MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 66989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007606	GC	3	6	247741	247746	0 %	0 %	50 %	50 %	82775613
4002	NC_007606	CGG	2	6	247804	247809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775613
4003	NC_007606	CTG	2	6	247991	247996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775613
4004	NC_007606	CGG	2	6	248043	248048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775613
4005	NC_007606	CGG	2	6	248092	248097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775613
4006	NC_007606	CGG	2	6	248112	248117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775613
4007	NC_007606	TAAG	2	8	248221	248228	50 %	25 %	25 %	0 %	82775613
4008	NC_007606	GTG	3	9	248506	248514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775614
4009	NC_007606	GGT	2	6	248651	248656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775614
4010	NC_007606	CGGT	2	8	248803	248810	0 %	25 %	50 %	25 %	82775614
4011	NC_007606	GCTG	2	8	248836	248843	0 %	25 %	50 %	25 %	82775614
4012	NC_007606	GGC	2	6	248888	248893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775614
4013	NC_007606	AT	3	6	248903	248908	50 %	50 %	0 %	0 %	82775614
4014	NC_007606	TGC	2	6	248953	248958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775614
4015	NC_007606	CGC	2	6	249015	249020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775614
4016	NC_007606	GC	3	6	249019	249024	0 %	0 %	50 %	50 %	82775614
4017	NC_007606	ATG	2	6	249091	249096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775614
4018	NC_007606	CGGT	2	8	249272	249279	0 %	25 %	50 %	25 %	82775615
4019	NC_007606	AGT	2	6	249299	249304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775615
4020	NC_007606	AGC	2	6	249482	249487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775615
4021	NC_007606	ATC	2	6	249511	249516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775615
4022	NC_007606	GTA	2	6	249582	249587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775615
4023	NC_007606	GCC	2	6	249675	249680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775615
4024	NC_007606	AGC	2	6	249709	249714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775615
4025	NC_007606	TTC	2	6	249756	249761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775615
4026	NC_007606	CTG	2	6	249798	249803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775615
4027	NC_007606	CTG	2	6	249838	249843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775615
4028	NC_007606	AAACG	2	10	249858	249867	60 %	0 %	20 %	20 %	82775615
4029	NC_007606	CAA	2	6	249876	249881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775615
4030	NC_007606	CGC	2	6	250079	250084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775616
4031	NC_007606	TC	3	6	250097	250102	0 %	50 %	0 %	50 %	82775616
4032	NC_007606	GGT	2	6	250195	250200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775616
4033	NC_007606	TAT	2	6	250228	250233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775616
4034	NC_007606	AAG	2	6	250238	250243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775616
4035	NC_007606	AAAT	2	8	250366	250373	75 %	25 %	0 %	0 %	82775617
4036	NC_007606	TGAT	2	8	250422	250429	25 %	50 %	25 %	0 %	82775617
4037	NC_007606	CG	3	6	250481	250486	0 %	0 %	50 %	50 %	82775617
4038	NC_007606	CCG	2	6	250548	250553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775617
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4040	NC_007606	TTTG	2	8	250867	250874	0 %	75 %	25 %	0 %	82775618
4041	NC_007606	TTC	2	6	250880	250885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775618
4042	NC_007606	CCA	2	6	250897	250902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775618
4043	NC_007606	CGC	2	6	250925	250930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775618
4044	NC_007606	TTA	2	6	250959	250964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775618
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4052	NC_007606	T	6	6	251522	251527	0 %	100 %	0 %	0 %	82775618
4053	NC_007606	GC	4	8	251530	251537	0 %	0 %	50 %	50 %	82775618
4054	NC_007606	GGA	2	6	251549	251554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775618
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4056	NC_007606	TTA	2	6	251760	251765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775619
4057	NC_007606	G	6	6	251772	251777	0 %	0 %	100 %	0 %	82775619
4058	NC_007606	TCG	2	6	251808	251813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775619
4059	NC_007606	ATT	2	6	251857	251862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775619
4060	NC_007606	TGCAT	2	10	251921	251930	20 %	40 %	20 %	20 %	82775619
4061	NC_007606	GAT	3	9	251950	251958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775619
4062	NC_007606	A	6	6	252012	252017	100 %	0 %	0 %	0 %	82775619
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4064	NC_007606	G	7	7	252509	252515	0 %	0 %	100 %	0 %	82775620
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4066	NC_007606	CGA	2	6	252607	252612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775620
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4069	NC_007606	TATTT	2	10	253076	253085	20 %	80 %	0 %	0 %	82775621
4070	NC_007606	TGC	2	6	253107	253112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775621
4071	NC_007606	TAT	2	6	253140	253145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775621
4072	NC_007606	CAG	2	6	253233	253238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775621
4073	NC_007606	AAAAG	2	10	253245	253254	80 %	0 %	20 %	0 %	82775621
4074	NC_007606	TCAT	2	8	253255	253262	25 %	50 %	0 %	25 %	82775621
4075	NC_007606	TGTT	2	8	253277	253284	0 %	75 %	25 %	0 %	82775621
4076	NC_007606	TAT	2	6	253314	253319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775621
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4083	NC_007606	GTT	2	6	253842	253847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775623
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4090	NC_007606	AGT	2	6	254897	254902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775624
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4093	NC_007606	TGA	2	6	256021	256026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775625
4094	NC_007606	G	7	7	256094	256100	0 %	0 %	100 %	0 %	82775625
4095	NC_007606	ACT	2	6	256147	256152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775625
4096	NC_007606	CGA	2	6	256192	256197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775625
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4098	NC_007606	AG	3	6	256959	256964	50 %	0 %	50 %	0 %	82775626
4099	NC_007606	AG	3	6	256969	256974	50 %	0 %	50 %	0 %	82775626
4100	NC_007606	CGGTTT	2	12	257027	257038	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	82775626
4101	NC_007606	TTTGCC	2	12	257051	257062	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	82775626
4102	NC_007606	CGC	2	6	257167	257172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775626
4103	NC_007606	CAG	2	6	257219	257224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775627
4104	NC_007606	A	6	6	257259	257264	100 %	0 %	0 %	0 %	82775627
4105	NC_007606	GCT	2	6	257308	257313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775627
4106	NC_007606	GTT	2	6	257315	257320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775627
4107	NC_007606	GGC	2	6	257345	257350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775627
4108	NC_007606	GTC	2	6	257369	257374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775627
4109	NC_007606	GGCGC	2	10	257415	257424	0 %	0 %	60 %	40 %	82775627
4110	NC_007606	CAGC	2	8	257452	257459	25 %	0 %	25 %	50 %	82775627
4111	NC_007606	GAC	2	6	257490	257495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775627
4112	NC_007606	A	6	6	257510	257515	100 %	0 %	0 %	0 %	82775627
4113	NC_007606	CTGG	2	8	257602	257609	0 %	25 %	50 %	25 %	82775627
4114	NC_007606	TCA	2	6	257677	257682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775627
4115	NC_007606	ATA	2	6	257736	257741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775627
4116	NC_007606	AAC	2	6	260962	260967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775628
4117	NC_007606	GCC	2	6	261044	261049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775628
4118	NC_007606	CTG	2	6	261063	261068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775628
4119	NC_007606	ACA	2	6	261101	261106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775628
4120	NC_007606	GC	3	6	261132	261137	0 %	0 %	50 %	50 %	82775628
4121	NC_007606	GCC	2	6	261220	261225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775628
4122	NC_007606	TCA	2	6	261268	261273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775628
4123	NC_007606	CACGC	2	10	261373	261382	20 %	0 %	20 %	60 %	82775628
4124	NC_007606	GTT	2	6	261494	261499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775628
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4482	NC_007606	GTC	2	6	283259	283264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775652
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4492	NC_007606	GAT	2	6	283502	283507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775652
4493	NC_007606	GTA	2	6	283556	283561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775652
4494	NC_007606	TGC	2	6	283590	283595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775652
4495	NC_007606	TTGTTT	2	12	283653	283664	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	82775652
4496	NC_007606	GTA	2	6	283670	283675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775652
4497	NC_007606	GCT	2	6	283702	283707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775652
4498	NC_007606	CGC	2	6	283709	283714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775652
4499	NC_007606	GTT	2	6	283753	283758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775652
4500	NC_007606	GCC	2	6	283770	283775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775652

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