MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007513	GAC	2	6	151102	151107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183727
3002	NC_007513	GCA	2	6	151149	151154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183727
3003	NC_007513	GGT	2	6	151167	151172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183727
3004	NC_007513	TGGA	2	8	151192	151199	25 %	25 %	50 %	0 %	78183727
3005	NC_007513	TCG	2	6	151231	151236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183727
3006	NC_007513	GGA	2	6	151239	151244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183727
3007	NC_007513	CTA	2	6	151272	151277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183727
3008	NC_007513	TGG	2	6	151316	151321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183727
3009	NC_007513	GTCG	2	8	151369	151376	0 %	25 %	50 %	25 %	78183727
3010	NC_007513	CAC	2	6	151377	151382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183727
3011	NC_007513	TGGA	2	8	151430	151437	25 %	25 %	50 %	0 %	78183727
3012	NC_007513	GCC	2	6	151479	151484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183727
3013	NC_007513	GCCG	2	8	151598	151605	0 %	0 %	50 %	50 %	78183727
3014	NC_007513	GCT	2	6	151639	151644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183727
3015	NC_007513	ATTGGT	2	12	151711	151722	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	78183727
3016	NC_007513	GTG	2	6	151723	151728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183727
3017	NC_007513	GATC	2	8	151752	151759	25 %	25 %	25 %	25 %	78183727
3018	NC_007513	GGA	2	6	151767	151772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183727
3019	NC_007513	CTT	2	6	151777	151782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183727
3020	NC_007513	GGA	2	6	151860	151865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183727
3021	NC_007513	GCCA	2	8	151987	151994	25 %	0 %	25 %	50 %	78183727
3022	NC_007513	CAT	2	6	152058	152063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183727
3023	NC_007513	GATC	2	8	152168	152175	25 %	25 %	25 %	25 %	78183728
3024	NC_007513	GAT	2	6	152220	152225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183728
3025	NC_007513	CCG	2	6	152278	152283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183728
3026	NC_007513	TTG	2	6	152290	152295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183728
3027	NC_007513	TGTT	2	8	152338	152345	0 %	75 %	25 %	0 %	78183728
3028	NC_007513	GCG	2	6	152411	152416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183728
3029	NC_007513	GTTG	2	8	152525	152532	0 %	50 %	50 %	0 %	78183728
3030	NC_007513	GGC	2	6	152684	152689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183728
3031	NC_007513	GGC	2	6	152720	152725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183728
3032	NC_007513	GAT	2	6	152772	152777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183728
3033	NC_007513	TCC	2	6	152790	152795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183728
3034	NC_007513	GCCC	2	8	152834	152841	0 %	0 %	25 %	75 %	78183728
3035	NC_007513	GTTG	2	8	152953	152960	0 %	50 %	50 %	0 %	78183728
3036	NC_007513	GT	3	6	153009	153014	0 %	50 %	50 %	0 %	78183728
3037	NC_007513	G	6	6	153023	153028	0 %	0 %	100 %	0 %	78183728
3038	NC_007513	GA	4	8	153110	153117	50 %	0 %	50 %	0 %	78183729
3039	NC_007513	TGGCTT	2	12	153190	153201	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	78183729
3040	NC_007513	GCG	2	6	153274	153279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183729
3041	NC_007513	CCGT	2	8	153285	153292	0 %	25 %	25 %	50 %	78183729
3042	NC_007513	CAG	2	6	153401	153406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183729
3043	NC_007513	TGG	2	6	153580	153585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183730
3044	NC_007513	ACTG	2	8	153621	153628	25 %	25 %	25 %	25 %	78183730
3045	NC_007513	CCGAGA	2	12	153682	153693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183730
3046	NC_007513	GCGA	2	8	153713	153720	25 %	0 %	50 %	25 %	78183730
3047	NC_007513	TC	3	6	153765	153770	0 %	50 %	0 %	50 %	78183730
3048	NC_007513	GAA	2	6	153810	153815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183730
3049	NC_007513	T	6	6	153850	153855	0 %	100 %	0 %	0 %	78183730
3050	NC_007513	GAG	2	6	153930	153935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183730
3051	NC_007513	GGT	2	6	153975	153980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183730
3052	NC_007513	CGA	2	6	153998	154003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183730
3053	NC_007513	GAA	3	9	154083	154091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183730
3054	NC_007513	AAG	2	6	154116	154121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183730
3055	NC_007513	AGC	2	6	154157	154162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183730
3056	NC_007513	TCAACG	2	12	154249	154260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78183730
3057	NC_007513	GC	3	6	154328	154333	0 %	0 %	50 %	50 %	78183730
3058	NC_007513	GTT	2	6	154368	154373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183730
3059	NC_007513	TTGCA	2	10	154433	154442	20 %	40 %	20 %	20 %	78183730
3060	NC_007513	GGC	2	6	154469	154474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183730
3061	NC_007513	TGG	2	6	154510	154515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183730
3062	NC_007513	ACA	2	6	154666	154671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183730
3063	NC_007513	ATCAC	2	10	154687	154696	40 %	20 %	0 %	40 %	78183730
3064	NC_007513	CAA	2	6	154709	154714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183730
3065	NC_007513	ATC	2	6	154716	154721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183730
3066	NC_007513	TGA	2	6	154780	154785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183730
3067	NC_007513	TGG	2	6	154888	154893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183730
3068	NC_007513	GCG	2	6	155146	155151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183731
3069	NC_007513	CCA	2	6	155173	155178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183731
3070	NC_007513	G	6	6	155205	155210	0 %	0 %	100 %	0 %	78183731
3071	NC_007513	GCA	2	6	155220	155225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183731
3072	NC_007513	GGT	2	6	155247	155252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183731
3073	NC_007513	TGAA	2	8	155315	155322	50 %	25 %	25 %	0 %	78183731
3074	NC_007513	ATG	2	6	155491	155496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183731
3075	NC_007513	ACA	2	6	155521	155526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183731
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3077	NC_007513	GGCA	2	8	155562	155569	25 %	0 %	50 %	25 %	78183731
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3080	NC_007513	CCG	2	6	155760	155765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183732
3081	NC_007513	TGC	2	6	155839	155844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183732
3082	NC_007513	CGC	2	6	155851	155856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183732
3083	NC_007513	TGC	2	6	155857	155862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183732
3084	NC_007513	GGTC	2	8	155863	155870	0 %	25 %	50 %	25 %	78183732
3085	NC_007513	GAT	2	6	155894	155899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183732
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3088	NC_007513	TCA	2	6	155982	155987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183732
3089	NC_007513	CCA	2	6	156025	156030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183732
3090	NC_007513	TGC	2	6	156031	156036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183732
3091	NC_007513	TCG	2	6	156258	156263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183733
3092	NC_007513	CGGCA	2	10	156297	156306	20 %	0 %	40 %	40 %	78183733
3093	NC_007513	TGC	2	6	156341	156346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183733
3094	NC_007513	CAC	2	6	156384	156389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183733
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3096	NC_007513	TGGC	2	8	156623	156630	0 %	25 %	50 %	25 %	78183733
3097	NC_007513	TGA	2	6	156651	156656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183733
3098	NC_007513	GCG	3	9	156664	156672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183733
3099	NC_007513	GGGCT	2	10	156677	156686	0 %	20 %	60 %	20 %	78183733
3100	NC_007513	TTG	2	6	156716	156721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183733
3101	NC_007513	GGT	3	9	156727	156735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183733
3102	NC_007513	TGG	2	6	156762	156767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183733
3103	NC_007513	CGA	2	6	156801	156806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183733
3104	NC_007513	A	6	6	156835	156840	100 %	0 %	0 %	0 %	78183733
3105	NC_007513	TGG	3	9	156851	156859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183733
3106	NC_007513	CGG	2	6	156869	156874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183733
3107	NC_007513	CAA	2	6	156925	156930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183733
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3109	NC_007513	TTG	2	6	157034	157039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183733
3110	NC_007513	ACGC	2	8	157062	157069	25 %	0 %	25 %	50 %	78183733
3111	NC_007513	TCG	2	6	157091	157096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183733
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3118	NC_007513	TTG	2	6	157559	157564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183734
3119	NC_007513	TGG	2	6	157634	157639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183734
3120	NC_007513	GGC	2	6	157706	157711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183734
3121	NC_007513	TGG	2	6	157713	157718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183734
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3123	NC_007513	AGT	2	6	157838	157843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183734
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3486	NC_007513	CATCG	2	10	176399	176408	20 %	20 %	20 %	40 %	78183753
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3490	NC_007513	GCC	2	6	176624	176629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183753
3491	NC_007513	GCTT	2	8	176703	176710	0 %	50 %	25 %	25 %	78183753
3492	NC_007513	GGC	2	6	176711	176716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183753
3493	NC_007513	CAC	2	6	176717	176722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183753
3494	NC_007513	CTG	2	6	176800	176805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183753
3495	NC_007513	AGT	2	6	176884	176889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183753
3496	NC_007513	TGA	2	6	176932	176937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183753
3497	NC_007513	CCA	2	6	176956	176961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183753
3498	NC_007513	TCG	2	6	177035	177040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183754
3499	NC_007513	CTT	2	6	177060	177065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183754
3500	NC_007513	CGAG	2	8	177093	177100	25 %	0 %	50 %	25 %	78183754

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