MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007516	CCTGGG	2	12	191531	191542	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78211736
4002	NC_007516	GCG	2	6	191554	191559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211736
4003	NC_007516	ACCGC	2	10	191563	191572	20 %	0 %	20 %	60 %	78211736
4004	NC_007516	GCT	2	6	191610	191615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211736
4005	NC_007516	GCT	2	6	191760	191765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211736
4006	NC_007516	AGC	2	6	191772	191777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211736
4007	NC_007516	C	6	6	191874	191879	0 %	0 %	0 %	100 %	78211736
4008	NC_007516	GCT	2	6	191988	191993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211736
4009	NC_007516	TGG	2	6	191998	192003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211736
4010	NC_007516	CG	3	6	192036	192041	0 %	0 %	50 %	50 %	78211736
4011	NC_007516	GAG	2	6	192085	192090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211736
4012	NC_007516	GCAG	2	8	192095	192102	25 %	0 %	50 %	25 %	78211736
4013	NC_007516	GTG	3	9	192147	192155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211737
4014	NC_007516	GTCT	2	8	192162	192169	0 %	50 %	25 %	25 %	78211737
4015	NC_007516	TGC	2	6	192280	192285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4016	NC_007516	GGA	2	6	192287	192292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211737
4017	NC_007516	GCTCTG	2	12	192320	192331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4018	NC_007516	GGTC	2	8	192341	192348	0 %	25 %	50 %	25 %	78211737
4019	NC_007516	TCCTG	2	10	192370	192379	0 %	40 %	20 %	40 %	78211737
4020	NC_007516	CGGTT	2	10	192499	192508	0 %	40 %	40 %	20 %	78211737
4021	NC_007516	GTGCTG	2	12	192534	192545	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78211737
4022	NC_007516	TGG	2	6	192547	192552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211737
4023	NC_007516	TGG	3	9	192561	192569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211737
4024	NC_007516	GTT	2	6	192638	192643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211737
4025	NC_007516	GGC	2	6	192653	192658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211737
4026	NC_007516	TGGC	2	8	192671	192678	0 %	25 %	50 %	25 %	78211737
4027	NC_007516	CGC	2	6	192681	192686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211737
4028	NC_007516	T	6	6	192693	192698	0 %	100 %	0 %	0 %	78211737
4029	NC_007516	CCG	2	6	192700	192705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211737
4030	NC_007516	GGA	2	6	192812	192817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211737
4031	NC_007516	CTG	2	6	192870	192875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4032	NC_007516	TGG	2	6	192880	192885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211737
4033	NC_007516	GCG	2	6	192890	192895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211737
4034	NC_007516	TCT	2	6	192935	192940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211737
4035	NC_007516	CTG	2	6	192966	192971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4036	NC_007516	TGTCG	2	10	192989	192998	0 %	40 %	40 %	20 %	78211737
4037	NC_007516	TCG	2	6	193030	193035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4038	NC_007516	TGC	2	6	193039	193044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4039	NC_007516	CGG	2	6	193045	193050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211737
4040	NC_007516	ATC	2	6	193119	193124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211737
4041	NC_007516	TGC	2	6	193129	193134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4042	NC_007516	TGG	2	6	193135	193140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211737
4043	NC_007516	TGG	2	6	193146	193151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211737
4044	NC_007516	GGT	2	6	193185	193190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211737
4045	NC_007516	CAGC	2	8	193220	193227	25 %	0 %	25 %	50 %	78211737
4046	NC_007516	GGC	2	6	193295	193300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211737
4047	NC_007516	G	8	8	193333	193340	0 %	0 %	100 %	0 %	78211737
4048	NC_007516	CTGG	2	8	193391	193398	0 %	25 %	50 %	25 %	78211737
4049	NC_007516	CAG	2	6	193400	193405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211737
4050	NC_007516	GCC	3	9	193409	193417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211737
4051	NC_007516	GTT	2	6	193511	193516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211737
4052	NC_007516	TGAG	2	8	193547	193554	25 %	25 %	50 %	0 %	78211737
4053	NC_007516	TGC	3	9	193569	193577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4054	NC_007516	CAG	3	9	193582	193590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4055	NC_007516	CCA	2	6	193611	193616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211738
4056	NC_007516	CCAG	2	8	193668	193675	25 %	0 %	25 %	50 %	78211738
4057	NC_007516	CTGTT	2	10	193788	193797	0 %	60 %	20 %	20 %	78211738
4058	NC_007516	GCT	2	6	193881	193886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4059	NC_007516	AGC	2	6	193889	193894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4060	NC_007516	GCTG	2	8	193899	193906	0 %	25 %	50 %	25 %	78211738
4061	NC_007516	GCA	2	6	193925	193930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4062	NC_007516	TGG	2	6	193947	193952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211738
4063	NC_007516	GGC	2	6	193995	194000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211738
4064	NC_007516	GCT	2	6	194053	194058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4065	NC_007516	GT	3	6	194132	194137	0 %	50 %	50 %	0 %	78211738
4066	NC_007516	TCAGC	2	10	194145	194154	20 %	20 %	20 %	40 %	78211738
4067	NC_007516	CAG	2	6	194200	194205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4068	NC_007516	CTG	2	6	194209	194214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4069	NC_007516	TCAC	2	8	194333	194340	25 %	25 %	0 %	50 %	78211738
4070	NC_007516	GCA	2	6	194367	194372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4071	NC_007516	GCG	2	6	194396	194401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211738
4072	NC_007516	C	6	6	194414	194419	0 %	0 %	0 %	100 %	78211738
4073	NC_007516	AGC	2	6	194437	194442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4074	NC_007516	GCTG	2	8	194513	194520	0 %	25 %	50 %	25 %	78211738
4075	NC_007516	G	6	6	194574	194579	0 %	0 %	100 %	0 %	78211738
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4080	NC_007516	GCCA	2	8	194876	194883	25 %	0 %	25 %	50 %	78211738
4081	NC_007516	TCG	3	9	194936	194944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4082	NC_007516	GCA	2	6	194967	194972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211738
4083	NC_007516	GTTGCA	2	12	195009	195020	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78211738
4084	NC_007516	GCG	2	6	195037	195042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211738
4085	NC_007516	GA	3	6	195136	195141	50 %	0 %	50 %	0 %	78211738
4086	NC_007516	CTG	2	6	195182	195187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211738
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4088	NC_007516	CA	3	6	195312	195317	50 %	0 %	0 %	50 %	78211738
4089	NC_007516	TCG	2	6	195341	195346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211738
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4093	NC_007516	GGAT	2	8	195543	195550	25 %	25 %	50 %	0 %	78211739
4094	NC_007516	CTG	2	6	195555	195560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211739
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4098	NC_007516	CAC	2	6	195726	195731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211739
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4100	NC_007516	GTT	2	6	195954	195959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211739
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4102	NC_007516	GCC	2	6	196063	196068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211739
4103	NC_007516	TGC	2	6	196175	196180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211739
4104	NC_007516	GCC	3	9	196216	196224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211739
4105	NC_007516	CATTCA	2	12	196238	196249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211739
4106	NC_007516	CCA	2	6	196382	196387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211739
4107	NC_007516	CTG	2	6	196441	196446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211739
4108	NC_007516	CAC	2	6	196464	196469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211739
4109	NC_007516	CAG	2	6	196488	196493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211739
4110	NC_007516	CCG	2	6	196528	196533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211739
4111	NC_007516	TGA	2	6	196535	196540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211739
4112	NC_007516	GC	3	6	196739	196744	0 %	0 %	50 %	50 %	78211740
4113	NC_007516	CGC	2	6	196782	196787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211740
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4117	NC_007516	GCA	2	6	196933	196938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211740
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4123	NC_007516	CT	4	8	197334	197341	0 %	50 %	0 %	50 %	78211740
4124	NC_007516	TAC	2	6	197438	197443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211740
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4132	NC_007516	GTG	2	6	197805	197810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211740
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4248	NC_007516	A	6	6	204972	204977	100 %	0 %	0 %	0 %	78211746
4249	NC_007516	A	8	8	204992	204999	100 %	0 %	0 %	0 %	78211746
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4281	NC_007516	TTG	2	6	206280	206285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211746
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4372	NC_007516	TGG	2	6	210468	210473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211753
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4493	NC_007516	CCA	4	12	216220	216231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211761
4494	NC_007516	GCC	2	6	216276	216281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4495	NC_007516	G	6	6	216301	216306	0 %	0 %	100 %	0 %	78211761
4496	NC_007516	CCG	2	6	216309	216314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4497	NC_007516	GGC	2	6	216334	216339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211761
4498	NC_007516	GCC	2	6	216345	216350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4499	NC_007516	CGG	2	6	216365	216370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211761
4500	NC_007516	CAG	2	6	216371	216376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761

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