MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9902 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007513	GCG	2	6	51617	51622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183640
1002	NC_007513	GCGA	2	8	51715	51722	25 %	0 %	50 %	25 %	78183640
1003	NC_007513	CGG	2	6	51786	51791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183640
1004	NC_007513	CTC	2	6	51867	51872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183640
1005	NC_007513	CGT	2	6	51917	51922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183640
1006	NC_007513	CCACG	2	10	51925	51934	20 %	0 %	20 %	60 %	78183640
1007	NC_007513	GCTT	2	8	52008	52015	0 %	50 %	25 %	25 %	78183640
1008	NC_007513	GTG	2	6	52118	52123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183640
1009	NC_007513	CCA	2	6	52311	52316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183640
1010	NC_007513	TCT	2	6	52510	52515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183640
1011	NC_007513	CGT	2	6	52751	52756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183640
1012	NC_007513	TTGT	2	8	52769	52776	0 %	75 %	25 %	0 %	78183640
1013	NC_007513	GGT	2	6	52817	52822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183640
1014	NC_007513	TAC	2	6	52907	52912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183640
1015	NC_007513	CCGC	2	8	53085	53092	0 %	0 %	25 %	75 %	78183641
1016	NC_007513	GGC	2	6	53129	53134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1017	NC_007513	TGC	2	6	53151	53156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1018	NC_007513	GTT	2	6	53164	53169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183641
1019	NC_007513	GAA	2	6	53219	53224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78183641
1020	NC_007513	TGG	3	9	53241	53249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1021	NC_007513	GAG	2	6	53261	53266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183641
1022	NC_007513	GGT	2	6	53269	53274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1023	NC_007513	CGA	2	6	53341	53346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1024	NC_007513	GGC	2	6	53438	53443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1025	NC_007513	GTT	2	6	53491	53496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183641
1026	NC_007513	GAC	2	6	53525	53530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1027	NC_007513	CGG	2	6	53574	53579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1028	NC_007513	GCG	2	6	53685	53690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183641
1029	NC_007513	TGAC	2	8	53772	53779	25 %	25 %	25 %	25 %	78183641
1030	NC_007513	GTT	2	6	53800	53805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183641
1031	NC_007513	AGG	2	6	53850	53855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183641
1032	NC_007513	AGC	2	6	53886	53891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1033	NC_007513	GGT	2	6	53909	53914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1034	NC_007513	T	6	6	53924	53929	0 %	100 %	0 %	0 %	78183641
1035	NC_007513	CGT	2	6	53949	53954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183641
1036	NC_007513	C	6	6	54065	54070	0 %	0 %	0 %	100 %	78183641
1037	NC_007513	ATCG	2	8	54085	54092	25 %	25 %	25 %	25 %	78183641
1038	NC_007513	GT	3	6	54102	54107	0 %	50 %	50 %	0 %	78183641
1039	NC_007513	CCTA	2	8	54117	54124	25 %	25 %	0 %	50 %	78183641
1040	NC_007513	TGG	2	6	54186	54191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183641
1041	NC_007513	GTTTG	2	10	54264	54273	0 %	60 %	40 %	0 %	78183641
1042	NC_007513	GCTGG	2	10	54535	54544	0 %	20 %	60 %	20 %	78183642
1043	NC_007513	TGG	2	6	54612	54617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183642
1044	NC_007513	TTGTG	2	10	54630	54639	0 %	60 %	40 %	0 %	78183642
1045	NC_007513	CAA	2	6	54665	54670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183642
1046	NC_007513	AAC	2	6	54678	54683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78183642
1047	NC_007513	GAG	2	6	54737	54742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78183642
1048	NC_007513	GCA	2	6	54778	54783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1049	NC_007513	GAT	2	6	54804	54809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183642
1050	NC_007513	CAC	2	6	54903	54908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183642
1051	NC_007513	CTG	2	6	54942	54947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1052	NC_007513	CAG	2	6	54951	54956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1053	NC_007513	TGC	2	6	54994	54999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1054	NC_007513	CCG	2	6	55046	55051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183642
1055	NC_007513	CGC	2	6	55116	55121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183642
1056	NC_007513	GTT	2	6	55126	55131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183642
1057	NC_007513	GAACTG	2	12	55163	55174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78183642
1058	NC_007513	GGGC	2	8	55220	55227	0 %	0 %	75 %	25 %	78183642
1059	NC_007513	CTG	2	6	55299	55304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1060	NC_007513	GCG	2	6	55426	55431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183642
1061	NC_007513	CAG	2	6	55503	55508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1062	NC_007513	CAG	2	6	55596	55601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1063	NC_007513	GCA	2	6	55634	55639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1064	NC_007513	AGGTG	2	10	55751	55760	20 %	20 %	60 %	0 %	78183642
1065	NC_007513	TCG	2	6	55785	55790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1066	NC_007513	GGT	2	6	55845	55850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78183642
1067	NC_007513	ACC	2	6	55864	55869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183642
1068	NC_007513	TTC	2	6	55881	55886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183642
1069	NC_007513	GCT	2	6	55912	55917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183642
1070	NC_007513	CCA	2	6	55940	55945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183642
1071	NC_007513	GC	3	6	55959	55964	0 %	0 %	50 %	50 %	78183642
1072	NC_007513	TGT	2	6	56006	56011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183642
1073	NC_007513	GC	3	6	56142	56147	0 %	0 %	50 %	50 %	78183642
1074	NC_007513	TGA	2	6	56299	56304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183642
1075	NC_007513	GCT	2	6	56467	56472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183643
1076	NC_007513	TGC	2	6	56493	56498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183643
1077	NC_007513	GTT	2	6	56536	56541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183643
1078	NC_007513	TGGC	2	8	56559	56566	0 %	25 %	50 %	25 %	78183643
1079	NC_007513	GTC	2	6	56582	56587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183643
1080	NC_007513	GGCG	2	8	56656	56663	0 %	0 %	75 %	25 %	78183643
1081	NC_007513	CGAT	2	8	56664	56671	25 %	25 %	25 %	25 %	78183643
1082	NC_007513	GTC	2	6	56698	56703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183643
1083	NC_007513	GTT	2	6	56735	56740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183643
1084	NC_007513	GGC	2	6	56770	56775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183643
1085	NC_007513	GT	3	6	56817	56822	0 %	50 %	50 %	0 %	78183643
1086	NC_007513	CAC	2	6	56834	56839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183643
1087	NC_007513	CAG	2	6	56974	56979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183643
1088	NC_007513	GTC	2	6	57146	57151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183644
1089	NC_007513	ACCC	2	8	57223	57230	25 %	0 %	0 %	75 %	78183644
1090	NC_007513	TC	3	6	57234	57239	0 %	50 %	0 %	50 %	78183644
1091	NC_007513	ATTT	2	8	57270	57277	25 %	75 %	0 %	0 %	78183644
1092	NC_007513	GATT	2	8	57291	57298	25 %	50 %	25 %	0 %	78183644
1093	NC_007513	CTC	2	6	57316	57321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183644
1094	NC_007513	AAT	2	6	57322	57327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78183644
1095	NC_007513	T	6	6	57364	57369	0 %	100 %	0 %	0 %	78183644
1096	NC_007513	CGT	2	6	57371	57376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183644
1097	NC_007513	CTTG	2	8	57379	57386	0 %	50 %	25 %	25 %	78183644
1098	NC_007513	TGT	2	6	57389	57394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78183644
1099	NC_007513	TGA	2	6	57408	57413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183644
1100	NC_007513	GCC	2	6	57487	57492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183644
1101	NC_007513	ATG	2	6	57497	57502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183644
1102	NC_007513	CCG	2	6	57515	57520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183644
1103	NC_007513	AAT	2	6	57523	57528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78183644
1104	NC_007513	TCC	2	6	57595	57600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183644
1105	NC_007513	TCC	2	6	57616	57621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183644
1106	NC_007513	CAT	2	6	57645	57650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183644
1107	NC_007513	GTTT	2	8	57760	57767	0 %	75 %	25 %	0 %	78183644
1108	NC_007513	TCC	2	6	58084	58089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78183644
1109	NC_007513	GTC	2	6	58090	58095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183644
1110	NC_007513	CTG	2	6	58131	58136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183644
1111	NC_007513	TC	3	6	58199	58204	0 %	50 %	0 %	50 %	78183644
1112	NC_007513	CAT	2	6	58290	58295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183644
1113	NC_007513	TCT	2	6	58322	58327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183644
1114	NC_007513	TTTC	2	8	58335	58342	0 %	75 %	0 %	25 %	78183644
1115	NC_007513	ATT	2	6	58385	58390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78183644
1116	NC_007513	CCG	2	6	58521	58526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78183645
1117	NC_007513	CCA	2	6	58537	58542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78183645
1118	NC_007513	GAT	2	6	58572	58577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78183645
1119	NC_007513	CGG	2	6	58653	58658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78183645
1120	NC_007513	CAT	2	6	58687	58692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78183645
1121	NC_007513	CAG	2	6	58724	58729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183645
1122	NC_007513	GCACT	2	10	58807	58816	20 %	20 %	20 %	40 %	78183645
1123	NC_007513	TCG	2	6	58866	58871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183645
1124	NC_007513	GCA	2	6	58885	58890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78183645
1125	NC_007513	GCGG	2	8	58941	58948	0 %	0 %	75 %	25 %	78183645
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1127	NC_007513	TCT	2	6	58992	58997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78183645
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1255	NC_007513	CGT	2	6	65794	65799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78183650
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1257	NC_007513	GCCGA	2	10	65870	65879	20 %	0 %	40 %	40 %	78183650
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