MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39502	NC_007513	GAA	2	6	2201303	2201308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185860
39503	NC_007513	CAT	2	6	2201321	2201326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185860
39504	NC_007513	ATG	2	6	2201423	2201428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185860
39505	NC_007513	AAG	2	6	2201462	2201467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185860
39506	NC_007513	TGG	2	6	2201585	2201590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185860
39507	NC_007513	CG	3	6	2201607	2201612	0 %	0 %	50 %	50 %	78185860
39508	NC_007513	TC	3	6	2201685	2201690	0 %	50 %	0 %	50 %	78185860
39509	NC_007513	CAACC	2	10	2201717	2201726	40 %	0 %	0 %	60 %	78185860
39510	NC_007513	ATGCCC	2	12	2201811	2201822	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	78185860
39511	NC_007513	GAA	2	6	2201828	2201833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185860
39512	NC_007513	GCA	2	6	2201838	2201843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185860
39513	NC_007513	GCA	2	6	2201901	2201906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185860
39514	NC_007513	TGG	2	6	2201923	2201928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185860
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39516	NC_007513	A	6	6	2201958	2201963	100 %	0 %	0 %	0 %	78185860
39517	NC_007513	TTC	2	6	2201964	2201969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185860
39518	NC_007513	GGA	2	6	2201987	2201992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185860
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39523	NC_007513	TGG	2	6	2202173	2202178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185861
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39538	NC_007513	TAC	2	6	2203178	2203183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185862
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39542	NC_007513	CGA	2	6	2203525	2203530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185862
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39544	NC_007513	GTT	2	6	2203597	2203602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185862
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39553	NC_007513	CCG	2	6	2204101	2204106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185863
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39970	NC_007513	GCT	2	6	2225617	2225622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185883
39971	NC_007513	ACA	2	6	2225739	2225744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185883
39972	NC_007513	TGCT	2	8	2225768	2225775	0 %	50 %	25 %	25 %	78185883
39973	NC_007513	TCA	2	6	2225823	2225828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185883
39974	NC_007513	CCA	2	6	2225890	2225895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185883
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39976	NC_007513	CAG	2	6	2225924	2225929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185883
39977	NC_007513	CAA	2	6	2225951	2225956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185883
39978	NC_007513	A	6	6	2226117	2226122	100 %	0 %	0 %	0 %	78185883
39979	NC_007513	GGAC	2	8	2226155	2226162	25 %	0 %	50 %	25 %	78185883
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39982	NC_007513	TGC	2	6	2226257	2226262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
39983	NC_007513	ACT	2	6	2226295	2226300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185884
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39988	NC_007513	CAG	2	6	2226693	2226698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185884
39989	NC_007513	GAA	2	6	2226816	2226821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185884
39990	NC_007513	ACTGA	2	10	2226889	2226898	40 %	20 %	20 %	20 %	78185884
39991	NC_007513	GCA	2	6	2226935	2226940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185884
39992	NC_007513	AAT	3	9	2227021	2227029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78185884
39993	NC_007513	ATCG	2	8	2227036	2227043	25 %	25 %	25 %	25 %	78185884
39994	NC_007513	CCACTA	2	12	2227148	2227159	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	78185884
39995	NC_007513	GTT	2	6	2227216	2227221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185884
39996	NC_007513	CAAT	2	8	2227229	2227236	50 %	25 %	0 %	25 %	78185884
39997	NC_007513	GTC	2	6	2227245	2227250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
39998	NC_007513	TTCC	2	8	2227254	2227261	0 %	50 %	0 %	50 %	78185884
39999	NC_007513	CGT	2	6	2227265	2227270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185884
40000	NC_007513	CGA	2	6	2227292	2227297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185884

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