MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007516	CAA	2	6	24834	24839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211579
502	NC_007516	CGG	2	6	24945	24950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211579
503	NC_007516	CAG	2	6	25072	25077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211579
504	NC_007516	GCAG	2	8	25116	25123	25 %	0 %	50 %	25 %	78211579
505	NC_007516	CAGGAG	2	12	25132	25143	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	78211579
506	NC_007516	GCG	2	6	25178	25183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211579
507	NC_007516	CAC	2	6	25212	25217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211579
508	NC_007516	GCG	2	6	25229	25234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211579
509	NC_007516	TGG	2	6	25350	25355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211579
510	NC_007516	AAG	2	6	25378	25383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211579
511	NC_007516	ATC	2	6	25505	25510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211579
512	NC_007516	TCT	2	6	25538	25543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211579
513	NC_007516	AGGTCA	2	12	25547	25558	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78211579
514	NC_007516	GCA	2	6	25610	25615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211579
515	NC_007516	CCG	2	6	25631	25636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211579
516	NC_007516	CTC	2	6	25771	25776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211579
517	NC_007516	CCGC	2	8	25799	25806	0 %	0 %	25 %	75 %	78211579
518	NC_007516	GCAA	2	8	25808	25815	50 %	0 %	25 %	25 %	78211579
519	NC_007516	CAC	4	12	25816	25827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211579
520	NC_007516	GTCT	2	8	25968	25975	0 %	50 %	25 %	25 %	78211580
521	NC_007516	TGG	3	9	26120	26128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211581
522	NC_007516	GATG	2	8	26173	26180	25 %	25 %	50 %	0 %	78211581
523	NC_007516	GCT	2	6	26190	26195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211581
524	NC_007516	CGC	2	6	26203	26208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211581
525	NC_007516	CCAGG	2	10	26275	26284	20 %	0 %	40 %	40 %	78211581
526	NC_007516	GTG	2	6	26293	26298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211581
527	NC_007516	GCCAC	2	10	26310	26319	20 %	0 %	20 %	60 %	78211581
528	NC_007516	TGG	2	6	26357	26362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211581
529	NC_007516	CGG	2	6	26426	26431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211581
530	NC_007516	CTG	2	6	26455	26460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211581
531	NC_007516	AGAC	2	8	26468	26475	50 %	0 %	25 %	25 %	78211581
532	NC_007516	CTC	2	6	26476	26481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211581
533	NC_007516	TG	3	6	26615	26620	0 %	50 %	50 %	0 %	78211581
534	NC_007516	CTG	2	6	26647	26652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211581
535	NC_007516	CAC	2	6	26721	26726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211581
536	NC_007516	AAC	2	6	26849	26854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211581
537	NC_007516	CTGC	2	8	26883	26890	0 %	25 %	25 %	50 %	78211581
538	NC_007516	GT	3	6	26912	26917	0 %	50 %	50 %	0 %	78211581
539	NC_007516	ACTG	2	8	26920	26927	25 %	25 %	25 %	25 %	78211581
540	NC_007516	GAGCA	2	10	26962	26971	40 %	0 %	40 %	20 %	78211581
541	NC_007516	GCC	2	6	26978	26983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211581
542	NC_007516	TTC	2	6	27020	27025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211582
543	NC_007516	GCC	2	6	27063	27068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211582
544	NC_007516	TGT	2	6	27102	27107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211582
545	NC_007516	GCA	2	6	27115	27120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211582
546	NC_007516	GCT	2	6	27188	27193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211582
547	NC_007516	CTT	2	6	27263	27268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211582
548	NC_007516	GCC	2	6	27345	27350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211583
549	NC_007516	CTTCA	2	10	27368	27377	20 %	40 %	0 %	40 %	78211583
550	NC_007516	GCC	2	6	27506	27511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211583
551	NC_007516	GTT	2	6	27598	27603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211583
552	NC_007516	CGT	2	6	27614	27619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211583
553	NC_007516	GTG	2	6	27642	27647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211583
554	NC_007516	ACA	2	6	27700	27705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211583
555	NC_007516	C	6	6	27783	27788	0 %	0 %	0 %	100 %	78211583
556	NC_007516	TCA	2	6	27853	27858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211583
557	NC_007516	GTG	2	6	27981	27986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211583
558	NC_007516	CAGA	2	8	28016	28023	50 %	0 %	25 %	25 %	78211583
559	NC_007516	CAG	2	6	28055	28060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211583
560	NC_007516	AGC	2	6	28103	28108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211583
561	NC_007516	GCCA	2	8	28152	28159	25 %	0 %	25 %	50 %	78211583
562	NC_007516	CTC	2	6	28168	28173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211583
563	NC_007516	GGT	2	6	28184	28189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211583
564	NC_007516	TGC	2	6	28410	28415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
565	NC_007516	CAG	4	12	28459	28470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
566	NC_007516	CAG	2	6	28549	28554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
567	NC_007516	TGG	2	6	28640	28645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211584
568	NC_007516	TCA	2	6	28652	28657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211584
569	NC_007516	GAC	2	6	28665	28670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
570	NC_007516	GCG	2	6	28696	28701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211584
571	NC_007516	GGCA	2	8	28764	28771	25 %	0 %	50 %	25 %	78211584
572	NC_007516	CAGCC	2	10	28804	28813	20 %	0 %	20 %	60 %	78211584
573	NC_007516	AGGGC	2	10	28890	28899	20 %	0 %	60 %	20 %	78211584
574	NC_007516	TCG	2	6	28916	28921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
575	NC_007516	ACC	2	6	28932	28937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211584
576	NC_007516	C	6	6	29003	29008	0 %	0 %	0 %	100 %	78211584
577	NC_007516	GTC	2	6	29035	29040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
578	NC_007516	AGT	2	6	29049	29054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211584
579	NC_007516	AGC	2	6	29147	29152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
580	NC_007516	TGC	2	6	29175	29180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
581	NC_007516	CAG	2	6	29233	29238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
582	NC_007516	GGT	2	6	29242	29247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211584
583	NC_007516	TGG	3	9	29259	29267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211584
584	NC_007516	TGC	2	6	29303	29308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
585	NC_007516	GCC	2	6	29318	29323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211584
586	NC_007516	CAC	2	6	29410	29415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211584
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588	NC_007516	CTG	2	6	29470	29475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211584
589	NC_007516	GTT	2	6	29505	29510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211584
590	NC_007516	CGA	2	6	29562	29567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211584
591	NC_007516	CCG	2	6	29597	29602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211584
592	NC_007516	GGAT	2	8	29867	29874	25 %	25 %	50 %	0 %	78211585
593	NC_007516	CCA	2	6	29934	29939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211585
594	NC_007516	CTG	2	6	29948	29953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211585
595	NC_007516	TTC	2	6	30044	30049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211585
596	NC_007516	GT	3	6	30117	30122	0 %	50 %	50 %	0 %	78211585
597	NC_007516	AAG	2	6	30167	30172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211585
598	NC_007516	ACG	2	6	30231	30236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211585
599	NC_007516	CAC	2	6	30283	30288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211585
600	NC_007516	TGA	2	6	30348	30353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211585
601	NC_007516	CCA	2	6	30354	30359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211585
602	NC_007516	CCGTGC	2	12	30415	30426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78211585
603	NC_007516	CAC	3	9	30448	30456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211585
604	NC_007516	CGC	2	6	30577	30582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211585
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607	NC_007516	ATC	2	6	30641	30646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211585
608	NC_007516	CCA	2	6	30699	30704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211585
609	NC_007516	CCTGG	2	10	30754	30763	0 %	20 %	40 %	40 %	78211585
610	NC_007516	CAGC	2	8	30784	30791	25 %	0 %	25 %	50 %	78211585
611	NC_007516	GTT	2	6	30794	30799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211585
612	NC_007516	GGT	2	6	30811	30816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211585
613	NC_007516	GCT	2	6	30919	30924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211586
614	NC_007516	GCTT	2	8	31022	31029	0 %	50 %	25 %	25 %	78211586
615	NC_007516	CA	3	6	31048	31053	50 %	0 %	0 %	50 %	78211586
616	NC_007516	TCCTC	2	10	31093	31102	0 %	40 %	0 %	60 %	78211586
617	NC_007516	GCA	2	6	31172	31177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211586
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620	NC_007516	CAG	2	6	31284	31289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211586
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622	NC_007516	TGG	2	6	31324	31329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211586
623	NC_007516	GTC	2	6	31386	31391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211586
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625	NC_007516	GGGC	2	8	31456	31463	0 %	0 %	75 %	25 %	78211586
626	NC_007516	GAC	2	6	31493	31498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211586
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