40393	40398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524450
520	NC_007607	GTCA	2	8	40465	40472	25 %	25 %	25 %	25 %	82524451
521	NC_007607	CTG	2	6	40486	40491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524451
522	NC_007607	TCCGCA	2	12	40529	40540	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	82524451
523	NC_007607	CTGC	2	8	40623	40630	0 %	25 %	25 %	50 %	82524451
524	NC_007607	ATTC	2	8	40701	40708	25 %	50 %	0 %	25 %	82524451
525	NC_007607	TCC	2	6	40898	40903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524451
526	NC_007607	AGG	2	6	40991	40996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524451
527	NC_007607	CAG	2	6	41055	41060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524451
528	NC_007607	CTG	2	6	41074	41079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524451
529	NC_007607	TTGT	2	8	41248	41255	0 %	75 %	25 %	0 %	82524451
530	NC_007607	AAT	2	6	41352	41357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524451
531	NC_007607	GGT	2	6	41365	41370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524451
532	NC_007607	TGT	2	6	41375	41380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524451
533	NC_007607	ATT	3	9	41476	41484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524451
534	NC_007607	GTT	2	6	41526	41531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524451
535	NC_007607	ATT	2	6	41539	41544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524451
536	NC_007607	AGCCAG	2	12	41545	41556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524451
537	NC_007607	G	6	6	41578	41583	0 %	0 %	100 %	0 %	82524451
538	NC_007607	TTA	2	6	41660	41665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524451
539	NC_007607	GAA	2	6	41694	41699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524451
540	NC_007607	TGG	2	6	41809	41814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524451
541	NC_007607	T	6	6	41840	41845	0 %	100 %	0 %	0 %	82524451
542	NC_007607	GTT	2	6	41858	41863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524451
543	NC_007607	TAAA	2	8	42016	42023	75 %	25 %	0 %	0 %	82524451
544	NC_007607	GAA	2	6	42056	42061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524451
545	NC_007607	TGT	2	6	42081	42086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524451
546	NC_007607	ATA	2	6	42098	42103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524451
547	NC_007607	TCA	2	6	42560	42565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524452
548	NC_007607	GCA	2	6	42638	42643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524452
549	NC_007607	TA	3	6	42659	42664	50 %	50 %	0 %	0 %	82524452
550	NC_007607	GCT	2	6	42665	42670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524452
551	NC_007607	T	6	6	42670	42675	0 %	100 %	0 %	0 %	82524452
552	NC_007607	GTA	2	6	42698	42703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524452
553	NC_007607	AGA	2	6	42709	42714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524452
554	NC_007607	TAA	2	6	42715	42720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524452
555	NC_007607	GAT	2	6	42742	42747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524452
556	NC_007607	A	7	7	42869	42875	100 %	0 %	0 %	0 %	82524453
557	NC_007607	GTT	2	6	43019	43024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524453
558	NC_007607	CA	3	6	43129	43134	50 %	0 %	0 %	50 %	82524453
559	NC_007607	AAT	2	6	43629	43634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524454
560	NC_007607	AAGCCG	2	12	43670	43681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524454
561	NC_007607	CCG	2	6	43769	43774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524454
562	NC_007607	AT	3	6	43877	43882	50 %	50 %	0 %	0 %	82524454
563	NC_007607	A	7	7	43884	43890	100 %	0 %	0 %	0 %	82524454
564	NC_007607	TAG	2	6	44085	44090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524455
565	NC_007607	GTC	2	6	44282	44287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524455
566	NC_007607	AGT	2	6	44328	44333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524455
567	NC_007607	C	8	8	44379	44386	0 %	0 %	0 %	100 %	82524455
568	NC_007607	TCA	2	6	44454	44459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524455
569	NC_007607	T	6	6	44525	44530	0 %	100 %	0 %	0 %	82524456
570	NC_007607	TAAGTG	2	12	44648	44659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524456
571	NC_007607	AATG	2	8	44757	44764	50 %	25 %	25 %	0 %	82524456
572	NC_007607	ATC	2	6	44985	44990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524457
573	NC_007607	ATA	2	6	45006	45011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524457
574	NC_007607	GGA	2	6	45031	45036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524457
575	NC_007607	TCG	2	6	45060	45065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524457
576	NC_007607	CCAC	2	8	45080	45087	25 %	0 %	0 %	75 %	82524457
577	NC_007607	TG	3	6	45244	45249	0 %	50 %	50 %	0 %	82524457
578	NC_007607	ATAC	2	8	45260	45267	50 %	25 %	0 %	25 %	82524457
579	NC_007607	ATG	2	6	45406	45411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524457
580	NC_007607	GTAA	2	8	45447	45454	50 %	25 %	25 %	0 %	82524457
581	NC_007607	CAG	2	6	45845	45850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524458
582	NC_007607	CAT	2	6	45854	45859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524458
583	NC_007607	T	6	6	45859	45864	0 %	100 %	0 %	0 %	82524458
584	NC_007607	GCG	2	6	45928	45933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524458
585	NC_007607	GGT	2	6	45982	45987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524458
586	NC_007607	TGA	2	6	46258	46263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524459
587	NC_007607	TC	3	6	46277	46282	0 %	50 %	0 %	50 %	82524459
588	NC_007607	CTG	2	6	46442	46447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524459
589	NC_007607	TTC	2	6	46448	46453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524459
590	NC_007607	GCT	2	6	46480	46485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524459
591	NC_007607	CATC	2	8	46510	46517	25 %	25 %	0 %	50 %	82524459
592	NC_007607	CGT	2	6	46519	46524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524459
593	NC_007607	CAGG	2	8	46643	46650	25 %	0 %	50 %	25 %	82524460
594	NC_007607	CCA	2	6	46702	46707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524460
595	NC_007607	TCA	2	6	46722	46727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524460
596	NC_007607	AT	3	6	47801	47806	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
597	NC_007607	TCA	2	6	47821	47826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524461
598	NC_007607	TACA	2	8	47864	47871	50 %	25 %	0 %	25 %	82524461
599	NC_007607	CAA	2	6	47908	47913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524461
600	NC_007607	ATT	2	6	47953	47958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524461
601	NC_007607	TTC	2	6	47965	47970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524461
602	NC_007607	AGC	2	6	47982	47987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524461
603	NC_007607	TAG	2	6	47997	48002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524461
604	NC_007607	TC	3	6	48008	48013	0 %	50 %	0 %	50 %	82524461
605	NC_007607	TA	3	6	48115	48120	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
606	NC_007607	A	6	6	48133	48138	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
607	NC_007607	ATT	2	6	48181	48186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524461
608	NC_007607	TGA	2	6	48306	48311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524461
609	NC_007607	A	8	8	48315	48322	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
610	NC_007607	T	6	6	48343	48348	0 %	100 %	0 %	0 %	82524461
611	NC_007607	A	6	6	48373	48378	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
612	NC_007607	AT	3	6	48426	48431	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
613	NC_007607	ATCA	2	8	48515	48522	50 %	25 %	0 %	25 %	82524461
614	NC_007607	GAA	2	6	48550	48555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524461
615	NC_007607	ATT	2	6	48586	48591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524461
616	NC_007607	TTA	2	6	48653	48658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524461
617	NC_007607	A	7	7	48698	48704	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
618	NC_007607	A	6	6	48793	48798	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
619	NC_007607	AGG	2	6	48824	48829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524461
620	NC_007607	GAA	2	6	48850	48855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524461
621	NC_007607	A	7	7	48877	48883	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
622	NC_007607	T	9	9	48899	48907	0 %	100 %	0 %	0 %	82524461
623	NC_007607	TAA	2	6	48915	48920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524461
624	NC_007607	A	6	6	48919	48924	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
625	NC_007607	TA	4	8	48938	48945	50 %	50 %	0 %	0 %	82524461
626	NC_007607	A	7	7	49096	49102	100 %	0 %	0 %	0 %	82524461
627	NC_007607	TAT	2	6	49166	49171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524461
628	NC_007607	AATA	2	8	49195	49202	75 %	25 %	0 %	0 %	82524461
629	NC_007607	ATAA	2	8	49569	49576	75 %	25 %	0 %	0 %	82524462
630	NC_007607	T	6	6	49652	49657	0 %	100 %	0 %	0 %	82524462
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