MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007516	GCC	2	6	263352	263357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211807
5502	NC_007516	TGC	2	6	263368	263373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211807
5503	NC_007516	AGCTG	2	10	263381	263390	20 %	20 %	40 %	20 %	78211807
5504	NC_007516	GGT	2	6	263444	263449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211807
5505	NC_007516	TGGCGG	2	12	263482	263493	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78211807
5506	NC_007516	GGT	2	6	263505	263510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211807
5507	NC_007516	GGC	2	6	263516	263521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211807
5508	NC_007516	TCG	2	6	263547	263552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211807
5509	NC_007516	CGT	2	6	263567	263572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211807
5510	NC_007516	GCA	2	6	263676	263681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211807
5511	NC_007516	GCA	2	6	263813	263818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211807
5512	NC_007516	GCG	2	6	263828	263833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211807
5513	NC_007516	TGCT	2	8	263892	263899	0 %	50 %	25 %	25 %	78211807
5514	NC_007516	CGG	2	6	263998	264003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211808
5515	NC_007516	TGTT	2	8	264015	264022	0 %	75 %	25 %	0 %	78211808
5516	NC_007516	CGA	2	6	264138	264143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211808
5517	NC_007516	CAG	2	6	264149	264154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211808
5518	NC_007516	GGA	2	6	264178	264183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211808
5519	NC_007516	AAC	2	6	264233	264238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211808
5520	NC_007516	CCAG	2	8	264295	264302	25 %	0 %	25 %	50 %	78211808
5521	NC_007516	CTG	2	6	264458	264463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211808
5522	NC_007516	GAGG	2	8	264614	264621	25 %	0 %	75 %	0 %	78211808
5523	NC_007516	TGG	2	6	264722	264727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211808
5524	NC_007516	CAACG	2	10	264748	264757	40 %	0 %	20 %	40 %	78211808
5525	NC_007516	CGA	3	9	264760	264768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211808
5526	NC_007516	GGT	2	6	264769	264774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211808
5527	NC_007516	CGC	2	6	264781	264786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211808
5528	NC_007516	CCAC	2	8	264794	264801	25 %	0 %	0 %	75 %	78211808
5529	NC_007516	GGA	2	6	264895	264900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211808
5530	NC_007516	GTC	2	6	264987	264992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211808
5531	NC_007516	TGCG	2	8	265002	265009	0 %	25 %	50 %	25 %	78211808
5532	NC_007516	GCT	2	6	265091	265096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211808
5533	NC_007516	GCT	2	6	265155	265160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211808
5534	NC_007516	TTG	2	6	265268	265273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211808
5535	NC_007516	TGG	2	6	265287	265292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211808
5536	NC_007516	CCG	2	6	265293	265298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211808
5537	NC_007516	TCCG	2	8	265342	265349	0 %	25 %	25 %	50 %	78211808
5538	NC_007516	TTG	2	6	265406	265411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211809
5539	NC_007516	CGGAT	2	10	265433	265442	20 %	20 %	40 %	20 %	78211809
5540	NC_007516	TGG	2	6	265571	265576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211809
5541	NC_007516	CG	3	6	265645	265650	0 %	0 %	50 %	50 %	78211809
5542	NC_007516	CGG	2	6	265718	265723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211809
5543	NC_007516	TCGA	2	8	265837	265844	25 %	25 %	25 %	25 %	78211809
5544	NC_007516	TGC	2	6	265862	265867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211809
5545	NC_007516	CGC	2	6	265959	265964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211809
5546	NC_007516	GTTG	2	8	266067	266074	0 %	50 %	50 %	0 %	78211810
5547	NC_007516	CTG	2	6	266090	266095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211810
5548	NC_007516	CTGAC	2	10	266258	266267	20 %	20 %	20 %	40 %	78211810
5549	NC_007516	GAG	2	6	266297	266302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211810
5550	NC_007516	GCA	2	6	266435	266440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211810
5551	NC_007516	ATC	2	6	266446	266451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211810
5552	NC_007516	TGAT	2	8	266460	266467	25 %	50 %	25 %	0 %	78211810
5553	NC_007516	TCCA	2	8	266495	266502	25 %	25 %	0 %	50 %	78211811
5554	NC_007516	TTG	2	6	266505	266510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211811
5555	NC_007516	CCA	2	6	266576	266581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211811
5556	NC_007516	CGT	2	6	266613	266618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5557	NC_007516	TGC	2	6	266661	266666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5558	NC_007516	CAA	2	6	266727	266732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211811
5559	NC_007516	TTG	2	6	266734	266739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211811
5560	NC_007516	CGA	2	6	266823	266828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5561	NC_007516	TGG	2	6	266880	266885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211811
5562	NC_007516	CTG	2	6	267024	267029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5563	NC_007516	CGG	2	6	267098	267103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211811
5564	NC_007516	CGT	2	6	267123	267128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5565	NC_007516	GCGGTA	2	12	267256	267267	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78211811
5566	NC_007516	GCT	2	6	267343	267348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5567	NC_007516	GCT	2	6	267373	267378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5568	NC_007516	AAAT	2	8	267442	267449	75 %	25 %	0 %	0 %	78211811
5569	NC_007516	GCG	2	6	267452	267457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211811
5570	NC_007516	GC	3	6	267479	267484	0 %	0 %	50 %	50 %	78211811
5571	NC_007516	CAA	2	6	267591	267596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211811
5572	NC_007516	CTTCCT	2	12	267612	267623	0 %	50 %	0 %	50 %	78211811
5573	NC_007516	CCG	2	6	267813	267818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211811
5574	NC_007516	GTTG	2	8	268020	268027	0 %	50 %	50 %	0 %	78211811
5575	NC_007516	CTG	3	9	268057	268065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
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5577	NC_007516	GCT	2	6	268102	268107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5578	NC_007516	TCC	2	6	268126	268131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211811
5579	NC_007516	TCGAG	2	10	268146	268155	20 %	20 %	40 %	20 %	78211811
5580	NC_007516	GAGG	2	8	268165	268172	25 %	0 %	75 %	0 %	78211811
5581	NC_007516	GTC	2	6	268201	268206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5582	NC_007516	GGC	2	6	268220	268225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211811
5583	NC_007516	TCGC	2	8	268232	268239	0 %	25 %	25 %	50 %	78211811
5584	NC_007516	GT	3	6	268248	268253	0 %	50 %	50 %	0 %	78211811
5585	NC_007516	TGC	2	6	268293	268298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
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5587	NC_007516	GGA	2	6	268369	268374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211811
5588	NC_007516	TGC	2	6	268604	268609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5589	NC_007516	GC	3	6	268661	268666	0 %	0 %	50 %	50 %	78211811
5590	NC_007516	GGC	2	6	268744	268749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211811
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5592	NC_007516	AGC	2	6	268817	268822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211811
5593	NC_007516	GGCT	2	8	268854	268861	0 %	25 %	50 %	25 %	78211811
5594	NC_007516	TGGC	2	8	268866	268873	0 %	25 %	50 %	25 %	78211811
5595	NC_007516	TGT	2	6	268888	268893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211811
5596	NC_007516	A	6	6	269005	269010	100 %	0 %	0 %	0 %	78211811
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5598	NC_007516	GC	3	6	269188	269193	0 %	0 %	50 %	50 %	78211811
5599	NC_007516	AGCCG	2	10	269227	269236	20 %	0 %	40 %	40 %	78211811
5600	NC_007516	AATC	2	8	269406	269413	50 %	25 %	0 %	25 %	78211812
5601	NC_007516	TCGC	2	8	269448	269455	0 %	25 %	25 %	50 %	78211812
5602	NC_007516	GAA	3	9	269483	269491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211812
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5604	NC_007516	CAG	2	6	269582	269587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211813
5605	NC_007516	GGTC	2	8	269606	269613	0 %	25 %	50 %	25 %	78211813
5606	NC_007516	T	6	6	269700	269705	0 %	100 %	0 %	0 %	78211813
5607	NC_007516	CTG	2	6	269757	269762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211813
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5609	NC_007516	CTG	2	6	269840	269845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211813
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5612	NC_007516	GC	3	6	269955	269960	0 %	0 %	50 %	50 %	78211813
5613	NC_007516	GTC	2	6	269962	269967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211813
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5618	NC_007516	TGGCT	2	10	270259	270268	0 %	40 %	40 %	20 %	78211813
5619	NC_007516	CGCC	2	8	270367	270374	0 %	0 %	25 %	75 %	78211813
5620	NC_007516	TGGA	2	8	270384	270391	25 %	25 %	50 %	0 %	78211813
5621	NC_007516	GCA	2	6	270392	270397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211813
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5623	NC_007516	TG	3	6	270483	270488	0 %	50 %	50 %	0 %	78211813
5624	NC_007516	GCTTTG	2	12	270592	270603	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	78211813
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5746	NC_007516	GCA	2	6	276975	276980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211822
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5751	NC_007516	TGG	2	6	277458	277463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211823
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5759	NC_007516	ATC	2	6	277859	277864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211823
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5870	NC_007516	TGG	2	6	283424	283429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211829
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