MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 2008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007606	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	82775384
2	NC_007606	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	82775385
3	NC_007606	CGCAG	2	10	8352	8361	20 %	0 %	40 %	40 %	82775390
4	NC_007606	CGTAC	2	10	9780	9789	20 %	20 %	20 %	40 %	82775391
5	NC_007606	CGCGC	2	10	10767	10776	0 %	0 %	40 %	60 %	82775393
6	NC_007606	CCGAT	2	10	17257	17266	20 %	20 %	20 %	40 %	82775400
7	NC_007606	AGCGA	2	10	17645	17654	40 %	0 %	40 %	20 %	82775400
8	NC_007606	TCTGG	2	10	23321	23330	0 %	40 %	40 %	20 %	82775407
9	NC_007606	GGGCA	2	10	24732	24741	20 %	0 %	60 %	20 %	161950172
10	NC_007606	CAGCG	2	10	25011	25020	20 %	0 %	40 %	40 %	82775409
11	NC_007606	ACGAC	2	10	26291	26300	40 %	0 %	20 %	40 %	82775410
12	NC_007606	CCGTC	2	10	32617	32626	0 %	20 %	20 %	60 %	161950171
13	NC_007606	GTGAA	2	10	32627	32636	40 %	20 %	40 %	0 %	161950171
14	NC_007606	GTTCA	2	10	33014	33023	20 %	40 %	20 %	20 %	82775415
15	NC_007606	ATCCA	2	10	33340	33349	40 %	20 %	0 %	40 %	82775415
16	NC_007606	CTTTA	2	10	34603	34612	20 %	60 %	0 %	20 %	82775417
17	NC_007606	TGGCG	2	10	34830	34839	0 %	20 %	60 %	20 %	82775417
18	NC_007606	TTTCA	2	10	37144	37153	20 %	60 %	0 %	20 %	82775421
19	NC_007606	CAGTA	2	10	45425	45434	40 %	20 %	20 %	20 %	82775431
20	NC_007606	GGCGC	2	10	47225	47234	0 %	0 %	60 %	40 %	82775433
21	NC_007606	CGATG	2	10	50281	50290	20 %	20 %	40 %	20 %	82775435
22	NC_007606	GCGAA	2	10	51222	51231	40 %	0 %	40 %	20 %	82775435
23	NC_007606	CCGTT	2	10	52116	52125	0 %	40 %	20 %	40 %	82775435
24	NC_007606	CACGG	2	10	52493	52502	20 %	0 %	40 %	40 %	82775435
25	NC_007606	CGAAT	2	10	55202	55211	40 %	20 %	20 %	20 %	82775439
26	NC_007606	CCATG	2	10	56740	56749	20 %	20 %	20 %	40 %	82775440
27	NC_007606	CCGTA	2	10	58386	58395	20 %	20 %	20 %	40 %	82775441
28	NC_007606	TTAAA	2	10	59124	59133	60 %	40 %	0 %	0 %	82775441
29	NC_007606	ACCCA	2	10	59867	59876	40 %	0 %	0 %	60 %	82775442
30	NC_007606	TGATC	2	10	61494	61503	20 %	40 %	20 %	20 %	161950169
31	NC_007606	AATCA	2	10	62025	62034	60 %	20 %	0 %	20 %	82775444
32	NC_007606	AGGGC	2	10	67325	67334	20 %	0 %	60 %	20 %	82775450
33	NC_007606	GGCGC	2	10	67359	67368	0 %	0 %	60 %	40 %	82775450
34	NC_007606	GAAAC	2	10	68172	68181	60 %	0 %	20 %	20 %	82775450
35	NC_007606	AACGT	2	10	70645	70654	40 %	20 %	20 %	20 %	82775455
36	NC_007606	GCGTC	2	10	73629	73638	0 %	20 %	40 %	40 %	82775458
37	NC_007606	ATGTT	2	10	74443	74452	20 %	60 %	20 %	0 %	82775459
38	NC_007606	CTTCG	2	10	74876	74885	0 %	40 %	20 %	40 %	82775459
39	NC_007606	TGCGT	2	10	75162	75171	0 %	40 %	40 %	20 %	82775459
40	NC_007606	AAAGT	2	10	82197	82206	60 %	20 %	20 %	0 %	82775463
41	NC_007606	CAGCG	2	10	87331	87340	20 %	0 %	40 %	40 %	82775468
42	NC_007606	TCGCG	2	10	88601	88610	0 %	20 %	40 %	40 %	82775468
43	NC_007606	GATGG	2	10	98308	98317	20 %	20 %	60 %	0 %	82775475
44	NC_007606	GCTTC	2	10	99453	99462	0 %	40 %	20 %	40 %	82775476
45	NC_007606	CCTGG	2	10	100561	100570	0 %	20 %	40 %	40 %	82775477
46	NC_007606	CTGGT	2	10	102280	102289	0 %	40 %	40 %	20 %	161950168
47	NC_007606	GACCG	2	10	102828	102837	20 %	0 %	40 %	40 %	82775479
48	NC_007606	TGCAT	2	10	106387	106396	20 %	40 %	20 %	20 %	82775484
49	NC_007606	ATTCC	2	10	106557	106566	20 %	40 %	0 %	40 %	82775484
50	NC_007606	GGTTT	2	10	107553	107562	0 %	60 %	40 %	0 %	82775484
51	NC_007606	AGTTC	2	10	111651	111660	20 %	40 %	20 %	20 %	82775489
52	NC_007606	CGTGG	2	10	113024	113033	0 %	20 %	60 %	20 %	82775491
53	NC_007606	TATCG	2	10	113531	113540	20 %	40 %	20 %	20 %	82775491
54	NC_007606	GGGCG	2	10	116428	116437	0 %	0 %	80 %	20 %	82775493
55	NC_007606	GCCTG	2	10	117863	117872	0 %	20 %	40 %	40 %	82775495
56	NC_007606	ACCGT	2	10	119776	119785	20 %	20 %	20 %	40 %	82775496
57	NC_007606	ATCAG	2	10	121549	121558	40 %	20 %	20 %	20 %	82775498
58	NC_007606	AGCCG	2	10	123317	123326	20 %	0 %	40 %	40 %	82775499
59	NC_007606	CGCAG	2	10	125646	125655	20 %	0 %	40 %	40 %	82775501
60	NC_007606	CGCGG	2	10	132816	132825	0 %	0 %	60 %	40 %	82775509
61	NC_007606	AATGC	2	10	137505	137514	40 %	20 %	20 %	20 %	82775513
62	NC_007606	TCTGT	2	10	138451	138460	0 %	60 %	20 %	20 %	82775515
63	NC_007606	GCATG	2	10	139544	139553	20 %	20 %	40 %	20 %	82775516
64	NC_007606	GCAGG	2	10	140883	140892	20 %	0 %	60 %	20 %	82775518
65	NC_007606	CGAAG	2	10	142797	142806	40 %	0 %	40 %	20 %	82775519
66	NC_007606	ACACG	2	10	142930	142939	40 %	0 %	20 %	40 %	82775519
67	NC_007606	TCGCG	2	10	143191	143200	0 %	20 %	40 %	40 %	82775519
68	NC_007606	GCATC	2	10	143281	143290	20 %	20 %	20 %	40 %	82775519
69	NC_007606	GACTG	2	10	144599	144608	20 %	20 %	40 %	20 %	82775520
70	NC_007606	AGAGC	2	10	145009	145018	40 %	0 %	40 %	20 %	82775520
71	NC_007606	AGGCG	2	10	150056	150065	20 %	0 %	60 %	20 %	82775523
72	NC_007606	GGTTG	2	10	150801	150810	0 %	40 %	60 %	0 %	82775523
73	NC_007606	GCGAG	2	10	158752	158761	20 %	0 %	60 %	20 %	161950166
74	NC_007606	GGCGT	2	10	159190	159199	0 %	20 %	60 %	20 %	161950166
75	NC_007606	CCACA	2	10	162094	162103	40 %	0 %	0 %	60 %	82775539
76	NC_007606	CTGCG	2	10	166971	166980	0 %	20 %	40 %	40 %	82775540
77	NC_007606	AAAAC	2	10	168822	168831	80 %	0 %	0 %	20 %	82775541
78	NC_007606	TGGTT	2	10	169079	169088	0 %	60 %	40 %	0 %	82775541
79	NC_007606	AACCT	2	10	171160	171169	40 %	20 %	0 %	40 %	82775543
80	NC_007606	TGGTC	2	10	171202	171211	0 %	40 %	40 %	20 %	82775543
81	NC_007606	TGGCG	2	10	172447	172456	0 %	20 %	60 %	20 %	82775544
82	NC_007606	TTCCA	2	10	173688	173697	20 %	40 %	0 %	40 %	82775544
83	NC_007606	GGTCC	2	10	178011	178020	0 %	20 %	40 %	40 %	82775549
84	NC_007606	GTTTG	2	10	182451	182460	0 %	60 %	40 %	0 %	82775552
85	NC_007606	GTGAT	2	10	182861	182870	20 %	40 %	40 %	0 %	82775552
86	NC_007606	GTGAT	2	10	183152	183161	20 %	40 %	40 %	0 %	82775552
87	NC_007606	GCCAG	2	10	186866	186875	20 %	0 %	40 %	40 %	82775557
88	NC_007606	GCCAC	2	10	187259	187268	20 %	0 %	20 %	60 %	82775557
89	NC_007606	AAACC	2	10	188155	188164	60 %	0 %	0 %	40 %	82775557
90	NC_007606	GTTCT	2	10	188307	188316	0 %	60 %	20 %	20 %	82775557
91	NC_007606	CTGAA	2	10	190299	190308	40 %	20 %	20 %	20 %	82775559
92	NC_007606	AAGCG	2	10	190363	190372	40 %	0 %	40 %	20 %	82775559
93	NC_007606	TGGTG	2	10	192269	192278	0 %	40 %	60 %	0 %	82775561
94	NC_007606	TGCAC	2	10	192395	192404	20 %	20 %	20 %	40 %	82775561
95	NC_007606	TGCGC	2	10	192788	192797	0 %	20 %	40 %	40 %	82775561
96	NC_007606	CATGG	2	10	194631	194640	20 %	20 %	40 %	20 %	82775563
97	NC_007606	CAGAT	2	10	195670	195679	40 %	20 %	20 %	20 %	82775564
98	NC_007606	ACTTT	2	10	195803	195812	20 %	60 %	0 %	20 %	82775564
99	NC_007606	GACGT	2	10	199723	199732	20 %	20 %	40 %	20 %	82775567
100	NC_007606	CGACG	2	10	201550	201559	20 %	0 %	40 %	40 %	82775569
101	NC_007606	CCACG	2	10	203391	203400	20 %	0 %	20 %	60 %	82775571
102	NC_007606	GGATG	2	10	204380	204389	20 %	20 %	60 %	0 %	82775572
103	NC_007606	TGGCC	2	10	205444	205453	0 %	20 %	40 %	40 %	82775574
104	NC_007606	ACCGC	2	10	205457	205466	20 %	0 %	20 %	60 %	82775574
105	NC_007606	GTAAC	2	10	206187	206196	40 %	20 %	20 %	20 %	82775574
106	NC_007606	AGCCG	2	10	206815	206824	20 %	0 %	40 %	40 %	82775574
107	NC_007606	GGTGG	2	10	206924	206933	0 %	20 %	80 %	0 %	82775574
108	NC_007606	TGATT	2	10	221531	221540	20 %	60 %	20 %	0 %	82775589
109	NC_007606	TAATT	2	10	233519	233528	40 %	60 %	0 %	0 %	82775596
110	NC_007606	TGTTC	2	10	235286	235295	0 %	60 %	20 %	20 %	82775598
111	NC_007606	CGCGG	2	10	237502	237511	0 %	0 %	60 %	40 %	82775601
112	NC_007606	TCGTG	2	10	242943	242952	0 %	40 %	40 %	20 %	82775610
113	NC_007606	TGAAC	2	10	247672	247681	40 %	20 %	20 %	20 %	82775613
114	NC_007606	AAACG	2	10	249858	249867	60 %	0 %	20 %	20 %	82775615
115	NC_007606	TGCAT	2	10	251921	251930	20 %	40 %	20 %	20 %	82775619
116	NC_007606	TATTT	2	10	253076	253085	20 %	80 %	0 %	0 %	82775621
117	NC_007606	AAAAG	2	10	253245	253254	80 %	0 %	20 %	0 %	82775621
118	NC_007606	GGCGC	2	10	257415	257424	0 %	0 %	60 %	40 %	82775627
119	NC_007606	CACGC	2	10	261373	261382	20 %	0 %	20 %	60 %	82775628
120	NC_007606	ACGCG	2	10	261599	261608	20 %	0 %	40 %	40 %	82775628
121	NC_007606	CGGCG	2	10	262268	262277	0 %	0 %	60 %	40 %	82775628
122	NC_007606	AGCGC	2	10	266091	266100	20 %	0 %	40 %	40 %	82775631
123	NC_007606	TCGCC	2	10	267545	267554	0 %	20 %	20 %	60 %	82775632
124	NC_007606	TGCGC	2	10	270855	270864	0 %	20 %	40 %	40 %	82775636
125	NC_007606	GTGAA	2	10	273679	273688	40 %	20 %	40 %	0 %	82775639
126	NC_007606	CAGCC	2	10	274274	274283	20 %	0 %	20 %	60 %	82775640
127	NC_007606	AACCC	2	10	274474	274483	40 %	0 %	0 %	60 %	82775640
128	NC_007606	CTCTT	2	10	284787	284796	0 %	60 %	0 %	40 %	82775653
129	NC_007606	GAATC	2	10	288964	288973	40 %	20 %	20 %	20 %	82775656
130	NC_007606	ACAAA	2	10	291374	291383	80 %	0 %	0 %	20 %	82775658
131	NC_007606	GGCTG	2	10	293209	293218	0 %	20 %	60 %	20 %	82775661
132	NC_007606	CACTA	2	10	295032	295041	40 %	20 %	0 %	40 %	82775663
133	NC_007606	TGCCC	2	10	295766	295775	0 %	20 %	20 %	60 %	82775664
134	NC_007606	TTGTG	2	10	295945	295954	0 %	60 %	40 %	0 %	82775664
135	NC_007606	TGGCG	2	10	296114	296123	0 %	20 %	60 %	20 %	82775664
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262	NC_007606	TGGGC	2	10	558100	558109	0 %	20 %	60 %	20 %	82775929
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264	NC_007606	GTCTG	2	10	560926	560935	0 %	40 %	40 %	20 %	82775932
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