MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007516	CGG	2	6	239758	239763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211784
5002	NC_007516	ACG	2	6	239840	239845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211784
5003	NC_007516	CTG	2	6	239852	239857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211784
5004	NC_007516	GAG	2	6	239858	239863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211784
5005	NC_007516	CCG	2	6	239870	239875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211784
5006	NC_007516	GGC	2	6	239923	239928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211784
5007	NC_007516	CTT	2	6	240105	240110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211785
5008	NC_007516	CTG	2	6	240111	240116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5009	NC_007516	GCTC	2	8	240125	240132	0 %	25 %	25 %	50 %	78211785
5010	NC_007516	CTT	2	6	240140	240145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211785
5011	NC_007516	CTG	2	6	240165	240170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5012	NC_007516	TGG	2	6	240199	240204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211785
5013	NC_007516	CAG	2	6	240210	240215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5014	NC_007516	TCCA	2	8	240228	240235	25 %	25 %	0 %	50 %	78211785
5015	NC_007516	GCG	2	6	240254	240259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211785
5016	NC_007516	TGG	2	6	240298	240303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211785
5017	NC_007516	GCCG	2	8	240315	240322	0 %	0 %	50 %	50 %	78211785
5018	NC_007516	G	7	7	240329	240335	0 %	0 %	100 %	0 %	78211785
5019	NC_007516	CTG	2	6	240402	240407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5020	NC_007516	TGG	2	6	240415	240420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211785
5021	NC_007516	TGC	2	6	240427	240432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5022	NC_007516	GCT	2	6	240485	240490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5023	NC_007516	CTG	2	6	240549	240554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5024	NC_007516	TGG	2	6	240628	240633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211785
5025	NC_007516	TGA	2	6	240662	240667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211785
5026	NC_007516	GAA	2	6	240668	240673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211785
5027	NC_007516	ATG	2	6	240777	240782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211785
5028	NC_007516	CGTG	2	8	240842	240849	0 %	25 %	50 %	25 %	78211785
5029	NC_007516	GCT	2	6	240911	240916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5030	NC_007516	GCT	2	6	240971	240976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5031	NC_007516	GAT	2	6	240980	240985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211785
5032	NC_007516	GCT	3	9	241001	241009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5033	NC_007516	GGT	2	6	241010	241015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211785
5034	NC_007516	CGG	2	6	241025	241030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211785
5035	NC_007516	TGA	2	6	241079	241084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211785
5036	NC_007516	CTGG	2	8	241142	241149	0 %	25 %	50 %	25 %	78211785
5037	NC_007516	CTG	2	6	241239	241244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211785
5038	NC_007516	AGA	3	9	241364	241372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211785
5039	NC_007516	ATCGGC	2	12	241459	241470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78211786
5040	NC_007516	TCT	2	6	241503	241508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211786
5041	NC_007516	ACT	2	6	241598	241603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211786
5042	NC_007516	TGC	2	6	241652	241657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211786
5043	NC_007516	GCCT	2	8	241675	241682	0 %	25 %	25 %	50 %	78211786
5044	NC_007516	GCG	2	6	241765	241770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211786
5045	NC_007516	CTG	2	6	241777	241782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211786
5046	NC_007516	GGT	2	6	241833	241838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211786
5047	NC_007516	GAG	2	6	241846	241851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211786
5048	NC_007516	GTG	2	6	241852	241857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211786
5049	NC_007516	GTG	2	6	241912	241917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211786
5050	NC_007516	TGA	2	6	241925	241930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211786
5051	NC_007516	GTG	2	6	241972	241977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211786
5052	NC_007516	CGC	2	6	241983	241988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211786
5053	NC_007516	GGT	2	6	241993	241998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211786
5054	NC_007516	CGAT	2	8	242015	242022	25 %	25 %	25 %	25 %	78211786
5055	NC_007516	TGG	2	6	242132	242137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211786
5056	NC_007516	CCG	2	6	242172	242177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211786
5057	NC_007516	CCG	2	6	242195	242200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211786
5058	NC_007516	GCT	2	6	242211	242216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211786
5059	NC_007516	GAG	2	6	242239	242244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211786
5060	NC_007516	CAC	2	6	242250	242255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211786
5061	NC_007516	TCGA	2	8	242257	242264	25 %	25 %	25 %	25 %	78211786
5062	NC_007516	GTGC	2	8	242298	242305	0 %	25 %	50 %	25 %	78211786
5063	NC_007516	CTG	2	6	242455	242460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5064	NC_007516	GCG	2	6	242494	242499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211787
5065	NC_007516	GAG	2	6	242513	242518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211787
5066	NC_007516	TTGTG	2	10	242546	242555	0 %	60 %	40 %	0 %	78211787
5067	NC_007516	AG	3	6	242573	242578	50 %	0 %	50 %	0 %	78211787
5068	NC_007516	CTG	2	6	242587	242592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5069	NC_007516	CAC	2	6	242620	242625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211787
5070	NC_007516	CGA	2	6	242670	242675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5071	NC_007516	GCG	2	6	242759	242764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211787
5072	NC_007516	GCT	2	6	242800	242805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5073	NC_007516	TGC	2	6	242858	242863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
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5076	NC_007516	CGC	2	6	243015	243020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211787
5077	NC_007516	GCT	2	6	243029	243034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5078	NC_007516	CTGA	2	8	243124	243131	25 %	25 %	25 %	25 %	78211787
5079	NC_007516	AGC	3	9	243161	243169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5080	NC_007516	CAG	2	6	243205	243210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5081	NC_007516	CGC	2	6	243221	243226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211787
5082	NC_007516	AGT	2	6	243248	243253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211787
5083	NC_007516	TGG	2	6	243291	243296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211787
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5085	NC_007516	CAC	3	9	243370	243378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211787
5086	NC_007516	CAC	2	6	243460	243465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211787
5087	NC_007516	CCT	2	6	243501	243506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211787
5088	NC_007516	GGC	2	6	243561	243566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211787
5089	NC_007516	GCA	2	6	243579	243584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
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5091	NC_007516	GTT	2	6	243737	243742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211787
5092	NC_007516	GCAG	2	8	243764	243771	25 %	0 %	50 %	25 %	78211787
5093	NC_007516	CCT	2	6	243777	243782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211787
5094	NC_007516	CGC	2	6	243840	243845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211787
5095	NC_007516	TGC	2	6	243884	243889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
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5099	NC_007516	CAG	2	6	243985	243990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5100	NC_007516	CTC	2	6	243991	243996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211787
5101	NC_007516	GCT	2	6	244015	244020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5102	NC_007516	ACGG	2	8	244034	244041	25 %	0 %	50 %	25 %	78211787
5103	NC_007516	TGA	2	6	244053	244058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211787
5104	NC_007516	CGC	2	6	244059	244064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211787
5105	NC_007516	TCG	2	6	244172	244177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5106	NC_007516	GATC	2	8	244206	244213	25 %	25 %	25 %	25 %	78211787
5107	NC_007516	CAGC	2	8	244224	244231	25 %	0 %	25 %	50 %	78211787
5108	NC_007516	T	7	7	244278	244284	0 %	100 %	0 %	0 %	78211787
5109	NC_007516	GGCTCC	2	12	244295	244306	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	78211787
5110	NC_007516	CAGAT	2	10	244337	244346	40 %	20 %	20 %	20 %	78211787
5111	NC_007516	AGC	2	6	244352	244357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5112	NC_007516	GCTG	2	8	244527	244534	0 %	25 %	50 %	25 %	78211787
5113	NC_007516	GCA	2	6	244567	244572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
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5116	NC_007516	CCG	2	6	244677	244682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211787
5117	NC_007516	CCA	2	6	244761	244766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211787
5118	NC_007516	CGA	2	6	244871	244876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5119	NC_007516	CAG	2	6	244903	244908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211787
5120	NC_007516	GCT	2	6	244967	244972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211787
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5122	NC_007516	CAC	2	6	245122	245127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211787
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5245	NC_007516	CG	3	6	250778	250783	0 %	0 %	50 %	50 %	78211794
5246	NC_007516	AGC	2	6	250837	250842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211794
5247	NC_007516	CCAT	2	8	250852	250859	25 %	25 %	0 %	50 %	78211794
5248	NC_007516	CTG	2	6	250931	250936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211795
5249	NC_007516	GCT	2	6	251002	251007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211795
5250	NC_007516	GGCC	2	8	251041	251048	0 %	0 %	50 %	50 %	78211795
5251	NC_007516	GT	3	6	251061	251066	0 %	50 %	50 %	0 %	78211795
5252	NC_007516	TCCA	2	8	251115	251122	25 %	25 %	0 %	50 %	78211795
5253	NC_007516	AGC	2	6	251181	251186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211795
5254	NC_007516	TGG	3	9	251208	251216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211795
5255	NC_007516	ACATCG	2	12	251283	251294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78211795
5256	NC_007516	GCGG	2	8	251311	251318	0 %	0 %	75 %	25 %	78211795
5257	NC_007516	CGGG	2	8	251397	251404	0 %	0 %	75 %	25 %	78211795
5258	NC_007516	GCG	2	6	251422	251427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211795
5259	NC_007516	CGT	2	6	251460	251465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211795
5260	NC_007516	CCA	2	6	251572	251577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211795
5261	NC_007516	GC	3	6	251582	251587	0 %	0 %	50 %	50 %	78211795
5262	NC_007516	GTG	2	6	251616	251621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211795
5263	NC_007516	AAC	2	6	251654	251659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211795
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5265	NC_007516	GTC	2	6	251750	251755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211795
5266	NC_007516	GCA	2	6	251801	251806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211795
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5268	NC_007516	CAT	2	6	251851	251856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211795
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5270	NC_007516	CGG	2	6	251883	251888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211795
5271	NC_007516	CGT	2	6	251920	251925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211795
5272	NC_007516	GGC	2	6	251962	251967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211795
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5274	NC_007516	TGGC	2	8	252015	252022	0 %	25 %	50 %	25 %	78211795
5275	NC_007516	GGT	2	6	252047	252052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211795
5276	NC_007516	CCGA	2	8	252089	252096	25 %	0 %	25 %	50 %	78211795
5277	NC_007516	GCCA	2	8	252107	252114	25 %	0 %	25 %	50 %	78211795
5278	NC_007516	GCC	2	6	252118	252123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211795
5279	NC_007516	GTT	2	6	252194	252199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211795
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5284	NC_007516	CGG	2	6	252385	252390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211795
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5321	NC_007516	CAC	2	6	254478	254483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211798
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5345	NC_007516	GCCA	2	8	255419	255426	25 %	0 %	25 %	50 %	78211799
5346	NC_007516	TGA	2	6	255436	255441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211799
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5349	NC_007516	GTG	2	6	255519	255524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211799
5350	NC_007516	TGT	2	6	255631	255636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211799
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5352	NC_007516	GGCC	2	8	255709	255716	0 %	0 %	50 %	50 %	78211799
5353	NC_007516	AGCC	2	8	255786	255793	25 %	0 %	25 %	50 %	78211799
5354	NC_007516	GGC	2	6	255908	255913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211799
5355	NC_007516	GCC	2	6	255927	255932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211799
5356	NC_007516	GGTCG	2	10	255992	256001	0 %	20 %	60 %	20 %	78211799
5357	NC_007516	AAG	2	6	256002	256007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211799
5358	NC_007516	CAGC	2	8	256022	256029	25 %	0 %	25 %	50 %	78211799
5359	NC_007516	CGAACA	2	12	256096	256107	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	78211799
5360	NC_007516	T	7	7	256134	256140	0 %	100 %	0 %	0 %	78211799
5361	NC_007516	TGG	2	6	256198	256203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211799
5362	NC_007516	GTT	2	6	256220	256225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211799
5363	NC_007516	GCG	2	6	256236	256241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211799
5364	NC_007516	AGC	2	6	256368	256373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211799
5365	NC_007516	AGG	2	6	256386	256391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211799
5366	NC_007516	CCT	2	6	256396	256401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211799
5367	NC_007516	GCTGAA	2	12	256601	256612	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78211800
5368	NC_007516	ACA	2	6	256613	256618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211800
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5370	NC_007516	CCGG	2	8	256711	256718	0 %	0 %	50 %	50 %	78211800
5371	NC_007516	TGC	2	6	256822	256827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211800
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5384	NC_007516	TGC	2	6	257528	257533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
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5403	NC_007516	CTG	2	6	258256	258261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
5404	NC_007516	CTG	2	6	258268	258273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211801
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5406	NC_007516	GAT	2	6	258360	258365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211801
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5425	NC_007516	G	6	6	259320	259325	0 %	0 %	100 %	0 %	78211803
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5490	NC_007516	GCT	2	6	262908	262913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211807
5491	NC_007516	CTC	2	6	262921	262926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211807
5492	NC_007516	GAG	2	6	262929	262934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211807
5493	NC_007516	CTGG	2	8	262946	262953	0 %	25 %	50 %	25 %	78211807
5494	NC_007516	CAG	2	6	262959	262964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211807
5495	NC_007516	GGCC	2	8	262980	262987	0 %	0 %	50 %	50 %	78211807
5496	NC_007516	GCC	2	6	263154	263159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211807
5497	NC_007516	GT	3	6	263191	263196	0 %	50 %	50 %	0 %	78211807
5498	NC_007516	GCC	2	6	263203	263208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211807
5499	NC_007516	TTG	2	6	263262	263267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211807
5500	NC_007516	CCA	2	6	263272	263277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211807

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