MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 66989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007606	GTT	2	6	30200	30205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775413
502	NC_007606	CTG	2	6	30257	30262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775413
503	NC_007606	GTG	2	6	30275	30280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775413
504	NC_007606	TGGC	2	8	30295	30302	0 %	25 %	50 %	25 %	82775413
505	NC_007606	GCA	2	6	30391	30396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775413
506	NC_007606	GTC	2	6	32288	32293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161950171
507	NC_007606	TGG	2	6	32336	32341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161950171
508	NC_007606	CTG	2	6	32344	32349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161950171
509	NC_007606	TTTATG	2	12	32359	32370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	161950171
510	NC_007606	CCA	2	6	32447	32452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161950171
511	NC_007606	TTG	2	6	32513	32518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161950171
512	NC_007606	ATC	2	6	32524	32529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161950171
513	NC_007606	GCT	2	6	32604	32609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161950171
514	NC_007606	CCGTC	2	10	32617	32626	0 %	20 %	20 %	60 %	161950171
515	NC_007606	GTGAA	2	10	32627	32636	40 %	20 %	40 %	0 %	161950171
516	NC_007606	TGG	2	6	32681	32686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161950171
517	NC_007606	CTG	2	6	32746	32751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161950171
518	NC_007606	GCA	2	6	32899	32904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775415
519	NC_007606	CGT	2	6	32908	32913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775415
520	NC_007606	TGG	2	6	32977	32982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775415
521	NC_007606	GTTCA	2	10	33014	33023	20 %	40 %	20 %	20 %	82775415
522	NC_007606	CA	3	6	33022	33027	50 %	0 %	0 %	50 %	82775415
523	NC_007606	GCA	2	6	33100	33105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775415
524	NC_007606	GTT	2	6	33110	33115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775415
525	NC_007606	CGC	3	9	33154	33162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775415
526	NC_007606	ATA	2	6	33180	33185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775415
527	NC_007606	ATCCA	2	10	33340	33349	40 %	20 %	0 %	40 %	82775415
528	NC_007606	A	6	6	33386	33391	100 %	0 %	0 %	0 %	82775415
529	NC_007606	CCA	2	6	33406	33411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775415
530	NC_007606	TTG	2	6	33432	33437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775415
531	NC_007606	TGA	2	6	33439	33444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775415
532	NC_007606	A	7	7	33602	33608	100 %	0 %	0 %	0 %	82775416
533	NC_007606	GGC	2	6	33617	33622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775416
534	NC_007606	TAT	2	6	33718	33723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775416
535	NC_007606	CT	3	6	33727	33732	0 %	50 %	0 %	50 %	82775416
536	NC_007606	TAAA	2	8	33735	33742	75 %	25 %	0 %	0 %	82775416
537	NC_007606	CGGG	2	8	33748	33755	0 %	0 %	75 %	25 %	82775416
538	NC_007606	GCA	2	6	33856	33861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775416
539	NC_007606	CAGG	2	8	33875	33882	25 %	0 %	50 %	25 %	82775416
540	NC_007606	TAC	2	6	33884	33889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775416
541	NC_007606	AAG	2	6	33903	33908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775416
542	NC_007606	AGC	2	6	33936	33941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775416
543	NC_007606	AACG	2	8	33962	33969	50 %	0 %	25 %	25 %	82775416
544	NC_007606	GC	3	6	33971	33976	0 %	0 %	50 %	50 %	82775416
545	NC_007606	ACT	2	6	34039	34044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775416
546	NC_007606	CGA	2	6	34051	34056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775416
547	NC_007606	CGC	2	6	34085	34090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775416
548	NC_007606	CAC	2	6	34129	34134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775416
549	NC_007606	CAT	2	6	34135	34140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775416
550	NC_007606	CAC	2	6	34144	34149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775416
551	NC_007606	AC	3	6	34148	34153	50 %	0 %	0 %	50 %	82775416
552	NC_007606	GAA	2	6	34160	34165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775416
553	NC_007606	ATT	2	6	34193	34198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775416
554	NC_007606	TGG	2	6	34212	34217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775416
555	NC_007606	GCT	2	6	34237	34242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775416
556	NC_007606	TGC	2	6	34356	34361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775416
557	NC_007606	TGTT	2	8	34455	34462	0 %	75 %	25 %	0 %	82775416
558	NC_007606	ATG	2	6	34495	34500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775416
559	NC_007606	GCC	2	6	34581	34586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775417
560	NC_007606	TCA	2	6	34589	34594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775417
561	NC_007606	CTTTA	2	10	34603	34612	20 %	60 %	0 %	20 %	82775417
562	NC_007606	ATG	2	6	34696	34701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775417
563	NC_007606	TCA	2	6	34735	34740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775417
564	NC_007606	T	6	6	34741	34746	0 %	100 %	0 %	0 %	82775417
565	NC_007606	GCT	2	6	34776	34781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775417
566	NC_007606	ATT	2	6	34807	34812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775417
567	NC_007606	CGG	2	6	34824	34829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775417
568	NC_007606	TGGCG	2	10	34830	34839	0 %	20 %	60 %	20 %	82775417
569	NC_007606	TGTT	2	8	34847	34854	0 %	75 %	25 %	0 %	82775417
570	NC_007606	T	6	6	34882	34887	0 %	100 %	0 %	0 %	82775417
571	NC_007606	CGG	2	6	34940	34945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775417
572	NC_007606	GCC	2	6	35076	35081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775417
573	NC_007606	ATG	2	6	35159	35164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775417
574	NC_007606	TGG	2	6	35192	35197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775417
575	NC_007606	ACGTGG	2	12	35241	35252	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82775417
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577	NC_007606	CTT	2	6	35448	35453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775418
578	NC_007606	ATG	2	6	35508	35513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775418
579	NC_007606	TCT	2	6	35554	35559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775418
580	NC_007606	ATT	2	6	35600	35605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775418
581	NC_007606	GAT	2	6	35666	35671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775418
582	NC_007606	TGGG	2	8	35725	35732	0 %	25 %	75 %	0 %	82775418
583	NC_007606	AGT	2	6	35742	35747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775418
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585	NC_007606	A	7	7	35764	35770	100 %	0 %	0 %	0 %	82775418
586	NC_007606	ACAA	2	8	35878	35885	75 %	0 %	0 %	25 %	82775419
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589	NC_007606	TTA	2	6	36059	36064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775419
590	NC_007606	CAA	2	6	36161	36166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775419
591	NC_007606	GC	3	6	36353	36358	0 %	0 %	50 %	50 %	82775420
592	NC_007606	CGA	2	6	36414	36419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775420
593	NC_007606	CGA	2	6	36446	36451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775420
594	NC_007606	TAA	2	6	36471	36476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775420
595	NC_007606	GAA	2	6	36543	36548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775420
596	NC_007606	GGT	2	6	36573	36578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775420
597	NC_007606	TGA	2	6	36588	36593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775420
598	NC_007606	T	6	6	36783	36788	0 %	100 %	0 %	0 %	82775420
599	NC_007606	CGC	2	6	36808	36813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775420
600	NC_007606	CGC	2	6	36868	36873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775420
601	NC_007606	GGC	2	6	36922	36927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775420
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604	NC_007606	TTTCA	2	10	37144	37153	20 %	60 %	0 %	20 %	82775421
605	NC_007606	CTT	2	6	37197	37202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775421
606	NC_007606	GAT	2	6	37228	37233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775421
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609	NC_007606	GCA	2	6	37470	37475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775421
610	NC_007606	GATG	2	8	37761	37768	25 %	25 %	50 %	0 %	82775422
611	NC_007606	TAC	2	6	37776	37781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775422
612	NC_007606	ATGC	2	8	37813	37820	25 %	25 %	25 %	25 %	82775422
613	NC_007606	AG	3	6	37920	37925	50 %	0 %	50 %	0 %	82775422
614	NC_007606	TGT	2	6	37992	37997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775422
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616	NC_007606	ATG	2	6	38041	38046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775422
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618	NC_007606	TGG	2	6	38105	38110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775422
619	NC_007606	ACG	2	6	38196	38201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775422
620	NC_007606	TGG	2	6	38225	38230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775422
621	NC_007606	CGG	2	6	38269	38274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775422
622	NC_007606	ACT	2	6	38289	38294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775422
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626	NC_007606	GA	3	6	38454	38459	50 %	0 %	50 %	0 %	82775422
627	NC_007606	GGGA	2	8	38469	38476	25 %	0 %	75 %	0 %	82775422
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