MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007516	AGC	2	6	50310	50315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1002	NC_007516	GGC	2	6	50392	50397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211607
1003	NC_007516	CTT	2	6	50401	50406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211607
1004	NC_007516	GGC	2	6	50578	50583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211607
1005	NC_007516	CGT	2	6	50622	50627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1006	NC_007516	CGGT	2	8	50657	50664	0 %	25 %	50 %	25 %	78211607
1007	NC_007516	TGT	2	6	50730	50735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211607
1008	NC_007516	AGC	2	6	50747	50752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1009	NC_007516	GGA	2	6	50802	50807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211607
1010	NC_007516	TGG	2	6	50871	50876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211607
1011	NC_007516	CGC	2	6	50877	50882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211607
1012	NC_007516	CAC	2	6	50923	50928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211607
1013	NC_007516	GGC	2	6	50956	50961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211607
1014	NC_007516	CAG	2	6	50962	50967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1015	NC_007516	GTT	2	6	50986	50991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211607
1016	NC_007516	TGG	2	6	51009	51014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211607
1017	NC_007516	GCT	2	6	51016	51021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211607
1018	NC_007516	GGC	2	6	51037	51042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211607
1019	NC_007516	CTC	2	6	51079	51084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211607
1020	NC_007516	TCC	2	6	51161	51166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211607
1021	NC_007516	GTCGAT	2	12	51223	51234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	78211607
1022	NC_007516	CCG	2	6	51323	51328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211607
1023	NC_007516	CCA	2	6	51443	51448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211608
1024	NC_007516	CAT	3	9	51480	51488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211608
1025	NC_007516	GAC	2	6	51563	51568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211608
1026	NC_007516	CTTCA	2	10	51679	51688	20 %	40 %	0 %	40 %	78211609
1027	NC_007516	GGC	2	6	51812	51817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211609
1028	NC_007516	CGCC	2	8	51823	51830	0 %	0 %	25 %	75 %	78211609
1029	NC_007516	GCC	2	6	51885	51890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211609
1030	NC_007516	CCA	3	9	51916	51924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211609
1031	NC_007516	GAT	2	6	51944	51949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211609
1032	NC_007516	GGC	2	6	51962	51967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211609
1033	NC_007516	TTG	2	6	51969	51974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211609
1034	NC_007516	CCT	2	6	52030	52035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211609
1035	NC_007516	GCAA	2	8	52047	52054	50 %	0 %	25 %	25 %	78211609
1036	NC_007516	GCA	2	6	52075	52080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211609
1037	NC_007516	CTT	2	6	52090	52095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211609
1038	NC_007516	GTT	2	6	52102	52107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211609
1039	NC_007516	ATCGG	2	10	52128	52137	20 %	20 %	40 %	20 %	78211609
1040	NC_007516	AGA	2	6	52140	52145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211609
1041	NC_007516	TCC	2	6	52188	52193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211609
1042	NC_007516	TCC	2	6	52245	52250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211609
1043	NC_007516	GCA	2	6	52276	52281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211609
1044	NC_007516	CAAT	2	8	52296	52303	50 %	25 %	0 %	25 %	78211609
1045	NC_007516	CTG	2	6	52394	52399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211609
1046	NC_007516	ATGG	2	8	52410	52417	25 %	25 %	50 %	0 %	78211609
1047	NC_007516	CGCC	2	8	52458	52465	0 %	0 %	25 %	75 %	78211609
1048	NC_007516	TGG	2	6	52821	52826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211610
1049	NC_007516	CAC	2	6	52858	52863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211610
1050	NC_007516	CGG	2	6	52948	52953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211610
1051	NC_007516	CCA	2	6	52983	52988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211610
1052	NC_007516	GTGG	2	8	53036	53043	0 %	25 %	75 %	0 %	78211610
1053	NC_007516	GAA	2	6	53072	53077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211610
1054	NC_007516	CTTT	2	8	53172	53179	0 %	75 %	0 %	25 %	78211611
1055	NC_007516	TGT	2	6	53187	53192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211611
1056	NC_007516	TCT	2	6	53211	53216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211611
1057	NC_007516	TGG	2	6	53328	53333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211611
1058	NC_007516	CAC	2	6	53409	53414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211611
1059	NC_007516	GCT	2	6	53447	53452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211611
1060	NC_007516	ACC	3	9	53591	53599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211611
1061	NC_007516	CAG	2	6	53629	53634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211611
1062	NC_007516	GCA	2	6	53646	53651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211611
1063	NC_007516	ACG	2	6	53689	53694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211612
1064	NC_007516	CTT	2	6	53763	53768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211612
1065	NC_007516	GCG	2	6	53815	53820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211612
1066	NC_007516	ACG	4	12	53859	53870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211612
1067	NC_007516	TCA	2	6	53897	53902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211612
1068	NC_007516	CCA	2	6	53938	53943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211612
1069	NC_007516	TTG	2	6	53971	53976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211612
1070	NC_007516	CT	3	6	53999	54004	0 %	50 %	0 %	50 %	78211612
1071	NC_007516	CAT	2	6	54086	54091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211613
1072	NC_007516	CCA	2	6	54121	54126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211613
1073	NC_007516	TGG	2	6	54133	54138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211613
1074	NC_007516	CAG	2	6	54173	54178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211613
1075	NC_007516	CGA	2	6	54195	54200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211613
1076	NC_007516	GCT	2	6	54337	54342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1077	NC_007516	TGC	2	6	54354	54359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1078	NC_007516	GAG	2	6	54389	54394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211614
1079	NC_007516	ACTGAG	2	12	54413	54424	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78211614
1080	NC_007516	TGG	2	6	54432	54437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211614
1081	NC_007516	ATC	2	6	54525	54530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211614
1082	NC_007516	TGC	2	6	54535	54540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1083	NC_007516	GCT	2	6	54551	54556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1084	NC_007516	GACC	2	8	54659	54666	25 %	0 %	25 %	50 %	78211614
1085	NC_007516	CCG	2	6	54679	54684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211614
1086	NC_007516	CGG	2	6	54714	54719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211614
1087	NC_007516	CGTG	2	8	54829	54836	0 %	25 %	50 %	25 %	78211614
1088	NC_007516	G	6	6	54889	54894	0 %	0 %	100 %	0 %	78211614
1089	NC_007516	TGG	2	6	55008	55013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211614
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1091	NC_007516	GGC	2	6	55081	55086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211614
1092	NC_007516	GC	3	6	55109	55114	0 %	0 %	50 %	50 %	78211614
1093	NC_007516	CTG	2	6	55215	55220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1094	NC_007516	CCA	2	6	55296	55301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211614
1095	NC_007516	GAT	2	6	55309	55314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211614
1096	NC_007516	CAG	3	9	55412	55420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1097	NC_007516	GGT	2	6	55426	55431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211614
1098	NC_007516	TTGC	2	8	55439	55446	0 %	50 %	25 %	25 %	78211614
1099	NC_007516	AGC	2	6	55534	55539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1100	NC_007516	GCA	2	6	55623	55628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211614
1101	NC_007516	AGG	2	6	55716	55721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211614
1102	NC_007516	GCTG	2	8	55728	55735	0 %	25 %	50 %	25 %	78211614
1103	NC_007516	GTG	3	9	55740	55748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211614
1104	NC_007516	CCTGG	2	10	55792	55801	0 %	20 %	40 %	40 %	78211614
1105	NC_007516	TGGC	2	8	55804	55811	0 %	25 %	50 %	25 %	78211614
1106	NC_007516	TAC	2	6	55835	55840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211614
1107	NC_007516	GCCTT	2	10	56040	56049	0 %	40 %	20 %	40 %	78211615
1108	NC_007516	TGG	2	6	56157	56162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211615
1109	NC_007516	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211615
1110	NC_007516	GGT	2	6	56185	56190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211615
1111	NC_007516	TGG	2	6	56199	56204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211615
1112	NC_007516	TCCG	2	8	56227	56234	0 %	25 %	25 %	50 %	78211615
1113	NC_007516	CAC	2	6	56242	56247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211615
1114	NC_007516	CGA	2	6	56257	56262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211615
1115	NC_007516	GCCA	2	8	56303	56310	25 %	0 %	25 %	50 %	78211615
1116	NC_007516	CATC	2	8	56329	56336	25 %	25 %	0 %	50 %	78211615
1117	NC_007516	GGT	2	6	56351	56356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211615
1118	NC_007516	GAC	2	6	56441	56446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211615
1119	NC_007516	TGG	2	6	56479	56484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211615
1120	NC_007516	CGG	2	6	56490	56495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211615
1121	NC_007516	GCG	2	6	56664	56669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211615
1122	NC_007516	TGACCT	2	12	56695	56706	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	78211615
1123	NC_007516	TGG	2	6	56736	56741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211615
1124	NC_007516	TTG	2	6	56744	56749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211615
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1126	NC_007516	T	6	6	56909	56914	0 %	100 %	0 %	0 %	78211615
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