MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007516	GCA	2	6	73440	73445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1502	NC_007516	CGGC	2	8	73447	73454	0 %	0 %	50 %	50 %	78211629
1503	NC_007516	GGCC	2	8	73506	73513	0 %	0 %	50 %	50 %	78211629
1504	NC_007516	GCA	3	9	73536	73544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1505	NC_007516	CAC	2	6	73579	73584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211629
1506	NC_007516	GCT	2	6	73701	73706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1507	NC_007516	GCT	2	6	73714	73719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1508	NC_007516	GCA	2	6	73812	73817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1509	NC_007516	CAG	2	6	73822	73827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1510	NC_007516	CCG	2	6	73844	73849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211629
1511	NC_007516	CAG	3	9	73858	73866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1512	NC_007516	AG	3	6	73865	73870	50 %	0 %	50 %	0 %	78211629
1513	NC_007516	GCA	2	6	73881	73886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1514	NC_007516	CAG	2	6	73900	73905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211629
1515	NC_007516	AGG	2	6	73944	73949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211629
1516	NC_007516	CAG	2	6	74016	74021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211630
1517	NC_007516	GCAGC	2	10	74036	74045	20 %	0 %	40 %	40 %	78211630
1518	NC_007516	AGC	2	6	74050	74055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211630
1519	NC_007516	TGA	2	6	74083	74088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211630
1520	NC_007516	GCC	2	6	74097	74102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211630
1521	NC_007516	CTGAT	2	10	74143	74152	20 %	40 %	20 %	20 %	78211630
1522	NC_007516	GT	5	10	74214	74223	0 %	50 %	50 %	0 %	78211630
1523	NC_007516	GGT	2	6	74252	74257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211630
1524	NC_007516	TGG	2	6	74275	74280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211630
1525	NC_007516	ACG	2	6	74293	74298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211630
1526	NC_007516	CGC	2	6	74352	74357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211630
1527	NC_007516	CTG	2	6	74367	74372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211630
1528	NC_007516	GTG	2	6	74379	74384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211630
1529	NC_007516	GAGCAG	2	12	74421	74432	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78211630
1530	NC_007516	TGG	2	6	74446	74451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211630
1531	NC_007516	CCG	2	6	74452	74457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211630
1532	NC_007516	GGC	2	6	74481	74486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211630
1533	NC_007516	CGG	2	6	74611	74616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211630
1534	NC_007516	CGGC	2	8	74647	74654	0 %	0 %	50 %	50 %	78211630
1535	NC_007516	CAG	2	6	74668	74673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211630
1536	NC_007516	CTGC	2	8	74678	74685	0 %	25 %	25 %	50 %	78211630
1537	NC_007516	TGG	2	6	74701	74706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211630
1538	NC_007516	GTT	2	6	74709	74714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211630
1539	NC_007516	CGCT	2	8	74817	74824	0 %	25 %	25 %	50 %	78211631
1540	NC_007516	TCA	2	6	74882	74887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211631
1541	NC_007516	TGG	3	9	74909	74917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211631
1542	NC_007516	CGGTGC	2	12	74939	74950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	78211631
1543	NC_007516	TGC	2	6	75026	75031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211631
1544	NC_007516	CTT	2	6	75048	75053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211631
1545	NC_007516	CGT	2	6	75054	75059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211631
1546	NC_007516	TCG	2	6	75179	75184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211632
1547	NC_007516	GTTC	2	8	75305	75312	0 %	50 %	25 %	25 %	78211632
1548	NC_007516	CAG	2	6	75331	75336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211632
1549	NC_007516	TGG	3	9	75413	75421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211632
1550	NC_007516	TGC	2	6	75441	75446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211632
1551	NC_007516	GC	3	6	75451	75456	0 %	0 %	50 %	50 %	78211632
1552	NC_007516	GCA	2	6	75504	75509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211632
1553	NC_007516	GCGG	2	8	75519	75526	0 %	0 %	75 %	25 %	78211632
1554	NC_007516	TGA	2	6	75584	75589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211632
1555	NC_007516	CAC	2	6	75653	75658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1556	NC_007516	CCA	2	6	75714	75719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1557	NC_007516	TGA	2	6	75729	75734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211633
1558	NC_007516	TCC	2	6	75759	75764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211633
1559	NC_007516	CGG	2	6	75799	75804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
1560	NC_007516	GTGG	2	8	75827	75834	0 %	25 %	75 %	0 %	78211633
1561	NC_007516	CGCC	2	8	75859	75866	0 %	0 %	25 %	75 %	78211633
1562	NC_007516	GCTC	2	8	75871	75878	0 %	25 %	25 %	50 %	78211633
1563	NC_007516	CCCG	2	8	75919	75926	0 %	0 %	25 %	75 %	78211633
1564	NC_007516	AGC	2	6	75936	75941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211633
1565	NC_007516	GTG	2	6	75962	75967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211633
1566	NC_007516	CCA	2	6	75994	75999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1567	NC_007516	CGG	2	6	76015	76020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
1568	NC_007516	ATC	2	6	76025	76030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211633
1569	NC_007516	CACC	2	8	76036	76043	25 %	0 %	0 %	75 %	78211633
1570	NC_007516	GTAG	2	8	76138	76145	25 %	25 %	50 %	0 %	78211633
1571	NC_007516	CAC	2	6	76178	76183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1572	NC_007516	CAT	2	6	76210	76215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211633
1573	NC_007516	CCA	2	6	76234	76239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1574	NC_007516	CCA	2	6	76249	76254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1575	NC_007516	GGC	2	6	76261	76266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
1576	NC_007516	TCC	2	6	76269	76274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211633
1577	NC_007516	TGGT	2	8	76300	76307	0 %	50 %	50 %	0 %	78211633
1578	NC_007516	GGC	2	6	76325	76330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
1579	NC_007516	GCA	2	6	76362	76367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211633
1580	NC_007516	GGC	2	6	76394	76399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
1581	NC_007516	TTC	2	6	76517	76522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211633
1582	NC_007516	CGG	2	6	76561	76566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
1583	NC_007516	GGT	2	6	76609	76614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211633
1584	NC_007516	TGC	2	6	76656	76661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211633
1585	NC_007516	TGG	2	6	76665	76670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211633
1586	NC_007516	CAG	2	6	76715	76720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211633
1587	NC_007516	GGAGAG	2	12	76754	76765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211633
1588	NC_007516	CCA	2	6	76777	76782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1589	NC_007516	AGC	2	6	76833	76838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211633
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1591	NC_007516	GCCC	2	8	76949	76956	0 %	0 %	25 %	75 %	78211633
1592	NC_007516	CGGCC	2	10	76957	76966	0 %	0 %	40 %	60 %	78211633
1593	NC_007516	CACC	2	8	77032	77039	25 %	0 %	0 %	75 %	78211633
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1596	NC_007516	CCAG	2	8	77098	77105	25 %	0 %	25 %	50 %	78211633
1597	NC_007516	GCC	2	6	77120	77125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211633
1598	NC_007516	CGAT	2	8	77142	77149	25 %	25 %	25 %	25 %	78211633
1599	NC_007516	GCG	2	6	77210	77215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
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1601	NC_007516	TCC	3	9	77286	77294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211633
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1604	NC_007516	TGC	3	9	77397	77405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211633
1605	NC_007516	GGCC	2	8	77480	77487	0 %	0 %	50 %	50 %	78211633
1606	NC_007516	GCG	2	6	77502	77507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211633
1607	NC_007516	CCT	2	6	77527	77532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211633
1608	NC_007516	GCT	2	6	77542	77547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211633
1609	NC_007516	GCT	2	6	77558	77563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211633
1610	NC_007516	TCT	2	6	77565	77570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211633
1611	NC_007516	CAGCG	2	10	77622	77631	20 %	0 %	40 %	40 %	78211633
1612	NC_007516	GTT	2	6	77632	77637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211633
1613	NC_007516	CCA	3	9	77653	77661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211633
1614	NC_007516	CCG	2	6	77662	77667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211633
1615	NC_007516	CCAG	2	8	77668	77675	25 %	0 %	25 %	50 %	78211633
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1621	NC_007516	GTG	2	6	77846	77851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211633
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