MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9605

Total Repeats: 47770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007516	ACC	2	6	216519	216524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211761
4502	NC_007516	GCA	2	6	216544	216549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4503	NC_007516	CTC	2	6	216569	216574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211761
4504	NC_007516	CGG	2	6	216606	216611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211761
4505	NC_007516	CGG	2	6	216660	216665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211761
4506	NC_007516	GCA	2	6	216679	216684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4507	NC_007516	CAC	2	6	216719	216724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211761
4508	NC_007516	TTTCGC	2	12	216749	216760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	78211761
4509	NC_007516	CAG	3	9	216770	216778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4510	NC_007516	CTC	2	6	216818	216823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211761
4511	NC_007516	CCG	2	6	216829	216834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4512	NC_007516	TCG	2	6	216852	216857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4513	NC_007516	TCG	2	6	216870	216875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4514	NC_007516	GTC	2	6	216881	216886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4515	NC_007516	TGT	2	6	216892	216897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211761
4516	NC_007516	GTTC	2	8	216907	216914	0 %	50 %	25 %	25 %	78211761
4517	NC_007516	GGT	3	9	216936	216944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211761
4518	NC_007516	TGT	2	6	216954	216959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211761
4519	NC_007516	GCG	4	12	216979	216990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211761
4520	NC_007516	GCGGTG	2	12	217003	217014	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78211761
4521	NC_007516	CTG	2	6	217022	217027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4522	NC_007516	GGC	2	6	217035	217040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211761
4523	NC_007516	GTC	2	6	217088	217093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4524	NC_007516	CCGCA	2	10	217142	217151	20 %	0 %	20 %	60 %	78211761
4525	NC_007516	CGC	2	6	217219	217224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4526	NC_007516	CAG	3	9	217256	217264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4527	NC_007516	GCT	2	6	217360	217365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4528	NC_007516	CAG	2	6	217412	217417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4529	NC_007516	CTC	2	6	217436	217441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211761
4530	NC_007516	CAG	2	6	217460	217465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4531	NC_007516	GGCTGA	2	12	217480	217491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78211761
4532	NC_007516	CGC	2	6	217516	217521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4533	NC_007516	GCC	2	6	217530	217535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4534	NC_007516	TCG	2	6	217575	217580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4535	NC_007516	GGC	2	6	217652	217657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211761
4536	NC_007516	CCA	2	6	217672	217677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211761
4537	NC_007516	CCT	2	6	217815	217820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211761
4538	NC_007516	G	6	6	217842	217847	0 %	0 %	100 %	0 %	78211761
4539	NC_007516	GAC	2	6	217907	217912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4540	NC_007516	CCG	2	6	217933	217938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211761
4541	NC_007516	CAA	2	6	217940	217945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78211761
4542	NC_007516	GTC	2	6	218009	218014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211761
4543	NC_007516	GTGA	2	8	218100	218107	25 %	25 %	50 %	0 %	78211762
4544	NC_007516	GATT	2	8	218120	218127	25 %	50 %	25 %	0 %	78211762
4545	NC_007516	AATT	2	8	218128	218135	50 %	50 %	0 %	0 %	78211762
4546	NC_007516	CTG	2	6	218394	218399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211762
4547	NC_007516	TTC	2	6	218401	218406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211762
4548	NC_007516	ATTG	2	8	218437	218444	25 %	50 %	25 %	0 %	78211762
4549	NC_007516	CTT	2	6	218445	218450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78211762
4550	NC_007516	CGT	2	6	218502	218507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211762
4551	NC_007516	AAGC	2	8	218543	218550	50 %	0 %	25 %	25 %	78211762
4552	NC_007516	ATTG	2	8	218572	218579	25 %	50 %	25 %	0 %	78211762
4553	NC_007516	TCA	2	6	218630	218635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211762
4554	NC_007516	ACT	2	6	218659	218664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78211762
4555	NC_007516	TAGA	2	8	218692	218699	50 %	25 %	25 %	0 %	78211762
4556	NC_007516	CTTT	2	8	218750	218757	0 %	75 %	0 %	25 %	78211762
4557	NC_007516	T	6	6	218821	218826	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4558	NC_007516	TGC	2	6	218828	218833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211762
4559	NC_007516	TAG	2	6	218869	218874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
4560	NC_007516	GAT	2	6	218908	218913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
4561	NC_007516	TGA	2	6	218917	218922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
4562	NC_007516	GAT	2	6	218977	218982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
4563	NC_007516	TGA	2	6	219007	219012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
4564	NC_007516	CTG	2	6	219031	219036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211762
4565	NC_007516	GAG	2	6	219070	219075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78211762
4566	NC_007516	AATT	2	8	219084	219091	50 %	50 %	0 %	0 %	78211762
4567	NC_007516	T	6	6	219127	219132	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4568	NC_007516	TTGT	2	8	219155	219162	0 %	75 %	25 %	0 %	78211762
4569	NC_007516	AGA	2	6	219221	219226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78211762
4570	NC_007516	T	6	6	219232	219237	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4571	NC_007516	TTG	2	6	219248	219253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211762
4572	NC_007516	GTA	2	6	219278	219283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
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4574	NC_007516	T	6	6	219391	219396	0 %	100 %	0 %	0 %	78211762
4575	NC_007516	TGA	2	6	219435	219440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78211762
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4577	NC_007516	TCC	2	6	219610	219615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211763
4578	NC_007516	GCTCC	2	10	219638	219647	0 %	20 %	20 %	60 %	78211763
4579	NC_007516	GGCT	2	8	219653	219660	0 %	25 %	50 %	25 %	78211763
4580	NC_007516	CTC	2	6	219700	219705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211763
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4588	NC_007516	GCT	2	6	220243	220248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211764
4589	NC_007516	CTG	2	6	220280	220285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211764
4590	NC_007516	CCG	2	6	220293	220298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211764
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4592	NC_007516	TGC	2	6	220398	220403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211764
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4594	NC_007516	GAC	2	6	220487	220492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211764
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4601	NC_007516	CGG	2	6	220706	220711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211765
4602	NC_007516	CGC	2	6	220751	220756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78211765
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4604	NC_007516	CCGGC	2	10	220777	220786	0 %	0 %	40 %	60 %	78211765
4605	NC_007516	TGG	2	6	220808	220813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211765
4606	NC_007516	GTT	2	6	220855	220860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78211765
4607	NC_007516	CAG	2	6	220897	220902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211765
4608	NC_007516	TGTGG	2	10	220917	220926	0 %	40 %	60 %	0 %	78211765
4609	NC_007516	CGG	2	6	220996	221001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211765
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4613	NC_007516	TGG	2	6	221153	221158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78211765
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4621	NC_007516	GCTGG	2	10	221478	221487	0 %	20 %	60 %	20 %	78211765
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4747	NC_007516	TCC	2	6	228095	228100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78211773
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4991	NC_007516	CCAG	2	8	239105	239112	25 %	0 %	25 %	50 %	78211783
4992	NC_007516	CGG	3	9	239177	239185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78211783
4993	NC_007516	GCTC	2	8	239333	239340	0 %	25 %	25 %	50 %	78211783
4994	NC_007516	CAG	2	6	239400	239405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211783
4995	NC_007516	CGA	2	6	239430	239435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78211783
4996	NC_007516	TGC	3	9	239502	239510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78211784
4997	NC_007516	CCTGCT	2	12	239530	239541	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	78211784
4998	NC_007516	CAC	2	6	239578	239583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211784
4999	NC_007516	TCCG	2	8	239599	239606	0 %	25 %	25 %	50 %	78211784
5000	NC_007516	ACC	2	6	239654	239659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78211784

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