MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 66989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007606	TGG	2	6	59463	59468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775442
1002	NC_007606	GAT	2	6	59500	59505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775442
1003	NC_007606	GC	4	8	59507	59514	0 %	0 %	50 %	50 %	82775442
1004	NC_007606	TGA	2	6	59547	59552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775442
1005	NC_007606	TATC	2	8	59559	59566	25 %	50 %	0 %	25 %	82775442
1006	NC_007606	CAG	2	6	59569	59574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775442
1007	NC_007606	TAC	2	6	59580	59585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775442
1008	NC_007606	CACG	2	8	59649	59656	25 %	0 %	25 %	50 %	82775442
1009	NC_007606	CACC	2	8	59710	59717	25 %	0 %	0 %	75 %	82775442
1010	NC_007606	GCC	2	6	59752	59757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775442
1011	NC_007606	AAC	2	6	59780	59785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775442
1012	NC_007606	AGT	2	6	59829	59834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775442
1013	NC_007606	ATG	2	6	59837	59842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775442
1014	NC_007606	ACCCA	2	10	59867	59876	40 %	0 %	0 %	60 %	82775442
1015	NC_007606	CAG	2	6	59969	59974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775442
1016	NC_007606	ATG	2	6	59978	59983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775442
1017	NC_007606	AAC	2	6	60017	60022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775442
1018	NC_007606	GCG	2	6	60045	60050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775442
1019	NC_007606	CGA	2	6	60090	60095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775442
1020	NC_007606	CGA	2	6	60108	60113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775442
1021	NC_007606	AAC	2	6	60122	60127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775442
1022	NC_007606	AGA	2	6	60201	60206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775442
1023	NC_007606	AGCC	2	8	60277	60284	25 %	0 %	25 %	50 %	82775442
1024	NC_007606	CGG	2	6	60325	60330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775442
1025	NC_007606	GTA	3	9	60340	60348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775442
1026	NC_007606	GCA	2	6	60377	60382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775442
1027	NC_007606	AGG	2	6	60390	60395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775442
1028	NC_007606	CAT	2	6	60400	60405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775442
1029	NC_007606	GGT	2	6	60434	60439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775442
1030	NC_007606	CCAG	2	8	60477	60484	25 %	0 %	25 %	50 %	82775442
1031	NC_007606	AACC	2	8	60485	60492	50 %	0 %	0 %	50 %	82775442
1032	NC_007606	ACC	2	6	60503	60508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775442
1033	NC_007606	TAA	2	6	60564	60569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775442
1034	NC_007606	CAA	2	6	60605	60610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775442
1035	NC_007606	CGA	2	6	60618	60623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775442
1036	NC_007606	TTA	2	6	60624	60629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775442
1037	NC_007606	GAAA	2	8	60636	60643	75 %	0 %	25 %	0 %	82775442
1038	NC_007606	TTC	2	6	60677	60682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775442
1039	NC_007606	ATT	2	6	61162	61167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161950169
1040	NC_007606	GTGC	2	8	61179	61186	0 %	25 %	50 %	25 %	161950169
1041	NC_007606	TGA	2	6	61188	61193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161950169
1042	NC_007606	AAT	2	6	61210	61215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161950169
1043	NC_007606	GCA	2	6	61309	61314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161950169
1044	NC_007606	CG	3	6	61388	61393	0 %	0 %	50 %	50 %	161950169
1045	NC_007606	TGAT	2	8	61415	61422	25 %	50 %	25 %	0 %	161950169
1046	NC_007606	CAA	2	6	61447	61452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161950169
1047	NC_007606	GCC	2	6	61474	61479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161950169
1048	NC_007606	TGATC	2	10	61494	61503	20 %	40 %	20 %	20 %	161950169
1049	NC_007606	TTC	2	6	61518	61523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161950169
1050	NC_007606	CAG	2	6	61537	61542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161950169
1051	NC_007606	CTG	2	6	61549	61554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161950169
1052	NC_007606	GAAACC	2	12	61651	61662	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161950169
1053	NC_007606	CTGC	2	8	61675	61682	0 %	25 %	25 %	50 %	161950169
1054	NC_007606	GTT	2	6	61684	61689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161950169
1055	NC_007606	CGG	3	9	61775	61783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161950169
1056	NC_007606	AAC	2	6	61817	61822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161950169
1057	NC_007606	GAA	2	6	61879	61884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161950169
1058	NC_007606	CGC	2	6	61890	61895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161950169
1059	NC_007606	TGA	2	6	61999	62004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775444
1060	NC_007606	AATCA	2	10	62025	62034	60 %	20 %	0 %	20 %	82775444
1061	NC_007606	ATG	2	6	62050	62055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775444
1062	NC_007606	GAT	2	6	62126	62131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775444
1063	NC_007606	GGC	2	6	62225	62230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775444
1064	NC_007606	AGC	2	6	62252	62257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775444
1065	NC_007606	CGG	2	6	62324	62329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775444
1066	NC_007606	GAA	2	6	62343	62348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775444
1067	NC_007606	CAG	2	6	62381	62386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775444
1068	NC_007606	TGG	2	6	62530	62535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775444
1069	NC_007606	GTCG	2	8	62541	62548	0 %	25 %	50 %	25 %	82775444
1070	NC_007606	GCA	2	6	62557	62562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775444
1071	NC_007606	ATGG	2	8	62648	62655	25 %	25 %	50 %	0 %	82775444
1072	NC_007606	TGGT	2	8	62743	62750	0 %	50 %	50 %	0 %	82775444
1073	NC_007606	TTG	2	6	62827	62832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775444
1074	NC_007606	ACT	2	6	63197	63202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775445
1075	NC_007606	GAA	2	6	63286	63291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775445
1076	NC_007606	GC	3	6	63296	63301	0 %	0 %	50 %	50 %	82775445
1077	NC_007606	GGC	2	6	63552	63557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775445
1078	NC_007606	CACC	2	8	63575	63582	25 %	0 %	0 %	75 %	82775445
1079	NC_007606	GCG	2	6	63596	63601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775445
1080	NC_007606	CAT	2	6	63655	63660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775445
1081	NC_007606	A	7	7	63672	63678	100 %	0 %	0 %	0 %	82775445
1082	NC_007606	TGG	2	6	63749	63754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775445
1083	NC_007606	GAA	2	6	63778	63783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775445
1084	NC_007606	TGC	2	6	63794	63799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775445
1085	NC_007606	GTTG	2	8	63804	63811	0 %	50 %	50 %	0 %	82775445
1086	NC_007606	ATTG	2	8	63822	63829	25 %	50 %	25 %	0 %	82775445
1087	NC_007606	GCC	2	6	63838	63843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775445
1088	NC_007606	GCC	2	6	63895	63900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775445
1089	NC_007606	GCA	2	6	63910	63915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775445
1090	NC_007606	CGA	2	6	63942	63947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775445
1091	NC_007606	TCC	2	6	64145	64150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82775445
1092	NC_007606	TCA	2	6	64172	64177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775445
1093	NC_007606	TTG	2	6	64288	64293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775446
1094	NC_007606	GCCGAT	2	12	64299	64310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	82775446
1095	NC_007606	GCT	2	6	64325	64330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775446
1096	NC_007606	AAG	2	6	64359	64364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775446
1097	NC_007606	CTGGGG	2	12	64428	64439	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	82775446
1098	NC_007606	CG	3	6	64465	64470	0 %	0 %	50 %	50 %	82775446
1099	NC_007606	CCG	2	6	64607	64612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775447
1100	NC_007606	GGT	2	6	64632	64637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775447
1101	NC_007606	ATC	2	6	64827	64832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775447
1102	NC_007606	CGA	2	6	64855	64860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775447
1103	NC_007606	TGTT	2	8	64861	64868	0 %	75 %	25 %	0 %	82775447
1104	NC_007606	GCC	2	6	65001	65006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775447
1105	NC_007606	ATG	2	6	65056	65061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775447
1106	NC_007606	GGC	2	6	65067	65072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775447
1107	NC_007606	GCG	2	6	65094	65099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775447
1108	NC_007606	TGTT	2	8	65106	65113	0 %	75 %	25 %	0 %	82775447
1109	NC_007606	GCTG	2	8	65152	65159	0 %	25 %	50 %	25 %	82775447
1110	NC_007606	GAT	3	9	65192	65200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775447
1111	NC_007606	AGC	2	6	65236	65241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775447
1112	NC_007606	GCA	2	6	65243	65248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775447
1113	NC_007606	CGC	2	6	65274	65279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775447
1114	NC_007606	TGTT	2	8	65296	65303	0 %	75 %	25 %	0 %	82775447
1115	NC_007606	GCC	2	6	65304	65309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775447
1116	NC_007606	TTG	2	6	65373	65378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775447
1117	NC_007606	GTG	2	6	65415	65420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775447
1118	NC_007606	CCG	2	6	65451	65456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775447
1119	NC_007606	TTG	2	6	65490	65495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775448
1120	NC_007606	ATG	2	6	65511	65516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775448
1121	NC_007606	CTGGCG	2	12	65520	65531	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82775448
1122	NC_007606	CTGG	2	8	65561	65568	0 %	25 %	50 %	25 %	82775448
1123	NC_007606	CAT	2	6	66035	66040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775449
1124	NC_007606	CT	3	6	66100	66105	0 %	50 %	0 %	50 %	82775449
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1126	NC_007606	AGG	2	6	66150	66155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775449
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