MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007516	TCC	2	6	289665	289670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211836
6002	NC_007516	GAT	2	6	289748	289753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211836
6003	NC_007516	G	6	6	289795	289800	0 %	0 %	100 %	0 %	78211836
6004	NC_007516	GCA	2	6	289870	289875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6005	NC_007516	GAA	2	6	289880	289885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211836
6006	NC_007516	GAA	2	6	289889	289894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211836
6007	NC_007516	GCA	2	6	289948	289953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6008	NC_007516	CAG	2	6	289978	289983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6009	NC_007516	CAG	2	6	290027	290032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6010	NC_007516	CGG	2	6	290107	290112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211836
6011	NC_007516	GCA	2	6	290140	290145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6012	NC_007516	C	6	6	290184	290189	0 %	0 %	0 %	100 %	78211836
6013	NC_007516	AAT	2	6	290192	290197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78211836
6014	NC_007516	CGG	2	6	290374	290379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211836
6015	NC_007516	CA	3	6	290439	290444	50 %	0 %	0 %	50 %	78211836
6016	NC_007516	GCA	2	6	290500	290505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6017	NC_007516	CCA	2	6	290525	290530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211836
6018	NC_007516	CAG	2	6	290588	290593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6019	NC_007516	GTT	2	6	290603	290608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211836
6020	NC_007516	AGA	2	6	290617	290622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211836
6021	NC_007516	C	6	6	290635	290640	0 %	0 %	0 %	100 %	78211836
6022	NC_007516	TCGAT	2	10	290686	290695	20 %	40 %	20 %	20 %	78211836
6023	NC_007516	TCCAC	2	10	290719	290728	20 %	20 %	0 %	60 %	78211836
6024	NC_007516	CTG	2	6	290750	290755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6025	NC_007516	TGG	2	6	290803	290808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211836
6026	NC_007516	CCT	2	6	290851	290856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211836
6027	NC_007516	GAT	2	6	290891	290896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211836
6028	NC_007516	TGGCGT	2	12	290899	290910	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	78211836
6029	NC_007516	GCA	2	6	290914	290919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6030	NC_007516	CGGCC	2	10	290936	290945	0 %	0 %	40 %	60 %	78211836
6031	NC_007516	TCG	2	6	290946	290951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6032	NC_007516	TTC	2	6	290997	291002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211836
6033	NC_007516	GTC	2	6	291017	291022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6034	NC_007516	GGT	2	6	291068	291073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211836
6035	NC_007516	ACTGG	2	10	291096	291105	20 %	20 %	40 %	20 %	78211836
6036	NC_007516	GC	3	6	291165	291170	0 %	0 %	50 %	50 %	78211836
6037	NC_007516	CCA	2	6	291223	291228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211836
6038	NC_007516	GCA	2	6	291229	291234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6039	NC_007516	CGT	2	6	291247	291252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6040	NC_007516	TTCA	2	8	291275	291282	25 %	50 %	0 %	25 %	78211836
6041	NC_007516	GTG	2	6	291318	291323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211836
6042	NC_007516	GTCT	2	8	291359	291366	0 %	50 %	25 %	25 %	78211836
6043	NC_007516	GGC	2	6	291437	291442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211836
6044	NC_007516	TTCGGC	2	12	291482	291493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6045	NC_007516	GCT	2	6	291622	291627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6046	NC_007516	GGC	3	9	291695	291703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211836
6047	NC_007516	T	6	6	291704	291709	0 %	100 %	0 %	0 %	78211836
6048	NC_007516	GCT	2	6	291739	291744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6049	NC_007516	GATC	2	8	291748	291755	25 %	25 %	25 %	25 %	78211836
6050	NC_007516	GCA	2	6	291760	291765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6051	NC_007516	GCC	2	6	291820	291825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211836
6052	NC_007516	TGA	2	6	291847	291852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211836
6053	NC_007516	TTG	2	6	291867	291872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211836
6054	NC_007516	GGGC	2	8	291908	291915	0 %	0 %	75 %	25 %	78211836
6055	NC_007516	TGT	2	6	291943	291948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211836
6056	NC_007516	GC	3	6	292023	292028	0 %	0 %	50 %	50 %	78211836
6057	NC_007516	GCA	2	6	292045	292050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211836
6058	NC_007516	GT	3	6	292059	292064	0 %	50 %	50 %	0 %	78211836
6059	NC_007516	AGG	2	6	292069	292074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211836
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6061	NC_007516	CG	3	6	292096	292101	0 %	0 %	50 %	50 %	78211836
6062	NC_007516	GCT	2	6	292173	292178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211837
6063	NC_007516	GCT	2	6	292185	292190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211837
6064	NC_007516	T	6	6	292247	292252	0 %	100 %	0 %	0 %	78211837
6065	NC_007516	CCGG	2	8	292272	292279	0 %	0 %	50 %	50 %	78211837
6066	NC_007516	GTT	2	6	292285	292290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211837
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6069	NC_007516	CAG	2	6	292523	292528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211837
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6071	NC_007516	GGC	2	6	292561	292566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211837
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6083	NC_007516	TGC	2	6	293143	293148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211838
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6089	NC_007516	TTC	2	6	293460	293465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211838
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6093	NC_007516	CCA	2	6	293629	293634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211838
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6107	NC_007516	GCGTG	2	10	294407	294416	0 %	20 %	60 %	20 %	78211840
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6118	NC_007516	CT	3	6	294877	294882	0 %	50 %	0 %	50 %	78211840
6119	NC_007516	GGCGA	2	10	294903	294912	20 %	0 %	60 %	20 %	78211840
6120	NC_007516	TGCCGT	2	12	295011	295022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211841
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6122	NC_007516	GCC	2	6	295045	295050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211841
6123	NC_007516	GAA	2	6	295060	295065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211841
6124	NC_007516	CAGG	2	8	295066	295073	25 %	0 %	50 %	25 %	78211841
6125	NC_007516	TGT	2	6	295209	295214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211842
6126	NC_007516	CCT	2	6	295222	295227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211842
6127	NC_007516	CGC	2	6	295296	295301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211842
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6131	NC_007516	GCT	2	6	295574	295579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211842
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6133	NC_007516	C	6	6	295630	295635	0 %	0 %	0 %	100 %	78211842
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6137	NC_007516	GATCA	2	10	295722	295731	40 %	20 %	20 %	20 %	78211842
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6139	NC_007516	TGC	2	6	295796	295801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211842
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6141	NC_007516	GCC	2	6	295948	295953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211843
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6143	NC_007516	T	6	6	295996	296001	0 %	100 %	0 %	0 %	78211843
6144	NC_007516	TGG	2	6	296033	296038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211843
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6152	NC_007516	CGT	2	6	296332	296337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211843
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6232	NC_007516	GCTCT	2	10	301263	301272	0 %	40 %	20 %	40 %	78211849
6233	NC_007516	GCT	2	6	301305	301310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211849
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6235	NC_007516	CAAG	2	8	301345	301352	50 %	0 %	25 %	25 %	78211849
6236	NC_007516	CAG	2	6	301371	301376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211849
6237	NC_007516	CTG	2	6	301410	301415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211849
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6239	NC_007516	TGA	2	6	301537	301542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211849
6240	NC_007516	CT	4	8	301647	301654	0 %	50 %	0 %	50 %	78211849
6241	NC_007516	GCC	2	6	301772	301777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211850
6242	NC_007516	T	7	7	301779	301785	0 %	100 %	0 %	0 %	78211850
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6244	NC_007516	GCA	2	6	301885	301890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211850
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6367	NC_007516	GGC	2	6	306383	306388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211854
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6369	NC_007516	TTG	2	6	306501	306506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211854
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6481	NC_007516	TGA	2	6	311518	311523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211860
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6485	NC_007516	GCT	2	6	311705	311710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211860
6486	NC_007516	AGC	2	6	311794	311799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211860
6487	NC_007516	GGT	2	6	311877	311882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211860
6488	NC_007516	TGT	2	6	311928	311933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211860
6489	NC_007516	GGT	2	6	311948	311953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211860
6490	NC_007516	GGT	2	6	311990	311995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211860
6491	NC_007516	GCG	2	6	312068	312073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211860
6492	NC_007516	CTG	2	6	312096	312101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211860
6493	NC_007516	GCC	2	6	312141	312146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211860
6494	NC_007516	GCTCA	2	10	312180	312189	20 %	20 %	20 %	40 %	78211860
6495	NC_007516	CGA	2	6	312362	312367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211860
6496	NC_007516	TCT	2	6	312451	312456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211860
6497	NC_007516	ATG	2	6	312540	312545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211860
6498	NC_007516	GT	3	6	312606	312611	0 %	50 %	50 %	0 %	78211860
6499	NC_007516	CTC	2	6	312663	312668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211860
6500	NC_007516	GCTTC	2	10	312687	312696	0 %	40 %	20 %	40 %	78211860

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