MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 plasmid 1

Total Repeats: 650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007595	CGGG	2	8	35057	35064	0 %	0 %	75 %	25 %	81230358
502	NC_007595	CTGG	2	8	35070	35077	0 %	25 %	50 %	25 %	81230358
503	NC_007595	GCT	2	6	35710	35715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230359
504	NC_007595	TCT	2	6	35729	35734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230359
505	NC_007595	CCA	2	6	35788	35793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230359
506	NC_007595	GTA	2	6	35946	35951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230359
507	NC_007595	CTTCTG	2	12	36023	36034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	81230359
508	NC_007595	CAGC	2	8	36380	36387	25 %	0 %	25 %	50 %	81230360
509	NC_007595	ACT	2	6	36514	36519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230361
510	NC_007595	GTC	2	6	36533	36538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230361
511	NC_007595	CCAG	2	8	36617	36624	25 %	0 %	25 %	50 %	81230361
512	NC_007595	TGGG	2	8	36649	36656	0 %	25 %	75 %	0 %	81230361
513	NC_007595	CCG	2	6	36678	36683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230361
514	NC_007595	AGCG	2	8	36731	36738	25 %	0 %	50 %	25 %	81230361
515	NC_007595	C	6	6	36745	36750	0 %	0 %	0 %	100 %	81230361
516	NC_007595	CAC	2	6	36764	36769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230361
517	NC_007595	GA	3	6	36773	36778	50 %	0 %	50 %	0 %	81230361
518	NC_007595	GCG	2	6	36811	36816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230361
519	NC_007595	CGT	2	6	36830	36835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230361
520	NC_007595	TGC	2	6	36838	36843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230361
521	NC_007595	CCA	2	6	36878	36883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230361
522	NC_007595	CAT	2	6	36884	36889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230361
523	NC_007595	GCA	2	6	36905	36910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230361
524	NC_007595	T	6	6	36917	36922	0 %	100 %	0 %	0 %	81230361
525	NC_007595	AGC	2	6	37062	37067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230361
526	NC_007595	CAG	3	9	37073	37081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230361
527	NC_007595	CA	3	6	37143	37148	50 %	0 %	0 %	50 %	81230361
528	NC_007595	CAT	2	6	37199	37204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230361
529	NC_007595	TGC	2	6	37228	37233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230361
530	NC_007595	ACCTG	2	10	37246	37255	20 %	20 %	20 %	40 %	81230361
531	NC_007595	CAA	2	6	37290	37295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81230361
532	NC_007595	C	6	6	37296	37301	0 %	0 %	0 %	100 %	81230361
533	NC_007595	CTTGC	2	10	37418	37427	0 %	40 %	20 %	40 %	81230361
534	NC_007595	TC	3	6	37762	37767	0 %	50 %	0 %	50 %	81230362
535	NC_007595	ATCA	2	8	37787	37794	50 %	25 %	0 %	25 %	81230362
536	NC_007595	AGG	2	6	37816	37821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230362
537	NC_007595	CCT	2	6	37828	37833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230362
538	NC_007595	AGG	2	6	37865	37870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230362
539	NC_007595	CAT	2	6	37886	37891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230362
540	NC_007595	TG	3	6	37896	37901	0 %	50 %	50 %	0 %	81230362
541	NC_007595	AATC	2	8	37951	37958	50 %	25 %	0 %	25 %	81230362
542	NC_007595	TCA	2	6	38188	38193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230362
543	NC_007595	CCA	3	9	38211	38219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230362
544	NC_007595	AG	3	6	38348	38353	50 %	0 %	50 %	0 %	81230362
545	NC_007595	CTCA	2	8	38525	38532	25 %	25 %	0 %	50 %	81230363
546	NC_007595	TCT	2	6	38643	38648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230363
547	NC_007595	ACAA	2	8	38653	38660	75 %	0 %	0 %	25 %	81230363
548	NC_007595	TGG	2	6	38879	38884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81230363
549	NC_007595	TTG	2	6	39080	39085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230363
550	NC_007595	A	6	6	39566	39571	100 %	0 %	0 %	0 %	81230364
551	NC_007595	AGC	2	6	39598	39603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230364
552	NC_007595	CGCGAT	2	12	39633	39644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81230364
553	NC_007595	CAG	2	6	39678	39683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230364
554	NC_007595	CAC	2	6	39763	39768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230364
555	NC_007595	ATCA	2	8	39799	39806	50 %	25 %	0 %	25 %	81230364
556	NC_007595	ATC	2	6	39841	39846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230364
557	NC_007595	TGC	2	6	39875	39880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230364
558	NC_007595	GCC	2	6	40045	40050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230364
559	NC_007595	GAT	2	6	40053	40058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230364
560	NC_007595	AGA	2	6	40089	40094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81230364
561	NC_007595	CGAT	2	8	40126	40133	25 %	25 %	25 %	25 %	81230364
562	NC_007595	ATT	2	6	40144	40149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81230364
563	NC_007595	CGA	2	6	40161	40166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230364
564	NC_007595	CGC	2	6	40171	40176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230364
565	NC_007595	AGC	2	6	40480	40485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230365
566	NC_007595	CCA	2	6	40712	40717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230365
567	NC_007595	AGC	2	6	40890	40895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230365
568	NC_007595	CTT	2	6	40898	40903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230365
569	NC_007595	CAG	2	6	40921	40926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230365
570	NC_007595	CAG	2	6	40965	40970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230365
571	NC_007595	TCAA	2	8	40981	40988	50 %	25 %	0 %	25 %	81230365
572	NC_007595	GCT	2	6	41035	41040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230365
573	NC_007595	TGA	2	6	41050	41055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230365
574	NC_007595	CCG	2	6	41111	41116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230365
575	NC_007595	CTG	2	6	41121	41126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230365
576	NC_007595	GCA	2	6	41144	41149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230365
577	NC_007595	CCA	2	6	41175	41180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230365
578	NC_007595	CAGC	2	8	41184	41191	25 %	0 %	25 %	50 %	81230365
579	NC_007595	ATG	2	6	41194	41199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230365
580	NC_007595	CTG	2	6	41250	41255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230365
581	NC_007595	CCA	2	6	41264	41269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230365
582	NC_007595	TGC	2	6	41302	41307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230365
583	NC_007595	CCT	2	6	41458	41463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230365
584	NC_007595	GCC	2	6	41467	41472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230365
585	NC_007595	TTG	2	6	41541	41546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81230365
586	NC_007595	CGCC	2	8	41606	41613	0 %	0 %	25 %	75 %	81230365
587	NC_007595	AGAGCA	2	12	41684	41695	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	81230365
588	NC_007595	GCTGC	2	10	41739	41748	0 %	20 %	40 %	40 %	81230365
589	NC_007595	TCAA	2	8	41795	41802	50 %	25 %	0 %	25 %	81230366
590	NC_007595	AGC	2	6	41851	41856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230366
591	NC_007595	TAC	2	6	41865	41870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230366
592	NC_007595	CATC	2	8	41880	41887	25 %	25 %	0 %	50 %	81230366
593	NC_007595	GAG	2	6	41902	41907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81230366
594	NC_007595	GAT	2	6	41934	41939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230366
595	NC_007595	GCA	2	6	42081	42086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230366
596	NC_007595	AGT	2	6	42135	42140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81230366
597	NC_007595	ATCCA	2	10	42272	42281	40 %	20 %	0 %	40 %	81230366
598	NC_007595	ATC	2	6	42311	42316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230366
599	NC_007595	TCA	2	6	42326	42331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230366
600	NC_007595	TCT	2	6	42407	42412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81230366
601	NC_007595	GCA	2	6	42701	42706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230368
602	NC_007595	CGC	2	6	42762	42767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230368
603	NC_007595	AGCC	2	8	42891	42898	25 %	0 %	25 %	50 %	81230368
604	NC_007595	CCA	2	6	42929	42934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81230368
605	NC_007595	TCAC	2	8	43027	43034	25 %	25 %	0 %	50 %	81230368
606	NC_007595	CTC	2	6	43056	43061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230368
607	NC_007595	A	6	6	43123	43128	100 %	0 %	0 %	0 %	81230368
608	NC_007595	TGC	2	6	43327	43332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230369
609	NC_007595	CCCG	2	8	43363	43370	0 %	0 %	25 %	75 %	81230369
610	NC_007595	CTC	2	6	43379	43384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230369
611	NC_007595	ATC	2	6	43391	43396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230369
612	NC_007595	CGG	2	6	43417	43422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81230369
613	NC_007595	CTC	2	6	43556	43561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81230369
614	NC_007595	CTA	2	6	43597	43602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81230369
615	NC_007595	TCGGC	2	10	43609	43618	0 %	20 %	40 %	40 %	81230369
616	NC_007595	C	7	7	43650	43656	0 %	0 %	0 %	100 %	81230369
617	NC_007595	CA	3	6	43710	43715	50 %	0 %	0 %	50 %	81230369
618	NC_007595	A	6	6	43730	43735	100 %	0 %	0 %	0 %	81230369
619	NC_007595	A	6	6	43823	43828	100 %	0 %	0 %	0 %	81230369
620	NC_007595	GATGT	2	10	44017	44026	20 %	40 %	40 %	0 %	81230379
621	NC_007595	CAG	2	6	44055	44060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230379
622	NC_007595	T	6	6	44061	44066	0 %	100 %	0 %	0 %	81230379
623	NC_007595	TGC	2	6	44105	44110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81230379
624	NC_007595	GCTG	2	8	44161	44168	0 %	25 %	50 %	25 %	81230379
625	NC_007595	CAG	2	6	44212	44217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230379
626	NC_007595	GAC	2	6	44871	44876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230370
627	NC_007595	CCG	2	6	44903	44908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230370
628	NC_007595	GCA	2	6	44921	44926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81230370
629	NC_007595	CCG	2	6	44985	44990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81230370
630	NC_007595	TAGA	2	8	45004	45011	50 %	25 %	25 %	0 %	81230370
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