MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 66989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007606	CGG	2	6	175774	175779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775546
3002	NC_007606	TGA	2	6	175822	175827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775546
3003	NC_007606	GCG	2	6	175859	175864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775546
3004	NC_007606	GGC	3	9	175870	175878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775546
3005	NC_007606	CGC	2	6	175887	175892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775546
3006	NC_007606	TAT	2	6	175909	175914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775546
3007	NC_007606	TATT	2	8	175965	175972	25 %	75 %	0 %	0 %	82775546
3008	NC_007606	TTGA	2	8	176024	176031	25 %	50 %	25 %	0 %	82775546
3009	NC_007606	CGC	2	6	176052	176057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775546
3010	NC_007606	TAT	2	6	176089	176094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775546
3011	NC_007606	TAA	2	6	176119	176124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775546
3012	NC_007606	TGC	2	6	176148	176153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775546
3013	NC_007606	CGG	2	6	176164	176169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775546
3014	NC_007606	TG	3	6	176214	176219	0 %	50 %	50 %	0 %	82775546
3015	NC_007606	GCG	2	6	176253	176258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775546
3016	NC_007606	TCG	2	6	176322	176327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775546
3017	NC_007606	CG	3	6	176326	176331	0 %	0 %	50 %	50 %	82775546
3018	NC_007606	ACC	2	6	176339	176344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775546
3019	NC_007606	GGC	2	6	176506	176511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775546
3020	NC_007606	CG	3	6	176519	176524	0 %	0 %	50 %	50 %	82775546
3021	NC_007606	ATT	2	6	176588	176593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775546
3022	NC_007606	CGG	2	6	176629	176634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775546
3023	NC_007606	GC	3	6	176660	176665	0 %	0 %	50 %	50 %	82775546
3024	NC_007606	CAGC	2	8	176715	176722	25 %	0 %	25 %	50 %	82775546
3025	NC_007606	TGA	2	6	176821	176826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775547
3026	NC_007606	GCA	2	6	176855	176860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775547
3027	NC_007606	CAA	2	6	176863	176868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775547
3028	NC_007606	TGA	2	6	176968	176973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775547
3029	NC_007606	TGG	2	6	177021	177026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775547
3030	NC_007606	CGG	2	6	177055	177060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775547
3031	NC_007606	TGCGGT	2	12	177131	177142	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	82775547
3032	NC_007606	GCC	2	6	177262	177267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775548
3033	NC_007606	CAT	2	6	177297	177302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775548
3034	NC_007606	TAA	2	6	177334	177339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775548
3035	NC_007606	CCG	2	6	177358	177363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775548
3036	NC_007606	ATA	2	6	177364	177369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775548
3037	NC_007606	TGGC	2	8	177585	177592	0 %	25 %	50 %	25 %	82775548
3038	NC_007606	CCG	2	6	177700	177705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775548
3039	NC_007606	TGT	2	6	177899	177904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775549
3040	NC_007606	ATA	2	6	177914	177919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775549
3041	NC_007606	GGTCC	2	10	178011	178020	0 %	20 %	40 %	40 %	82775549
3042	NC_007606	T	6	6	178201	178206	0 %	100 %	0 %	0 %	82775549
3043	NC_007606	CAG	2	6	178249	178254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775549
3044	NC_007606	GGA	2	6	178505	178510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775549
3045	NC_007606	GCT	2	6	178522	178527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775549
3046	NC_007606	CGG	2	6	178548	178553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775549
3047	NC_007606	TGA	2	6	178587	178592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775549
3048	NC_007606	CG	3	6	178593	178598	0 %	0 %	50 %	50 %	82775549
3049	NC_007606	ACA	2	6	178788	178793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775550
3050	NC_007606	TGA	2	6	178903	178908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775550
3051	NC_007606	CGC	2	6	178915	178920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775550
3052	NC_007606	CGT	2	6	179062	179067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775550
3053	NC_007606	TAA	2	6	179143	179148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775550
3054	NC_007606	CCG	2	6	179271	179276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775550
3055	NC_007606	GCA	2	6	179311	179316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775550
3056	NC_007606	CTT	3	9	179323	179331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775550
3057	NC_007606	ATG	2	6	179343	179348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775550
3058	NC_007606	TGA	2	6	180817	180822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775551
3059	NC_007606	G	7	7	180890	180896	0 %	0 %	100 %	0 %	82775551
3060	NC_007606	ACT	2	6	180943	180948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775551
3061	NC_007606	CGA	2	6	180988	180993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775551
3062	NC_007606	CTA	2	6	181186	181191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775551
3063	NC_007606	A	7	7	181867	181873	100 %	0 %	0 %	0 %	82775552
3064	NC_007606	CT	3	6	181927	181932	0 %	50 %	0 %	50 %	82775552
3065	NC_007606	CGG	2	6	181937	181942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775552
3066	NC_007606	CTT	2	6	181949	181954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775552
3067	NC_007606	CAG	2	6	181969	181974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775552
3068	NC_007606	CGC	2	6	182057	182062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775552
3069	NC_007606	CAG	2	6	182080	182085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775552
3070	NC_007606	TTC	2	6	182086	182091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775552
3071	NC_007606	TGA	2	6	182094	182099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775552
3072	NC_007606	TGG	2	6	182169	182174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775552
3073	NC_007606	TCA	2	6	182213	182218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775552
3074	NC_007606	GTC	2	6	182239	182244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775552
3075	NC_007606	CAA	2	6	182247	182252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775552
3076	NC_007606	GTT	2	6	182257	182262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775552
3077	NC_007606	GTTTG	2	10	182451	182460	0 %	60 %	40 %	0 %	82775552
3078	NC_007606	GGT	2	6	182572	182577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775552
3079	NC_007606	CGG	2	6	182637	182642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775552
3080	NC_007606	ATCGGT	2	12	182647	182658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82775552
3081	NC_007606	TGG	2	6	182702	182707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775552
3082	NC_007606	TAT	2	6	182739	182744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775552
3083	NC_007606	TCC	2	6	182830	182835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82775552
3084	NC_007606	GTGAT	2	10	182861	182870	20 %	40 %	40 %	0 %	82775552
3085	NC_007606	CAG	2	6	182895	182900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775552
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3087	NC_007606	TGC	2	6	182963	182968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775552
3088	NC_007606	GCA	2	6	183003	183008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775552
3089	NC_007606	AGC	2	6	183010	183015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775552
3090	NC_007606	CAA	2	6	183072	183077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775552
3091	NC_007606	AAC	2	6	183103	183108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775552
3092	NC_007606	GAA	2	6	183144	183149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775552
3093	NC_007606	GTGAT	2	10	183152	183161	20 %	40 %	40 %	0 %	82775552
3094	NC_007606	CAG	2	6	183175	183180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775552
3095	NC_007606	GCG	2	6	183254	183259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775552
3096	NC_007606	CAT	2	6	183498	183503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775553
3097	NC_007606	GCG	2	6	183551	183556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775553
3098	NC_007606	GTC	2	6	183616	183621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775553
3099	NC_007606	ATG	2	6	183778	183783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775553
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3101	NC_007606	GGA	2	6	183834	183839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775553
3102	NC_007606	TGA	2	6	183845	183850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775553
3103	NC_007606	GATC	2	8	183909	183916	25 %	25 %	25 %	25 %	82775553
3104	NC_007606	TCAA	2	8	183917	183924	50 %	25 %	0 %	25 %	82775553
3105	NC_007606	GTG	2	6	183931	183936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775553
3106	NC_007606	TTG	2	6	183941	183946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775553
3107	NC_007606	TAA	2	6	184029	184034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775553
3108	NC_007606	TGG	2	6	184037	184042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775553
3109	NC_007606	TGG	2	6	184064	184069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775553
3110	NC_007606	AGA	2	6	184110	184115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775553
3111	NC_007606	AAC	2	6	184133	184138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775553
3112	NC_007606	ACG	2	6	184243	184248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775553
3113	NC_007606	TGG	3	9	184250	184258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775553
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3117	NC_007606	GTT	2	6	184467	184472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775554
3118	NC_007606	TGA	2	6	184545	184550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775554
3119	NC_007606	TGC	2	6	184556	184561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775554
3120	NC_007606	ATT	2	6	184684	184689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775555
3121	NC_007606	GACT	2	8	184742	184749	25 %	25 %	25 %	25 %	82775555
3122	NC_007606	GTC	2	6	184763	184768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775555
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3243	NC_007606	TGC	2	6	191637	191642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775560
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3250	NC_007606	GCT	2	6	191850	191855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775560
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3490	NC_007606	CGT	2	6	205972	205977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775574
3491	NC_007606	CAG	2	6	206005	206010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775574
3492	NC_007606	ACG	2	6	206046	206051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775574
3493	NC_007606	CGA	2	6	206062	206067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775574
3494	NC_007606	CGC	2	6	206091	206096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775574
3495	NC_007606	AT	3	6	206101	206106	50 %	50 %	0 %	0 %	82775574
3496	NC_007606	GTAAC	2	10	206187	206196	40 %	20 %	20 %	20 %	82775574
3497	NC_007606	GAA	2	6	206321	206326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775574
3498	NC_007606	GCC	2	6	206337	206342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775574
3499	NC_007606	TGG	2	6	206493	206498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775574
3500	NC_007606	CTG	2	6	206543	206548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775574

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