MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007513	GCT	2	6	177162	177167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183754
3502	NC_007513	CGA	2	6	177171	177176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183754
3503	NC_007513	GTGC	2	8	177418	177425	0 %	25 %	50 %	25 %	78183755
3504	NC_007513	TCCTC	2	10	177491	177500	0 %	40 %	0 %	60 %	78183755
3505	NC_007513	AGA	2	6	177505	177510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183755
3506	NC_007513	TG	3	6	177512	177517	0 %	50 %	50 %	0 %	78183755
3507	NC_007513	AAC	2	6	177586	177591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183755
3508	NC_007513	TTG	2	6	177681	177686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183756
3509	NC_007513	GCT	2	6	177718	177723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3510	NC_007513	GGC	2	6	177792	177797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183756
3511	NC_007513	GGAT	2	8	177946	177953	25 %	25 %	50 %	0 %	78183756
3512	NC_007513	GGT	2	6	177961	177966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183756
3513	NC_007513	ACC	2	6	177987	177992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183756
3514	NC_007513	GGCT	2	8	178092	178099	0 %	25 %	50 %	25 %	78183756
3515	NC_007513	TTC	2	6	178314	178319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183756
3516	NC_007513	ACG	2	6	178371	178376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3517	NC_007513	CAG	2	6	178391	178396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3518	NC_007513	AGC	2	6	178479	178484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3519	NC_007513	CCCTT	2	10	178551	178560	0 %	40 %	0 %	60 %	78183756
3520	NC_007513	CGC	2	6	178624	178629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183756
3521	NC_007513	TGG	2	6	178632	178637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183756
3522	NC_007513	CTG	2	6	178646	178651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3523	NC_007513	CGG	2	6	178674	178679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183756
3524	NC_007513	TAC	2	6	178682	178687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183756
3525	NC_007513	CGC	2	6	178710	178715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183756
3526	NC_007513	CCG	2	6	178764	178769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183756
3527	NC_007513	CTA	2	6	178935	178940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183756
3528	NC_007513	GC	4	8	179047	179054	0 %	0 %	50 %	50 %	78183756
3529	NC_007513	TCG	2	6	179076	179081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3530	NC_007513	TGC	2	6	179101	179106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3531	NC_007513	CCA	2	6	179124	179129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183756
3532	NC_007513	GTG	2	6	179285	179290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183756
3533	NC_007513	CCTGG	2	10	179303	179312	0 %	20 %	40 %	40 %	78183756
3534	NC_007513	AGG	2	6	179340	179345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183756
3535	NC_007513	GTT	2	6	179401	179406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183756
3536	NC_007513	TGA	2	6	179407	179412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183756
3537	NC_007513	TGAG	2	8	179433	179440	25 %	25 %	50 %	0 %	78183756
3538	NC_007513	TGC	2	6	179494	179499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183756
3539	NC_007513	CCAA	2	8	179648	179655	50 %	0 %	0 %	50 %	78183757
3540	NC_007513	GTT	2	6	179680	179685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183757
3541	NC_007513	T	6	6	179684	179689	0 %	100 %	0 %	0 %	78183757
3542	NC_007513	TTGC	2	8	179706	179713	0 %	50 %	25 %	25 %	78183757
3543	NC_007513	CAA	2	6	179740	179745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183757
3544	NC_007513	TGAT	2	8	179773	179780	25 %	50 %	25 %	0 %	78183757
3545	NC_007513	GTC	2	6	179828	179833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183757
3546	NC_007513	TGGG	2	8	179846	179853	0 %	25 %	75 %	0 %	78183757
3547	NC_007513	AGGC	2	8	179880	179887	25 %	0 %	50 %	25 %	78183757
3548	NC_007513	ATC	2	6	179897	179902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183757
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3550	NC_007513	GTG	2	6	179923	179928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183757
3551	NC_007513	CAG	2	6	179940	179945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183757
3552	NC_007513	CTT	2	6	179974	179979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183757
3553	NC_007513	CGA	2	6	179985	179990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183757
3554	NC_007513	TTGG	2	8	180051	180058	0 %	50 %	50 %	0 %	78183757
3555	NC_007513	TGA	2	6	180067	180072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183757
3556	NC_007513	TGC	2	6	180084	180089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183757
3557	NC_007513	TAATT	2	10	180107	180116	40 %	60 %	0 %	0 %	78183757
3558	NC_007513	CGAG	2	8	180157	180164	25 %	0 %	50 %	25 %	78183757
3559	NC_007513	AG	3	6	180172	180177	50 %	0 %	50 %	0 %	78183757
3560	NC_007513	CT	3	6	180182	180187	0 %	50 %	0 %	50 %	78183757
3561	NC_007513	ACA	2	6	180235	180240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183757
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3563	NC_007513	CGTT	2	8	180277	180284	0 %	50 %	25 %	25 %	78183757
3564	NC_007513	GCA	2	6	180301	180306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183757
3565	NC_007513	GTG	2	6	180324	180329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183757
3566	NC_007513	GCA	2	6	180354	180359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183757
3567	NC_007513	TTG	2	6	180381	180386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183757
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3570	NC_007513	CT	3	6	180577	180582	0 %	50 %	0 %	50 %	78183758
3571	NC_007513	CCT	2	6	180621	180626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183758
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3574	NC_007513	CTG	2	6	180747	180752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183758
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3579	NC_007513	TTG	2	6	180955	180960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183758
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3582	NC_007513	GTT	2	6	181238	181243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183758
3583	NC_007513	TAT	2	6	181311	181316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183758
3584	NC_007513	AAT	2	6	181459	181464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78183758
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3590	NC_007513	GA	3	6	181822	181827	50 %	0 %	50 %	0 %	78183759
3591	NC_007513	AT	3	6	181849	181854	50 %	50 %	0 %	0 %	78183759
3592	NC_007513	CACC	2	8	181868	181875	25 %	0 %	0 %	75 %	78183759
3593	NC_007513	ACC	2	6	181921	181926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183759
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3597	NC_007513	CAT	2	6	182150	182155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183759
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3602	NC_007513	GCC	2	6	182464	182469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183759
3603	NC_007513	CAA	2	6	182473	182478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183759
3604	NC_007513	CAC	2	6	182481	182486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183759
3605	NC_007513	GGAACA	2	12	182531	182542	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	78183759
3606	NC_007513	CG	3	6	182617	182622	0 %	0 %	50 %	50 %	78183759
3607	NC_007513	GCT	2	6	182662	182667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183759
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3609	NC_007513	CGG	2	6	182759	182764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183759
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3619	NC_007513	GC	3	6	183082	183087	0 %	0 %	50 %	50 %	78183759
3620	NC_007513	CCG	2	6	183115	183120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183759
3621	NC_007513	AGCC	2	8	183255	183262	25 %	0 %	25 %	50 %	78183760
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3623	NC_007513	TCC	2	6	183353	183358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183760
3624	NC_007513	ACCA	2	8	183419	183426	50 %	0 %	0 %	50 %	78183760
3625	NC_007513	GGTC	2	8	183462	183469	0 %	25 %	50 %	25 %	78183760
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3636	NC_007513	GTG	3	9	184117	184125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183762
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3644	NC_007513	GTT	2	6	184311	184316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183762
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3646	NC_007513	TGC	2	6	184346	184351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183762
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3657	NC_007513	CGACG	2	10	184777	184786	20 %	0 %	40 %	40 %	78183762
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3730	NC_007513	AG	3	6	188732	188737	50 %	0 %	50 %	0 %	78183766
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3992	NC_007513	GCT	2	6	201979	201984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183777
3993	NC_007513	GGC	2	6	202041	202046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183777
3994	NC_007513	GCA	2	6	202082	202087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183777
3995	NC_007513	CAC	2	6	202126	202131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183777
3996	NC_007513	GGTT	2	8	202145	202152	0 %	50 %	50 %	0 %	78183777
3997	NC_007513	TCGT	2	8	202270	202277	0 %	50 %	25 %	25 %	78183777
3998	NC_007513	GCT	2	6	202286	202291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183777
3999	NC_007513	CGT	2	6	202345	202350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183777
4000	NC_007513	TTG	2	6	202391	202396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183777

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