MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007513	CAA	2	6	202518	202523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183777
4003	NC_007513	TGAT	2	8	202545	202552	25 %	50 %	25 %	0 %	78183777
4004	NC_007513	TGG	2	6	202614	202619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183777
4005	NC_007513	GCA	2	6	202754	202759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183777
4006	NC_007513	CA	3	6	202765	202770	50 %	0 %	0 %	50 %	78183777
4007	NC_007513	GCCA	2	8	202795	202802	25 %	0 %	25 %	50 %	78183777
4008	NC_007513	GCG	2	6	202803	202808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183777
4009	NC_007513	TCC	2	6	202831	202836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183777
4010	NC_007513	AGCC	2	8	202865	202872	25 %	0 %	25 %	50 %	78183777
4011	NC_007513	CGC	2	6	202878	202883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183777
4012	NC_007513	AGC	2	6	202930	202935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183777
4013	NC_007513	CAA	2	6	202964	202969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183777
4014	NC_007513	CAA	2	6	203001	203006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183777
4015	NC_007513	ACA	2	6	203047	203052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183778
4016	NC_007513	GAA	2	6	203059	203064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183778
4017	NC_007513	GGT	2	6	203077	203082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183778
4018	NC_007513	GCA	2	6	203149	203154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4019	NC_007513	CCT	2	6	203170	203175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183778
4020	NC_007513	GCA	2	6	203196	203201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4021	NC_007513	AGC	2	6	203339	203344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4022	NC_007513	ACG	2	6	203463	203468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4023	NC_007513	CGG	2	6	203509	203514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183778
4024	NC_007513	CAG	2	6	203564	203569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
4025	NC_007513	GCG	2	6	203586	203591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183778
4026	NC_007513	GATG	2	8	203653	203660	25 %	25 %	50 %	0 %	78183778
4027	NC_007513	AGC	2	6	203688	203693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183778
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4030	NC_007513	GAG	2	6	203866	203871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183779
4031	NC_007513	CAG	2	6	203928	203933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183779
4032	NC_007513	GAC	2	6	203960	203965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183779
4033	NC_007513	GT	3	6	204111	204116	0 %	50 %	50 %	0 %	78183779
4034	NC_007513	ACG	2	6	204135	204140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183779
4035	NC_007513	GCAG	2	8	204208	204215	25 %	0 %	50 %	25 %	78183779
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4037	NC_007513	TGC	2	6	204378	204383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183780
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4040	NC_007513	GAA	2	6	204523	204528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183780
4041	NC_007513	GAA	2	6	204573	204578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183780
4042	NC_007513	GA	3	6	204629	204634	50 %	0 %	50 %	0 %	78183780
4043	NC_007513	GGAA	2	8	204638	204645	50 %	0 %	50 %	0 %	78183780
4044	NC_007513	GCCATC	2	12	204654	204665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78183780
4045	NC_007513	TGC	2	6	204666	204671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183780
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4048	NC_007513	ATGG	2	8	204805	204812	25 %	25 %	50 %	0 %	78183780
4049	NC_007513	CGA	2	6	204840	204845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183780
4050	NC_007513	TGA	2	6	204852	204857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183780
4051	NC_007513	GATG	2	8	204888	204895	25 %	25 %	50 %	0 %	78183780
4052	NC_007513	GATCG	2	10	204922	204931	20 %	20 %	40 %	20 %	78183780
4053	NC_007513	CAA	2	6	204942	204947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183780
4054	NC_007513	GCA	2	6	205000	205005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183780
4055	NC_007513	CGT	2	6	205036	205041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183780
4056	NC_007513	GTA	2	6	205052	205057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183780
4057	NC_007513	GAC	2	6	205255	205260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183781
4058	NC_007513	CGA	2	6	205336	205341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183781
4059	NC_007513	CAG	2	6	205374	205379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183781
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4061	NC_007513	CAG	2	6	205425	205430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183781
4062	NC_007513	TTG	2	6	205631	205636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183781
4063	NC_007513	AATC	2	8	205678	205685	50 %	25 %	0 %	25 %	78183781
4064	NC_007513	GCC	2	6	205752	205757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183781
4065	NC_007513	TG	3	6	205780	205785	0 %	50 %	50 %	0 %	78183781
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4069	NC_007513	GAT	2	6	205951	205956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183781
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4072	NC_007513	TTGG	2	8	206085	206092	0 %	50 %	50 %	0 %	78183781
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4087	NC_007513	T	6	6	206762	206767	0 %	100 %	0 %	0 %	78183782
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4093	NC_007513	CTG	2	6	207140	207145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183782
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4095	NC_007513	TCAG	2	8	207241	207248	25 %	25 %	25 %	25 %	78183782
4096	NC_007513	CAA	2	6	207279	207284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183782
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4104	NC_007513	TTG	2	6	207864	207869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183782
4105	NC_007513	GTC	2	6	207870	207875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183782
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4107	NC_007513	CAT	2	6	208056	208061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183783
4108	NC_007513	AGC	2	6	208106	208111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183783
4109	NC_007513	TGCG	2	8	208172	208179	0 %	25 %	50 %	25 %	78183783
4110	NC_007513	CCG	2	6	208279	208284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183783
4111	NC_007513	TGG	2	6	208293	208298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183783
4112	NC_007513	TGG	2	6	208363	208368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183783
4113	NC_007513	GAA	2	6	208516	208521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183783
4114	NC_007513	CGCGC	2	10	208531	208540	0 %	0 %	40 %	60 %	78183783
4115	NC_007513	GGT	2	6	208542	208547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183783
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4118	NC_007513	CGAT	2	8	208721	208728	25 %	25 %	25 %	25 %	78183783
4119	NC_007513	AACC	2	8	208770	208777	50 %	0 %	0 %	50 %	78183783
4120	NC_007513	GTC	2	6	208867	208872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183783
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4123	NC_007513	TTC	2	6	208978	208983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183783
4124	NC_007513	TGG	2	6	209009	209014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183783
4125	NC_007513	CAGGGG	2	12	209110	209121	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78183783
4126	NC_007513	TGC	2	6	209195	209200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183783
4127	NC_007513	GGCTGA	2	12	209217	209228	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78183783
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4142	NC_007513	GCA	2	6	210027	210032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183783
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4237	NC_007513	CCGA	2	8	213806	213813	25 %	0 %	25 %	50 %	78183786
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4241	NC_007513	ACG	2	6	214075	214080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183787
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4245	NC_007513	GAC	2	6	214167	214172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183787
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4262	NC_007513	GCC	2	6	215277	215282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183788
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4491	NC_007513	GCT	2	6	226198	226203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183797
4492	NC_007513	GGC	2	6	226285	226290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183797
4493	NC_007513	GTT	2	6	226302	226307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183797
4494	NC_007513	GGA	2	6	226308	226313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183797
4495	NC_007513	CTG	2	6	226360	226365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183797
4496	NC_007513	CGT	2	6	226387	226392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183797
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